Doublet Group distance statistics: 52060

back

Distances from reference structure (by RMSD)

6, 17, 15, 13, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.003, 0.006, 0.010, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.012 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.032 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.012, 0.039, 0.066, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.039 std_dev=0.027
C2'	A	0, 0.037, 0.084, 0.130, 0.206 max_d=0.206 avg_d=0.084 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.027, 0.074, 0.120, 0.191 max_d=0.191 avg_d=0.074 std_dev=0.047
C4'	A	0, 0.051, 0.113, 0.176, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.113 std_dev=0.062
C3'	A	0, 0.039, 0.103, 0.166, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.103 std_dev=0.064
O3'	A	0, 0.042, 0.113, 0.183, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.113 std_dev=0.071
O2'	A	0, 0.050, 0.146, 0.243, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.146 std_dev=0.097
C5'	A	0, 0.075, 0.184, 0.293, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.184 std_dev=0.109
C2'	B	0, 0.078, 0.193, 0.309, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.193 std_dev=0.116
O2'	B	0, 0.105, 0.227, 0.350, 0.510 max_d=0.510 avg_d=0.227 std_dev=0.123
O5'	A	0, 0.081, 0.204, 0.328, 0.595 max_d=0.595 avg_d=0.204 std_dev=0.124
O2	B	0, 0.116, 0.254, 0.392, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.254 std_dev=0.138
C3'	B	0, 0.081, 0.227, 0.372, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.227 std_dev=0.146
C1'	B	0, 0.069, 0.221, 0.374, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.221 std_dev=0.152
C2	B	0, 0.069, 0.224, 0.380, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.224 std_dev=0.156
O3'	B	0, 0.093, 0.249, 0.405, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.249 std_dev=0.156
P	A	0, 0.102, 0.257, 0.413, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.257 std_dev=0.156
N1	B	0, 0.053, 0.215, 0.377, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.215 std_dev=0.162
OP2	A	0, 0.119, 0.296, 0.472, 0.949 max_d=0.949 avg_d=0.296 std_dev=0.176
N3	B	0, 0.074, 0.252, 0.429, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.252 std_dev=0.178
C6	B	0, 0.072, 0.255, 0.439, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.255 std_dev=0.183
C4'	B	0, 0.085, 0.276, 0.466, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.276 std_dev=0.191
OP1	A	0, 0.121, 0.313, 0.504, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.313 std_dev=0.192
O4'	B	0, 0.081, 0.274, 0.467, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.274 std_dev=0.193
C5	B	0, 0.074, 0.277, 0.479, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.277 std_dev=0.202
C4	B	0, 0.061, 0.266, 0.471, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.266 std_dev=0.205
OP2	B	0, 0.156, 0.374, 0.593, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.374 std_dev=0.218
O5'	B	0, 0.097, 0.318, 0.539, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.318 std_dev=0.221
O4	B	0, 0.093, 0.321, 0.549, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.321 std_dev=0.228
C5'	B	0, 0.093, 0.321, 0.549, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.321 std_dev=0.228
P	B	0, 0.134, 0.364, 0.594, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.364 std_dev=0.230
OP1	B	0, 0.147, 0.396, 0.644, 1.317 max_d=1.317 avg_d=0.396 std_dev=0.249

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.04	0.08	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.04	0.03	0.08	0.09	0.14	0.09
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.05	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.07	0.04
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.05	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.05	0.03
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.04	0.02	0.08	0.09	0.15	0.10
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.03	0.07	0.07	0.14	0.08
C5'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.06	0.06	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.03	0.06	0.06	0.12	0.07
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.06	0.06	0.11	0.07
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.04	0.02	0.09	0.11	0.16	0.11
N4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.05	0.02	0.09	0.11	0.17	0.11
O2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.05	0.06	0.09	0.10	0.14	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.08	0.02	0.07	0.02	0.06	0.04	0.08	0.10	0.09	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.09	0.06
O3'	0.03	0.04	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05	0.00	0.02	0.03	0.07	0.05	0.03
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.08	0.06
O5'	0.04	0.08	0.04	0.03	0.08	0.01	0.07	0.00	0.06	0.06	0.09	0.09	0.09	0.05	0.03	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.09	0.05	0.06	0.09	0.05	0.07	0.05	0.06	0.06	0.11	0.11	0.10	0.07	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.14	0.07	0.05	0.15	0.03	0.14	0.01	0.12	0.11	0.16	0.17	0.14	0.09	0.05	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.09	0.04	0.03	0.10	0.01	0.08	0.01	0.07	0.07	0.11	0.11	0.10	0.06	0.03	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.07	0.06	0.06	0.09	0.06	0.09	0.06	0.08	0.06	0.08	0.10	0.09	0.07	0.14	0.06	0.08	0.12	0.12	0.10
C2	0.06	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07	0.09	0.07	0.08	0.06	0.08	0.11	0.08	0.09	0.14	0.06	0.09	0.14	0.13	0.11
C2'	0.06	0.08	0.06	0.05	0.09	0.05	0.08	0.05	0.07	0.06	0.08	0.11	0.09	0.05	0.15	0.06	0.08	0.11	0.12	0.09
C3'	0.07	0.08	0.07	0.05	0.08	0.05	0.08	0.05	0.07	0.07	0.08	0.11	0.10	0.04	0.13	0.06	0.07	0.10	0.11	0.08
C4	0.08	0.08	0.08	0.09	0.06	0.10	0.11	0.11	0.10	0.08	0.06	0.12	0.08	0.09	0.13	0.09	0.13	0.17	0.18	0.15
C4'	0.08	0.09	0.07	0.05	0.09	0.05	0.08	0.05	0.08	0.08	0.09	0.12	0.10	0.05	0.11	0.07	0.07	0.11	0.10	0.08
C5	0.09	0.08	0.08	0.09	0.12	0.09	0.14	0.11	0.13	0.09	0.08	0.10	0.09	0.09	0.17	0.10	0.13	0.16	0.18	0.15
C5'	0.09	0.11	0.09	0.05	0.08	0.05	0.08	0.05	0.08	0.09	0.10	0.14	0.11	0.03	0.09	0.07	0.06	0.11	0.09	0.07
C6	0.09	0.08	0.08	0.08	0.12	0.08	0.13	0.09	0.12	0.09	0.10	0.10	0.10	0.08	0.16	0.09	0.12	0.15	0.16	0.14
N1	0.06	0.06	0.07	0.07	0.09	0.07	0.10	0.07	0.09	0.06	0.07	0.09	0.09	0.08	0.14	0.06	0.09	0.13	0.14	0.11
N3	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.08	0.10	0.08	0.07	0.09	0.13	0.09	0.10	0.14	0.08	0.11	0.16	0.16	0.14
N4	0.10	0.11	0.09	0.11	0.08	0.12	0.13	0.13	0.12	0.10	0.10	0.13	0.09	0.10	0.10	0.12	0.15	0.19	0.20	0.18
O2	0.10	0.11	0.10	0.10	0.12	0.09	0.12	0.08	0.11	0.10	0.11	0.13	0.10	0.11	0.15	0.09	0.08	0.12	0.12	0.09
O2'	0.07	0.07	0.06	0.06	0.11	0.06	0.11	0.07	0.09	0.07	0.09	0.10	0.09	0.06	0.18	0.06	0.09	0.13	0.14	0.11
O3'	0.08	0.09	0.08	0.05	0.10	0.05	0.09	0.05	0.08	0.08	0.10	0.12	0.11	0.05	0.15	0.07	0.07	0.11	0.11	0.09
O4'	0.08	0.09	0.07	0.08	0.10	0.07	0.10	0.08	0.09	0.08	0.09	0.11	0.10	0.09	0.12	0.07	0.10	0.13	0.13	0.11
O5'	0.08	0.09	0.09	0.05	0.08	0.04	0.08	0.04	0.08	0.08	0.09	0.12	0.09	0.01	0.09	0.07	0.06	0.10	0.09	0.07
OP1	0.03	0.05	0.04	0.02	0.07	0.04	0.09	0.07	0.07	0.03	0.05	0.09	0.08	0.02	0.09	0.03	0.08	0.13	0.10	0.10
OP2	0.05	0.08	0.04	0.04	0.13	0.05	0.14	0.06	0.12	0.08	0.10	0.07	0.04	0.02	0.16	0.05	0.08	0.11	0.10	0.08
P	0.02	0.04	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.07	0.03	0.05	0.07	0.05	0.00	0.10	0.02	0.06	0.11	0.09	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.07	0.11	0.08
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.06	0.07	0.04
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.06	0.01	0.04	0.07	0.06	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.09	0.12	0.15	0.12
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.09	0.12	0.15	0.12
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.08	0.09	0.11	0.09
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.06	0.09	0.07
N3	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.07	0.09	0.13	0.10
O2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.05	0.06	0.10	0.07
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.03	0.03	0.03	0.03	0.06	0.05	0.03
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.05	0.02	0.04	0.05	0.03	0.00	0.07	0.01	0.04	0.11	0.07	0.06
O4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.10	0.14	0.17	0.13
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.04	0.06	0.04
O5'	0.03	0.06	0.04	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.08	0.05	0.07	0.05	0.03	0.04	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.07	0.06	0.07	0.12	0.04	0.12	0.04	0.09	0.06	0.09	0.06	0.06	0.11	0.14	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.11	0.07	0.06	0.15	0.02	0.15	0.01	0.11	0.09	0.13	0.10	0.05	0.07	0.17	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.08	0.04	0.05	0.12	0.01	0.12	0.01	0.09	0.07	0.10	0.07	0.03	0.06	0.13	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00