Doublet Group distance statistics: 52061

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 3, 1, 3, 1, 8, 8, 8, 8, 6, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.009, 0.014, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.016, 0.026, 0.037, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.026 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.010, 0.023, 0.035, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.019, 0.032, 0.045, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.032 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.027 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.033, 0.063, 0.092, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.063 std_dev=0.029
N4	A	0, 0.055, 0.088, 0.121, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.088 std_dev=0.033
O4'	A	0, -0.016, 0.163, 0.342, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.163 std_dev=0.179
C2'	B	0, 0.398, 0.580, 0.761, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.580 std_dev=0.181
C2'	A	0, 0.045, 0.227, 0.409, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.227 std_dev=0.182
C3'	B	0, 0.137, 0.349, 0.560, 1.206 max_d=1.206 avg_d=0.349 std_dev=0.212
C3'	A	0, 0.373, 0.604, 0.835, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.604 std_dev=0.231
C4'	A	0, 0.451, 0.696, 0.941, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.696 std_dev=0.245
C5	B	0, 0.512, 0.774, 1.035, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.774 std_dev=0.262
C4	B	0, 0.465, 0.733, 1.002, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.733 std_dev=0.268
O3'	B	0, 0.086, 0.355, 0.625, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.355 std_dev=0.270
C6	B	0, 0.526, 0.798, 1.071, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.798 std_dev=0.273
O2'	B	0, 0.532, 0.809, 1.086, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.809 std_dev=0.277
O3'	A	0, 0.492, 0.776, 1.060, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.776 std_dev=0.284
N1	B	0, 0.509, 0.798, 1.088, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.798 std_dev=0.290
N3	B	0, 0.514, 0.804, 1.094, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.804 std_dev=0.290
O4	B	0, 0.420, 0.712, 1.004, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.712 std_dev=0.292
C2	B	0, 0.546, 0.852, 1.159, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.852 std_dev=0.306
O2'	A	0, -0.019, 0.291, 0.602, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.291 std_dev=0.311
C1'	B	0, 0.539, 0.861, 1.183, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.861 std_dev=0.322
C4'	B	0, 0.412, 0.743, 1.075, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.743 std_dev=0.331
O2	B	0, 0.637, 0.997, 1.356, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.997 std_dev=0.359
O4'	B	0, 0.601, 1.010, 1.419, 1.592 max_d=1.592 avg_d=1.010 std_dev=0.409
C5'	A	0, 0.816, 1.263, 1.710, 2.327 max_d=2.327 avg_d=1.263 std_dev=0.447
C5'	B	0, 0.552, 1.050, 1.548, 2.356 max_d=2.356 avg_d=1.050 std_dev=0.498
O5'	B	0, 0.611, 1.122, 1.633, 2.594 max_d=2.594 avg_d=1.122 std_dev=0.511
O5'	A	0, 0.814, 1.381, 1.947, 3.954 max_d=3.954 avg_d=1.381 std_dev=0.567
OP2	B	0, 0.739, 1.311, 1.882, 3.303 max_d=3.303 avg_d=1.311 std_dev=0.572
P	B	0, 0.769, 1.382, 1.995, 3.380 max_d=3.380 avg_d=1.382 std_dev=0.613
OP2	A	0, 0.846, 1.497, 2.149, 4.080 max_d=4.080 avg_d=1.497 std_dev=0.651
P	A	0, 0.819, 1.472, 2.125, 4.478 max_d=4.478 avg_d=1.472 std_dev=0.653
OP1	B	0, 0.901, 1.586, 2.270, 3.950 max_d=3.950 avg_d=1.586 std_dev=0.685
OP1	A	0, 0.898, 1.594, 2.291, 5.064 max_d=5.064 avg_d=1.594 std_dev=0.697

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.07	0.00	0.33	0.35	0.19	0.26
C2	0.03	0.00	0.06	0.03	0.01	0.06	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.11	0.09	0.33	0.30	0.18	0.22
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.07	0.03	0.07	0.07	0.09	0.00	0.02	0.02	0.47	0.54	0.33	0.44
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.07	0.01	0.10	0.03	0.10	0.03	0.04	0.08	0.07	0.01	0.01	0.01	0.22	0.39	0.18	0.25
C4	0.02	0.01	0.06	0.07	0.00	0.10	0.01	0.31	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.06	0.03	0.35	0.26	0.19	0.22
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.10	0.00	0.15	0.01	0.15	0.06	0.07	0.11	0.12	0.02	0.02	0.01	0.02	0.18	0.23	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.15	0.00	0.36	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.06	0.06	0.37	0.27	0.22	0.24
C5'	0.08	0.19	0.09	0.03	0.31	0.01	0.36	0.00	0.33	0.20	0.24	0.33	0.15	0.07	0.05	0.02	0.01	0.19	0.35	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.10	0.01	0.15	0.00	0.33	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.06	0.09	0.39	0.30	0.23	0.27
N1	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.20	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.07	0.02	0.36	0.32	0.20	0.25
N3	0.03	0.01	0.07	0.04	0.01	0.07	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.10	0.08	0.34	0.27	0.18	0.21
N4	0.02	0.02	0.07	0.08	0.00	0.11	0.01	0.33	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.06	0.04	0.35	0.24	0.19	0.20
O2	0.04	0.01	0.09	0.07	0.02	0.12	0.02	0.15	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.19	0.15	0.15	0.29	0.31	0.17	0.22
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.10	0.07	0.12	0.04	0.11	0.08	0.19	0.00	0.04	0.01	0.47	0.62	0.45	0.51
O3'	0.07	0.11	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.05	0.06	0.07	0.10	0.06	0.15	0.04	0.00	0.07	0.11	0.29	0.18	0.16
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.08	0.04	0.15	0.01	0.07	0.00	0.21	0.24	0.23	0.18
O5'	0.33	0.33	0.47	0.22	0.35	0.02	0.37	0.01	0.39	0.36	0.34	0.35	0.29	0.47	0.11	0.21	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.35	0.30	0.54	0.39	0.26	0.18	0.27	0.19	0.30	0.32	0.27	0.24	0.31	0.62	0.29	0.24	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.18	0.33	0.18	0.19	0.23	0.22	0.35	0.23	0.20	0.18	0.19	0.17	0.45	0.18	0.23	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.22	0.44	0.25	0.22	0.04	0.24	0.02	0.27	0.25	0.21	0.20	0.22	0.51	0.16	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.11	0.15	0.13	0.10	0.18	0.20	0.21	0.21	0.16	0.09	0.11	0.16	0.12	0.10	0.24	0.21	0.24	0.25	0.24
C2	0.11	0.13	0.13	0.13	0.10	0.13	0.11	0.15	0.11	0.10	0.14	0.17	0.15	0.14	0.17	0.14	0.15	0.19	0.19	0.17
C2'	0.29	0.21	0.22	0.17	0.21	0.27	0.32	0.28	0.33	0.28	0.18	0.19	0.22	0.11	0.16	0.36	0.27	0.27	0.29	0.29
C3'	0.28	0.17	0.22	0.20	0.17	0.30	0.31	0.34	0.33	0.26	0.13	0.14	0.22	0.14	0.11	0.38	0.34	0.38	0.40	0.39
C4	0.10	0.14	0.12	0.16	0.15	0.16	0.13	0.20	0.12	0.10	0.17	0.18	0.14	0.17	0.19	0.14	0.20	0.24	0.24	0.22
C4'	0.23	0.12	0.20	0.21	0.13	0.30	0.28	0.37	0.30	0.21	0.09	0.11	0.20	0.16	0.09	0.35	0.37	0.45	0.47	0.44
C5	0.14	0.11	0.14	0.17	0.14	0.20	0.17	0.26	0.18	0.12	0.13	0.13	0.14	0.15	0.17	0.21	0.26	0.29	0.31	0.29
C5'	0.39	0.24	0.38	0.41	0.22	0.49	0.39	0.59	0.44	0.36	0.18	0.20	0.37	0.37	0.14	0.51	0.58	0.68	0.69	0.67
C6	0.16	0.10	0.14	0.15	0.12	0.20	0.18	0.25	0.19	0.14	0.10	0.11	0.14	0.14	0.16	0.24	0.25	0.28	0.31	0.29
N1	0.14	0.09	0.14	0.14	0.07	0.17	0.15	0.20	0.17	0.13	0.09	0.12	0.15	0.13	0.12	0.20	0.19	0.23	0.25	0.23
N3	0.11	0.17	0.13	0.15	0.15	0.13	0.12	0.16	0.10	0.10	0.19	0.21	0.15	0.17	0.20	0.12	0.16	0.20	0.20	0.18
N4	0.13	0.19	0.13	0.18	0.17	0.16	0.15	0.21	0.14	0.13	0.21	0.23	0.15	0.21	0.20	0.13	0.21	0.26	0.24	0.23
O2	0.13	0.16	0.14	0.13	0.14	0.13	0.14	0.13	0.12	0.12	0.18	0.20	0.16	0.14	0.20	0.13	0.13	0.16	0.17	0.15
O2'	0.27	0.24	0.19	0.14	0.24	0.21	0.29	0.20	0.29	0.27	0.23	0.23	0.21	0.14	0.23	0.31	0.20	0.25	0.27	0.24
O3'	0.19	0.15	0.14	0.12	0.16	0.19	0.23	0.21	0.23	0.18	0.16	0.16	0.15	0.10	0.16	0.26	0.21	0.26	0.27	0.25
O4'	0.16	0.10	0.14	0.15	0.09	0.21	0.21	0.27	0.22	0.15	0.10	0.13	0.15	0.12	0.11	0.25	0.28	0.34	0.36	0.33
O5'	0.31	0.37	0.35	0.35	0.34	0.28	0.29	0.24	0.28	0.31	0.38	0.40	0.37	0.41	0.35	0.27	0.26	0.23	0.20	0.22
OP1	0.25	0.32	0.30	0.31	0.35	0.26	0.27	0.25	0.24	0.26	0.36	0.34	0.31	0.37	0.41	0.24	0.26	0.29	0.24	0.25
OP2	0.26	0.27	0.32	0.31	0.27	0.25	0.24	0.21	0.23	0.25	0.28	0.29	0.33	0.36	0.29	0.24	0.21	0.18	0.15	0.16
P	0.23	0.28	0.28	0.28	0.28	0.22	0.23	0.19	0.21	0.23	0.30	0.30	0.30	0.35	0.32	0.20	0.20	0.20	0.15	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.06	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01	0.03	0.10	0.09	0.11	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.04	0.10	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.07	0.07	0.04
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.12	0.05	0.05	0.07	0.01	0.01	0.10	0.01	0.07	0.10	0.08	0.07
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.01	0.02	0.18	0.18	0.19	0.17
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.04	0.05	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.09	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.01	0.03	0.20	0.18	0.18	0.18
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.13	0.01	0.15	0.00	0.13	0.07	0.09	0.05	0.05	0.02	0.15	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.13	0.01	0.03	0.16	0.14	0.13	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.10	0.09	0.10	0.08
N3	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.04	0.01	0.03	0.13	0.13	0.15	0.13
O2	0.04	0.01	0.10	0.07	0.02	0.05	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.10	0.02	0.05	0.09	0.08	0.11	0.08
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.06	0.04	0.05	0.04	0.03	0.08	0.15	0.00	0.03	0.06	0.04	0.04	0.08	0.06	0.05
O3'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.10	0.01	0.14	0.02	0.13	0.05	0.04	0.10	0.03	0.00	0.11	0.01	0.11	0.16	0.13	0.11
O4	0.02	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.03	0.20	0.21	0.22	0.20
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.09	0.08	0.13	0.11
O5'	0.05	0.10	0.03	0.07	0.18	0.01	0.20	0.01	0.16	0.10	0.13	0.09	0.04	0.11	0.20	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.09	0.07	0.10	0.18	0.05	0.18	0.06	0.14	0.09	0.13	0.08	0.08	0.16	0.21	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.11	0.07	0.08	0.19	0.04	0.18	0.02	0.13	0.10	0.15	0.11	0.06	0.13	0.22	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.09	0.04	0.07	0.17	0.02	0.18	0.01	0.13	0.08	0.13	0.08	0.05	0.11	0.20	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00