Doublet Group distance statistics: 52063

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 4, 3, 0, 2, 0, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.004, 0.007, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.009, 0.013, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.013 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.010, 0.015, 0.021, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.015 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.012, 0.019, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.019 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.013, 0.021, 0.028, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.021 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.016, 0.026, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.026 std_dev=0.010
N4	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C4	B	0, 0.152, 0.335, 0.517, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.335 std_dev=0.183
O4	B	0, 0.164, 0.351, 0.539, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.351 std_dev=0.188
C5	B	0, 0.098, 0.315, 0.532, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.315 std_dev=0.217
N3	B	0, 0.148, 0.378, 0.607, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.378 std_dev=0.229
O3'	A	0, -0.051, 0.191, 0.433, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.191 std_dev=0.242
OP1	A	0, 0.168, 0.429, 0.690, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.429 std_dev=0.261
O4'	A	0, -0.099, 0.163, 0.426, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.163 std_dev=0.263
C3'	A	0, -0.073, 0.192, 0.457, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.192 std_dev=0.265
C2	B	0, 0.094, 0.362, 0.629, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.362 std_dev=0.267
C6	B	0, 0.057, 0.329, 0.601, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.329 std_dev=0.272
C4'	A	0, -0.082, 0.192, 0.467, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.192 std_dev=0.274
P	A	0, 0.135, 0.410, 0.684, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.410 std_dev=0.275
N1	B	0, 0.045, 0.327, 0.609, 1.106 max_d=1.106 avg_d=0.327 std_dev=0.282
C2'	A	0, -0.116, 0.189, 0.495, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.189 std_dev=0.306
O5'	A	0, 0.029, 0.358, 0.687, 1.561 max_d=1.561 avg_d=0.358 std_dev=0.329
O2	B	0, 0.076, 0.412, 0.748, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.412 std_dev=0.336
C1'	B	0, 0.018, 0.360, 0.701, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.360 std_dev=0.342
C2'	B	0, 0.042, 0.404, 0.765, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.404 std_dev=0.361
OP2	A	0, 0.135, 0.515, 0.894, 1.532 max_d=1.532 avg_d=0.515 std_dev=0.379
O4'	B	0, 0.022, 0.405, 0.788, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.405 std_dev=0.383
C3'	B	0, 0.047, 0.446, 0.845, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.446 std_dev=0.399
O2'	B	0, 0.087, 0.503, 0.919, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.503 std_dev=0.416
C4'	B	0, 0.017, 0.442, 0.866, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.442 std_dev=0.425
O5'	B	0, 0.066, 0.493, 0.919, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.493 std_dev=0.427
C5'	A	0, -0.084, 0.358, 0.801, 2.104 max_d=2.104 avg_d=0.358 std_dev=0.442
C5'	B	0, 0.027, 0.488, 0.950, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.488 std_dev=0.462
O3'	B	0, 0.047, 0.517, 0.987, 2.031 max_d=2.031 avg_d=0.517 std_dev=0.470
OP2	B	0, 0.162, 0.654, 1.146, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.654 std_dev=0.492
P	B	0, 0.099, 0.610, 1.121, 1.924 max_d=1.924 avg_d=0.610 std_dev=0.511
O2'	A	0, -0.202, 0.324, 0.849, 2.450 max_d=2.450 avg_d=0.324 std_dev=0.526
OP1	B	0, 0.139, 0.714, 1.289, 2.379 max_d=2.379 avg_d=0.714 std_dev=0.575

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.15	0.00	0.14	0.24	0.08	0.11
C2	0.01	0.00	0.10	0.03	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.14	0.10	0.20	0.21	0.09	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.11	0.11	0.02	0.08	0.04	0.17	0.00	0.02	0.01	0.38	0.55	0.35	0.43
C3'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.21	0.43	0.17	0.29
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.03	0.29	0.20	0.11	0.17
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.04	0.07	0.07	0.01	0.00	0.01	0.15	0.13	0.04
C5	0.01	0.00	0.08	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.10	0.06	0.31	0.20	0.13	0.20
C5'	0.04	0.12	0.11	0.01	0.13	0.00	0.10	0.00	0.08	0.08	0.14	0.14	0.13	0.03	0.09	0.01	0.00	0.03	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.04	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.10	0.08	0.29	0.21	0.11	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.22	0.22	0.08	0.14
N3	0.02	0.00	0.08	0.04	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.13	0.08	0.24	0.21	0.10	0.14
N4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.11	0.04	0.31	0.20	0.13	0.19
O2	0.01	0.00	0.17	0.03	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.28	0.16	0.15	0.15	0.22	0.10	0.09
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.08	0.07	0.20	0.03	0.21	0.05	0.08	0.09	0.28	0.00	0.04	0.03	0.29	0.58	0.41	0.42
O3'	0.15	0.14	0.02	0.01	0.11	0.01	0.10	0.09	0.10	0.13	0.13	0.11	0.16	0.04	0.00	0.11	0.06	0.31	0.11	0.16
O4'	0.00	0.10	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.04	0.15	0.03	0.11	0.00	0.05	0.06	0.30	0.11
O5'	0.14	0.20	0.38	0.21	0.29	0.01	0.31	0.00	0.29	0.22	0.24	0.31	0.15	0.29	0.06	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.24	0.21	0.55	0.43	0.20	0.15	0.20	0.03	0.21	0.22	0.21	0.20	0.22	0.58	0.31	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.09	0.35	0.17	0.11	0.13	0.13	0.13	0.11	0.08	0.10	0.13	0.10	0.41	0.11	0.30	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.12	0.43	0.29	0.17	0.04	0.20	0.01	0.19	0.14	0.14	0.19	0.09	0.42	0.16	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.11	0.08	0.08	0.11	0.06	0.09	0.09	0.07	0.07	0.13	0.13	0.10	0.10	0.16	0.06	0.12	0.21	0.22	0.18
C2	0.06	0.11	0.11	0.14	0.09	0.12	0.11	0.17	0.10	0.06	0.15	0.16	0.13	0.15	0.14	0.07	0.20	0.27	0.29	0.25
C2'	0.08	0.13	0.07	0.08	0.19	0.06	0.13	0.06	0.10	0.10	0.17	0.14	0.08	0.12	0.27	0.07	0.07	0.13	0.11	0.08
C3'	0.11	0.12	0.09	0.09	0.17	0.12	0.17	0.16	0.15	0.12	0.14	0.11	0.10	0.08	0.21	0.12	0.17	0.24	0.25	0.23
C4	0.13	0.19	0.13	0.17	0.12	0.18	0.17	0.25	0.19	0.13	0.18	0.25	0.15	0.16	0.13	0.15	0.29	0.37	0.38	0.35
C4'	0.06	0.09	0.07	0.08	0.11	0.10	0.14	0.18	0.12	0.07	0.10	0.11	0.09	0.08	0.15	0.09	0.20	0.33	0.35	0.30
C5	0.14	0.19	0.14	0.12	0.13	0.15	0.18	0.23	0.18	0.14	0.18	0.24	0.16	0.11	0.14	0.14	0.28	0.39	0.42	0.37
C5'	0.06	0.11	0.09	0.06	0.10	0.07	0.13	0.16	0.10	0.06	0.11	0.16	0.12	0.10	0.15	0.06	0.19	0.35	0.37	0.32
C6	0.09	0.15	0.10	0.09	0.11	0.09	0.13	0.16	0.11	0.10	0.15	0.19	0.13	0.10	0.15	0.08	0.20	0.32	0.35	0.29
N1	0.05	0.12	0.08	0.09	0.09	0.08	0.09	0.13	0.07	0.05	0.14	0.16	0.10	0.10	0.15	0.04	0.17	0.26	0.29	0.23
N3	0.08	0.14	0.13	0.18	0.09	0.16	0.14	0.21	0.15	0.08	0.16	0.20	0.15	0.19	0.12	0.11	0.25	0.32	0.33	0.29
N4	0.21	0.23	0.20	0.26	0.14	0.26	0.21	0.32	0.25	0.20	0.21	0.30	0.21	0.23	0.14	0.23	0.35	0.42	0.41	0.39
O2	0.11	0.13	0.14	0.17	0.14	0.14	0.13	0.17	0.13	0.11	0.17	0.15	0.16	0.18	0.18	0.12	0.20	0.25	0.27	0.23
O2'	0.19	0.10	0.17	0.27	0.12	0.30	0.24	0.35	0.25	0.17	0.12	0.10	0.15	0.29	0.18	0.28	0.37	0.44	0.44	0.42
O3'	0.12	0.13	0.12	0.12	0.14	0.10	0.13	0.09	0.13	0.13	0.14	0.14	0.13	0.14	0.15	0.12	0.09	0.16	0.16	0.13
O4'	0.05	0.13	0.07	0.10	0.11	0.12	0.11	0.21	0.10	0.06	0.16	0.18	0.10	0.11	0.17	0.07	0.25	0.40	0.42	0.36
O5'	0.32	0.33	0.34	0.33	0.25	0.30	0.24	0.24	0.27	0.31	0.30	0.36	0.34	0.37	0.23	0.31	0.22	0.16	0.10	0.13
OP1	0.30	0.34	0.29	0.28	0.31	0.26	0.29	0.21	0.29	0.31	0.34	0.36	0.29	0.29	0.32	0.30	0.21	0.15	0.12	0.13
OP2	0.20	0.20	0.20	0.22	0.16	0.21	0.17	0.19	0.18	0.19	0.18	0.22	0.20	0.24	0.16	0.22	0.18	0.17	0.12	0.14
P	0.27	0.28	0.27	0.27	0.23	0.25	0.22	0.21	0.24	0.26	0.27	0.31	0.26	0.29	0.22	0.27	0.20	0.15	0.10	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.02
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.08	0.07	0.11	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.04	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.07	0.04
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.03	0.06	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.02	0.13	0.14	0.18	0.14
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.02	0.06	0.02	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.09	0.01	0.02	0.13	0.14	0.17	0.14
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.08	0.05	0.07	0.03	0.06	0.03	0.10	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.02	0.11	0.10	0.12	0.09
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.07	0.06	0.09	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.10	0.11	0.15	0.11
O2	0.02	0.00	0.07	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.06	0.01	0.03	0.06	0.05	0.10	0.06
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.04	0.06	0.04	0.06	0.03	0.02	0.06	0.09	0.00	0.03	0.05	0.05	0.03	0.04	0.04	0.03
O3'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.08	0.04	0.05	0.06	0.03	0.00	0.07	0.02	0.04	0.07	0.06	0.05
O4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.13	0.17	0.21	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.03	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04
O5'	0.03	0.08	0.04	0.03	0.13	0.01	0.13	0.01	0.11	0.07	0.10	0.06	0.03	0.04	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.07	0.05	0.06	0.14	0.03	0.14	0.03	0.10	0.06	0.11	0.05	0.04	0.07	0.17	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.11	0.07	0.06	0.18	0.03	0.17	0.01	0.12	0.09	0.15	0.10	0.04	0.06	0.21	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.08	0.04	0.04	0.14	0.01	0.14	0.01	0.09	0.06	0.11	0.06	0.03	0.05	0.16	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00