Doublet Group distance statistics: 52066

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.010, 0.020, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.013, 0.027, 0.040, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.011, 0.028, 0.044, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.028 std_dev=0.016
O2	A	0, -0.002, 0.034, 0.070, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.034 std_dev=0.036
N4	A	0, 0.014, 0.056, 0.099, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.056 std_dev=0.042
C2'	A	0, -0.010, 0.163, 0.336, 0.514 max_d=0.514 avg_d=0.163 std_dev=0.173
O4'	A	0, 0.001, 0.192, 0.383, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.192 std_dev=0.191
O2'	A	0, -0.050, 0.218, 0.487, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.218 std_dev=0.268
N3	B	0, 0.123, 0.416, 0.709, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.416 std_dev=0.293
C4'	A	0, 0.020, 0.314, 0.607, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.314 std_dev=0.293
C4	B	0, 0.103, 0.401, 0.700, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.401 std_dev=0.299
C2	B	0, 0.101, 0.415, 0.730, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.415 std_dev=0.314
C3'	A	0, -0.007, 0.312, 0.631, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.312 std_dev=0.319
O2	B	0, 0.143, 0.480, 0.816, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.480 std_dev=0.336
N1	B	0, 0.074, 0.433, 0.792, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.433 std_dev=0.359
O4	B	0, 0.119, 0.484, 0.849, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.484 std_dev=0.365
C5	B	0, 0.066, 0.438, 0.811, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.438 std_dev=0.373
C6	B	0, 0.071, 0.474, 0.876, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.474 std_dev=0.402
C1'	B	0, 0.125, 0.538, 0.952, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.538 std_dev=0.414
C2'	B	0, 0.097, 0.522, 0.946, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.522 std_dev=0.425
O2'	B	0, 0.169, 0.628, 1.088, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.628 std_dev=0.459
C5'	A	0, 0.038, 0.516, 0.994, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.516 std_dev=0.478
O3'	A	0, -0.016, 0.479, 0.973, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.479 std_dev=0.494
O4'	B	0, 0.167, 0.667, 1.167, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.667 std_dev=0.500
C3'	B	0, 0.116, 0.628, 1.140, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.628 std_dev=0.512
O5'	A	0, 0.050, 0.580, 1.109, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.580 std_dev=0.529
OP2	A	0, 0.109, 0.639, 1.169, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.639 std_dev=0.530
C4'	B	0, 0.188, 0.747, 1.306, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.747 std_dev=0.559
O3'	B	0, 0.116, 0.684, 1.252, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.684 std_dev=0.568
P	A	0, 0.076, 0.663, 1.249, 1.742 max_d=1.742 avg_d=0.663 std_dev=0.587
C5'	B	0, 0.223, 0.886, 1.549, 1.886 max_d=1.886 avg_d=0.886 std_dev=0.663
O5'	B	0, 0.204, 0.877, 1.550, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.877 std_dev=0.673
OP1	A	0, 0.026, 0.769, 1.511, 2.300 max_d=2.300 avg_d=0.769 std_dev=0.742
P	B	0, 0.197, 1.048, 1.898, 2.135 max_d=2.135 avg_d=1.048 std_dev=0.851
OP1	B	0, 0.195, 1.096, 1.998, 2.343 max_d=2.343 avg_d=1.096 std_dev=0.901
OP2	B	0, 0.166, 1.075, 1.984, 2.551 max_d=2.551 avg_d=1.075 std_dev=0.909

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.07	0.11	0.13	0.06
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.07	0.05	0.14	0.16	0.14	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.06	0.04	0.13	0.01	0.02	0.01	0.06	0.17	0.18	0.10
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.14	0.01	0.16	0.02	0.15	0.08	0.11	0.16	0.12	0.02	0.01	0.01	0.08	0.19	0.18	0.13
C4	0.01	0.01	0.04	0.14	0.00	0.12	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.05	0.26	0.27	0.26	0.26
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.12	0.00	0.16	0.01	0.15	0.07	0.07	0.14	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.10	0.07	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.16	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.17	0.07	0.29	0.28	0.23	0.26
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.24	0.01	0.27	0.00	0.23	0.12	0.17	0.27	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.08	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.15	0.00	0.23	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.15	0.08	0.24	0.22	0.17	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.07	0.02	0.14	0.15	0.12	0.11
N3	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.09	0.05	0.20	0.22	0.21	0.21
N4	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.14	0.02	0.27	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.16	0.05	0.30	0.33	0.34	0.32
O2	0.02	0.00	0.13	0.12	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.17	0.13	0.06	0.09	0.11	0.11	0.09
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.07	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.12	0.07	0.17	0.00	0.05	0.04	0.06	0.17	0.16	0.09
O3'	0.03	0.07	0.02	0.01	0.14	0.03	0.17	0.03	0.15	0.07	0.09	0.16	0.13	0.05	0.00	0.03	0.14	0.25	0.21	0.18
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.02	0.08	0.02	0.05	0.05	0.06	0.04	0.03	0.00	0.10	0.11	0.16	0.11
O5'	0.07	0.14	0.06	0.08	0.26	0.01	0.29	0.01	0.24	0.14	0.20	0.30	0.09	0.06	0.14	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.11	0.16	0.17	0.19	0.27	0.10	0.28	0.08	0.22	0.15	0.22	0.33	0.11	0.17	0.25	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.14	0.18	0.18	0.26	0.07	0.23	0.03	0.17	0.12	0.21	0.34	0.11	0.16	0.21	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.10	0.13	0.26	0.02	0.26	0.02	0.18	0.11	0.21	0.32	0.09	0.09	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.20	0.25	0.18	0.12	0.18	0.25	0.18	0.27	0.20	0.18	0.27	0.38	0.18	0.28	0.20	0.24	0.25	0.44	0.33
C2	0.19	0.14	0.17	0.09	0.13	0.13	0.24	0.10	0.24	0.16	0.13	0.24	0.32	0.11	0.33	0.15	0.15	0.15	0.32	0.21
C2'	0.22	0.18	0.21	0.15	0.13	0.18	0.29	0.23	0.29	0.20	0.16	0.22	0.32	0.14	0.12	0.20	0.31	0.36	0.52	0.42
C3'	0.24	0.21	0.23	0.11	0.20	0.14	0.32	0.17	0.33	0.24	0.21	0.22	0.32	0.09	0.13	0.19	0.24	0.31	0.47	0.36
C4	0.18	0.14	0.14	0.08	0.20	0.14	0.23	0.11	0.22	0.11	0.20	0.29	0.31	0.11	0.35	0.15	0.11	0.12	0.24	0.14
C4'	0.25	0.20	0.26	0.10	0.14	0.12	0.29	0.06	0.33	0.24	0.18	0.22	0.36	0.08	0.11	0.18	0.12	0.16	0.35	0.22
C5	0.23	0.25	0.21	0.13	0.24	0.18	0.26	0.15	0.26	0.18	0.27	0.36	0.39	0.14	0.38	0.20	0.19	0.18	0.32	0.23
C5'	0.30	0.22	0.30	0.15	0.19	0.16	0.34	0.10	0.40	0.30	0.19	0.21	0.36	0.13	0.11	0.24	0.07	0.09	0.25	0.13
C6	0.26	0.25	0.26	0.19	0.23	0.21	0.26	0.20	0.28	0.21	0.26	0.33	0.40	0.19	0.39	0.23	0.25	0.24	0.41	0.31
N1	0.22	0.18	0.23	0.15	0.14	0.16	0.25	0.15	0.26	0.18	0.18	0.27	0.37	0.16	0.34	0.18	0.20	0.21	0.38	0.27
N3	0.18	0.09	0.14	0.07	0.16	0.13	0.23	0.09	0.22	0.13	0.13	0.23	0.29	0.10	0.33	0.15	0.11	0.11	0.26	0.15
N4	0.20	0.13	0.17	0.16	0.21	0.21	0.23	0.19	0.23	0.14	0.21	0.28	0.28	0.16	0.31	0.20	0.15	0.17	0.20	0.15
O2	0.19	0.15	0.17	0.10	0.15	0.14	0.25	0.11	0.24	0.18	0.13	0.22	0.31	0.12	0.28	0.16	0.16	0.17	0.34	0.24
O2'	0.23	0.20	0.22	0.15	0.18	0.19	0.31	0.24	0.29	0.22	0.19	0.25	0.34	0.14	0.20	0.22	0.32	0.38	0.54	0.45
O3'	0.27	0.25	0.26	0.15	0.25	0.19	0.36	0.22	0.36	0.29	0.25	0.25	0.32	0.14	0.20	0.23	0.28	0.38	0.48	0.40
O4'	0.29	0.24	0.31	0.22	0.10	0.22	0.22	0.18	0.29	0.24	0.21	0.30	0.43	0.21	0.22	0.24	0.20	0.20	0.38	0.26
O5'	0.31	0.24	0.31	0.15	0.22	0.17	0.36	0.11	0.43	0.32	0.21	0.21	0.36	0.11	0.14	0.26	0.08	0.08	0.23	0.11
OP1	0.36	0.30	0.33	0.23	0.27	0.25	0.39	0.23	0.46	0.38	0.26	0.27	0.33	0.17	0.17	0.34	0.22	0.19	0.17	0.17
OP2	0.35	0.27	0.34	0.21	0.21	0.22	0.29	0.14	0.40	0.35	0.22	0.26	0.33	0.15	0.16	0.30	0.09	0.05	0.22	0.08
P	0.33	0.26	0.32	0.19	0.23	0.21	0.35	0.15	0.44	0.34	0.23	0.23	0.33	0.14	0.16	0.29	0.12	0.09	0.17	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.04	0.07	0.06
C2	0.04	0.00	0.11	0.08	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.02	0.08	0.11	0.10	0.16	0.13
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.10	0.16	0.00	0.03	0.11	0.01	0.03	0.07	0.06	0.03
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.12	0.00	0.11	0.01	0.08	0.06	0.10	0.08	0.02	0.00	0.18	0.01	0.06	0.08	0.09	0.06
C4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.06	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.03	0.20	0.21	0.29	0.25
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.10	0.03	0.03	0.11	0.05	0.02	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02
C5	0.03	0.02	0.04	0.11	0.01	0.11	0.00	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.09	0.02	0.09	0.26	0.27	0.34	0.31
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.16	0.05	0.04	0.13	0.05	0.02	0.12	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.03	0.02	0.06	0.08	0.02	0.10	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.07	0.04	0.11	0.23	0.22	0.27	0.26
N1	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02	0.12	0.11	0.17	0.14
N3	0.03	0.01	0.10	0.10	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.01	0.05	0.13	0.13	0.20	0.16
O2	0.07	0.01	0.16	0.08	0.01	0.11	0.02	0.13	0.03	0.03	0.01	0.00	0.18	0.10	0.02	0.14	0.13	0.12	0.15	0.15
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.03	0.05	0.07	0.05	0.09	0.01	0.07	0.18	0.00	0.03	0.08	0.03	0.02	0.07	0.05	0.03
O3'	0.03	0.08	0.03	0.00	0.11	0.02	0.09	0.02	0.07	0.04	0.10	0.10	0.03	0.00	0.18	0.02	0.08	0.14	0.12	0.09
O4	0.04	0.02	0.11	0.18	0.01	0.09	0.02	0.12	0.04	0.04	0.01	0.02	0.08	0.18	0.00	0.04	0.23	0.25	0.34	0.29
O4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.11	0.02	0.05	0.14	0.03	0.02	0.04	0.00	0.07	0.07	0.08	0.08
O5'	0.05	0.11	0.03	0.06	0.20	0.01	0.26	0.01	0.23	0.12	0.13	0.13	0.02	0.08	0.23	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.04	0.10	0.07	0.08	0.21	0.02	0.27	0.05	0.22	0.11	0.13	0.12	0.07	0.14	0.25	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.16	0.06	0.09	0.29	0.03	0.34	0.02	0.27	0.17	0.20	0.15	0.05	0.12	0.34	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.03	0.06	0.25	0.02	0.31	0.02	0.26	0.14	0.16	0.15	0.03	0.09	0.29	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00