Doublet Group distance statistics: 52067

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 0, 2, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.009, 0.018, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.036, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.017 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.030, 0.061, 0.092, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.061 std_dev=0.031
N4	A	0, 0.004, 0.036, 0.069, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.036 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.030, 0.113, 0.197, 0.259 max_d=0.259 avg_d=0.113 std_dev=0.083
O4'	A	0, 0.004, 0.107, 0.209, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.107 std_dev=0.103
O2'	A	0, 0.041, 0.163, 0.285, 0.432 max_d=0.432 avg_d=0.163 std_dev=0.122
C3'	A	0, 0.031, 0.197, 0.362, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.197 std_dev=0.166
C4'	A	0, 0.027, 0.209, 0.391, 0.581 max_d=0.581 avg_d=0.209 std_dev=0.182
O3'	A	0, 0.068, 0.298, 0.529, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.298 std_dev=0.231
C2	B	0, 0.207, 0.460, 0.713, 0.920 max_d=0.920 avg_d=0.460 std_dev=0.253
P	B	0, 0.198, 0.474, 0.749, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.474 std_dev=0.275
O2	B	0, 0.245, 0.526, 0.807, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.526 std_dev=0.281
C5'	A	0, 0.061, 0.363, 0.666, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.363 std_dev=0.303
N1	B	0, 0.210, 0.516, 0.821, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.516 std_dev=0.306
OP1	B	0, 0.267, 0.575, 0.883, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.575 std_dev=0.308
O5'	A	0, 0.170, 0.488, 0.806, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.488 std_dev=0.318
C6	B	0, 0.353, 0.675, 0.996, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.675 std_dev=0.322
N3	B	0, 0.207, 0.536, 0.866, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.536 std_dev=0.330
C5	B	0, 0.379, 0.728, 1.078, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.728 std_dev=0.350
O5'	B	0, 0.155, 0.533, 0.910, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.533 std_dev=0.378
C4	B	0, 0.310, 0.695, 1.080, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.695 std_dev=0.385
OP2	B	0, 0.295, 0.697, 1.099, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.697 std_dev=0.402
P	A	0, 0.280, 0.684, 1.087, 1.577 max_d=1.577 avg_d=0.684 std_dev=0.404
C1'	B	0, 0.249, 0.671, 1.094, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.671 std_dev=0.422
OP2	A	0, 0.313, 0.757, 1.201, 1.666 max_d=1.666 avg_d=0.757 std_dev=0.444
C2'	B	0, 0.255, 0.710, 1.166, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.710 std_dev=0.455
O4'	B	0, 0.290, 0.756, 1.221, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.756 std_dev=0.466
O2'	B	0, 0.371, 0.864, 1.357, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.864 std_dev=0.493
O4	B	0, 0.408, 0.926, 1.445, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.926 std_dev=0.519
OP1	A	0, 0.248, 0.794, 1.340, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.794 std_dev=0.546
C5'	B	0, 0.190, 0.747, 1.304, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.747 std_dev=0.557
C4'	B	0, 0.275, 0.842, 1.410, 1.881 max_d=1.881 avg_d=0.842 std_dev=0.568
C3'	B	0, 0.301, 0.883, 1.466, 1.916 max_d=1.916 avg_d=0.883 std_dev=0.582
O3'	B	0, 0.408, 1.120, 1.832, 2.389 max_d=2.389 avg_d=1.120 std_dev=0.712

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.09	0.10	0.09
C2	0.03	0.00	0.06	0.09	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.09	0.04	0.14	0.15	0.20	0.17
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.05	0.09	0.01	0.02	0.01	0.05	0.08	0.08	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.10	0.01	0.08	0.07	0.11	0.12	0.09	0.02	0.00	0.01	0.07	0.11	0.10	0.07
C4	0.01	0.02	0.04	0.11	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.13	0.02	0.20	0.24	0.31	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.06	0.07	0.05	0.07	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02	0.03
C5	0.01	0.02	0.03	0.10	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.12	0.03	0.22	0.26	0.31	0.27
C5'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.14	0.01	0.16	0.00	0.14	0.08	0.11	0.14	0.07	0.07	0.03	0.02	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.09	0.04	0.19	0.20	0.22	0.21
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.13	0.14	0.17	0.16
N3	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.11	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.12	0.04	0.18	0.20	0.27	0.22
N4	0.01	0.03	0.05	0.12	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.15	0.01	0.22	0.27	0.35	0.28
O2	0.04	0.01	0.09	0.09	0.04	0.05	0.03	0.07	0.02	0.02	0.03	0.05	0.00	0.05	0.09	0.07	0.11	0.12	0.17	0.14
O2'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.07	0.04	0.07	0.03	0.02	0.04	0.05	0.05	0.00	0.04	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06
O3'	0.02	0.09	0.02	0.00	0.13	0.01	0.12	0.03	0.09	0.06	0.12	0.15	0.09	0.04	0.00	0.01	0.10	0.17	0.13	0.12
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.06	0.01	0.00	0.09	0.14	0.12	0.13
O5'	0.07	0.14	0.05	0.07	0.20	0.01	0.22	0.01	0.19	0.13	0.18	0.22	0.11	0.05	0.10	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.09	0.15	0.08	0.11	0.24	0.08	0.26	0.09	0.20	0.14	0.20	0.27	0.12	0.05	0.17	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.20	0.08	0.10	0.31	0.02	0.31	0.02	0.22	0.17	0.27	0.35	0.17	0.06	0.13	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.17	0.05	0.07	0.25	0.03	0.27	0.02	0.21	0.16	0.22	0.28	0.14	0.06	0.12	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.24	0.21	0.21	0.28	0.18	0.20	0.11	0.15	0.17	0.30	0.25	0.23	0.21	0.35	0.21	0.11	0.20	0.06	0.06
C2	0.14	0.22	0.15	0.15	0.23	0.11	0.11	0.10	0.13	0.12	0.28	0.25	0.17	0.16	0.32	0.14	0.20	0.25	0.14	0.14
C2'	0.21	0.24	0.25	0.26	0.29	0.22	0.23	0.15	0.17	0.19	0.29	0.24	0.26	0.25	0.35	0.23	0.12	0.23	0.11	0.12
C3'	0.11	0.12	0.18	0.19	0.20	0.14	0.18	0.09	0.12	0.08	0.17	0.12	0.24	0.20	0.25	0.16	0.08	0.09	0.02	0.01
C4	0.19	0.22	0.23	0.24	0.13	0.19	0.21	0.19	0.21	0.16	0.23	0.29	0.25	0.24	0.19	0.18	0.28	0.27	0.18	0.19
C4'	0.12	0.12	0.14	0.17	0.20	0.17	0.17	0.20	0.15	0.09	0.18	0.12	0.22	0.18	0.26	0.20	0.15	0.07	0.09	0.04
C5	0.21	0.22	0.25	0.27	0.18	0.23	0.21	0.22	0.23	0.18	0.24	0.28	0.24	0.26	0.22	0.22	0.27	0.23	0.17	0.16
C5'	0.17	0.09	0.15	0.22	0.17	0.29	0.19	0.37	0.20	0.13	0.14	0.09	0.20	0.21	0.22	0.27	0.27	0.07	0.22	0.13
C6	0.20	0.24	0.22	0.24	0.22	0.21	0.18	0.19	0.20	0.18	0.27	0.27	0.21	0.22	0.26	0.22	0.22	0.19	0.13	0.11
N1	0.17	0.23	0.18	0.19	0.25	0.16	0.16	0.12	0.15	0.15	0.29	0.25	0.19	0.18	0.32	0.18	0.17	0.20	0.09	0.09
N3	0.16	0.22	0.18	0.18	0.17	0.14	0.14	0.14	0.16	0.14	0.27	0.28	0.21	0.19	0.25	0.14	0.25	0.28	0.17	0.18
N4	0.23	0.22	0.27	0.28	0.15	0.22	0.27	0.22	0.25	0.19	0.19	0.32	0.32	0.30	0.18	0.21	0.32	0.31	0.22	0.22
O2	0.12	0.21	0.13	0.13	0.24	0.09	0.10	0.08	0.10	0.11	0.28	0.24	0.16	0.13	0.35	0.13	0.18	0.27	0.17	0.15
O2'	0.24	0.29	0.25	0.26	0.38	0.24	0.33	0.20	0.24	0.24	0.36	0.28	0.26	0.26	0.45	0.26	0.15	0.35	0.21	0.20
O3'	0.05	0.07	0.18	0.18	0.19	0.06	0.20	0.04	0.13	0.06	0.13	0.06	0.26	0.20	0.24	0.11	0.02	0.01	0.01	0.01
O4'	0.19	0.19	0.21	0.23	0.23	0.21	0.17	0.19	0.17	0.15	0.24	0.20	0.25	0.23	0.30	0.23	0.15	0.13	0.05	0.01
O5'	0.14	0.10	0.14	0.21	0.16	0.24	0.17	0.30	0.18	0.11	0.14	0.11	0.21	0.21	0.20	0.22	0.19	0.10	0.19	0.08
OP1	0.21	0.18	0.19	0.27	0.16	0.32	0.17	0.40	0.18	0.17	0.18	0.22	0.25	0.30	0.18	0.28	0.23	0.14	0.34	0.18
OP2	0.20	0.18	0.22	0.35	0.18	0.34	0.18	0.35	0.19	0.16	0.19	0.21	0.17	0.37	0.19	0.26	0.21	0.19	0.23	0.13
P	0.16	0.14	0.16	0.28	0.16	0.30	0.17	0.35	0.18	0.13	0.16	0.16	0.18	0.30	0.18	0.24	0.20	0.11	0.25	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.03	0.00	0.15	0.25	0.12	0.08
C2	0.04	0.00	0.05	0.05	0.02	0.05	0.03	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.02	0.07	0.20	0.30	0.16	0.14
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.01	0.05	0.08	0.05	0.02	0.05	0.08	0.01	0.03	0.07	0.02	0.14	0.21	0.19	0.13
C3'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.02	0.07	0.01	0.03	0.11	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.19	0.20	0.12
C4	0.02	0.02	0.05	0.04	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.09	0.01	0.03	0.24	0.34	0.21	0.20
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.04	0.12	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.19	0.11	0.03
C5	0.02	0.03	0.05	0.07	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.05	0.01	0.06	0.26	0.34	0.22	0.21
C5'	0.05	0.09	0.08	0.02	0.14	0.01	0.17	0.00	0.15	0.09	0.10	0.12	0.08	0.02	0.15	0.02	0.01	0.12	0.11	0.01
C6	0.02	0.02	0.05	0.07	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.05	0.02	0.07	0.25	0.32	0.18	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.08	0.02	0.01	0.21	0.29	0.15	0.14
N3	0.03	0.01	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.13	0.02	0.05	0.21	0.32	0.17	0.16
O2	0.08	0.01	0.08	0.11	0.02	0.12	0.03	0.12	0.03	0.02	0.01	0.00	0.15	0.21	0.02	0.13	0.19	0.30	0.17	0.14
O2'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.08	0.02	0.07	0.08	0.07	0.04	0.10	0.15	0.00	0.06	0.10	0.02	0.15	0.21	0.24	0.17
O3'	0.07	0.14	0.03	0.01	0.09	0.01	0.05	0.02	0.05	0.08	0.13	0.21	0.06	0.00	0.09	0.05	0.09	0.19	0.20	0.11
O4	0.03	0.02	0.07	0.06	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.02	0.02	0.02	0.10	0.09	0.00	0.04	0.24	0.35	0.24	0.23
O4'	0.00	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.06	0.02	0.07	0.01	0.05	0.13	0.02	0.05	0.04	0.00	0.13	0.30	0.13	0.14
O5'	0.15	0.20	0.14	0.08	0.24	0.01	0.26	0.01	0.25	0.21	0.21	0.19	0.15	0.09	0.24	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.25	0.30	0.21	0.19	0.34	0.19	0.34	0.12	0.32	0.29	0.32	0.30	0.21	0.19	0.35	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.16	0.19	0.20	0.21	0.11	0.22	0.11	0.18	0.15	0.17	0.17	0.24	0.20	0.24	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.13	0.12	0.20	0.03	0.21	0.01	0.17	0.14	0.16	0.14	0.17	0.11	0.23	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00