Doublet Group distance statistics: 52068

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 0, 2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.017 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.009, 0.020, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.006, 0.023, 0.039, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.021, 0.043, 0.064, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.043 std_dev=0.021
O2	A	0, 0.014, 0.061, 0.109, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.061 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.034, 0.119, 0.204, 0.274 max_d=0.274 avg_d=0.119 std_dev=0.085
C2'	A	0, 0.031, 0.137, 0.243, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.137 std_dev=0.106
C5'	A	0, 0.101, 0.225, 0.350, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.225 std_dev=0.125
C5	B	0, 0.081, 0.228, 0.376, 0.369 max_d=0.369 avg_d=0.228 std_dev=0.148
C4'	A	0, 0.013, 0.173, 0.333, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.173 std_dev=0.160
C6	B	0, 0.078, 0.264, 0.450, 0.486 max_d=0.486 avg_d=0.264 std_dev=0.186
O2'	B	0, 0.125, 0.339, 0.553, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.339 std_dev=0.214
C4	B	0, 0.059, 0.285, 0.511, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.285 std_dev=0.226
O4	B	0, 0.059, 0.306, 0.553, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.306 std_dev=0.247
N1	B	0, 0.046, 0.304, 0.562, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.304 std_dev=0.258
C2'	B	0, 0.134, 0.408, 0.683, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.408 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.081, 0.376, 0.670, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.376 std_dev=0.295
N3	B	0, 0.042, 0.364, 0.685, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.364 std_dev=0.322
O5'	A	0, 0.073, 0.396, 0.719, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.396 std_dev=0.323
OP1	A	0, 0.123, 0.447, 0.770, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.447 std_dev=0.323
C2	B	0, 0.013, 0.362, 0.712, 0.975 max_d=0.975 avg_d=0.362 std_dev=0.349
C3'	A	0, -0.075, 0.348, 0.772, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.348 std_dev=0.424
O4'	B	0, 0.038, 0.470, 0.902, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.470 std_dev=0.432
P	A	0, 0.034, 0.521, 1.007, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.521 std_dev=0.487
O2	B	0, -0.015, 0.476, 0.967, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.476 std_dev=0.491
O2'	A	0, -0.044, 0.457, 0.957, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.457 std_dev=0.501
C4'	B	0, 0.017, 0.566, 1.116, 1.566 max_d=1.566 avg_d=0.566 std_dev=0.550
O5'	B	0, 0.021, 0.584, 1.148, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.584 std_dev=0.563
C5'	B	0, 0.013, 0.581, 1.149, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.581 std_dev=0.568
OP2	B	0, -0.051, 0.537, 1.126, 1.863 max_d=1.863 avg_d=0.537 std_dev=0.589
C3'	B	0, 0.018, 0.643, 1.267, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.643 std_dev=0.625
OP2	A	0, -0.023, 0.720, 1.462, 2.033 max_d=2.033 avg_d=0.720 std_dev=0.743
P	B	0, -0.124, 0.732, 1.589, 2.218 max_d=2.218 avg_d=0.732 std_dev=0.856
O3'	B	0, -0.077, 0.856, 1.788, 2.592 max_d=2.592 avg_d=0.856 std_dev=0.932
O3'	A	0, -0.260, 0.715, 1.691, 2.437 max_d=2.437 avg_d=0.715 std_dev=0.976
OP1	B	0, -0.322, 1.001, 2.323, 3.450 max_d=3.450 avg_d=1.001 std_dev=1.322

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.31	0.00	0.15	0.19	0.15	0.19
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.02	0.02	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.34	0.03	0.14	0.25	0.10	0.21
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.02	0.05	0.19	0.07	0.02	0.05	0.04	0.07	0.01	0.04	0.02	0.39	0.34	0.48	0.43
C3'	0.03	0.05	0.01	0.00	0.18	0.00	0.24	0.01	0.22	0.10	0.10	0.20	0.10	0.02	0.00	0.02	0.03	0.07	0.03	0.03
C4	0.02	0.02	0.04	0.18	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.29	0.12	0.04	0.12	0.27	0.07	0.22
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.03	0.03	0.07	0.07	0.21	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.01
C5	0.02	0.02	0.05	0.24	0.01	0.09	0.00	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.31	0.08	0.07	0.12	0.28	0.06	0.23
C5'	0.07	0.08	0.19	0.01	0.07	0.01	0.07	0.00	0.08	0.08	0.08	0.08	0.11	0.04	0.20	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.22	0.01	0.09	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.27	0.06	0.07	0.12	0.27	0.07	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.10	0.02	0.03	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.19	0.01	0.14	0.25	0.11	0.22
N3	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.23	0.27	0.02	0.13	0.26	0.07	0.21
N4	0.03	0.02	0.04	0.20	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.04	0.31	0.11	0.04	0.13	0.28	0.09	0.22
O2	0.05	0.01	0.07	0.10	0.03	0.07	0.02	0.11	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.06	0.53	0.09	0.17	0.24	0.14	0.21
O2'	0.01	0.16	0.01	0.02	0.29	0.21	0.31	0.04	0.27	0.17	0.23	0.31	0.06	0.00	0.06	0.11	0.33	0.22	0.59	0.39
O3'	0.31	0.34	0.04	0.00	0.12	0.02	0.08	0.20	0.06	0.19	0.27	0.11	0.53	0.06	0.00	0.20	0.21	0.41	0.24	0.27
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.09	0.11	0.20	0.00	0.05	0.10	0.10	0.03
O5'	0.15	0.14	0.39	0.03	0.12	0.02	0.12	0.01	0.12	0.14	0.13	0.13	0.17	0.33	0.21	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.19	0.25	0.34	0.07	0.27	0.06	0.28	0.07	0.27	0.25	0.26	0.28	0.24	0.22	0.41	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.10	0.48	0.03	0.07	0.03	0.06	0.02	0.07	0.11	0.07	0.09	0.14	0.59	0.24	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.21	0.43	0.03	0.22	0.01	0.23	0.01	0.23	0.22	0.21	0.22	0.21	0.39	0.27	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.10	0.09	0.20	0.07	0.19	0.06	0.23	0.11	0.10	0.09	0.16	0.09	0.10	0.17	0.17	0.33	0.53	0.31	0.49
C2	0.07	0.09	0.02	0.08	0.15	0.09	0.09	0.14	0.11	0.05	0.20	0.14	0.03	0.17	0.24	0.07	0.18	0.28	0.20	0.30
C2'	0.27	0.27	0.23	0.40	0.08	0.38	0.10	0.41	0.18	0.24	0.18	0.38	0.13	0.22	0.13	0.35	0.54	0.76	0.52	0.73
C3'	0.29	0.30	0.26	0.37	0.29	0.31	0.31	0.31	0.33	0.31	0.29	0.33	0.18	0.22	0.27	0.30	0.42	0.67	0.45	0.61
C4	0.05	0.17	0.06	0.08	0.16	0.10	0.08	0.15	0.07	0.07	0.22	0.20	0.08	0.38	0.21	0.10	0.06	0.05	0.17	0.17
C4'	0.19	0.19	0.16	0.28	0.13	0.24	0.15	0.28	0.19	0.19	0.16	0.25	0.10	0.11	0.10	0.21	0.42	0.69	0.44	0.62
C5	0.04	0.11	0.05	0.04	0.10	0.07	0.05	0.13	0.06	0.04	0.14	0.13	0.09	0.32	0.17	0.07	0.12	0.11	0.22	0.25
C5'	0.10	0.13	0.11	0.19	0.11	0.17	0.07	0.24	0.08	0.09	0.13	0.19	0.15	0.16	0.15	0.14	0.33	0.57	0.38	0.53
C6	0.06	0.09	0.06	0.08	0.08	0.09	0.05	0.15	0.07	0.05	0.12	0.13	0.09	0.22	0.17	0.07	0.20	0.26	0.26	0.35
N1	0.09	0.07	0.06	0.13	0.08	0.12	0.07	0.17	0.11	0.08	0.11	0.12	0.06	0.14	0.19	0.11	0.25	0.37	0.27	0.40
N3	0.02	0.18	0.04	0.05	0.19	0.08	0.10	0.14	0.10	0.05	0.27	0.23	0.05	0.30	0.25	0.06	0.08	0.09	0.16	0.18
N4	0.12	0.22	0.10	0.17	0.17	0.18	0.10	0.20	0.09	0.13	0.23	0.26	0.11	0.50	0.19	0.19	0.08	0.17	0.15	0.11
O2	0.13	0.07	0.03	0.13	0.16	0.13	0.10	0.16	0.14	0.09	0.20	0.12	0.03	0.08	0.25	0.14	0.24	0.38	0.19	0.34
O2'	0.16	0.19	0.27	0.15	0.50	0.17	0.44	0.25	0.31	0.22	0.36	0.10	0.45	0.19	0.63	0.12	0.30	0.60	0.26	0.51
O3'	0.11	0.13	0.16	0.19	0.17	0.18	0.18	0.27	0.15	0.12	0.14	0.16	0.19	0.19	0.22	0.14	0.19	0.48	0.35	0.37
O4'	0.11	0.10	0.09	0.17	0.04	0.15	0.09	0.21	0.13	0.10	0.09	0.16	0.07	0.11	0.08	0.13	0.32	0.54	0.33	0.49
O5'	0.13	0.16	0.17	0.15	0.19	0.17	0.14	0.23	0.11	0.13	0.19	0.16	0.27	0.30	0.24	0.14	0.18	0.31	0.25	0.31
OP1	0.20	0.20	0.22	0.18	0.25	0.20	0.24	0.26	0.21	0.20	0.22	0.19	0.34	0.39	0.28	0.19	0.21	0.35	0.34	0.37
OP2	0.21	0.23	0.27	0.21	0.29	0.20	0.26	0.25	0.22	0.22	0.26	0.19	0.41	0.45	0.35	0.18	0.14	0.09	0.24	0.10
P	0.25	0.26	0.29	0.22	0.33	0.23	0.31	0.26	0.27	0.26	0.30	0.22	0.42	0.47	0.38	0.22	0.13	0.18	0.23	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.01	0.03	0.06	0.03	0.01	0.03	0.09	0.01	0.26	0.03	0.00	0.09	0.36	0.21	0.07
C2	0.04	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.15	0.02	0.05	0.09	0.11	0.32	0.24
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.15	0.03	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.05	0.02	0.31	0.66	0.19	0.30
C3'	0.04	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.11	0.53	0.34	0.11
C4	0.04	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.15	0.21	0.01	0.05	0.05	0.08	0.25	0.21
C4'	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.08	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.26	0.28	0.02
C5	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.02	0.02	0.02	0.13	0.28	0.01	0.04	0.07	0.21	0.19	0.11
C5'	0.06	0.08	0.15	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.07	0.07	0.09	0.11	0.12	0.09	0.08	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01
C6	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.03	0.10	0.31	0.02	0.03	0.08	0.29	0.19	0.07
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.03	0.08	0.24	0.02	0.01	0.07	0.22	0.23	0.10
N3	0.03	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.02	0.09	0.03	0.01	0.00	0.02	0.14	0.15	0.02	0.05	0.08	0.13	0.31	0.27
O2	0.09	0.00	0.11	0.08	0.01	0.08	0.02	0.11	0.03	0.03	0.02	0.00	0.16	0.13	0.03	0.12	0.15	0.21	0.40	0.34
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.15	0.03	0.13	0.12	0.10	0.08	0.14	0.16	0.00	0.03	0.16	0.03	0.36	0.84	0.28	0.43
O3'	0.26	0.15	0.05	0.01	0.21	0.03	0.28	0.09	0.31	0.24	0.15	0.13	0.03	0.00	0.19	0.19	0.08	0.49	0.42	0.11
O4	0.03	0.02	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.02	0.02	0.03	0.16	0.19	0.00	0.05	0.05	0.12	0.26	0.26
O4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.12	0.03	0.19	0.05	0.00	0.10	0.12	0.30	0.12
O5'	0.09	0.09	0.31	0.11	0.05	0.01	0.07	0.01	0.08	0.07	0.08	0.15	0.36	0.08	0.05	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.36	0.11	0.66	0.53	0.08	0.26	0.21	0.08	0.29	0.22	0.13	0.21	0.84	0.49	0.12	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.32	0.19	0.34	0.25	0.28	0.19	0.19	0.19	0.23	0.31	0.40	0.28	0.42	0.26	0.30	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.24	0.30	0.11	0.21	0.02	0.11	0.01	0.07	0.10	0.27	0.34	0.43	0.11	0.26	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00