Doublet Group distance statistics: 52073

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.023 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
N4	A	0, 0.000, 0.048, 0.096, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.048 std_dev=0.048
O4'	A	0, 0.000, 0.054, 0.108, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.054 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.000, 0.079, 0.158, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.079 std_dev=0.079
O2'	A	0, 0.000, 0.084, 0.167, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.084 std_dev=0.084
C4'	A	0, 0.000, 0.116, 0.232, 0.232 max_d=0.232 avg_d=0.116 std_dev=0.116
C3'	A	0, 0.000, 0.117, 0.234, 0.234 max_d=0.234 avg_d=0.117 std_dev=0.117
O3'	A	0, 0.000, 0.175, 0.350, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.175 std_dev=0.175
C5'	A	0, 0.000, 0.195, 0.390, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.195 std_dev=0.195
OP2	B	0, 0.000, 0.281, 0.563, 0.563 max_d=0.563 avg_d=0.281 std_dev=0.281
C2'	B	0, 0.000, 0.358, 0.716, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.358 std_dev=0.358
P	B	0, 0.000, 0.388, 0.776, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.388 std_dev=0.388
C4'	B	0, 0.000, 0.531, 1.062, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.531 std_dev=0.531
O5'	B	0, 0.000, 0.534, 1.069, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.534 std_dev=0.534
C5'	B	0, 0.000, 0.549, 1.097, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.549 std_dev=0.549
C1'	B	0, 0.000, 0.557, 1.114, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.557 std_dev=0.557
C2	B	0, 0.000, 0.567, 1.134, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.567 std_dev=0.567
C3'	B	0, 0.000, 0.581, 1.163, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.581 std_dev=0.581
O2	B	0, 0.000, 0.583, 1.166, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.583 std_dev=0.583
O4'	B	0, 0.000, 0.595, 1.190, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.595 std_dev=0.595
N3	B	0, 0.000, 0.623, 1.245, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.623 std_dev=0.623
N1	B	0, 0.000, 0.633, 1.265, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.633 std_dev=0.633
OP1	B	0, 0.000, 0.648, 1.295, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.648 std_dev=0.648
C4	B	0, 0.000, 0.691, 1.383, 1.383 max_d=1.383 avg_d=0.691 std_dev=0.691
O4	B	0, 0.000, 0.707, 1.413, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.707 std_dev=0.707
C5	B	0, 0.000, 0.840, 1.680, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.840 std_dev=0.840
C6	B	0, 0.000, 0.867, 1.734, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.867 std_dev=0.867
O3'	B	0, 0.000, 1.185, 2.369, 2.369 max_d=2.369 avg_d=1.185 std_dev=1.185
O2'	B	0, 0.000, 1.200, 2.400, 2.400 max_d=2.400 avg_d=1.200 std_dev=1.200
O5'	A	0, 0.000, 1.481, 2.962, 2.962 max_d=2.962 avg_d=1.481 std_dev=1.481
P	A	0, 0.000, 1.964, 3.928, 3.928 max_d=3.928 avg_d=1.964 std_dev=1.964
OP1	A	0, 0.000, 2.103, 4.206, 4.206 max_d=4.206 avg_d=2.103 std_dev=2.103
OP2	A	0, 0.000, 2.150, 4.299, 4.299 max_d=4.299 avg_d=2.150 std_dev=2.150

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.34	0.35	0.11	0.23
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.07	0.00	0.63	0.63	0.53	0.57
C2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.25	0.37	0.17	0.22
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.06	0.01	0.02	0.01	0.19	0.39	0.11	0.21
C4	0.02	0.02	0.06	0.06	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.88	0.91	0.89	0.90
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.23	0.04
C5	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.00	0.92	0.93	0.88	0.94
C5'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.10	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.35	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.83	0.78	0.62	0.76
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.63	0.60	0.43	0.54
N3	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.75	0.77	0.72	0.73
N4	0.03	0.02	0.07	0.08	0.01	0.06	0.03	0.10	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02	0.96	1.03	1.05	1.03
O2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.09	0.02	0.52	0.52	0.43	0.45
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.00	0.04	0.01	0.00	0.13	0.03	0.02
O3'	0.03	0.07	0.03	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.04	0.04	0.07	0.10	0.09	0.04	0.00	0.03	0.06	0.23	0.00	0.04
O4'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.24	0.25	0.14	0.08
O5'	0.34	0.63	0.25	0.19	0.88	0.00	0.92	0.00	0.83	0.63	0.75	0.96	0.52	0.00	0.06	0.24	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.35	0.63	0.37	0.39	0.91	0.19	0.93	0.28	0.78	0.60	0.77	1.03	0.52	0.13	0.23	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.53	0.17	0.11	0.89	0.23	0.88	0.35	0.62	0.43	0.72	1.05	0.43	0.03	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.57	0.22	0.21	0.90	0.04	0.94	0.02	0.76	0.54	0.73	1.03	0.45	0.02	0.04	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.36	0.05	0.18	0.12	0.20	0.01	0.44	0.16	0.54	0.35	0.00	0.20	0.43	0.06	0.10	0.19	0.17	0.04	0.02	0.06
C2	0.26	0.15	0.22	0.02	0.01	0.15	0.30	0.28	0.43	0.18	0.20	0.34	0.50	0.30	0.10	0.04	0.28	0.13	0.02	0.13
C2'	0.35	0.10	0.14	0.12	0.19	0.04	0.37	0.15	0.46	0.34	0.05	0.14	0.40	0.00	0.11	0.26	0.17	0.08	0.01	0.08
C3'	0.30	0.17	0.04	0.17	0.27	0.10	0.40	0.06	0.47	0.36	0.14	0.08	0.19	0.13	0.19	0.27	0.10	0.01	0.01	0.03
C4	0.14	0.26	0.17	0.03	0.12	0.17	0.27	0.29	0.37	0.06	0.32	0.41	0.28	0.31	0.21	0.16	0.29	0.11	0.02	0.13
C4'	0.31	0.15	0.05	0.17	0.29	0.10	0.47	0.05	0.52	0.37	0.12	0.11	0.19	0.12	0.21	0.26	0.08	0.06	0.01	0.00
C5	0.20	0.17	0.15	0.12	0.03	0.09	0.46	0.22	0.51	0.18	0.24	0.36	0.20	0.16	0.08	0.06	0.23	0.05	0.02	0.07
C5'	0.24	0.12	0.03	0.19	0.30	0.10	0.45	0.02	0.48	0.32	0.11	0.12	0.03	0.16	0.23	0.21	0.04	0.16	0.04	0.05
C6	0.29	0.06	0.16	0.15	0.16	0.03	0.51	0.18	0.58	0.30	0.12	0.31	0.26	0.08	0.04	0.05	0.19	0.02	0.04	0.05
N1	0.33	0.04	0.21	0.11	0.12	0.05	0.43	0.21	0.55	0.31	0.10	0.29	0.42	0.14	0.02	0.08	0.21	0.06	0.02	0.07
N3	0.17	0.23	0.21	0.01	0.10	0.20	0.22	0.30	0.34	0.08	0.28	0.38	0.44	0.37	0.18	0.15	0.30	0.14	0.02	0.13
N4	0.05	0.33	0.15	0.00	0.26	0.20	0.11	0.30	0.20	0.05	0.41	0.43	0.21	0.36	0.34	0.22	0.31	0.14	0.04	0.15
O2	0.27	0.13	0.25	0.03	0.01	0.17	0.25	0.31	0.37	0.17	0.17	0.31	0.63	0.35	0.09	0.03	0.29	0.18	0.05	0.15
O2'	0.33	0.11	0.13	0.06	0.18	0.04	0.33	0.14	0.42	0.31	0.07	0.09	0.47	0.02	0.11	0.27	0.15	0.12	0.04	0.09
O3'	0.24	0.22	0.04	0.16	0.27	0.15	0.34	0.03	0.39	0.32	0.21	0.06	0.12	0.23	0.22	0.29	0.01	0.01	0.02	0.02
O4'	0.35	0.10	0.13	0.16	0.27	0.05	0.51	0.11	0.58	0.38	0.05	0.17	0.31	0.02	0.18	0.22	0.12	0.03	0.03	0.02
O5'	0.36	0.58	0.56	0.20	0.58	0.24	0.42	0.18	0.33	0.41	0.70	0.67	0.54	0.22	0.66	0.28	0.22	0.37	0.14	0.04
OP1	0.67	0.87	0.96	0.50	0.87	0.48	0.72	0.41	0.63	0.71	0.98	0.94	1.04	0.44	0.96	0.51	0.51	0.07	0.59	0.31
OP2	0.68	0.92	0.91	0.49	0.99	0.49	0.78	0.39	0.68	0.75	1.09	0.94	1.03	0.56	1.11	0.54	0.44	0.20	0.24	0.11
P	0.55	0.80	0.79	0.37	0.84	0.37	0.65	0.30	0.54	0.61	0.96	0.86	0.84	0.39	0.96	0.41	0.38	0.23	0.33	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.31	0.04	0.00	0.11	0.03	0.12	0.05
C2	0.03	0.00	0.05	0.30	0.04	0.11	0.06	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.14	0.06	0.02	0.08	0.21	0.30	0.22
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.16	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.04	0.06	0.02	0.32	0.37	0.19	0.25
C3'	0.02	0.30	0.01	0.00	0.23	0.00	0.11	0.00	0.07	0.15	0.32	0.37	0.00	0.00	0.24	0.01	0.05	0.06	0.20	0.08
C4	0.03	0.04	0.04	0.23	0.00	0.05	0.01	0.04	0.04	0.01	0.02	0.05	0.35	0.01	0.01	0.05	0.06	0.28	0.38	0.26
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.10	0.14	0.22	0.02	0.04	0.00	0.00	0.02	0.12	0.06
C5	0.05	0.06	0.04	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.35	0.21	0.03	0.06	0.00	0.22	0.36	0.24
C5'	0.04	0.08	0.16	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.08	0.08	0.06	0.17	0.03	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00
C6	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.00	0.27	0.30	0.04	0.02	0.01	0.18	0.35	0.24
N1	0.01	0.01	0.01	0.15	0.01	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.20	0.14	0.02	0.01	0.01	0.14	0.29	0.20
N3	0.01	0.00	0.03	0.32	0.02	0.10	0.00	0.08	0.06	0.03	0.00	0.02	0.28	0.17	0.05	0.02	0.11	0.28	0.37	0.25
O2	0.04	0.00	0.08	0.37	0.05	0.14	0.06	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00	0.17	0.32	0.07	0.03	0.10	0.15	0.17	0.14
O2'	0.00	0.24	0.01	0.00	0.35	0.22	0.35	0.06	0.27	0.20	0.28	0.17	0.00	0.03	0.38	0.15	0.24	0.33	0.26	0.20
O3'	0.31	0.14	0.04	0.00	0.01	0.02	0.21	0.17	0.30	0.14	0.17	0.32	0.03	0.00	0.05	0.20	0.25	0.18	0.31	0.25
O4	0.04	0.06	0.06	0.24	0.01	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.07	0.38	0.05	0.00	0.06	0.06	0.31	0.37	0.25
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.15	0.20	0.06	0.00	0.03	0.08	0.18	0.14
O5'	0.11	0.08	0.32	0.05	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.24	0.25	0.06	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.03	0.21	0.37	0.06	0.28	0.02	0.22	0.04	0.18	0.14	0.28	0.15	0.33	0.18	0.31	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01
OP2	0.12	0.30	0.19	0.20	0.38	0.12	0.36	0.02	0.35	0.29	0.37	0.17	0.26	0.31	0.37	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.22	0.25	0.08	0.26	0.06	0.24	0.00	0.24	0.20	0.25	0.14	0.20	0.25	0.25	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00