Doublet Group distance statistics: 52074

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
O2'	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2'	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.000, 0.034, 0.067, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.000, 0.060, 0.120, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.060 std_dev=0.060
C3'	A	0, 0.000, 0.062, 0.124, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.062 std_dev=0.062
O2	A	0, 0.000, 0.067, 0.135, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.067 std_dev=0.067
C4'	A	0, 0.000, 0.084, 0.169, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.084 std_dev=0.084
O3'	A	0, 0.000, 0.100, 0.201, 0.201 max_d=0.201 avg_d=0.100 std_dev=0.100
C5'	A	0, 0.000, 0.122, 0.243, 0.243 max_d=0.243 avg_d=0.122 std_dev=0.122
C5	B	0, 0.000, 0.150, 0.301, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.150 std_dev=0.150
N3	B	0, 0.000, 0.151, 0.303, 0.303 max_d=0.303 avg_d=0.151 std_dev=0.151
C2	B	0, 0.000, 0.166, 0.331, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.166 std_dev=0.166
C4	B	0, 0.000, 0.175, 0.349, 0.349 max_d=0.349 avg_d=0.175 std_dev=0.175
C6	B	0, 0.000, 0.181, 0.362, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.181 std_dev=0.181
O2	B	0, 0.000, 0.205, 0.410, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.205 std_dev=0.205
N1	B	0, 0.000, 0.209, 0.418, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.209 std_dev=0.209
O5'	A	0, 0.000, 0.215, 0.429, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.215 std_dev=0.215
O4	B	0, 0.000, 0.254, 0.509, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.254 std_dev=0.254
O4'	B	0, 0.000, 0.272, 0.544, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.272 std_dev=0.272
C1'	B	0, 0.000, 0.298, 0.596, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.298 std_dev=0.298
C4'	B	0, 0.000, 0.302, 0.603, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.302 std_dev=0.302
P	B	0, 0.000, 0.320, 0.641, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.320 std_dev=0.320
C3'	B	0, 0.000, 0.324, 0.647, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.324 std_dev=0.324
C2'	B	0, 0.000, 0.327, 0.655, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.327 std_dev=0.327
P	A	0, 0.000, 0.331, 0.662, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.331 std_dev=0.331
C5'	B	0, 0.000, 0.336, 0.672, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.336 std_dev=0.336
OP2	A	0, 0.000, 0.356, 0.713, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.356 std_dev=0.356
OP1	A	0, 0.000, 0.375, 0.749, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.375 std_dev=0.375
OP1	B	0, 0.000, 0.410, 0.820, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.410 std_dev=0.410
O2'	B	0, 0.000, 0.536, 1.073, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.536 std_dev=0.536
O3'	B	0, 0.000, 0.592, 1.184, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.592 std_dev=0.592
O5'	B	0, 0.000, 0.625, 1.250, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.625 std_dev=0.625
OP2	B	0, 0.000, 0.889, 1.778, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.889 std_dev=0.889

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.02	0.00	0.05	0.04	0.07	0.06
C2	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.07	0.11	0.09
C2'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02
C3'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02
C4	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.07	0.11	0.09
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.08	0.12	0.09
C5'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.04	0.04	0.04	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.08	0.09	0.12	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.07	0.07	0.10	0.09
N3	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.06	0.10	0.08
N4	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.06	0.07	0.10	0.08
O2	0.06	0.00	0.04	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.09	0.08	0.12	0.11
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01
O3'	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.05	0.03	0.00	0.01	0.05	0.08	0.06	0.06
O4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.07	0.06
O5'	0.05	0.07	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.07	0.06	0.06	0.09	0.01	0.05	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.07	0.00	0.03	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.07	0.06	0.07	0.08	0.02	0.08	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.07	0.11	0.03	0.02	0.11	0.02	0.12	0.02	0.12	0.10	0.10	0.10	0.12	0.02	0.06	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.06	0.09	0.02	0.02	0.09	0.01	0.09	0.01	0.10	0.09	0.08	0.08	0.11	0.01	0.06	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.03	0.18	0.11	0.11	0.05	0.07	0.21	0.00	0.03	0.08	0.01	0.28	0.14	0.16	0.01	0.29	0.18	0.09	0.01
C2	0.12	0.00	0.20	0.15	0.11	0.01	0.04	0.15	0.05	0.07	0.07	0.02	0.30	0.18	0.18	0.04	0.33	0.26	0.13	0.03
C2'	0.03	0.05	0.13	0.07	0.12	0.09	0.10	0.22	0.04	0.02	0.09	0.04	0.21	0.07	0.16	0.05	0.21	0.15	0.16	0.04
C3'	0.02	0.10	0.08	0.03	0.15	0.13	0.13	0.26	0.09	0.07	0.13	0.09	0.15	0.03	0.17	0.09	0.21	0.11	0.02	0.02
C4	0.16	0.03	0.20	0.17	0.10	0.06	0.01	0.10	0.09	0.11	0.07	0.04	0.31	0.23	0.18	0.09	0.38	0.27	0.00	0.01
C4'	0.01	0.08	0.10	0.06	0.13	0.11	0.11	0.27	0.06	0.04	0.11	0.07	0.19	0.08	0.17	0.07	0.21	0.10	0.06	0.04
C5	0.17	0.00	0.22	0.18	0.11	0.07	0.04	0.11	0.06	0.09	0.09	0.02	0.34	0.26	0.17	0.09	0.41	0.24	0.08	0.05
C5'	0.02	0.07	0.09	0.06	0.12	0.09	0.10	0.25	0.06	0.03	0.10	0.06	0.18	0.11	0.15	0.05	0.23	0.08	0.21	0.09
C6	0.15	0.02	0.22	0.18	0.12	0.04	0.06	0.14	0.04	0.06	0.09	0.00	0.33	0.24	0.18	0.07	0.41	0.21	0.08	0.06
N1	0.12	0.01	0.21	0.15	0.11	0.01	0.06	0.16	0.04	0.06	0.08	0.01	0.31	0.19	0.17	0.04	0.36	0.22	0.04	0.01
N3	0.14	0.02	0.19	0.15	0.10	0.03	0.02	0.12	0.08	0.09	0.06	0.04	0.29	0.19	0.18	0.06	0.34	0.28	0.10	0.03
N4	0.17	0.06	0.18	0.16	0.06	0.09	0.03	0.07	0.12	0.13	0.04	0.07	0.27	0.24	0.15	0.12	0.38	0.27	0.02	0.02
O2	0.11	0.00	0.20	0.15	0.10	0.00	0.04	0.14	0.05	0.06	0.06	0.02	0.29	0.16	0.18	0.03	0.30	0.22	0.20	0.04
O2'	0.01	0.05	0.12	0.05	0.11	0.11	0.09	0.23	0.04	0.02	0.09	0.04	0.20	0.04	0.15	0.07	0.11	0.07	0.27	0.08
O3'	0.08	0.13	0.02	0.04	0.15	0.19	0.15	0.28	0.13	0.11	0.14	0.12	0.07	0.07	0.17	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01
O4'	0.07	0.04	0.16	0.10	0.12	0.07	0.08	0.24	0.02	0.01	0.09	0.03	0.26	0.15	0.16	0.02	0.28	0.15	0.01	0.03
O5'	0.00	0.09	0.06	0.03	0.13	0.11	0.11	0.27	0.07	0.05	0.12	0.09	0.17	0.10	0.15	0.07	0.26	0.16	0.20	0.06
OP1	0.05	0.11	0.02	0.04	0.13	0.14	0.13	0.24	0.10	0.09	0.12	0.10	0.06	0.05	0.15	0.11	0.12	0.13	0.30	0.06
OP2	0.01	0.09	0.02	0.01	0.10	0.08	0.08	0.20	0.05	0.05	0.10	0.09	0.09	0.13	0.12	0.05	0.26	0.18	0.28	0.07
P	0.02	0.10	0.01	0.01	0.12	0.12	0.10	0.25	0.07	0.06	0.11	0.10	0.11	0.10	0.14	0.08	0.22	0.16	0.26	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.21	0.15	0.00
C2	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01	0.03	0.19	0.30	0.03	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.00	0.02	0.00	0.33	0.11	0.30	0.13
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.22	0.09	0.35	0.11
C4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.35	0.15	0.14
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.16	0.24	0.02
C5	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.04	0.12	0.36	0.19	0.16
C5'	0.02	0.06	0.04	0.00	0.11	0.01	0.14	0.00	0.12	0.08	0.08	0.04	0.04	0.01	0.12	0.01	0.00	0.11	0.33	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.07	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01	0.05	0.14	0.33	0.10	0.12
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.28	0.03	0.06
N3	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.19	0.33	0.05	0.10
O2	0.01	0.00	0.09	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.14	0.03	0.02	0.05	0.20	0.28	0.10	0.03
O2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.06	0.01	0.04	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.35	0.10	0.32	0.15
O3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.14	0.31	0.05
O4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.37	0.21	0.17
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.21	0.12	0.05
O5'	0.19	0.19	0.33	0.22	0.15	0.01	0.12	0.00	0.14	0.18	0.19	0.20	0.35	0.10	0.14	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.21	0.30	0.11	0.09	0.35	0.16	0.36	0.11	0.33	0.28	0.33	0.28	0.10	0.14	0.37	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.03	0.30	0.35	0.15	0.24	0.19	0.33	0.10	0.03	0.05	0.10	0.32	0.31	0.21	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.00	0.06	0.13	0.11	0.14	0.02	0.16	0.01	0.12	0.06	0.10	0.03	0.15	0.05	0.17	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00