Doublet Group distance statistics: 52078

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 9, 8, 16, 5, 5, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.017, 0.031, 0.045, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.031 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.017, 0.031, 0.046, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.031 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.017, 0.031, 0.046, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.031 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.034, 0.066, 0.098, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.066 std_dev=0.032
N4	A	0, 0.052, 0.098, 0.145, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.098 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.049, 0.146, 0.242, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.146 std_dev=0.096
C2'	A	0, 0.142, 0.272, 0.401, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.272 std_dev=0.129
C4'	A	0, 0.161, 0.302, 0.443, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.302 std_dev=0.141
C5	B	0, 0.297, 0.466, 0.634, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.466 std_dev=0.169
C4	B	0, 0.291, 0.465, 0.639, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.465 std_dev=0.174
C3'	A	0, 0.298, 0.483, 0.669, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.483 std_dev=0.185
C6	B	0, 0.223, 0.408, 0.594, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.408 std_dev=0.185
N3	B	0, 0.229, 0.423, 0.617, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.423 std_dev=0.194
N7	B	0, 0.393, 0.592, 0.792, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.592 std_dev=0.200
N9	B	0, 0.379, 0.592, 0.806, 1.071 max_d=1.071 avg_d=0.592 std_dev=0.213
N1	B	0, 0.159, 0.372, 0.585, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.372 std_dev=0.213
C2	B	0, 0.166, 0.382, 0.598, 0.795 max_d=0.795 avg_d=0.382 std_dev=0.216
O6	B	0, 0.238, 0.455, 0.672, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.455 std_dev=0.217
O2'	A	0, 0.211, 0.430, 0.649, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.430 std_dev=0.219
C8	B	0, 0.435, 0.660, 0.885, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.660 std_dev=0.225
N2	B	0, 0.185, 0.442, 0.699, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.442 std_dev=0.257
C2'	B	0, 0.466, 0.727, 0.987, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.727 std_dev=0.260
C1'	B	0, 0.439, 0.701, 0.963, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.701 std_dev=0.262
O5'	A	0, 0.160, 0.433, 0.705, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.433 std_dev=0.273
C5'	A	0, 0.128, 0.403, 0.677, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.403 std_dev=0.275
C3'	B	0, 0.493, 0.792, 1.092, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.792 std_dev=0.299
P	A	0, 0.131, 0.432, 0.733, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.432 std_dev=0.301
OP2	A	0, 0.146, 0.451, 0.755, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.451 std_dev=0.304
O2'	B	0, 0.528, 0.833, 1.139, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.833 std_dev=0.305
O4'	B	0, 0.470, 0.799, 1.128, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.799 std_dev=0.329
C4'	B	0, 0.528, 0.876, 1.224, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.876 std_dev=0.348
O5'	B	0, 0.567, 0.919, 1.272, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.919 std_dev=0.352
O3'	B	0, 0.532, 0.887, 1.243, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.887 std_dev=0.356
O3'	A	0, 0.536, 0.914, 1.291, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.914 std_dev=0.377
OP1	A	0, 0.102, 0.483, 0.864, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.483 std_dev=0.381
C5'	B	0, 0.570, 0.965, 1.360, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.965 std_dev=0.395
P	B	0, 0.701, 1.158, 1.614, 1.925 max_d=1.925 avg_d=1.158 std_dev=0.456
OP2	B	0, 0.653, 1.159, 1.665, 2.208 max_d=2.208 avg_d=1.159 std_dev=0.506
OP1	B	0, 0.778, 1.391, 2.003, 2.679 max_d=2.679 avg_d=1.391 std_dev=0.613

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.08	0.09	0.14	0.10
C2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.15	0.05	0.12	0.12	0.16	0.12
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.08	0.02	0.08	0.01	0.07	0.04	0.08	0.08	0.12	0.00	0.03	0.01	0.03	0.08	0.12	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.17	0.00	0.18	0.01	0.16	0.10	0.15	0.19	0.11	0.02	0.01	0.01	0.06	0.12	0.17	0.08
C4	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.25	0.04	0.14	0.14	0.17	0.14
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.04	0.07	0.03	0.07	0.06	0.01	0.02	0.09	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.18	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.26	0.04	0.15	0.14	0.17	0.14
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.05	0.07	0.10	0.05	0.07	0.05	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.20	0.04	0.14	0.13	0.17	0.13
N1	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.02	0.11	0.12	0.16	0.12
N3	0.01	0.00	0.08	0.15	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.21	0.05	0.13	0.13	0.17	0.13
N4	0.02	0.01	0.08	0.19	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.29	0.05	0.15	0.15	0.18	0.15
O2	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.16	0.06	0.11	0.12	0.16	0.12
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.07	0.05	0.07	0.05	0.02	0.06	0.04	0.14	0.00	0.07	0.05	0.04	0.13	0.12	0.05
O3'	0.03	0.15	0.03	0.01	0.25	0.06	0.26	0.05	0.20	0.12	0.21	0.29	0.16	0.07	0.00	0.04	0.12	0.22	0.29	0.17
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.06	0.05	0.04	0.00	0.11	0.13	0.14	0.12
O5'	0.08	0.12	0.03	0.06	0.14	0.02	0.15	0.01	0.14	0.11	0.13	0.15	0.11	0.04	0.12	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.12	0.08	0.12	0.14	0.09	0.14	0.10	0.13	0.12	0.13	0.15	0.12	0.13	0.22	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.16	0.12	0.17	0.17	0.08	0.17	0.05	0.17	0.16	0.17	0.18	0.16	0.12	0.29	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.12	0.05	0.08	0.14	0.02	0.14	0.02	0.13	0.12	0.13	0.15	0.12	0.05	0.17	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.19	0.24	0.26	0.18	0.23	0.19	0.22	0.19	0.19	0.17	0.23	0.19	0.20	0.18	0.26	0.31	0.20	0.22	0.24	0.23	0.27	0.24
C2	0.22	0.17	0.27	0.29	0.18	0.26	0.18	0.26	0.18	0.20	0.16	0.18	0.19	0.20	0.20	0.28	0.34	0.22	0.25	0.22	0.25	0.26	0.25
C2'	0.20	0.22	0.23	0.23	0.19	0.20	0.21	0.18	0.23	0.20	0.22	0.27	0.21	0.22	0.19	0.27	0.27	0.19	0.16	0.29	0.18	0.25	0.19
C3'	0.22	0.27	0.21	0.20	0.23	0.20	0.25	0.18	0.28	0.24	0.27	0.32	0.24	0.27	0.22	0.24	0.22	0.21	0.18	0.33	0.21	0.28	0.22
C4	0.17	0.11	0.21	0.25	0.12	0.22	0.13	0.23	0.12	0.17	0.09	0.16	0.12	0.17	0.16	0.20	0.29	0.19	0.24	0.15	0.24	0.25	0.24
C4'	0.14	0.20	0.17	0.18	0.14	0.15	0.16	0.16	0.18	0.15	0.19	0.26	0.17	0.18	0.13	0.19	0.22	0.13	0.18	0.24	0.24	0.29	0.24
C5	0.16	0.15	0.18	0.21	0.15	0.19	0.15	0.21	0.13	0.18	0.11	0.19	0.15	0.19	0.16	0.18	0.24	0.18	0.22	0.16	0.22	0.26	0.24
C5'	0.11	0.19	0.14	0.17	0.12	0.15	0.14	0.19	0.17	0.15	0.19	0.25	0.15	0.17	0.12	0.15	0.20	0.13	0.21	0.22	0.31	0.33	0.29
C6	0.18	0.17	0.20	0.22	0.17	0.20	0.18	0.21	0.17	0.19	0.15	0.21	0.17	0.21	0.18	0.20	0.25	0.18	0.22	0.20	0.23	0.27	0.24
N1	0.20	0.17	0.24	0.26	0.18	0.23	0.18	0.23	0.18	0.19	0.15	0.20	0.18	0.20	0.18	0.25	0.30	0.20	0.22	0.22	0.23	0.26	0.24
N3	0.22	0.14	0.27	0.30	0.17	0.26	0.17	0.26	0.16	0.19	0.14	0.17	0.16	0.18	0.19	0.27	0.34	0.22	0.25	0.19	0.26	0.26	0.26
N4	0.14	0.18	0.18	0.25	0.11	0.21	0.11	0.23	0.13	0.15	0.16	0.21	0.15	0.14	0.13	0.16	0.28	0.17	0.24	0.15	0.25	0.26	0.25
O2	0.25	0.21	0.30	0.31	0.21	0.29	0.20	0.28	0.21	0.21	0.20	0.22	0.22	0.20	0.22	0.32	0.36	0.25	0.26	0.24	0.26	0.26	0.26
O2'	0.23	0.24	0.28	0.27	0.21	0.24	0.22	0.20	0.24	0.20	0.23	0.28	0.23	0.23	0.20	0.32	0.33	0.21	0.18	0.31	0.19	0.25	0.20
O3'	0.37	0.43	0.32	0.30	0.40	0.34	0.43	0.32	0.47	0.41	0.45	0.45	0.40	0.45	0.39	0.34	0.29	0.38	0.32	0.52	0.33	0.39	0.35
O4'	0.19	0.19	0.23	0.25	0.17	0.22	0.17	0.23	0.17	0.18	0.17	0.23	0.18	0.19	0.17	0.24	0.30	0.19	0.24	0.22	0.27	0.30	0.28
O5'	0.12	0.18	0.13	0.14	0.12	0.13	0.15	0.16	0.17	0.17	0.19	0.24	0.14	0.19	0.13	0.15	0.16	0.14	0.18	0.22	0.26	0.30	0.25
OP1	0.13	0.19	0.13	0.15	0.12	0.16	0.13	0.20	0.15	0.17	0.19	0.24	0.14	0.17	0.13	0.14	0.16	0.15	0.22	0.18	0.35	0.35	0.31
OP2	0.13	0.21	0.15	0.17	0.12	0.17	0.12	0.21	0.17	0.16	0.23	0.26	0.15	0.15	0.13	0.16	0.20	0.15	0.23	0.21	0.35	0.36	0.31
P	0.11	0.19	0.12	0.13	0.11	0.13	0.11	0.17	0.15	0.14	0.20	0.24	0.14	0.14	0.11	0.14	0.16	0.13	0.19	0.18	0.31	0.31	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.07	0.10	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.08	0.02	0.11	0.02	0.12	0.24	0.16
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.07	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.09	0.07	0.04
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.07	0.07	0.07	0.06	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.09	0.10	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.11	0.01	0.12	0.21	0.15
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.03	0.04	0.02	0.08	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.08	0.10	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.16	0.01	0.19	0.28	0.21
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.12	0.13	0.09	0.04	0.04	0.15	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.16	0.10	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.17	0.01	0.22	0.32	0.24
C8	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.04	0.15	0.02	0.16	0.21	0.18
N1	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.03	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.14	0.01	0.17	0.29	0.21
N2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.10	0.03	0.10	0.02	0.10	0.22	0.14
N3	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.02	0.09	0.01	0.09	0.19	0.12
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.04	0.18	0.02	0.22	0.30	0.24
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.10	0.01	0.10	0.16	0.12
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.02	0.08	0.11	0.08	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.05	0.12	0.06	0.04
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.02	0.08	0.03	0.09	0.07	0.09	0.10	0.07	0.09	0.04	0.03	0.00	0.01	0.07	0.11	0.14	0.10	0.06
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.04	0.08	0.10	0.06
O5'	0.05	0.11	0.03	0.04	0.11	0.01	0.16	0.01	0.17	0.15	0.14	0.10	0.09	0.18	0.10	0.03	0.07	0.07	0.00	0.20	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.11	0.04	0.20	0.00	0.27	0.37	0.29
OP1	0.07	0.12	0.09	0.10	0.12	0.10	0.19	0.10	0.22	0.16	0.17	0.10	0.09	0.22	0.10	0.12	0.14	0.08	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.24	0.07	0.06	0.21	0.04	0.28	0.02	0.32	0.21	0.29	0.22	0.19	0.30	0.16	0.06	0.10	0.10	0.02	0.37	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.16	0.04	0.04	0.15	0.02	0.21	0.01	0.24	0.18	0.21	0.14	0.12	0.24	0.12	0.04	0.06	0.06	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00