Doublet Group distance statistics: 52079

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 3, 0, 0, 1, 1, 7, 7, 8, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.014, 0.022, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.018, 0.029, 0.040, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.029 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.015, 0.026, 0.038, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.038, 0.066, 0.093, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.066 std_dev=0.027
N4	A	0, 0.038, 0.068, 0.097, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.068 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.140, 0.247, 0.354, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.247 std_dev=0.107
C2'	A	0, 0.159, 0.300, 0.442, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.300 std_dev=0.141
O2'	A	0, 0.203, 0.362, 0.521, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.362 std_dev=0.159
C4'	A	0, 0.211, 0.386, 0.562, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.386 std_dev=0.176
C3'	A	0, 0.228, 0.439, 0.649, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.439 std_dev=0.210
C5	B	0, 0.362, 0.618, 0.874, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.618 std_dev=0.256
C6	B	0, 0.379, 0.643, 0.906, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.643 std_dev=0.263
N7	B	0, 0.388, 0.653, 0.918, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.653 std_dev=0.265
O6	B	0, 0.391, 0.660, 0.929, 1.204 max_d=1.204 avg_d=0.660 std_dev=0.269
C4	B	0, 0.360, 0.648, 0.936, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.648 std_dev=0.288
C8	B	0, 0.429, 0.722, 1.015, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.722 std_dev=0.293
O3'	A	0, 0.342, 0.638, 0.935, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.638 std_dev=0.297
C5'	A	0, 0.366, 0.664, 0.961, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.664 std_dev=0.297
N9	B	0, 0.408, 0.708, 1.007, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.708 std_dev=0.300
N3	B	0, 0.378, 0.697, 1.017, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.697 std_dev=0.320
N1	B	0, 0.401, 0.722, 1.042, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.722 std_dev=0.320
C2	B	0, 0.403, 0.744, 1.085, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.744 std_dev=0.341
OP2	A	0, 0.380, 0.723, 1.065, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.723 std_dev=0.342
C1'	B	0, 0.497, 0.854, 1.211, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.854 std_dev=0.357
O5'	B	0, 0.500, 0.857, 1.214, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.857 std_dev=0.357
C2'	B	0, 0.444, 0.812, 1.180, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.812 std_dev=0.368
P	A	0, 0.324, 0.695, 1.066, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.695 std_dev=0.371
O5'	A	0, 0.279, 0.651, 1.023, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.651 std_dev=0.372
OP1	A	0, 0.359, 0.737, 1.116, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.737 std_dev=0.379
C3'	B	0, 0.398, 0.777, 1.156, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.777 std_dev=0.379
O3'	B	0, 0.360, 0.770, 1.181, 1.550 max_d=1.550 avg_d=0.770 std_dev=0.410
N2	B	0, 0.437, 0.860, 1.283, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.860 std_dev=0.423
OP2	B	0, 0.376, 0.807, 1.238, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.807 std_dev=0.431
P	B	0, 0.354, 0.795, 1.236, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.795 std_dev=0.441
O4'	B	0, 0.480, 0.931, 1.381, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.931 std_dev=0.451
C4'	B	0, 0.397, 0.850, 1.303, 1.573 max_d=1.573 avg_d=0.850 std_dev=0.453
O2'	B	0, 0.482, 0.955, 1.428, 1.983 max_d=1.983 avg_d=0.955 std_dev=0.473
C5'	B	0, 0.542, 1.044, 1.546, 1.983 max_d=1.983 avg_d=1.044 std_dev=0.502
OP1	B	0, 0.505, 1.045, 1.586, 1.987 max_d=1.987 avg_d=1.045 std_dev=0.541

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.07	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.01	0.04	0.03	0.06	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.11	0.02	0.11	0.12	0.19	0.14
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.07	0.04	0.16	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.13	0.08
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.10	0.02	0.07	0.05	0.16	0.02	0.01	0.01	0.08	0.18	0.16	0.12
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03	0.13	0.17	0.24	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.02	0.09	0.04	0.03
C5	0.02	0.03	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.09	0.05	0.14	0.18	0.24	0.17
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.12	0.00	0.11	0.06	0.08	0.11	0.07	0.06	0.03	0.02	0.02	0.07	0.03	0.02
C6	0.02	0.02	0.07	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.10	0.05	0.12	0.14	0.19	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.10	0.11	0.16	0.12
N3	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.09	0.02	0.12	0.15	0.22	0.16
N4	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.06	0.03	0.14	0.20	0.26	0.19
O2	0.04	0.01	0.16	0.16	0.02	0.07	0.03	0.07	0.03	0.03	0.01	0.02	0.00	0.14	0.19	0.04	0.11	0.12	0.19	0.13
O2'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.02	0.07	0.05	0.14	0.00	0.02	0.05	0.07	0.14	0.11	0.08
O3'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.05	0.02	0.09	0.03	0.10	0.03	0.09	0.06	0.19	0.02	0.00	0.02	0.11	0.26	0.23	0.17
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.00	0.07	0.08	0.13	0.12
O5'	0.06	0.11	0.07	0.08	0.13	0.02	0.14	0.02	0.12	0.10	0.12	0.14	0.11	0.07	0.11	0.07	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.07	0.12	0.14	0.18	0.17	0.09	0.18	0.07	0.14	0.11	0.15	0.20	0.12	0.14	0.26	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.19	0.13	0.16	0.24	0.04	0.24	0.03	0.19	0.16	0.22	0.26	0.19	0.11	0.23	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.14	0.08	0.12	0.17	0.03	0.17	0.02	0.14	0.12	0.16	0.19	0.13	0.08	0.17	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.36	0.18	0.11	0.25	0.17	0.26	0.31	0.30	0.25	0.35	0.43	0.30	0.25	0.24	0.33	0.16	0.16	0.19	0.31	0.09	0.10	0.05
C2	0.27	0.32	0.27	0.22	0.26	0.22	0.26	0.34	0.29	0.30	0.32	0.36	0.28	0.27	0.28	0.34	0.22	0.19	0.22	0.29	0.16	0.19	0.13
C2'	0.22	0.32	0.15	0.15	0.25	0.18	0.25	0.34	0.28	0.22	0.31	0.36	0.29	0.24	0.22	0.27	0.20	0.17	0.20	0.28	0.13	0.08	0.09
C3'	0.13	0.35	0.08	0.20	0.23	0.14	0.25	0.29	0.30	0.18	0.34	0.42	0.29	0.22	0.17	0.14	0.26	0.13	0.09	0.31	0.03	0.08	0.01
C4	0.20	0.28	0.20	0.21	0.16	0.22	0.20	0.33	0.27	0.24	0.31	0.33	0.21	0.23	0.18	0.22	0.21	0.21	0.16	0.30	0.08	0.16	0.06
C4'	0.15	0.40	0.07	0.19	0.24	0.14	0.26	0.30	0.33	0.20	0.39	0.50	0.30	0.23	0.18	0.17	0.26	0.13	0.08	0.34	0.08	0.17	0.06
C5	0.18	0.35	0.14	0.13	0.17	0.20	0.22	0.29	0.32	0.21	0.38	0.41	0.24	0.23	0.16	0.21	0.15	0.20	0.20	0.34	0.11	0.19	0.12
C5'	0.13	0.44	0.11	0.24	0.25	0.13	0.28	0.26	0.36	0.19	0.43	0.57	0.33	0.24	0.18	0.14	0.31	0.12	0.10	0.38	0.18	0.27	0.14
C6	0.21	0.39	0.15	0.12	0.22	0.19	0.25	0.27	0.33	0.22	0.39	0.46	0.29	0.24	0.19	0.24	0.14	0.20	0.21	0.34	0.11	0.17	0.12
N1	0.23	0.36	0.19	0.12	0.24	0.16	0.26	0.28	0.30	0.25	0.36	0.42	0.29	0.25	0.23	0.30	0.14	0.14	0.19	0.31	0.08	0.13	0.05
N3	0.27	0.29	0.29	0.27	0.23	0.25	0.25	0.35	0.27	0.30	0.29	0.32	0.24	0.27	0.27	0.30	0.26	0.24	0.20	0.28	0.13	0.18	0.11
N4	0.20	0.25	0.21	0.25	0.14	0.24	0.15	0.35	0.23	0.23	0.27	0.29	0.18	0.22	0.18	0.20	0.25	0.23	0.16	0.28	0.08	0.17	0.07
O2	0.35	0.32	0.36	0.28	0.30	0.26	0.29	0.40	0.29	0.34	0.31	0.35	0.31	0.30	0.34	0.43	0.26	0.28	0.32	0.29	0.26	0.25	0.23
O2'	0.29	0.30	0.26	0.27	0.26	0.30	0.25	0.47	0.27	0.26	0.29	0.34	0.28	0.25	0.26	0.38	0.33	0.25	0.24	0.27	0.19	0.07	0.13
O3'	0.13	0.32	0.16	0.29	0.23	0.16	0.24	0.31	0.29	0.17	0.32	0.37	0.27	0.21	0.17	0.11	0.35	0.15	0.02	0.30	0.02	0.02	0.01
O4'	0.20	0.41	0.11	0.13	0.24	0.15	0.27	0.31	0.34	0.23	0.41	0.52	0.31	0.25	0.21	0.26	0.19	0.13	0.13	0.36	0.06	0.16	0.04
O5'	0.17	0.45	0.11	0.17	0.26	0.15	0.29	0.23	0.37	0.21	0.45	0.60	0.34	0.26	0.20	0.17	0.24	0.18	0.15	0.39	0.11	0.19	0.09
OP1	0.26	0.45	0.17	0.15	0.31	0.23	0.35	0.25	0.43	0.27	0.49	0.57	0.35	0.32	0.26	0.23	0.18	0.31	0.24	0.48	0.25	0.23	0.22
OP2	0.31	0.47	0.23	0.24	0.35	0.32	0.39	0.41	0.46	0.33	0.51	0.57	0.39	0.37	0.32	0.29	0.28	0.33	0.27	0.49	0.22	0.18	0.20
P	0.23	0.46	0.16	0.15	0.31	0.21	0.34	0.26	0.42	0.27	0.49	0.58	0.36	0.31	0.26	0.22	0.20	0.25	0.19	0.46	0.16	0.14	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.06	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.18	0.02	0.21	0.15	0.12
C2	0.06	0.00	0.16	0.19	0.01	0.16	0.01	0.34	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.26	0.13	0.39	0.02	0.27	0.20	0.28
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.02	0.07	0.03	0.08	0.13	0.12	0.20	0.16	0.11	0.03	0.00	0.02	0.01	0.16	0.09	0.19	0.18	0.14
C3'	0.02	0.19	0.01	0.00	0.15	0.00	0.19	0.02	0.20	0.19	0.19	0.23	0.18	0.21	0.12	0.02	0.01	0.02	0.28	0.22	0.29	0.21	0.23
C4	0.03	0.01	0.08	0.15	0.00	0.13	0.01	0.28	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.18	0.06	0.33	0.01	0.25	0.14	0.22
C4'	0.01	0.16	0.02	0.00	0.13	0.00	0.14	0.01	0.15	0.09	0.16	0.16	0.14	0.11	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.16	0.15	0.24	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.19	0.01	0.14	0.00	0.30	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.23	0.04	0.34	0.02	0.25	0.17	0.23
C5'	0.04	0.34	0.03	0.02	0.28	0.01	0.30	0.00	0.34	0.19	0.35	0.34	0.31	0.25	0.18	0.06	0.04	0.02	0.01	0.35	0.22	0.35	0.02
C6	0.02	0.02	0.08	0.20	0.01	0.15	0.01	0.34	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.26	0.06	0.37	0.01	0.26	0.21	0.27
C8	0.03	0.02	0.13	0.19	0.01	0.09	0.02	0.19	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.04	0.27	0.04	0.23	0.14	0.18
N1	0.04	0.01	0.12	0.19	0.02	0.16	0.01	0.35	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.26	0.10	0.38	0.01	0.27	0.23	0.29
N2	0.06	0.01	0.20	0.23	0.01	0.16	0.02	0.34	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.32	0.15	0.38	0.03	0.28	0.26	0.31
N3	0.06	0.00	0.16	0.18	0.01	0.14	0.01	0.31	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.23	0.13	0.36	0.02	0.25	0.15	0.24
N7	0.02	0.02	0.11	0.21	0.01	0.11	0.00	0.25	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.25	0.03	0.31	0.03	0.25	0.15	0.21
N9	0.01	0.02	0.03	0.12	0.01	0.08	0.01	0.18	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.12	0.01	0.26	0.03	0.23	0.13	0.17
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.06	0.10	0.09	0.16	0.11	0.08	0.03	0.00	0.04	0.09	0.09	0.06	0.12	0.22	0.10
O3'	0.02	0.26	0.02	0.01	0.18	0.02	0.23	0.04	0.26	0.21	0.26	0.32	0.23	0.25	0.12	0.04	0.00	0.02	0.34	0.29	0.33	0.30	0.30
O4'	0.00	0.13	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.04	0.10	0.15	0.13	0.03	0.01	0.09	0.02	0.00	0.24	0.04	0.27	0.22	0.18
O5'	0.18	0.39	0.16	0.28	0.33	0.02	0.34	0.01	0.37	0.27	0.38	0.38	0.36	0.31	0.26	0.09	0.34	0.24	0.00	0.37	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.09	0.22	0.01	0.16	0.02	0.35	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.29	0.04	0.37	0.00	0.27	0.23	0.28
OP1	0.21	0.27	0.19	0.29	0.25	0.15	0.25	0.22	0.26	0.23	0.27	0.28	0.25	0.25	0.23	0.12	0.33	0.27	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.20	0.18	0.21	0.14	0.24	0.17	0.35	0.21	0.14	0.23	0.26	0.15	0.15	0.13	0.22	0.30	0.22	0.02	0.23	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.28	0.14	0.23	0.22	0.04	0.23	0.02	0.27	0.18	0.29	0.31	0.24	0.21	0.17	0.10	0.30	0.18	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00