Doublet Group distance statistics: 52081

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 2, 4, 9, 3, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.009, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.009 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.005, 0.007, 0.010, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.002
C6	A	0, 0.008, 0.013, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.012, 0.016, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.016 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.007, 0.012, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.014, 0.027, 0.040, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.015, 0.029, 0.044, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.029 std_dev=0.015
O4'	A	0, 0.249, 0.384, 0.518, 0.600 max_d=0.600 avg_d=0.384 std_dev=0.135
C2'	A	0, 0.285, 0.434, 0.584, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.434 std_dev=0.150
C4'	A	0, 0.367, 0.561, 0.754, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.561 std_dev=0.193
O2'	A	0, 0.378, 0.577, 0.775, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.577 std_dev=0.198
C3'	A	0, 0.435, 0.664, 0.892, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.664 std_dev=0.229
N3	B	0, 0.461, 0.742, 1.023, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.742 std_dev=0.281
O5'	A	0, 0.358, 0.650, 0.943, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.650 std_dev=0.292
C4	B	0, 0.512, 0.809, 1.106, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.809 std_dev=0.297
C2	B	0, 0.449, 0.750, 1.050, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.750 std_dev=0.301
C6	B	0, 0.564, 0.868, 1.172, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.868 std_dev=0.304
C5	B	0, 0.564, 0.870, 1.176, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.870 std_dev=0.306
OP1	B	0, 0.515, 0.828, 1.142, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.828 std_dev=0.314
N1	B	0, 0.497, 0.811, 1.125, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.811 std_dev=0.314
P	B	0, 0.481, 0.797, 1.114, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.797 std_dev=0.316
OP2	B	0, 0.466, 0.788, 1.110, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.788 std_dev=0.322
O6	B	0, 0.633, 0.959, 1.286, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.959 std_dev=0.327
N9	B	0, 0.570, 0.900, 1.230, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.900 std_dev=0.330
C5'	A	0, 0.609, 0.941, 1.273, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.941 std_dev=0.332
O3'	A	0, 0.657, 0.998, 1.339, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.998 std_dev=0.341
N7	B	0, 0.637, 0.979, 1.320, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.979 std_dev=0.341
C2'	B	0, 0.576, 0.931, 1.285, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.931 std_dev=0.354
O4'	B	0, 0.638, 0.993, 1.348, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.993 std_dev=0.355
C8	B	0, 0.647, 1.002, 1.357, 1.456 max_d=1.456 avg_d=1.002 std_dev=0.355
C1'	B	0, 0.575, 0.931, 1.287, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.931 std_dev=0.356
O5'	B	0, 0.709, 1.068, 1.426, 1.429 max_d=1.429 avg_d=1.068 std_dev=0.359
N2	B	0, 0.409, 0.772, 1.136, 1.729 max_d=1.729 avg_d=0.772 std_dev=0.363
C5'	B	0, 0.833, 1.206, 1.578, 1.539 max_d=1.539 avg_d=1.206 std_dev=0.372
C4'	B	0, 0.639, 1.013, 1.386, 1.389 max_d=1.389 avg_d=1.013 std_dev=0.374
C3'	B	0, 0.841, 1.291, 1.741, 1.764 max_d=1.764 avg_d=1.291 std_dev=0.450
P	A	0, 0.732, 1.211, 1.691, 1.960 max_d=1.960 avg_d=1.211 std_dev=0.480
O2'	B	0, 0.944, 1.434, 1.925, 1.948 max_d=1.948 avg_d=1.434 std_dev=0.491
OP2	A	0, 0.937, 1.451, 1.964, 2.224 max_d=2.224 avg_d=1.451 std_dev=0.513
OP1	A	0, 0.979, 1.588, 2.197, 3.023 max_d=3.023 avg_d=1.588 std_dev=0.609
O3'	B	0, 1.145, 1.787, 2.429, 2.580 max_d=2.580 avg_d=1.787 std_dev=0.642

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.11	0.04
C2	0.01	0.00	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.02	0.07	0.22	0.27	0.10
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.03	0.09	0.00	0.01	0.00	0.05	0.09	0.10	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.03	0.04	0.05	0.07	0.01	0.01	0.00	0.06	0.11	0.08	0.07
C4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.11	0.34	0.42	0.15
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.08	0.01
C5	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.11	0.34	0.41	0.16
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.07	0.04	0.05	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.17	0.16	0.01
C6	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.10	0.25	0.30	0.12
N1	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.07	0.19	0.23	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.09	0.29	0.36	0.13
N4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.12	0.38	0.47	0.17
O2	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.09	0.03	0.05	0.19	0.22	0.08
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.05	0.03	0.10	0.00	0.02	0.02	0.03	0.10	0.06	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.09	0.03	0.05	0.07	0.09	0.02	0.00	0.01	0.07	0.19	0.09	0.09
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.05	0.05
O5'	0.03	0.07	0.05	0.06	0.11	0.01	0.11	0.01	0.10	0.07	0.09	0.12	0.05	0.03	0.07	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.22	0.09	0.11	0.34	0.10	0.34	0.17	0.25	0.19	0.29	0.38	0.19	0.10	0.19	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.27	0.10	0.08	0.42	0.08	0.41	0.16	0.30	0.23	0.36	0.47	0.22	0.06	0.09	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.10	0.05	0.07	0.15	0.01	0.16	0.01	0.12	0.09	0.13	0.17	0.08	0.04	0.09	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.28	0.14	0.17	0.13	0.17	0.20	0.24	0.24	0.25	0.27	0.38	0.18	0.26	0.15	0.25	0.12	0.15	0.18	0.27	0.05	0.06	0.04
C2	0.22	0.26	0.21	0.22	0.09	0.24	0.17	0.27	0.23	0.25	0.27	0.35	0.18	0.25	0.15	0.31	0.16	0.21	0.21	0.27	0.09	0.07	0.07
C2'	0.13	0.22	0.13	0.13	0.17	0.13	0.22	0.24	0.23	0.25	0.22	0.30	0.17	0.26	0.19	0.20	0.10	0.11	0.19	0.25	0.09	0.03	0.07
C3'	0.18	0.24	0.21	0.06	0.21	0.08	0.23	0.10	0.22	0.26	0.22	0.32	0.21	0.26	0.22	0.14	0.08	0.15	0.08	0.23	0.01	0.05	0.01
C4	0.29	0.26	0.25	0.32	0.15	0.30	0.12	0.30	0.19	0.29	0.26	0.33	0.22	0.25	0.23	0.25	0.20	0.30	0.26	0.25	0.13	0.10	0.12
C4'	0.16	0.30	0.20	0.06	0.20	0.08	0.23	0.09	0.25	0.25	0.27	0.42	0.24	0.26	0.20	0.15	0.08	0.13	0.05	0.26	0.09	0.12	0.05
C5	0.26	0.27	0.20	0.32	0.13	0.29	0.14	0.31	0.18	0.27	0.26	0.37	0.21	0.25	0.21	0.21	0.21	0.29	0.28	0.24	0.14	0.13	0.15
C5'	0.16	0.32	0.25	0.06	0.21	0.09	0.22	0.05	0.23	0.24	0.28	0.47	0.26	0.25	0.20	0.19	0.08	0.14	0.04	0.24	0.17	0.17	0.11
C6	0.21	0.28	0.17	0.28	0.09	0.26	0.16	0.29	0.21	0.25	0.27	0.40	0.18	0.25	0.17	0.21	0.19	0.25	0.26	0.26	0.11	0.11	0.13
N1	0.19	0.28	0.16	0.22	0.09	0.23	0.18	0.27	0.23	0.25	0.27	0.38	0.18	0.25	0.15	0.24	0.14	0.21	0.22	0.27	0.08	0.06	0.08
N3	0.28	0.26	0.25	0.28	0.12	0.28	0.13	0.29	0.21	0.27	0.26	0.33	0.20	0.23	0.19	0.31	0.19	0.27	0.23	0.26	0.11	0.08	0.09
N4	0.33	0.26	0.28	0.35	0.22	0.32	0.17	0.31	0.18	0.32	0.25	0.31	0.25	0.27	0.28	0.26	0.22	0.32	0.27	0.23	0.15	0.12	0.14
O2	0.19	0.26	0.21	0.18	0.12	0.20	0.19	0.25	0.24	0.25	0.27	0.33	0.19	0.25	0.14	0.37	0.19	0.16	0.17	0.28	0.10	0.09	0.07
O2'	0.13	0.20	0.13	0.12	0.17	0.13	0.22	0.25	0.22	0.25	0.21	0.26	0.16	0.26	0.18	0.28	0.10	0.12	0.18	0.24	0.11	0.03	0.08
O3'	0.24	0.18	0.28	0.09	0.22	0.14	0.23	0.05	0.20	0.27	0.17	0.22	0.19	0.26	0.25	0.15	0.08	0.22	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00
O4'	0.14	0.33	0.14	0.11	0.17	0.11	0.23	0.16	0.26	0.25	0.31	0.46	0.23	0.26	0.17	0.18	0.10	0.12	0.11	0.29	0.06	0.11	0.03
O5'	0.12	0.31	0.21	0.12	0.16	0.10	0.19	0.12	0.21	0.21	0.26	0.49	0.22	0.22	0.15	0.20	0.12	0.12	0.09	0.22	0.10	0.12	0.06
OP1	0.31	0.49	0.46	0.18	0.43	0.18	0.50	0.18	0.56	0.45	0.56	0.54	0.42	0.51	0.40	0.50	0.16	0.19	0.19	0.61	0.35	0.27	0.25
OP2	0.26	0.38	0.18	0.26	0.28	0.22	0.32	0.16	0.34	0.32	0.36	0.53	0.30	0.35	0.28	0.21	0.27	0.28	0.18	0.36	0.21	0.21	0.14
P	0.15	0.34	0.30	0.12	0.19	0.10	0.20	0.11	0.21	0.21	0.28	0.53	0.26	0.23	0.18	0.32	0.11	0.11	0.10	0.23	0.23	0.21	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.19	0.00	0.09	0.02	0.10	0.18	0.15
C2	0.02	0.00	0.14	0.26	0.00	0.14	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.24	0.12	0.14	0.01	0.14	0.17	0.12
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.02	0.05	0.10	0.08	0.06	0.12	0.16	0.14	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.22	0.07	0.18	0.31	0.25
C3'	0.02	0.26	0.00	0.00	0.16	0.00	0.14	0.01	0.18	0.05	0.23	0.29	0.24	0.08	0.07	0.01	0.01	0.03	0.06	0.17	0.10	0.07	0.05
C4	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.08	0.07	0.08	0.01	0.11	0.20	0.14
C4'	0.01	0.14	0.02	0.00	0.07	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.11	0.16	0.13	0.02	0.02	0.18	0.01	0.00	0.01	0.08	0.04	0.05	0.05
C5	0.01	0.00	0.05	0.14	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.08	0.04	0.09	0.01	0.13	0.21	0.15
C5'	0.03	0.13	0.10	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.09	0.05	0.12	0.16	0.10	0.06	0.04	0.09	0.12	0.01	0.01	0.09	0.04	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.18	0.00	0.08	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.30	0.10	0.06	0.11	0.00	0.15	0.21	0.15
C8	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.22	0.04	0.09	0.02	0.12	0.21	0.17
N1	0.02	0.00	0.12	0.23	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.29	0.18	0.10	0.13	0.01	0.15	0.19	0.14
N2	0.03	0.00	0.16	0.29	0.01	0.16	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.34	0.14	0.17	0.01	0.15	0.16	0.13
N3	0.03	0.00	0.14	0.24	0.00	0.13	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.20	0.13	0.10	0.01	0.11	0.18	0.12
N7	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.16	0.02	0.09	0.02	0.12	0.22	0.16
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.13	0.01	0.08	0.02	0.11	0.20	0.16
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.22	0.18	0.26	0.09	0.30	0.19	0.29	0.26	0.22	0.24	0.15	0.00	0.04	0.09	0.13	0.31	0.10	0.29	0.16
O3'	0.19	0.24	0.02	0.01	0.08	0.01	0.08	0.12	0.10	0.22	0.18	0.34	0.20	0.16	0.13	0.04	0.00	0.10	0.16	0.09	0.30	0.17	0.17
O4'	0.00	0.12	0.02	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.04	0.10	0.14	0.13	0.02	0.01	0.09	0.10	0.00	0.04	0.06	0.09	0.13	0.12
O5'	0.09	0.14	0.22	0.06	0.08	0.01	0.09	0.01	0.11	0.09	0.13	0.17	0.10	0.09	0.08	0.13	0.16	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.31	0.09	0.06	0.12	0.00	0.16	0.22	0.16
OP1	0.10	0.14	0.18	0.10	0.11	0.04	0.13	0.04	0.15	0.12	0.15	0.15	0.11	0.12	0.11	0.10	0.30	0.09	0.01	0.16	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.17	0.31	0.07	0.20	0.05	0.21	0.02	0.21	0.21	0.19	0.16	0.18	0.22	0.20	0.29	0.17	0.13	0.01	0.22	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.12	0.25	0.05	0.14	0.05	0.15	0.01	0.15	0.17	0.14	0.13	0.12	0.16	0.16	0.16	0.17	0.12	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00