Doublet Group distance statistics: 52083

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 5, 4, 2, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.031, 0.043, 0.056, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.043 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.023, 0.040, 0.057, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.040 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.017, 0.036, 0.054, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.036 std_dev=0.019
C6	A	0, 0.041, 0.061, 0.081, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.061 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.044, 0.064, 0.083, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.064 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.034, 0.055, 0.077, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.055 std_dev=0.022
C1'	A	0, 0.042, 0.066, 0.089, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.066 std_dev=0.023
O2	A	0, 0.094, 0.141, 0.188, 0.205 max_d=0.205 avg_d=0.141 std_dev=0.047
N4	A	0, 0.060, 0.112, 0.165, 0.288 max_d=0.288 avg_d=0.112 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.127, 0.232, 0.337, 0.468 max_d=0.468 avg_d=0.232 std_dev=0.105
C8	B	0, 0.174, 0.312, 0.449, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.312 std_dev=0.137
N7	B	0, 0.335, 0.495, 0.655, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.495 std_dev=0.160
C2'	A	0, 0.189, 0.356, 0.523, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.356 std_dev=0.167
N9	B	0, 0.193, 0.362, 0.531, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.362 std_dev=0.169
C4	B	0, 0.331, 0.506, 0.682, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.506 std_dev=0.176
C5	B	0, 0.375, 0.558, 0.742, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.558 std_dev=0.184
C5'	A	0, 0.134, 0.326, 0.518, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.326 std_dev=0.192
C4'	A	0, 0.328, 0.527, 0.725, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.527 std_dev=0.198
C1'	B	0, 0.308, 0.521, 0.733, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.521 std_dev=0.212
C4'	B	0, 0.605, 0.849, 1.093, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.849 std_dev=0.244
O4'	B	0, 0.244, 0.493, 0.742, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.493 std_dev=0.249
C2'	B	0, 0.466, 0.721, 0.975, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.721 std_dev=0.255
N3	B	0, 0.506, 0.764, 1.022, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.764 std_dev=0.258
C3'	A	0, 0.802, 1.104, 1.406, 1.373 max_d=1.373 avg_d=1.104 std_dev=0.302
C6	B	0, 0.624, 0.938, 1.253, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.938 std_dev=0.314
O2'	A	0, 0.758, 1.074, 1.389, 1.445 max_d=1.445 avg_d=1.074 std_dev=0.316
O5'	A	0, 0.398, 0.740, 1.082, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.740 std_dev=0.342
C5'	B	0, 0.411, 0.763, 1.114, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.763 std_dev=0.351
C2	B	0, 0.596, 0.950, 1.305, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.950 std_dev=0.355
N1	B	0, 0.632, 1.009, 1.386, 1.547 max_d=1.547 avg_d=1.009 std_dev=0.377
C3'	B	0, 0.973, 1.360, 1.746, 1.748 max_d=1.748 avg_d=1.360 std_dev=0.387
O6	B	0, 0.880, 1.305, 1.729, 1.973 max_d=1.973 avg_d=1.305 std_dev=0.425
O2'	B	0, 0.843, 1.271, 1.700, 2.011 max_d=2.011 avg_d=1.271 std_dev=0.429
N2	B	0, 0.659, 1.117, 1.575, 1.824 max_d=1.824 avg_d=1.117 std_dev=0.458
O5'	B	0, 0.630, 1.093, 1.556, 1.726 max_d=1.726 avg_d=1.093 std_dev=0.463
P	B	0, 0.760, 1.245, 1.731, 1.983 max_d=1.983 avg_d=1.245 std_dev=0.485
P	A	0, 0.739, 1.248, 1.756, 2.063 max_d=2.063 avg_d=1.248 std_dev=0.509
O3'	A	0, 1.620, 2.271, 2.922, 2.747 max_d=2.747 avg_d=2.271 std_dev=0.651
OP1	A	0, 1.603, 2.282, 2.961, 2.846 max_d=2.846 avg_d=2.282 std_dev=0.679
O3'	B	0, 1.586, 2.317, 3.048, 3.015 max_d=3.015 avg_d=2.317 std_dev=0.731
OP2	A	0, 1.754, 2.511, 3.267, 3.397 max_d=3.397 avg_d=2.511 std_dev=0.756
OP1	B	0, 1.326, 2.142, 2.958, 2.995 max_d=2.995 avg_d=2.142 std_dev=0.816
OP2	B	0, 1.631, 2.584, 3.538, 3.929 max_d=3.929 avg_d=2.584 std_dev=0.953

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.15	0.00	0.09	0.31	0.12	0.12
C2	0.02	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.13	0.03	0.09	0.43	0.28	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.10	0.07	0.02	0.05	0.04	0.12	0.00	0.02	0.01	0.21	0.32	0.15	0.24
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.18	0.01	0.22	0.02	0.20	0.10	0.13	0.20	0.10	0.02	0.01	0.02	0.07	0.14	0.10	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.18	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.16	0.08	0.06	0.17	0.48	0.49	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.10	0.04	0.04	0.10	0.05	0.14	0.02	0.01	0.02	0.09	0.11	0.03
C5	0.03	0.01	0.07	0.22	0.01	0.11	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.15	0.07	0.20	0.48	0.49	0.12
C5'	0.04	0.05	0.10	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.05	0.07	0.14	0.05	0.05	0.11	0.02	0.01	0.12	0.20	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.20	0.01	0.10	0.01	0.11	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.11	0.13	0.07	0.15	0.45	0.34	0.08
N1	0.01	0.01	0.02	0.10	0.02	0.04	0.02	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.06	0.03	0.08	0.40	0.24	0.09
N3	0.02	0.00	0.05	0.13	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.04	0.11	0.46	0.39	0.09
N4	0.03	0.01	0.04	0.20	0.01	0.10	0.02	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.10	0.07	0.20	0.49	0.57	0.15
O2	0.05	0.01	0.12	0.10	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.21	0.26	0.04	0.10	0.40	0.22	0.11
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.16	0.14	0.14	0.05	0.11	0.11	0.18	0.17	0.21	0.00	0.04	0.11	0.16	0.26	0.13	0.20
O3'	0.15	0.13	0.02	0.01	0.08	0.02	0.15	0.11	0.13	0.06	0.08	0.10	0.26	0.04	0.00	0.10	0.16	0.33	0.19	0.20
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.03	0.04	0.07	0.04	0.11	0.10	0.00	0.07	0.23	0.15	0.12
O5'	0.09	0.09	0.21	0.07	0.17	0.02	0.20	0.01	0.15	0.08	0.11	0.20	0.10	0.16	0.16	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.31	0.43	0.32	0.14	0.48	0.09	0.48	0.12	0.45	0.40	0.46	0.49	0.40	0.26	0.33	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.28	0.15	0.10	0.49	0.11	0.49	0.20	0.34	0.24	0.39	0.57	0.22	0.13	0.19	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.09	0.24	0.08	0.12	0.03	0.12	0.02	0.08	0.09	0.09	0.15	0.11	0.20	0.20	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.12	0.14	0.40	0.10	0.22	0.11	0.14	0.14	0.13	0.14	0.13	0.11	0.14	0.10	0.40	0.57	0.13	0.11	0.18	0.43	0.30	0.16
C2	0.13	0.17	0.14	0.38	0.12	0.21	0.09	0.14	0.13	0.10	0.16	0.19	0.16	0.08	0.11	0.37	0.41	0.12	0.13	0.16	0.59	0.38	0.16
C2'	0.10	0.11	0.19	0.43	0.09	0.25	0.14	0.18	0.17	0.13	0.15	0.11	0.09	0.18	0.09	0.37	0.58	0.13	0.15	0.22	0.46	0.34	0.17
C3'	0.33	0.28	0.41	0.17	0.31	0.13	0.31	0.16	0.29	0.36	0.28	0.27	0.30	0.34	0.34	0.56	0.37	0.27	0.23	0.29	0.25	0.15	0.28
C4	0.22	0.17	0.27	0.39	0.14	0.27	0.08	0.22	0.17	0.13	0.17	0.20	0.19	0.09	0.17	0.43	0.37	0.21	0.20	0.24	0.59	0.27	0.22
C4'	0.22	0.16	0.29	0.23	0.18	0.15	0.20	0.18	0.19	0.26	0.17	0.16	0.17	0.24	0.21	0.51	0.54	0.20	0.23	0.20	0.15	0.32	0.32
C5	0.24	0.16	0.29	0.43	0.12	0.32	0.08	0.27	0.16	0.16	0.18	0.20	0.15	0.10	0.18	0.46	0.44	0.25	0.25	0.20	0.51	0.26	0.27
C5'	0.21	0.17	0.29	0.28	0.16	0.26	0.17	0.29	0.17	0.23	0.17	0.19	0.17	0.21	0.18	0.49	0.64	0.23	0.27	0.19	0.12	0.52	0.31
C6	0.19	0.15	0.20	0.42	0.11	0.29	0.09	0.24	0.13	0.17	0.15	0.17	0.13	0.13	0.15	0.43	0.50	0.21	0.22	0.16	0.47	0.27	0.25
N1	0.13	0.14	0.14	0.40	0.11	0.23	0.10	0.16	0.13	0.13	0.14	0.15	0.13	0.11	0.12	0.40	0.49	0.15	0.14	0.16	0.51	0.30	0.18
N3	0.17	0.19	0.20	0.37	0.14	0.21	0.08	0.15	0.13	0.11	0.16	0.22	0.20	0.10	0.14	0.39	0.35	0.14	0.14	0.20	0.63	0.34	0.18
N4	0.27	0.19	0.34	0.39	0.15	0.29	0.11	0.25	0.23	0.13	0.22	0.23	0.22	0.11	0.19	0.46	0.37	0.24	0.22	0.33	0.61	0.26	0.23
O2	0.10	0.20	0.11	0.39	0.12	0.21	0.11	0.16	0.17	0.10	0.21	0.23	0.17	0.09	0.10	0.35	0.42	0.12	0.16	0.19	0.61	0.50	0.18
O2'	0.23	0.24	0.25	0.49	0.24	0.34	0.25	0.27	0.26	0.23	0.25	0.24	0.24	0.25	0.23	0.35	0.61	0.27	0.26	0.27	0.47	0.50	0.18
O3'	0.49	0.28	0.57	0.29	0.35	0.40	0.31	0.49	0.26	0.43	0.25	0.27	0.33	0.35	0.42	0.65	0.26	0.48	0.51	0.25	0.47	0.23	0.63
O4'	0.13	0.11	0.17	0.36	0.09	0.21	0.11	0.16	0.13	0.17	0.13	0.13	0.10	0.16	0.12	0.44	0.61	0.16	0.15	0.17	0.27	0.28	0.23
O5'	0.17	0.21	0.25	0.36	0.16	0.31	0.17	0.29	0.19	0.16	0.21	0.24	0.19	0.16	0.14	0.49	0.69	0.22	0.16	0.21	0.21	0.41	0.15
OP1	0.34	0.60	0.38	0.33	0.48	0.28	0.46	0.25	0.53	0.31	0.58	0.65	0.55	0.37	0.38	0.48	0.70	0.29	0.23	0.52	0.15	0.47	0.25
OP2	0.29	0.50	0.32	0.24	0.39	0.26	0.35	0.31	0.39	0.24	0.46	0.56	0.47	0.26	0.31	0.58	0.55	0.16	0.18	0.37	0.40	0.33	0.13
P	0.20	0.27	0.21	0.40	0.22	0.41	0.20	0.36	0.23	0.18	0.25	0.32	0.26	0.18	0.19	0.42	0.83	0.29	0.17	0.23	0.31	0.40	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.26	0.01	0.11	0.02	0.47	0.06	0.18
C2	0.03	0.00	0.14	0.13	0.02	0.05	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.17	0.30	0.07	0.11	0.02	0.65	0.21	0.20
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.14	0.08	0.08	0.11	0.17	0.14	0.07	0.03	0.00	0.06	0.02	0.29	0.08	0.46	0.25	0.34
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.13	0.01	0.18	0.02	0.19	0.18	0.16	0.12	0.11	0.21	0.12	0.02	0.02	0.01	0.10	0.21	0.16	0.16	0.09
C4	0.02	0.02	0.08	0.13	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.22	0.03	0.11	0.02	0.65	0.20	0.20
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.06	0.05	0.05	0.07	0.04	0.17	0.05	0.00	0.03	0.06	0.16	0.12	0.05
C5	0.01	0.02	0.06	0.18	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.20	0.18	0.02	0.15	0.02	0.73	0.30	0.22
C5'	0.05	0.06	0.14	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.06	0.06	0.12	0.07	0.07	0.12	0.02	0.01	0.11	0.12	0.20	0.03
C6	0.02	0.01	0.08	0.19	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.21	0.20	0.03	0.15	0.00	0.74	0.34	0.22
C8	0.01	0.02	0.08	0.18	0.00	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.12	0.05	0.16	0.03	0.71	0.24	0.21
N1	0.03	0.01	0.11	0.16	0.02	0.06	0.02	0.08	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.19	0.25	0.06	0.13	0.02	0.70	0.29	0.21
N2	0.03	0.01	0.17	0.12	0.02	0.05	0.03	0.06	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.18	0.35	0.08	0.10	0.05	0.62	0.19	0.20
N3	0.03	0.01	0.14	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.31	0.07	0.10	0.03	0.61	0.16	0.20
N7	0.01	0.02	0.07	0.21	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.21	0.15	0.04	0.18	0.03	0.76	0.33	0.22
N9	0.00	0.02	0.03	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.17	0.01	0.11	0.02	0.61	0.15	0.20
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.16	0.17	0.20	0.07	0.21	0.18	0.19	0.18	0.16	0.21	0.13	0.00	0.07	0.12	0.25	0.23	0.43	0.26	0.32
O3'	0.26	0.30	0.06	0.02	0.22	0.05	0.18	0.12	0.20	0.12	0.25	0.35	0.31	0.15	0.17	0.07	0.00	0.20	0.17	0.20	0.31	0.29	0.21
O4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.06	0.08	0.07	0.04	0.01	0.12	0.20	0.00	0.09	0.03	0.38	0.12	0.14
O5'	0.11	0.11	0.29	0.10	0.11	0.03	0.15	0.01	0.15	0.16	0.13	0.10	0.10	0.18	0.11	0.25	0.17	0.09	0.00	0.17	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.21	0.02	0.06	0.02	0.11	0.00	0.03	0.02	0.05	0.03	0.03	0.02	0.23	0.20	0.03	0.17	0.00	0.77	0.40	0.24
OP1	0.47	0.65	0.46	0.16	0.65	0.16	0.73	0.12	0.74	0.71	0.70	0.62	0.61	0.76	0.61	0.43	0.31	0.38	0.02	0.77	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.21	0.25	0.16	0.20	0.12	0.30	0.20	0.34	0.24	0.29	0.19	0.16	0.33	0.15	0.26	0.29	0.12	0.02	0.40	0.02	0.00	0.01
P	0.18	0.20	0.34	0.09	0.20	0.05	0.22	0.03	0.22	0.21	0.21	0.20	0.20	0.22	0.20	0.32	0.21	0.14	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00