Doublet Group distance statistics: 52088

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 1, 2, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.006, 0.010, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.006, 0.010, 0.014, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.010, 0.018, 0.027, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N4	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.030 std_dev=0.013
O4'	A	0, 0.210, 0.361, 0.513, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.361 std_dev=0.152
C2'	A	0, 0.255, 0.433, 0.611, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.433 std_dev=0.178
C4'	A	0, 0.319, 0.537, 0.756, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.537 std_dev=0.219
C4	B	0, 0.335, 0.582, 0.830, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.582 std_dev=0.247
N3	B	0, 0.368, 0.622, 0.876, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.622 std_dev=0.254
O2'	A	0, 0.346, 0.608, 0.869, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.608 std_dev=0.262
C2	B	0, 0.389, 0.655, 0.921, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.655 std_dev=0.266
C3'	A	0, 0.387, 0.656, 0.926, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.656 std_dev=0.270
N1	B	0, 0.350, 0.620, 0.890, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.620 std_dev=0.270
N9	B	0, 0.325, 0.629, 0.933, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.629 std_dev=0.304
C5	B	0, 0.317, 0.622, 0.926, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.622 std_dev=0.304
C6	B	0, 0.327, 0.632, 0.938, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.632 std_dev=0.305
C1'	B	0, 0.391, 0.705, 1.019, 1.362 max_d=1.362 avg_d=0.705 std_dev=0.314
N2	B	0, 0.486, 0.824, 1.163, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.824 std_dev=0.339
O6	B	0, 0.366, 0.741, 1.117, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.741 std_dev=0.376
O3'	A	0, 0.553, 0.938, 1.323, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.938 std_dev=0.385
C5'	A	0, 0.537, 0.928, 1.319, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.928 std_dev=0.391
O5'	A	0, 0.448, 0.845, 1.242, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.845 std_dev=0.397
N7	B	0, 0.338, 0.742, 1.147, 1.746 max_d=1.746 avg_d=0.742 std_dev=0.404
C8	B	0, 0.310, 0.717, 1.124, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.717 std_dev=0.407
O5'	B	0, 0.633, 1.097, 1.561, 1.595 max_d=1.595 avg_d=1.097 std_dev=0.464
OP2	B	0, 0.739, 1.211, 1.683, 1.641 max_d=1.641 avg_d=1.211 std_dev=0.472
C2'	B	0, 0.097, 0.573, 1.049, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.573 std_dev=0.476
P	B	0, 0.606, 1.091, 1.575, 1.618 max_d=1.618 avg_d=1.091 std_dev=0.484
O4'	B	0, 0.719, 1.249, 1.778, 1.693 max_d=1.693 avg_d=1.249 std_dev=0.529
OP1	B	0, 0.663, 1.291, 1.920, 2.042 max_d=2.042 avg_d=1.291 std_dev=0.629
P	A	0, 0.705, 1.342, 1.979, 1.905 max_d=1.905 avg_d=1.342 std_dev=0.637
O2'	B	0, 0.994, 1.651, 2.308, 2.244 max_d=2.244 avg_d=1.651 std_dev=0.657
OP2	A	0, 0.766, 1.441, 2.117, 2.043 max_d=2.043 avg_d=1.441 std_dev=0.676
OP1	A	0, 0.911, 1.650, 2.388, 2.296 max_d=2.296 avg_d=1.650 std_dev=0.739
C3'	B	0, 1.108, 1.869, 2.631, 2.409 max_d=2.409 avg_d=1.869 std_dev=0.762
C4'	B	0, 1.025, 1.841, 2.658, 2.510 max_d=2.510 avg_d=1.841 std_dev=0.816
C5'	B	0, 1.245, 2.271, 3.296, 3.046 max_d=3.046 avg_d=2.271 std_dev=1.025
O3'	B	0, 1.581, 2.729, 3.878, 3.611 max_d=3.611 avg_d=2.729 std_dev=1.149

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.03
C2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.02	0.07	0.08	0.08	0.08
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.06	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.04	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.06	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.08	0.02	0.12	0.14	0.15	0.13
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.14	0.17	0.17	0.15
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.09	0.05	0.06	0.08	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.03	0.13	0.14	0.13	0.12
N1	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.08	0.08	0.08	0.08
N3	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.09	0.10	0.11	0.10
N4	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.02	0.12	0.16	0.17	0.15
O2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.06	0.04	0.05	0.05	0.07	0.06
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.09	0.00	0.03	0.03	0.02	0.05	0.04	0.02
O3'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.08	0.03	0.12	0.05	0.11	0.04	0.05	0.08	0.06	0.03	0.00	0.03	0.06	0.08	0.08	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03	0.06	0.04
O5'	0.02	0.07	0.02	0.04	0.12	0.01	0.14	0.00	0.13	0.08	0.09	0.12	0.05	0.02	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.08	0.04	0.05	0.14	0.04	0.17	0.04	0.14	0.08	0.10	0.16	0.05	0.05	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.08	0.05	0.06	0.15	0.03	0.17	0.01	0.13	0.08	0.11	0.17	0.07	0.04	0.08	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.08	0.03	0.04	0.13	0.01	0.15	0.01	0.12	0.08	0.10	0.15	0.06	0.02	0.07	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.16	0.12	0.07	0.11	0.10	0.14	0.41	0.19	0.24	0.20	0.24	0.09	0.20	0.22	0.41	0.06	0.12	0.36	0.24	0.07	0.06	0.07
C2	0.19	0.12	0.06	0.19	0.05	0.20	0.10	0.39	0.17	0.10	0.15	0.16	0.12	0.14	0.11	0.14	0.18	0.18	0.46	0.25	0.09	0.12	0.08
C2'	0.34	0.16	0.18	0.04	0.15	0.06	0.18	0.42	0.18	0.29	0.18	0.26	0.09	0.25	0.26	0.42	0.04	0.12	0.38	0.21	0.04	0.08	0.11
C3'	0.38	0.15	0.29	0.11	0.19	0.13	0.20	0.24	0.18	0.30	0.19	0.25	0.11	0.25	0.29	0.34	0.10	0.28	0.19	0.20	0.11	0.04	0.02
C4	0.19	0.15	0.15	0.32	0.13	0.25	0.11	0.36	0.17	0.10	0.12	0.19	0.18	0.13	0.14	0.15	0.27	0.19	0.40	0.28	0.23	0.19	0.12
C4'	0.38	0.17	0.25	0.12	0.17	0.12	0.18	0.29	0.20	0.28	0.22	0.26	0.10	0.23	0.27	0.43	0.12	0.24	0.11	0.24	0.22	0.07	0.03
C5	0.20	0.14	0.13	0.29	0.11	0.25	0.10	0.35	0.19	0.09	0.17	0.20	0.17	0.11	0.13	0.11	0.26	0.21	0.34	0.30	0.31	0.21	0.15
C5'	0.36	0.18	0.30	0.13	0.17	0.17	0.17	0.19	0.21	0.26	0.24	0.26	0.12	0.21	0.26	0.35	0.14	0.29	0.03	0.26	0.36	0.13	0.09
C6	0.24	0.13	0.08	0.22	0.08	0.20	0.09	0.31	0.19	0.12	0.20	0.20	0.14	0.11	0.15	0.09	0.20	0.20	0.33	0.28	0.28	0.18	0.14
N1	0.23	0.13	0.04	0.16	0.07	0.15	0.11	0.35	0.19	0.15	0.19	0.20	0.11	0.15	0.15	0.19	0.13	0.14	0.39	0.26	0.14	0.11	0.08
N3	0.18	0.13	0.13	0.27	0.10	0.23	0.07	0.37	0.15	0.08	0.10	0.16	0.16	0.10	0.12	0.08	0.24	0.19	0.46	0.25	0.13	0.15	0.09
N4	0.19	0.18	0.20	0.37	0.16	0.28	0.16	0.38	0.17	0.17	0.12	0.22	0.19	0.19	0.17	0.28	0.32	0.20	0.40	0.29	0.25	0.20	0.13
O2	0.17	0.12	0.11	0.15	0.06	0.26	0.15	0.47	0.19	0.16	0.15	0.16	0.11	0.21	0.10	0.27	0.23	0.26	0.51	0.25	0.10	0.10	0.12
O2'	0.36	0.16	0.24	0.10	0.14	0.17	0.18	0.59	0.17	0.32	0.17	0.26	0.10	0.27	0.27	0.70	0.10	0.11	0.38	0.20	0.15	0.09	0.15
O3'	0.46	0.12	0.38	0.24	0.24	0.27	0.23	0.22	0.17	0.36	0.15	0.20	0.15	0.30	0.35	0.44	0.22	0.41	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00
O4'	0.33	0.18	0.16	0.04	0.12	0.04	0.15	0.34	0.21	0.24	0.25	0.27	0.08	0.19	0.23	0.42	0.05	0.14	0.23	0.27	0.18	0.06	0.02
O5'	0.29	0.19	0.33	0.08	0.15	0.15	0.17	0.11	0.23	0.20	0.26	0.27	0.12	0.18	0.20	0.25	0.08	0.28	0.11	0.27	0.39	0.16	0.09
OP1	0.31	0.19	0.45	0.17	0.17	0.25	0.17	0.11	0.22	0.21	0.25	0.25	0.16	0.18	0.22	0.35	0.16	0.37	0.15	0.26	0.51	0.24	0.16
OP2	0.21	0.22	0.47	0.08	0.16	0.15	0.20	0.07	0.28	0.16	0.31	0.26	0.15	0.18	0.16	0.44	0.08	0.27	0.16	0.33	0.45	0.22	0.13
P	0.27	0.20	0.40	0.10	0.15	0.18	0.17	0.05	0.25	0.18	0.28	0.26	0.14	0.17	0.19	0.31	0.10	0.31	0.10	0.30	0.46	0.22	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.00	0.26	0.02	0.21	0.38	0.24
C2	0.01	0.00	0.37	0.25	0.00	0.23	0.01	0.33	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.56	0.26	0.18	0.44	0.00	0.10	0.10	0.13
C2'	0.00	0.37	0.00	0.00	0.19	0.02	0.09	0.16	0.16	0.19	0.28	0.45	0.37	0.11	0.03	0.00	0.01	0.03	0.57	0.12	0.59	0.40	0.45
C3'	0.02	0.25	0.00	0.00	0.25	0.00	0.31	0.02	0.33	0.26	0.30	0.22	0.21	0.31	0.20	0.01	0.00	0.03	0.31	0.35	0.44	0.17	0.19
C4	0.01	0.00	0.19	0.25	0.00	0.16	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.41	0.16	0.09	0.41	0.01	0.15	0.25	0.14
C4'	0.01	0.23	0.02	0.00	0.16	0.00	0.16	0.00	0.19	0.06	0.22	0.24	0.21	0.10	0.09	0.29	0.01	0.01	0.02	0.19	0.10	0.43	0.17
C5	0.01	0.01	0.09	0.31	0.00	0.16	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.40	0.18	0.03	0.41	0.01	0.14	0.21	0.13
C5'	0.04	0.33	0.16	0.02	0.22	0.00	0.23	0.00	0.29	0.11	0.33	0.35	0.29	0.17	0.12	0.12	0.19	0.01	0.01	0.29	0.22	0.37	0.02
C6	0.01	0.00	0.16	0.33	0.00	0.19	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.49	0.24	0.06	0.44	0.00	0.12	0.14	0.12
C8	0.01	0.01	0.19	0.26	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.10	0.08	0.34	0.02	0.18	0.31	0.19
N1	0.01	0.00	0.28	0.30	0.01	0.22	0.00	0.33	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.56	0.28	0.13	0.44	0.01	0.10	0.09	0.13
N2	0.02	0.00	0.45	0.22	0.01	0.24	0.01	0.35	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.59	0.28	0.22	0.43	0.01	0.07	0.12	0.17
N3	0.01	0.00	0.37	0.21	0.00	0.21	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.20	0.19	0.44	0.00	0.13	0.21	0.12
N7	0.01	0.01	0.11	0.31	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.11	0.05	0.38	0.02	0.16	0.26	0.16
N9	0.01	0.01	0.03	0.20	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.12	0.01	0.34	0.01	0.18	0.33	0.19
O2'	0.01	0.56	0.00	0.01	0.41	0.29	0.40	0.12	0.49	0.14	0.56	0.59	0.49	0.26	0.22	0.00	0.02	0.18	0.23	0.49	0.32	0.34	0.24
O3'	0.27	0.26	0.01	0.00	0.16	0.01	0.18	0.19	0.24	0.10	0.28	0.28	0.20	0.11	0.12	0.02	0.00	0.14	0.03	0.25	0.21	0.31	0.08
O4'	0.00	0.18	0.03	0.03	0.09	0.01	0.03	0.01	0.06	0.08	0.13	0.22	0.19	0.05	0.01	0.18	0.14	0.00	0.06	0.04	0.18	0.58	0.32
O5'	0.26	0.44	0.57	0.31	0.41	0.02	0.41	0.01	0.44	0.34	0.44	0.43	0.44	0.38	0.34	0.23	0.03	0.06	0.00	0.44	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.12	0.35	0.01	0.19	0.01	0.29	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.49	0.25	0.04	0.44	0.00	0.11	0.12	0.13
OP1	0.21	0.10	0.59	0.44	0.15	0.10	0.14	0.22	0.12	0.18	0.10	0.07	0.13	0.16	0.18	0.32	0.21	0.18	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00
OP2	0.38	0.10	0.40	0.17	0.25	0.43	0.21	0.37	0.14	0.31	0.09	0.12	0.21	0.26	0.33	0.34	0.31	0.58	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.13	0.45	0.19	0.14	0.17	0.13	0.02	0.12	0.19	0.13	0.17	0.12	0.16	0.19	0.24	0.08	0.32	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00