Doublet Group distance statistics: 52092

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.009, 0.021, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.013, 0.026, 0.038, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.027, 0.047, 0.068, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.047 std_dev=0.021
C6	A	0, 0.013, 0.034, 0.056, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.034 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.018, 0.042, 0.067, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.042 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.007, 0.031, 0.056, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.031 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.024, 0.068, 0.113, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.068 std_dev=0.044
O2	A	0, 0.038, 0.112, 0.186, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.112 std_dev=0.074
C5	B	0, 0.114, 0.279, 0.443, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.279 std_dev=0.165
C4	B	0, 0.171, 0.337, 0.503, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.337 std_dev=0.166
C6	B	0, 0.159, 0.330, 0.500, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.330 std_dev=0.170
O4'	A	0, 0.024, 0.195, 0.365, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.195 std_dev=0.170
C2'	A	0, 0.010, 0.191, 0.371, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.191 std_dev=0.181
N9	B	0, 0.210, 0.402, 0.595, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.402 std_dev=0.193
O2'	A	0, 0.159, 0.355, 0.551, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.355 std_dev=0.196
C8	B	0, 0.192, 0.389, 0.585, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.389 std_dev=0.196
N7	B	0, 0.130, 0.344, 0.557, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.344 std_dev=0.214
O6	B	0, 0.223, 0.442, 0.660, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.442 std_dev=0.219
C4'	A	0, 0.073, 0.293, 0.513, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.293 std_dev=0.220
N3	B	0, 0.218, 0.439, 0.661, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.439 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.121, 0.352, 0.582, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.352 std_dev=0.231
C2	B	0, 0.202, 0.440, 0.678, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.440 std_dev=0.238
C1'	B	0, 0.293, 0.563, 0.834, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.563 std_dev=0.271
C3'	A	0, 0.083, 0.360, 0.636, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.360 std_dev=0.277
C2'	B	0, 0.273, 0.572, 0.871, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.572 std_dev=0.299
C3'	B	0, 0.276, 0.585, 0.893, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.585 std_dev=0.308
N2	B	0, 0.300, 0.609, 0.918, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.609 std_dev=0.309
O4'	B	0, 0.337, 0.649, 0.961, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.649 std_dev=0.312
P	A	0, 0.331, 0.653, 0.975, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.653 std_dev=0.322
C4'	B	0, 0.350, 0.692, 1.033, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.692 std_dev=0.341
O5'	A	0, 0.271, 0.623, 0.976, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.623 std_dev=0.352
OP2	A	0, 0.412, 0.791, 1.171, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.791 std_dev=0.379
C5'	B	0, 0.393, 0.776, 1.158, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.776 std_dev=0.382
O3'	B	0, 0.239, 0.629, 1.020, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.629 std_dev=0.391
O5'	B	0, 0.352, 0.745, 1.137, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.745 std_dev=0.392
O2'	B	0, 0.321, 0.741, 1.162, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.741 std_dev=0.420
O3'	A	0, 0.150, 0.576, 1.001, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.576 std_dev=0.425
C5'	A	0, 0.035, 0.468, 0.901, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.468 std_dev=0.433
P	B	0, 0.417, 0.895, 1.372, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.895 std_dev=0.478
OP2	B	0, 0.425, 0.941, 1.456, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.941 std_dev=0.516
OP1	A	0, 0.402, 0.931, 1.461, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.931 std_dev=0.530
OP1	B	0, 0.490, 1.047, 1.605, 1.613 max_d=1.613 avg_d=1.047 std_dev=0.557

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.09	0.02	0.03	0.01	0.10	0.05	0.40	0.10
C2	0.05	0.00	0.11	0.15	0.02	0.08	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.12	0.12	0.06	0.22	0.11	0.41	0.14
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.02	0.09	0.02	0.10	0.05	0.09	0.08	0.18	0.00	0.01	0.01	0.25	0.24	0.30	0.13
C3'	0.03	0.15	0.00	0.00	0.19	0.00	0.22	0.02	0.22	0.14	0.17	0.20	0.18	0.01	0.01	0.01	0.29	0.30	0.29	0.19
C4	0.04	0.02	0.07	0.19	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.20	0.02	0.32	0.22	0.41	0.21
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.11	0.08	0.09	0.11	0.10	0.11	0.02	0.00	0.02	0.13	0.34	0.05
C5	0.01	0.02	0.09	0.22	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.25	0.04	0.33	0.23	0.41	0.22
C5'	0.02	0.11	0.02	0.02	0.16	0.00	0.17	0.00	0.15	0.11	0.14	0.18	0.11	0.09	0.03	0.01	0.00	0.13	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.22	0.01	0.11	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.23	0.05	0.29	0.16	0.42	0.17
N1	0.02	0.01	0.05	0.14	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.11	0.02	0.21	0.09	0.41	0.13
N3	0.05	0.01	0.09	0.17	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.12	0.15	0.05	0.28	0.16	0.41	0.18
N4	0.04	0.03	0.08	0.20	0.00	0.11	0.01	0.18	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.09	0.22	0.02	0.34	0.26	0.40	0.24
O2	0.09	0.01	0.18	0.18	0.03	0.10	0.02	0.11	0.01	0.02	0.03	0.05	0.00	0.19	0.18	0.10	0.18	0.08	0.41	0.13
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.08	0.11	0.06	0.09	0.07	0.04	0.12	0.09	0.19	0.00	0.06	0.10	0.10	0.20	0.32	0.07
O3'	0.03	0.12	0.01	0.01	0.20	0.02	0.25	0.03	0.23	0.11	0.15	0.22	0.18	0.06	0.00	0.03	0.25	0.39	0.34	0.25
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.10	0.10	0.03	0.00	0.10	0.10	0.46	0.19
O5'	0.10	0.22	0.25	0.29	0.32	0.02	0.33	0.00	0.29	0.21	0.28	0.34	0.18	0.10	0.25	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.05	0.11	0.24	0.30	0.22	0.13	0.23	0.13	0.16	0.09	0.16	0.26	0.08	0.20	0.39	0.10	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.41	0.30	0.29	0.41	0.34	0.41	0.29	0.42	0.41	0.41	0.40	0.41	0.32	0.34	0.46	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.14	0.13	0.19	0.21	0.05	0.22	0.01	0.17	0.13	0.18	0.24	0.13	0.07	0.25	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.32	0.26	0.14	0.24	0.17	0.16	0.15	0.11	0.19	0.21	0.39	0.31	0.18	0.23	0.36	0.10	0.23	0.19	0.13	0.31	0.30	0.24
C2	0.29	0.20	0.28	0.19	0.22	0.23	0.16	0.22	0.10	0.24	0.08	0.26	0.26	0.21	0.26	0.36	0.15	0.27	0.24	0.19	0.32	0.30	0.26
C2'	0.25	0.28	0.23	0.14	0.23	0.18	0.17	0.20	0.15	0.18	0.22	0.32	0.28	0.16	0.23	0.31	0.11	0.23	0.28	0.09	0.41	0.46	0.36
C3'	0.32	0.28	0.30	0.20	0.30	0.23	0.29	0.17	0.27	0.31	0.25	0.28	0.30	0.31	0.31	0.37	0.16	0.31	0.18	0.29	0.31	0.34	0.24
C4	0.15	0.12	0.12	0.06	0.07	0.10	0.11	0.14	0.08	0.23	0.10	0.18	0.09	0.22	0.16	0.15	0.05	0.16	0.19	0.13	0.31	0.27	0.24
C4'	0.25	0.25	0.25	0.12	0.23	0.14	0.23	0.08	0.20	0.27	0.19	0.31	0.26	0.28	0.24	0.34	0.08	0.23	0.11	0.27	0.28	0.25	0.18
C5	0.11	0.15	0.08	0.05	0.10	0.03	0.13	0.08	0.11	0.20	0.12	0.19	0.13	0.22	0.13	0.12	0.13	0.12	0.12	0.13	0.28	0.22	0.18
C5'	0.27	0.22	0.26	0.14	0.24	0.17	0.27	0.12	0.24	0.32	0.18	0.26	0.24	0.35	0.27	0.34	0.09	0.27	0.12	0.33	0.29	0.24	0.18
C6	0.15	0.21	0.13	0.02	0.15	0.05	0.14	0.09	0.13	0.19	0.16	0.25	0.19	0.21	0.15	0.19	0.08	0.14	0.14	0.15	0.29	0.25	0.20
N1	0.23	0.24	0.22	0.11	0.20	0.14	0.15	0.15	0.09	0.20	0.15	0.30	0.25	0.20	0.21	0.30	0.06	0.20	0.18	0.15	0.30	0.28	0.23
N3	0.27	0.13	0.26	0.19	0.16	0.22	0.14	0.24	0.11	0.26	0.11	0.20	0.15	0.22	0.25	0.31	0.13	0.26	0.26	0.17	0.34	0.31	0.29
N4	0.10	0.17	0.06	0.02	0.06	0.07	0.11	0.15	0.11	0.23	0.15	0.22	0.13	0.21	0.12	0.07	0.10	0.13	0.22	0.12	0.34	0.30	0.28
O2	0.34	0.24	0.34	0.25	0.25	0.29	0.17	0.27	0.13	0.25	0.10	0.30	0.31	0.21	0.29	0.45	0.23	0.33	0.27	0.22	0.34	0.31	0.28
O2'	0.24	0.33	0.21	0.15	0.24	0.19	0.16	0.25	0.16	0.15	0.27	0.41	0.31	0.12	0.21	0.29	0.12	0.22	0.33	0.08	0.44	0.49	0.40
O3'	0.36	0.31	0.32	0.23	0.35	0.28	0.36	0.23	0.35	0.38	0.32	0.29	0.33	0.39	0.37	0.37	0.19	0.37	0.23	0.37	0.32	0.35	0.26
O4'	0.20	0.26	0.22	0.08	0.17	0.09	0.13	0.08	0.10	0.18	0.15	0.36	0.26	0.21	0.17	0.34	0.05	0.17	0.13	0.21	0.29	0.27	0.21
O5'	0.32	0.42	0.35	0.27	0.33	0.28	0.27	0.34	0.29	0.22	0.38	0.47	0.41	0.19	0.29	0.40	0.24	0.27	0.38	0.23	0.56	0.50	0.45
OP1	0.31	0.25	0.30	0.27	0.25	0.32	0.24	0.33	0.20	0.36	0.23	0.30	0.24	0.33	0.30	0.33	0.25	0.36	0.34	0.19	0.44	0.42	0.40
OP2	0.40	0.39	0.41	0.34	0.40	0.34	0.40	0.31	0.40	0.40	0.39	0.39	0.40	0.40	0.40	0.43	0.34	0.39	0.32	0.39	0.49	0.43	0.39
P	0.23	0.23	0.25	0.17	0.20	0.19	0.18	0.22	0.17	0.23	0.20	0.27	0.23	0.21	0.22	0.29	0.15	0.24	0.24	0.15	0.42	0.36	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.03	0.11	0.17	0.13
C2	0.02	0.00	0.06	0.11	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.12	0.04	0.24	0.01	0.27	0.41	0.30
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.07	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.03	0.09	0.08	0.06
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.10	0.08	0.11	0.11	0.10	0.09	0.07	0.02	0.01	0.01	0.03	0.11	0.10	0.03	0.04
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.25	0.02	0.27	0.39	0.29
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.05	0.04	0.03	0.07	0.04	0.09	0.03	0.00	0.01	0.07	0.05	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.03	0.30	0.02	0.36	0.48	0.37
C5'	0.04	0.10	0.02	0.02	0.12	0.01	0.15	0.00	0.16	0.16	0.13	0.09	0.08	0.18	0.11	0.08	0.04	0.02	0.01	0.18	0.05	0.01	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.13	0.04	0.31	0.01	0.39	0.52	0.39
C8	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.16	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.03	0.29	0.03	0.33	0.40	0.34
N1	0.02	0.01	0.05	0.11	0.02	0.05	0.02	0.13	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.13	0.04	0.28	0.01	0.34	0.48	0.35
N2	0.04	0.01	0.07	0.11	0.02	0.04	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.13	0.06	0.23	0.01	0.24	0.40	0.28
N3	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.04	0.22	0.02	0.22	0.36	0.26
N7	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.07	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.12	0.03	0.32	0.04	0.40	0.50	0.40
N9	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.23	0.03	0.23	0.31	0.25
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.03	0.09	0.03	0.08	0.04	0.03	0.06	0.05	0.06	0.03	0.02	0.00	0.04	0.07	0.05	0.04	0.03	0.05	0.06
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.09	0.03	0.11	0.04	0.13	0.09	0.13	0.13	0.10	0.12	0.06	0.04	0.00	0.03	0.11	0.14	0.14	0.13	0.11
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.06	0.04	0.03	0.01	0.07	0.03	0.00	0.08	0.05	0.07	0.10	0.09
O5'	0.12	0.24	0.06	0.03	0.25	0.01	0.30	0.01	0.31	0.29	0.28	0.23	0.22	0.32	0.23	0.05	0.11	0.08	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.03	0.11	0.02	0.07	0.02	0.18	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.14	0.05	0.33	0.00	0.44	0.57	0.43
OP1	0.11	0.27	0.09	0.10	0.27	0.05	0.36	0.05	0.39	0.33	0.34	0.24	0.22	0.40	0.23	0.03	0.14	0.07	0.01	0.44	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.41	0.08	0.03	0.39	0.02	0.48	0.01	0.52	0.40	0.48	0.40	0.36	0.50	0.31	0.05	0.13	0.10	0.01	0.57	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.30	0.06	0.04	0.29	0.02	0.37	0.02	0.39	0.34	0.35	0.28	0.26	0.40	0.25	0.06	0.11	0.09	0.01	0.43	0.01	0.01	0.00