Doublet Group distance statistics: 52093

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.004, 0.006, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.001, 0.010, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.012, 0.022, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.001, 0.018, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.017
O2	A	0, 0.007, 0.031, 0.055, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.031 std_dev=0.024
C2'	A	0, -0.069, 0.177, 0.424, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.177 std_dev=0.247
O4'	A	0, -0.082, 0.184, 0.451, 0.754 max_d=0.754 avg_d=0.184 std_dev=0.267
C2	B	0, 0.067, 0.362, 0.656, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.362 std_dev=0.294
N3	B	0, 0.048, 0.360, 0.672, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.360 std_dev=0.312
O2'	A	0, -0.103, 0.224, 0.552, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.224 std_dev=0.328
N1	B	0, 0.064, 0.393, 0.722, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.393 std_dev=0.329
C4	B	0, -0.011, 0.352, 0.714, 1.070 max_d=1.070 avg_d=0.352 std_dev=0.363
N2	B	0, 0.045, 0.434, 0.823, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.434 std_dev=0.389
O2'	B	0, 0.131, 0.533, 0.935, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.533 std_dev=0.402
O5'	A	0, -0.041, 0.364, 0.770, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.364 std_dev=0.406
N9	B	0, 0.015, 0.433, 0.851, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.433 std_dev=0.418
C6	B	0, 0.026, 0.455, 0.885, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.455 std_dev=0.429
C5	B	0, -0.012, 0.422, 0.855, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.422 std_dev=0.434
C2'	B	0, 0.096, 0.540, 0.983, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.540 std_dev=0.443
C3'	B	0, 0.068, 0.517, 0.965, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.517 std_dev=0.449
C1'	B	0, 0.039, 0.490, 0.941, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.490 std_dev=0.451
C4'	B	0, 0.036, 0.488, 0.940, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.488 std_dev=0.452
O4'	B	0, 0.013, 0.483, 0.953, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.483 std_dev=0.470
O3'	B	0, 0.089, 0.568, 1.048, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.568 std_dev=0.480
C3'	A	0, -0.162, 0.322, 0.806, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.322 std_dev=0.484
C8	B	0, 0.038, 0.538, 1.039, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.538 std_dev=0.501
N7	B	0, 0.023, 0.556, 1.089, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.556 std_dev=0.533
OP1	B	0, -0.027, 0.510, 1.047, 1.602 max_d=1.602 avg_d=0.510 std_dev=0.537
C4'	A	0, -0.213, 0.345, 0.904, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.345 std_dev=0.559
P	B	0, -0.070, 0.489, 1.048, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.489 std_dev=0.559
O6	B	0, 0.010, 0.570, 1.130, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.570 std_dev=0.560
C5'	B	0, -0.064, 0.497, 1.059, 1.522 max_d=1.522 avg_d=0.497 std_dev=0.561
O3'	A	0, -0.185, 0.417, 1.019, 1.711 max_d=1.711 avg_d=0.417 std_dev=0.602
O5'	B	0, -0.093, 0.628, 1.348, 2.012 max_d=2.012 avg_d=0.628 std_dev=0.720
P	A	0, -0.106, 0.811, 1.729, 2.273 max_d=2.273 avg_d=0.811 std_dev=0.918
OP2	B	0, -0.250, 0.720, 1.690, 2.730 max_d=2.730 avg_d=0.720 std_dev=0.970
C5'	A	0, -0.378, 0.631, 1.639, 2.829 max_d=2.829 avg_d=0.631 std_dev=1.008
OP1	A	0, -0.159, 1.069, 2.297, 3.334 max_d=3.334 avg_d=1.069 std_dev=1.228
OP2	A	0, -0.457, 1.095, 2.647, 4.430 max_d=4.430 avg_d=1.095 std_dev=1.552

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00	0.07	0.22	0.11	0.27
C2	0.03	0.00	0.10	0.21	0.01	0.05	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.19	0.05	0.05	0.31	0.45	0.39
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.09	0.02	0.08	0.04	0.18	0.00	0.00	0.00	0.23	0.23	0.43	0.28
C3'	0.02	0.21	0.01	0.00	0.23	0.00	0.18	0.01	0.14	0.15	0.25	0.25	0.20	0.01	0.01	0.02	0.34	0.43	0.63	0.46
C4	0.02	0.01	0.03	0.23	0.00	0.17	0.00	0.40	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.24	0.02	0.04	0.42	0.89	0.54
C4'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.17	0.00	0.22	0.00	0.20	0.09	0.10	0.19	0.05	0.08	0.01	0.00	0.01	0.08	0.15	0.09
C5	0.01	0.01	0.08	0.18	0.00	0.22	0.00	0.47	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.20	0.07	0.07	0.43	0.97	0.56
C5'	0.03	0.17	0.02	0.01	0.40	0.00	0.47	0.00	0.40	0.21	0.28	0.44	0.04	0.07	0.01	0.01	0.00	0.23	0.06	0.00
C6	0.01	0.00	0.09	0.14	0.00	0.20	0.00	0.40	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.09	0.03	0.36	0.74	0.48
N1	0.01	0.00	0.02	0.15	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.04	0.29	0.44	0.38
N3	0.02	0.00	0.08	0.25	0.00	0.10	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.24	0.03	0.02	0.36	0.67	0.47
N4	0.02	0.01	0.04	0.25	0.00	0.19	0.00	0.44	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.27	0.03	0.06	0.47	1.03	0.59
O2	0.05	0.00	0.18	0.20	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.18	0.11	0.10	0.29	0.26	0.34
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.14	0.08	0.14	0.07	0.10	0.07	0.12	0.16	0.05	0.00	0.03	0.12	0.02	0.09	0.48	0.17
O3'	0.00	0.19	0.00	0.01	0.24	0.01	0.20	0.01	0.14	0.13	0.24	0.27	0.18	0.03	0.00	0.00	0.30	0.60	1.04	0.64
O4'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.03	0.03	0.11	0.12	0.00	0.00	0.03	0.27	0.24	0.35
O5'	0.07	0.05	0.23	0.34	0.04	0.01	0.07	0.00	0.03	0.04	0.02	0.06	0.10	0.02	0.30	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.22	0.31	0.23	0.43	0.42	0.08	0.43	0.23	0.36	0.29	0.36	0.47	0.29	0.09	0.60	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.45	0.43	0.63	0.89	0.15	0.97	0.06	0.74	0.44	0.67	1.03	0.26	0.48	1.04	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.39	0.28	0.46	0.54	0.09	0.56	0.00	0.48	0.38	0.47	0.59	0.34	0.17	0.64	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.45	0.10	0.42	0.33	0.31	0.31	0.39	0.15	0.28	0.60	0.13	0.31	0.10	0.55	0.47	0.40	0.37	0.28	0.46	0.33	0.21	0.30	0.08
C2	0.29	0.07	0.28	0.16	0.30	0.15	0.44	0.21	0.34	0.59	0.13	0.26	0.07	0.60	0.41	0.28	0.19	0.14	0.25	0.40	0.18	0.57	0.10
C2'	0.35	0.16	0.35	0.33	0.19	0.32	0.22	0.19	0.15	0.39	0.12	0.31	0.12	0.33	0.31	0.33	0.37	0.25	0.52	0.17	0.35	0.08	0.21
C3'	0.13	0.54	0.19	0.21	0.23	0.23	0.19	0.22	0.31	0.07	0.46	0.73	0.43	0.06	0.08	0.25	0.26	0.19	0.25	0.29	0.02	0.23	0.01
C4	0.32	0.18	0.32	0.18	0.40	0.17	0.51	0.25	0.46	0.52	0.28	0.20	0.24	0.57	0.42	0.30	0.17	0.22	0.27	0.48	0.05	0.75	0.20
C4'	0.23	0.49	0.22	0.18	0.07	0.20	0.10	0.24	0.20	0.31	0.39	0.76	0.33	0.24	0.16	0.27	0.25	0.14	0.15	0.20	0.24	0.45	0.18
C5	0.41	0.20	0.39	0.27	0.42	0.27	0.47	0.23	0.40	0.53	0.26	0.17	0.30	0.53	0.46	0.34	0.25	0.34	0.40	0.41	0.07	0.72	0.19
C5'	0.07	0.80	0.13	0.24	0.32	0.26	0.30	0.42	0.50	0.11	0.72	1.11	0.59	0.15	0.08	0.19	0.28	0.19	0.05	0.49	0.51	0.67	0.36
C6	0.45	0.11	0.41	0.31	0.39	0.32	0.43	0.22	0.34	0.55	0.19	0.18	0.23	0.53	0.48	0.36	0.30	0.37	0.47	0.36	0.07	0.61	0.13
N1	0.41	0.06	0.37	0.26	0.34	0.25	0.42	0.17	0.32	0.58	0.15	0.26	0.12	0.56	0.46	0.34	0.28	0.26	0.39	0.36	0.13	0.51	0.05
N3	0.26	0.08	0.27	0.14	0.33	0.13	0.50	0.26	0.42	0.56	0.19	0.21	0.12	0.62	0.39	0.27	0.15	0.14	0.20	0.47	0.13	0.69	0.17
N4	0.28	0.26	0.30	0.16	0.37	0.14	0.50	0.27	0.51	0.47	0.37	0.25	0.26	0.54	0.37	0.29	0.15	0.20	0.22	0.56	0.03	0.81	0.25
O2	0.19	0.12	0.21	0.11	0.19	0.12	0.38	0.23	0.29	0.57	0.09	0.30	0.09	0.58	0.32	0.23	0.16	0.15	0.21	0.38	0.27	0.48	0.09
O2'	0.68	0.17	0.69	0.64	0.46	0.57	0.53	0.39	0.41	0.76	0.25	0.19	0.25	0.69	0.64	0.63	0.68	0.46	0.55	0.44	0.55	0.08	0.34
O3'	0.17	0.63	0.27	0.31	0.35	0.30	0.31	0.27	0.42	0.12	0.57	0.81	0.53	0.17	0.18	0.31	0.36	0.26	0.01	0.40	0.01	0.00	0.00
O4'	0.37	0.19	0.33	0.23	0.21	0.24	0.31	0.14	0.23	0.52	0.15	0.45	0.07	0.48	0.38	0.34	0.28	0.22	0.35	0.28	0.07	0.41	0.06
O5'	0.42	0.28	0.35	0.27	0.24	0.29	0.30	0.17	0.28	0.47	0.31	0.50	0.13	0.41	0.37	0.32	0.27	0.31	0.53	0.32	0.26	0.10	0.10
OP1	0.37	0.48	0.36	0.38	0.22	0.36	0.26	0.41	0.39	0.35	0.52	0.71	0.27	0.29	0.29	0.30	0.40	0.30	0.77	0.43	0.52	0.48	0.53
OP2	0.50	0.72	0.60	0.63	0.20	0.66	0.34	0.61	0.64	0.26	0.84	1.02	0.34	0.21	0.24	0.65	0.78	0.46	1.08	0.75	0.72	0.80	0.93
P	0.44	0.38	0.45	0.45	0.06	0.48	0.10	0.43	0.28	0.31	0.43	0.62	0.12	0.17	0.27	0.45	0.50	0.40	0.87	0.34	0.30	0.44	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.02	0.60	0.19	0.14
C2	0.02	0.00	0.06	0.21	0.01	0.27	0.01	0.55	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.27	0.07	0.24	0.01	0.34	1.12	0.61
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.62	0.14	0.12
C3'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.19	0.01	0.22	0.01	0.25	0.16	0.24	0.20	0.18	0.20	0.14	0.01	0.01	0.04	0.16	0.26	0.56	0.15	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.19	0.00	0.19	0.00	0.39	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.20	0.05	0.09	0.02	0.18	0.70	0.26
C4'	0.02	0.27	0.01	0.01	0.19	0.00	0.19	0.01	0.24	0.08	0.27	0.29	0.24	0.14	0.10	0.08	0.01	0.00	0.00	0.24	0.52	0.13	0.10
C5	0.01	0.01	0.03	0.22	0.00	0.19	0.00	0.43	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.24	0.04	0.13	0.02	0.19	0.76	0.28
C5'	0.05	0.55	0.02	0.01	0.39	0.01	0.43	0.00	0.52	0.24	0.56	0.57	0.46	0.35	0.23	0.07	0.05	0.03	0.01	0.53	0.36	0.21	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.25	0.01	0.24	0.01	0.52	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.29	0.05	0.20	0.00	0.16	0.96	0.43
C8	0.01	0.02	0.02	0.16	0.01	0.08	0.02	0.24	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.17	0.13	0.01	0.05	0.04	0.51	0.40	0.06
N1	0.02	0.00	0.05	0.24	0.01	0.27	0.01	0.56	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.29	0.06	0.25	0.01	0.30	1.12	0.58
N2	0.04	0.00	0.07	0.20	0.02	0.29	0.01	0.57	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.11	0.28	0.08	0.31	0.02	0.59	1.33	0.80
N3	0.02	0.01	0.05	0.18	0.01	0.24	0.00	0.46	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.21	0.06	0.15	0.01	0.15	0.88	0.44
N7	0.01	0.01	0.02	0.20	0.00	0.14	0.01	0.35	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.19	0.03	0.07	0.04	0.37	0.58	0.12
N9	0.01	0.02	0.01	0.14	0.01	0.10	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.07	0.11	0.02	0.04	0.03	0.43	0.43	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.08	0.10	0.07	0.09	0.17	0.05	0.11	0.06	0.17	0.07	0.00	0.04	0.12	0.13	0.12	0.63	0.09	0.12
O3'	0.02	0.27	0.01	0.01	0.20	0.01	0.24	0.05	0.29	0.13	0.29	0.28	0.21	0.19	0.11	0.04	0.00	0.02	0.30	0.31	0.62	0.03	0.16
O4'	0.01	0.07	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.03	0.05	0.01	0.06	0.08	0.06	0.03	0.02	0.12	0.02	0.00	0.19	0.05	0.44	0.24	0.06
O5'	0.14	0.24	0.04	0.16	0.09	0.00	0.13	0.01	0.20	0.05	0.25	0.31	0.15	0.07	0.04	0.13	0.30	0.19	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.26	0.02	0.24	0.02	0.53	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.12	0.31	0.05	0.22	0.00	0.17	1.00	0.45
OP1	0.60	0.34	0.62	0.56	0.18	0.52	0.19	0.36	0.16	0.51	0.30	0.59	0.15	0.37	0.43	0.63	0.62	0.44	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	1.12	0.14	0.15	0.70	0.13	0.76	0.21	0.96	0.40	1.12	1.33	0.88	0.58	0.43	0.09	0.03	0.24	0.01	1.00	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.61	0.12	0.10	0.26	0.10	0.28	0.01	0.43	0.06	0.58	0.80	0.44	0.12	0.06	0.12	0.16	0.06	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00