Doublet Group distance statistics: 52095

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.022 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.001, 0.024, 0.046, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.024 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.010, 0.039, 0.067, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.039 std_dev=0.029
N1	A	0, 0.007, 0.036, 0.066, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.036 std_dev=0.030
C5	A	0, 0.006, 0.036, 0.065, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.036 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.004, 0.038, 0.072, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.038 std_dev=0.034
N4	A	0, -0.003, 0.043, 0.088, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.043 std_dev=0.045
O2	A	0, 0.013, 0.063, 0.112, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.063 std_dev=0.049
O4'	A	0, 0.180, 0.416, 0.651, 0.693 max_d=0.693 avg_d=0.416 std_dev=0.235
C2'	A	0, 0.252, 0.569, 0.885, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.569 std_dev=0.316
N7	B	0, 0.264, 0.606, 0.947, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.606 std_dev=0.342
C5	B	0, 0.091, 0.454, 0.816, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.454 std_dev=0.363
C4	B	0, 0.140, 0.523, 0.906, 1.008 max_d=1.008 avg_d=0.523 std_dev=0.383
N9	B	0, 0.227, 0.614, 1.000, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.614 std_dev=0.386
C8	B	0, 0.273, 0.672, 1.071, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.672 std_dev=0.399
N3	B	0, 0.274, 0.683, 1.091, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.683 std_dev=0.409
C4'	A	0, 0.468, 0.906, 1.344, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.906 std_dev=0.438
O5'	A	0, 0.530, 0.969, 1.407, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.969 std_dev=0.438
C6	B	0, 0.039, 0.483, 0.927, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.483 std_dev=0.444
C1'	B	0, 0.362, 0.827, 1.292, 1.435 max_d=1.435 avg_d=0.827 std_dev=0.465
C5'	A	0, 0.562, 1.050, 1.537, 1.523 max_d=1.523 avg_d=1.050 std_dev=0.488
C2'	B	0, 0.451, 0.947, 1.442, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.947 std_dev=0.495
C2	B	0, 0.177, 0.697, 1.218, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.697 std_dev=0.520
O6	B	0, 0.037, 0.580, 1.123, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.580 std_dev=0.543
N1	B	0, 0.007, 0.560, 1.114, 1.720 max_d=1.720 avg_d=0.560 std_dev=0.554
C3'	A	0, 0.603, 1.158, 1.713, 1.555 max_d=1.555 avg_d=1.158 std_dev=0.555
O2'	A	0, 0.599, 1.188, 1.778, 1.779 max_d=1.779 avg_d=1.188 std_dev=0.589
N2	B	0, 0.273, 0.918, 1.564, 2.180 max_d=2.180 avg_d=0.918 std_dev=0.645
O2'	B	0, 0.209, 0.955, 1.701, 2.464 max_d=2.464 avg_d=0.955 std_dev=0.746
P	A	0, 0.564, 1.431, 2.298, 2.788 max_d=2.788 avg_d=1.431 std_dev=0.867
O4'	B	0, 0.996, 1.974, 2.953, 2.947 max_d=2.947 avg_d=1.974 std_dev=0.978
O3'	A	0, 0.999, 2.021, 3.043, 2.846 max_d=2.846 avg_d=2.021 std_dev=1.022
OP1	A	0, 0.805, 1.870, 2.935, 3.320 max_d=3.320 avg_d=1.870 std_dev=1.065
C3'	B	0, 1.333, 2.439, 3.545, 3.280 max_d=3.280 avg_d=2.439 std_dev=1.106
OP2	A	0, 0.591, 1.771, 2.950, 3.678 max_d=3.678 avg_d=1.771 std_dev=1.179
C4'	B	0, 1.406, 2.615, 3.823, 3.700 max_d=3.700 avg_d=2.615 std_dev=1.209
O3'	B	0, 1.704, 3.224, 4.744, 4.210 max_d=4.210 avg_d=3.224 std_dev=1.520
C5'	B	0, 1.671, 3.228, 4.784, 4.621 max_d=4.621 avg_d=3.228 std_dev=1.557
O5'	B	0, 2.300, 4.218, 6.136, 5.539 max_d=5.539 avg_d=4.218 std_dev=1.918
OP2	B	0, 2.480, 4.562, 6.643, 6.129 max_d=6.129 avg_d=4.562 std_dev=2.081
P	B	0, 2.529, 4.682, 6.835, 6.213 max_d=6.213 avg_d=4.682 std_dev=2.153
OP1	B	0, 3.016, 5.562, 8.107, 7.225 max_d=7.225 avg_d=5.562 std_dev=2.545

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.05	0.08	0.07	0.24	0.01	0.16	0.09	0.32	0.08
C2	0.05	0.00	0.19	0.28	0.02	0.07	0.05	0.09	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.14	0.08	0.06	0.20	0.15	0.52	0.23
C2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.05	0.02	0.18	0.17	0.23	0.02	0.14	0.06	0.38	0.01	0.04	0.02	0.51	0.38	0.80	0.48
C3'	0.03	0.28	0.01	0.00	0.32	0.00	0.26	0.02	0.21	0.22	0.32	0.34	0.30	0.01	0.01	0.03	0.28	0.25	0.42	0.26
C4	0.05	0.02	0.05	0.32	0.00	0.13	0.01	0.19	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.28	0.15	0.04	0.26	0.35	0.70	0.42
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.13	0.00	0.13	0.01	0.13	0.09	0.09	0.14	0.09	0.34	0.01	0.01	0.05	0.18	0.08	0.12
C5	0.04	0.05	0.18	0.26	0.01	0.13	0.00	0.20	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.35	0.16	0.05	0.28	0.39	0.70	0.45
C5'	0.03	0.09	0.17	0.02	0.19	0.01	0.20	0.00	0.17	0.10	0.13	0.22	0.07	0.17	0.16	0.04	0.02	0.09	0.10	0.04
C6	0.04	0.05	0.23	0.21	0.01	0.13	0.01	0.17	0.00	0.02	0.04	0.02	0.05	0.31	0.13	0.08	0.23	0.27	0.54	0.32
N1	0.02	0.01	0.02	0.22	0.03	0.09	0.02	0.10	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.15	0.08	0.01	0.18	0.14	0.46	0.20
N3	0.04	0.01	0.14	0.32	0.02	0.09	0.04	0.13	0.04	0.01	0.00	0.02	0.03	0.20	0.10	0.05	0.23	0.24	0.63	0.33
N4	0.05	0.03	0.06	0.34	0.01	0.14	0.02	0.22	0.02	0.03	0.02	0.00	0.05	0.32	0.18	0.05	0.29	0.42	0.77	0.49
O2	0.08	0.01	0.38	0.30	0.04	0.09	0.05	0.07	0.05	0.02	0.03	0.05	0.00	0.24	0.14	0.06	0.16	0.12	0.44	0.14
O2'	0.07	0.14	0.01	0.01	0.28	0.34	0.35	0.17	0.31	0.15	0.20	0.32	0.24	0.00	0.04	0.28	0.20	0.19	0.54	0.16
O3'	0.24	0.08	0.04	0.01	0.15	0.01	0.16	0.16	0.13	0.08	0.10	0.18	0.14	0.04	0.00	0.17	0.16	0.20	0.22	0.14
O4'	0.01	0.06	0.02	0.03	0.04	0.01	0.05	0.04	0.08	0.01	0.05	0.05	0.06	0.28	0.17	0.00	0.12	0.26	0.15	0.23
O5'	0.16	0.20	0.51	0.28	0.26	0.05	0.28	0.02	0.23	0.18	0.23	0.29	0.16	0.20	0.16	0.12	0.00	0.04	0.05	0.02
OP1	0.09	0.15	0.38	0.25	0.35	0.18	0.39	0.09	0.27	0.14	0.24	0.42	0.12	0.19	0.20	0.26	0.04	0.00	0.05	0.02
OP2	0.32	0.52	0.80	0.42	0.70	0.08	0.70	0.10	0.54	0.46	0.63	0.77	0.44	0.54	0.22	0.15	0.05	0.05	0.00	0.02
P	0.08	0.23	0.48	0.26	0.42	0.12	0.45	0.04	0.32	0.20	0.33	0.49	0.14	0.16	0.14	0.23	0.02	0.02	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.14	0.15	0.25	0.08	0.13	0.14	0.19	0.24	0.07	0.19	0.20	0.09	0.12	0.04	0.16	0.22	0.04	0.50	0.36	0.56	0.59	0.54
C2	0.08	0.32	0.16	0.26	0.16	0.13	0.17	0.11	0.29	0.03	0.35	0.39	0.23	0.08	0.07	0.13	0.26	0.07	0.40	0.31	0.46	0.47	0.43
C2'	0.08	0.19	0.22	0.21	0.07	0.12	0.20	0.30	0.27	0.19	0.11	0.29	0.16	0.29	0.06	0.33	0.22	0.10	0.58	0.56	0.69	0.75	0.68
C3'	0.49	0.60	0.52	0.40	0.49	0.30	0.40	0.12	0.40	0.35	0.56	0.60	0.56	0.32	0.45	0.65	0.44	0.40	0.30	0.25	0.39	0.42	0.36
C4	0.09	0.21	0.18	0.32	0.12	0.23	0.14	0.23	0.18	0.15	0.19	0.27	0.18	0.21	0.07	0.22	0.29	0.15	0.50	0.23	0.56	0.59	0.53
C4'	0.25	0.35	0.24	0.24	0.28	0.10	0.25	0.12	0.27	0.21	0.36	0.33	0.31	0.23	0.25	0.32	0.22	0.20	0.44	0.23	0.56	0.57	0.51
C5	0.10	0.16	0.21	0.38	0.13	0.31	0.19	0.34	0.23	0.15	0.18	0.20	0.15	0.23	0.10	0.24	0.38	0.16	0.59	0.32	0.65	0.65	0.62
C5'	0.31	0.47	0.26	0.27	0.39	0.18	0.39	0.24	0.45	0.31	0.53	0.45	0.42	0.36	0.34	0.34	0.26	0.28	0.53	0.46	0.67	0.66	0.61
C6	0.09	0.14	0.16	0.34	0.11	0.27	0.15	0.33	0.20	0.10	0.17	0.19	0.13	0.16	0.08	0.17	0.31	0.12	0.59	0.27	0.65	0.65	0.62
N1	0.05	0.16	0.13	0.26	0.08	0.16	0.11	0.20	0.20	0.05	0.19	0.22	0.11	0.09	0.03	0.12	0.21	0.05	0.49	0.26	0.55	0.56	0.52
N3	0.09	0.32	0.15	0.28	0.15	0.16	0.12	0.15	0.21	0.06	0.31	0.39	0.25	0.07	0.06	0.13	0.26	0.12	0.42	0.19	0.47	0.49	0.44
N4	0.11	0.21	0.26	0.37	0.13	0.28	0.18	0.29	0.18	0.27	0.18	0.28	0.20	0.32	0.11	0.35	0.38	0.23	0.55	0.28	0.61	0.71	0.61
O2	0.10	0.45	0.19	0.27	0.23	0.10	0.25	0.07	0.40	0.09	0.50	0.53	0.31	0.14	0.12	0.16	0.34	0.10	0.34	0.43	0.39	0.40	0.36
O2'	0.57	0.62	0.37	0.48	0.71	0.62	0.88	0.79	1.02	0.78	0.81	0.51	0.59	0.89	0.68	0.21	0.28	0.67	1.01	1.28	1.04	1.11	1.09
O3'	0.40	0.50	0.44	0.34	0.40	0.24	0.33	0.11	0.32	0.30	0.47	0.52	0.46	0.28	0.37	0.56	0.38	0.34	0.27	0.20	0.35	0.38	0.32
O4'	0.07	0.08	0.13	0.27	0.05	0.16	0.05	0.22	0.06	0.08	0.08	0.13	0.07	0.10	0.07	0.12	0.23	0.06	0.52	0.11	0.61	0.61	0.57
O5'	0.27	0.17	0.34	0.47	0.22	0.48	0.23	0.60	0.19	0.27	0.17	0.17	0.19	0.26	0.25	0.37	0.49	0.33	0.77	0.20	0.85	0.83	0.82
OP1	0.50	0.24	0.51	0.69	0.38	0.78	0.43	0.99	0.31	0.58	0.24	0.24	0.30	0.55	0.48	0.51	0.68	0.64	1.13	0.32	1.28	1.28	1.26
OP2	1.00	0.64	1.05	1.20	0.85	1.30	0.86	1.47	0.71	1.02	0.58	0.60	0.76	0.96	0.96	1.05	1.21	1.11	1.55	0.62	1.60	1.60	1.61
P	0.58	0.29	0.62	0.79	0.46	0.87	0.49	1.05	0.37	0.62	0.25	0.26	0.38	0.58	0.55	0.63	0.80	0.69	1.17	0.34	1.29	1.28	1.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.02	0.02	0.05	0.04	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.15	0.08	0.14	0.28	0.17
C2	0.03	0.00	0.18	0.11	0.02	0.06	0.02	0.13	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.26	0.20	0.13	0.22	0.04	0.22	0.23	0.20
C2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.02	0.08	0.07	0.12	0.10	0.15	0.22	0.18	0.08	0.03	0.01	0.04	0.02	0.07	0.13	0.17	0.28	0.13
C3'	0.04	0.11	0.00	0.00	0.08	0.01	0.12	0.03	0.13	0.17	0.12	0.14	0.12	0.18	0.08	0.03	0.03	0.10	0.06	0.15	0.19	0.19	0.10
C4	0.02	0.02	0.10	0.08	0.00	0.07	0.02	0.14	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.16	0.09	0.08	0.26	0.06	0.25	0.24	0.22
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.07	0.00	0.12	0.02	0.09	0.22	0.08	0.11	0.07	0.22	0.10	0.12	0.07	0.02	0.04	0.07	0.16	0.13	0.04
C5	0.03	0.02	0.08	0.12	0.02	0.12	0.00	0.21	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.16	0.06	0.05	0.38	0.06	0.35	0.30	0.33
C5'	0.04	0.13	0.07	0.03	0.14	0.02	0.21	0.00	0.19	0.27	0.18	0.13	0.10	0.31	0.14	0.06	0.10	0.05	0.01	0.17	0.19	0.12	0.05
C6	0.04	0.01	0.12	0.13	0.03	0.09	0.02	0.19	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.19	0.09	0.05	0.38	0.01	0.37	0.35	0.35
C8	0.02	0.03	0.10	0.17	0.01	0.22	0.01	0.27	0.03	0.00	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.15	0.12	0.09	0.43	0.11	0.35	0.28	0.32
N1	0.02	0.02	0.15	0.12	0.02	0.08	0.02	0.18	0.01	0.02	0.00	0.06	0.03	0.03	0.02	0.22	0.14	0.11	0.32	0.05	0.31	0.29	0.29
N2	0.05	0.02	0.22	0.14	0.03	0.11	0.04	0.13	0.05	0.04	0.06	0.00	0.03	0.05	0.03	0.33	0.27	0.15	0.17	0.11	0.18	0.21	0.16
N3	0.04	0.02	0.18	0.12	0.01	0.07	0.02	0.10	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.26	0.21	0.12	0.17	0.03	0.17	0.22	0.16
N7	0.02	0.03	0.08	0.18	0.02	0.22	0.01	0.31	0.04	0.01	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.15	0.13	0.09	0.49	0.13	0.42	0.35	0.41
N9	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.10	0.02	0.14	0.04	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.09	0.03	0.05	0.26	0.09	0.23	0.24	0.20
O2'	0.06	0.26	0.01	0.03	0.16	0.12	0.16	0.06	0.19	0.15	0.22	0.33	0.26	0.15	0.09	0.00	0.05	0.09	0.07	0.21	0.15	0.29	0.10
O3'	0.12	0.20	0.04	0.03	0.09	0.07	0.06	0.10	0.09	0.12	0.14	0.27	0.21	0.13	0.03	0.05	0.00	0.13	0.07	0.11	0.26	0.17	0.09
O4'	0.01	0.13	0.02	0.10	0.08	0.02	0.05	0.05	0.05	0.09	0.11	0.15	0.12	0.09	0.05	0.09	0.13	0.00	0.20	0.04	0.18	0.33	0.24
O5'	0.15	0.22	0.07	0.06	0.26	0.04	0.38	0.01	0.38	0.43	0.32	0.17	0.17	0.49	0.26	0.07	0.07	0.20	0.00	0.41	0.03	0.01	0.01
O6	0.08	0.04	0.13	0.15	0.06	0.07	0.06	0.17	0.01	0.11	0.05	0.11	0.03	0.13	0.09	0.21	0.11	0.04	0.41	0.00	0.41	0.42	0.40
OP1	0.14	0.22	0.17	0.19	0.25	0.16	0.35	0.19	0.37	0.35	0.31	0.18	0.17	0.42	0.23	0.15	0.26	0.18	0.03	0.41	0.00	0.03	0.01
OP2	0.28	0.23	0.28	0.19	0.24	0.13	0.30	0.12	0.35	0.28	0.29	0.21	0.22	0.35	0.24	0.29	0.17	0.33	0.01	0.42	0.03	0.00	0.02
P	0.17	0.20	0.13	0.10	0.22	0.04	0.33	0.05	0.35	0.32	0.29	0.16	0.16	0.41	0.20	0.10	0.09	0.24	0.01	0.40	0.01	0.02	0.00