Doublet Group distance statistics: 52097

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.013, 0.026, 0.039, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.014, 0.028, 0.041, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.027 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.030 std_dev=0.015
O2	A	0, 0.036, 0.069, 0.102, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.069 std_dev=0.033
N4	A	0, 0.047, 0.086, 0.125, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.086 std_dev=0.039
N3	B	0, 0.174, 0.380, 0.586, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.380 std_dev=0.206
C4	B	0, 0.230, 0.476, 0.721, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.476 std_dev=0.246
N9	B	0, 0.338, 0.629, 0.919, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.629 std_dev=0.290
C2	B	0, 0.315, 0.612, 0.909, 0.967 max_d=0.967 avg_d=0.612 std_dev=0.297
C1'	B	0, 0.400, 0.729, 1.058, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.729 std_dev=0.329
C5	B	0, 0.381, 0.738, 1.094, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.738 std_dev=0.357
N2	B	0, 0.451, 0.832, 1.213, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.832 std_dev=0.381
N1	B	0, 0.439, 0.836, 1.233, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.836 std_dev=0.397
O2'	A	0, 0.442, 0.843, 1.244, 1.228 max_d=1.228 avg_d=0.843 std_dev=0.401
O4'	B	0, 0.415, 0.819, 1.224, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.819 std_dev=0.405
C2'	A	0, 0.495, 0.910, 1.325, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.910 std_dev=0.415
C8	B	0, 0.498, 0.916, 1.333, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.916 std_dev=0.418
C6	B	0, 0.471, 0.901, 1.331, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.901 std_dev=0.430
N7	B	0, 0.517, 0.965, 1.413, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.965 std_dev=0.448
O4'	A	0, 0.540, 0.990, 1.440, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.990 std_dev=0.450
O6	B	0, 0.639, 1.197, 1.755, 1.665 max_d=1.665 avg_d=1.197 std_dev=0.558
C4'	B	0, 0.539, 1.111, 1.684, 1.815 max_d=1.815 avg_d=1.111 std_dev=0.573
C3'	B	0, 0.589, 1.249, 1.910, 1.943 max_d=1.943 avg_d=1.249 std_dev=0.660
C4'	A	0, 0.831, 1.508, 2.186, 1.940 max_d=1.940 avg_d=1.508 std_dev=0.677
C3'	A	0, 0.845, 1.536, 2.227, 2.000 max_d=2.000 avg_d=1.536 std_dev=0.691
OP1	B	0, 0.628, 1.329, 2.031, 2.314 max_d=2.314 avg_d=1.329 std_dev=0.702
O3'	B	0, 0.745, 1.452, 2.160, 2.187 max_d=2.187 avg_d=1.452 std_dev=0.708
P	B	0, 0.661, 1.386, 2.110, 2.331 max_d=2.331 avg_d=1.386 std_dev=0.724
C2'	B	0, 0.805, 1.559, 2.314, 2.195 max_d=2.195 avg_d=1.559 std_dev=0.755
OP2	B	0, 0.760, 1.587, 2.413, 2.693 max_d=2.693 avg_d=1.587 std_dev=0.826
O5'	B	0, 1.021, 1.933, 2.846, 2.728 max_d=2.728 avg_d=1.933 std_dev=0.913
O3'	A	0, 1.132, 2.061, 2.989, 2.658 max_d=2.658 avg_d=2.061 std_dev=0.929
C5'	B	0, 1.059, 2.020, 2.980, 2.986 max_d=2.986 avg_d=2.020 std_dev=0.960
C5'	A	0, 1.392, 2.532, 3.672, 3.328 max_d=3.328 avg_d=2.532 std_dev=1.140
O2'	B	0, 1.388, 2.553, 3.718, 3.282 max_d=3.282 avg_d=2.553 std_dev=1.165
O5'	A	0, 1.478, 2.692, 3.907, 3.573 max_d=3.573 avg_d=2.692 std_dev=1.215
P	A	0, 1.787, 3.263, 4.738, 4.334 max_d=4.334 avg_d=3.263 std_dev=1.475
OP2	A	0, 1.870, 3.419, 4.969, 4.553 max_d=4.553 avg_d=3.419 std_dev=1.549
OP1	A	0, 1.880, 3.436, 4.991, 4.540 max_d=4.540 avg_d=3.436 std_dev=1.555

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.05	0.08	0.09	0.05
C2	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.05	0.11	0.13	0.20	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.07	0.05	0.13	0.00	0.01	0.01	0.06	0.14	0.12	0.08
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.09	0.05	0.07	0.10	0.09	0.01	0.01	0.01	0.04	0.15	0.10	0.08
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.01	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.09	0.03	0.20	0.24	0.32	0.24
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.03	0.08	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.10	0.06	0.22	0.26	0.32	0.27
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.13	0.01	0.17	0.00	0.15	0.07	0.09	0.15	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.02	0.09	0.01	0.15	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.09	0.07	0.19	0.19	0.23	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.11	0.12	0.17	0.12
N3	0.01	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.04	0.15	0.19	0.26	0.19
N4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.02	0.15	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.03	0.21	0.28	0.36	0.28
O2	0.04	0.01	0.13	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.11	0.08	0.07	0.09	0.16	0.08
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.12	0.00	0.02	0.02	0.03	0.11	0.09	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.09	0.02	0.10	0.02	0.09	0.05	0.08	0.10	0.11	0.02	0.00	0.02	0.03	0.16	0.08	0.08
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.08	0.02	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.02
O5'	0.05	0.11	0.06	0.04	0.20	0.01	0.22	0.01	0.19	0.11	0.15	0.21	0.07	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.08	0.13	0.14	0.15	0.24	0.05	0.26	0.02	0.19	0.12	0.19	0.28	0.09	0.11	0.16	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.20	0.12	0.10	0.32	0.04	0.32	0.01	0.23	0.17	0.26	0.36	0.16	0.09	0.08	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.13	0.08	0.08	0.24	0.02	0.27	0.01	0.20	0.12	0.19	0.28	0.08	0.04	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.14	0.10	0.11	0.08	0.07	0.06	0.31	0.07	0.16	0.14	0.18	0.10	0.14	0.11	0.31	0.15	0.06	0.33	0.07	0.22	0.14	0.16
C2	0.10	0.11	0.07	0.15	0.07	0.09	0.10	0.29	0.06	0.17	0.10	0.17	0.07	0.18	0.11	0.18	0.15	0.09	0.30	0.08	0.19	0.11	0.13
C2'	0.08	0.11	0.07	0.14	0.08	0.11	0.08	0.35	0.09	0.12	0.11	0.13	0.09	0.12	0.08	0.27	0.17	0.03	0.40	0.08	0.25	0.19	0.23
C3'	0.23	0.13	0.23	0.03	0.19	0.13	0.20	0.36	0.14	0.29	0.12	0.12	0.16	0.28	0.23	0.42	0.07	0.16	0.29	0.12	0.20	0.16	0.15
C4	0.15	0.09	0.19	0.23	0.11	0.15	0.15	0.32	0.09	0.22	0.07	0.17	0.05	0.22	0.17	0.16	0.17	0.15	0.32	0.11	0.13	0.14	0.15
C4'	0.30	0.11	0.32	0.11	0.20	0.18	0.19	0.36	0.10	0.35	0.09	0.12	0.15	0.30	0.28	0.52	0.08	0.23	0.23	0.07	0.26	0.24	0.18
C5	0.14	0.13	0.14	0.21	0.08	0.15	0.11	0.34	0.03	0.23	0.10	0.19	0.09	0.22	0.16	0.20	0.17	0.13	0.35	0.05	0.12	0.15	0.16
C5'	0.43	0.13	0.46	0.25	0.28	0.30	0.27	0.43	0.14	0.47	0.09	0.09	0.22	0.39	0.39	0.66	0.17	0.35	0.26	0.09	0.37	0.39	0.31
C6	0.12	0.14	0.07	0.15	0.08	0.11	0.07	0.33	0.06	0.19	0.13	0.19	0.11	0.18	0.12	0.27	0.16	0.09	0.35	0.06	0.14	0.14	0.16
N1	0.11	0.14	0.06	0.13	0.07	0.08	0.07	0.30	0.05	0.17	0.13	0.18	0.10	0.16	0.11	0.25	0.15	0.07	0.32	0.03	0.19	0.11	0.14
N3	0.12	0.09	0.14	0.20	0.09	0.12	0.14	0.30	0.11	0.19	0.09	0.16	0.05	0.21	0.14	0.15	0.16	0.13	0.31	0.14	0.16	0.13	0.14
N4	0.20	0.08	0.27	0.27	0.16	0.18	0.18	0.31	0.14	0.24	0.09	0.15	0.07	0.23	0.21	0.22	0.19	0.20	0.31	0.15	0.12	0.16	0.15
O2	0.09	0.11	0.05	0.14	0.07	0.07	0.10	0.26	0.08	0.16	0.11	0.17	0.07	0.17	0.10	0.18	0.15	0.09	0.29	0.11	0.22	0.11	0.13
O2'	0.03	0.15	0.04	0.16	0.07	0.14	0.07	0.37	0.13	0.05	0.16	0.17	0.11	0.04	0.04	0.24	0.18	0.05	0.43	0.15	0.26	0.23	0.26
O3'	0.25	0.17	0.27	0.05	0.22	0.14	0.23	0.36	0.19	0.30	0.17	0.16	0.19	0.29	0.25	0.44	0.06	0.19	0.26	0.17	0.19	0.13	0.12
O4'	0.24	0.13	0.24	0.08	0.16	0.11	0.14	0.29	0.08	0.28	0.12	0.17	0.14	0.24	0.22	0.47	0.12	0.18	0.23	0.05	0.26	0.18	0.14
O5'	0.48	0.18	0.50	0.27	0.34	0.33	0.32	0.44	0.19	0.52	0.14	0.13	0.27	0.44	0.45	0.69	0.18	0.40	0.25	0.14	0.36	0.40	0.31
OP1	0.53	0.22	0.61	0.43	0.35	0.48	0.30	0.60	0.19	0.50	0.17	0.19	0.31	0.38	0.47	0.76	0.32	0.47	0.46	0.13	0.48	0.64	0.51
OP2	0.64	0.33	0.69	0.45	0.46	0.48	0.40	0.50	0.30	0.59	0.29	0.29	0.41	0.47	0.58	0.85	0.32	0.55	0.35	0.25	0.45	0.49	0.41
P	0.58	0.25	0.63	0.42	0.40	0.45	0.35	0.53	0.23	0.56	0.20	0.21	0.34	0.44	0.52	0.81	0.30	0.49	0.37	0.17	0.45	0.54	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.09	0.02	0.20	0.33	0.16
C2	0.02	0.00	0.13	0.11	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.10	0.13	0.16	0.02	0.16	0.23	0.10
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03	0.11	0.06	0.07	0.11	0.16	0.13	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.05	0.31	0.41	0.25
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.10	0.00	0.12	0.02	0.14	0.09	0.13	0.11	0.09	0.12	0.08	0.02	0.01	0.01	0.05	0.15	0.22	0.29	0.20
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.06	0.20	0.01	0.18	0.23	0.11
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.11	0.06	0.09	0.06	0.11	0.05	0.10	0.02	0.00	0.02	0.08	0.06	0.25	0.09
C5	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.07	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.03	0.28	0.01	0.20	0.17	0.14
C5'	0.09	0.18	0.11	0.02	0.19	0.01	0.24	0.00	0.24	0.27	0.21	0.17	0.16	0.28	0.19	0.10	0.07	0.02	0.00	0.25	0.11	0.15	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.07	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.06	0.28	0.00	0.20	0.17	0.15
C8	0.01	0.02	0.07	0.09	0.01	0.11	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.15	0.07	0.07	0.32	0.01	0.21	0.17	0.15
N1	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.10	0.22	0.01	0.18	0.19	0.11
N2	0.04	0.00	0.16	0.11	0.02	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.15	0.11	0.15	0.12	0.02	0.16	0.25	0.11
N3	0.02	0.01	0.13	0.09	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.09	0.12	0.14	0.01	0.16	0.26	0.10
N7	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.11	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.14	0.10	0.04	0.34	0.01	0.23	0.15	0.18
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.01	0.21	0.01	0.19	0.25	0.12
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.10	0.07	0.10	0.05	0.15	0.06	0.15	0.10	0.14	0.06	0.00	0.06	0.07	0.02	0.07	0.31	0.40	0.23
O3'	0.07	0.10	0.05	0.01	0.08	0.02	0.10	0.07	0.12	0.07	0.11	0.11	0.09	0.10	0.06	0.06	0.00	0.04	0.06	0.13	0.11	0.20	0.12
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.06	0.07	0.10	0.15	0.12	0.04	0.01	0.07	0.04	0.00	0.12	0.04	0.18	0.35	0.19
O5'	0.09	0.16	0.03	0.05	0.20	0.02	0.28	0.00	0.28	0.32	0.22	0.12	0.14	0.34	0.21	0.02	0.06	0.12	0.00	0.32	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.02	0.05	0.15	0.01	0.08	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.04	0.32	0.00	0.23	0.17	0.18
OP1	0.20	0.16	0.31	0.22	0.18	0.06	0.20	0.11	0.20	0.21	0.18	0.16	0.16	0.23	0.19	0.31	0.11	0.18	0.02	0.23	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.23	0.41	0.29	0.23	0.25	0.17	0.15	0.17	0.17	0.19	0.25	0.26	0.15	0.25	0.40	0.20	0.35	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.10	0.25	0.20	0.11	0.09	0.14	0.01	0.15	0.15	0.11	0.11	0.10	0.18	0.12	0.23	0.12	0.19	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00