Doublet Group distance statistics: 52100

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.002, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.002 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.000, 0.003, 0.005, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.003 std_dev=0.003
O2	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C1'	B	0, 0.000, 0.196, 0.392, 0.392 max_d=0.392 avg_d=0.196 std_dev=0.196
C4'	B	0, 0.000, 0.242, 0.485, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.242 std_dev=0.242
O4'	B	0, 0.000, 0.287, 0.575, 0.575 max_d=0.575 avg_d=0.287 std_dev=0.287
O3'	B	0, 0.000, 0.311, 0.623, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.311 std_dev=0.311
C3'	B	0, 0.000, 0.313, 0.627, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.313 std_dev=0.313
N9	B	0, 0.000, 0.321, 0.641, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.321 std_dev=0.321
C2'	B	0, 0.000, 0.347, 0.694, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.347 std_dev=0.347
C4	B	0, 0.000, 0.452, 0.903, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.452 std_dev=0.452
C5'	B	0, 0.000, 0.465, 0.931, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.465 std_dev=0.465
O4'	A	0, 0.000, 0.500, 1.000, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.500 std_dev=0.500
N3	B	0, 0.000, 0.514, 1.028, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.514 std_dev=0.514
O2'	B	0, 0.000, 0.523, 1.045, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.523 std_dev=0.523
C8	B	0, 0.000, 0.540, 1.080, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.540 std_dev=0.540
C2'	A	0, 0.000, 0.573, 1.146, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.573 std_dev=0.573
C5	B	0, 0.000, 0.675, 1.350, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.675 std_dev=0.675
N7	B	0, 0.000, 0.723, 1.446, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.723 std_dev=0.723
C2	B	0, 0.000, 0.751, 1.501, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.751 std_dev=0.751
O5'	A	0, 0.000, 0.784, 1.567, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.784 std_dev=0.784
C4'	A	0, 0.000, 0.791, 1.583, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.791 std_dev=0.791
C3'	A	0, 0.000, 0.847, 1.694, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.847 std_dev=0.847
C6	B	0, 0.000, 0.893, 1.786, 1.786 max_d=1.786 avg_d=0.893 std_dev=0.893
N1	B	0, 0.000, 0.899, 1.799, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.899 std_dev=0.899
N2	B	0, 0.000, 0.920, 1.840, 1.840 max_d=1.840 avg_d=0.920 std_dev=0.920
O2'	A	0, 0.000, 0.930, 1.860, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.930 std_dev=0.930
C5'	A	0, 0.000, 0.987, 1.975, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.987 std_dev=0.987
O6	B	0, 0.000, 1.105, 2.209, 2.209 max_d=2.209 avg_d=1.105 std_dev=1.105
P	A	0, 0.000, 1.125, 2.249, 2.249 max_d=2.249 avg_d=1.125 std_dev=1.125
OP2	A	0, 0.000, 1.128, 2.255, 2.255 max_d=2.255 avg_d=1.128 std_dev=1.128
O3'	A	0, 0.000, 1.295, 2.591, 2.591 max_d=2.591 avg_d=1.295 std_dev=1.295
OP1	A	0, 0.000, 1.403, 2.807, 2.807 max_d=2.807 avg_d=1.403 std_dev=1.403
O5'	B	0, 0.000, 1.419, 2.839, 2.839 max_d=2.839 avg_d=1.419 std_dev=1.419
P	B	0, 0.000, 1.834, 3.668, 3.668 max_d=3.668 avg_d=1.834 std_dev=1.834
OP2	B	0, 0.000, 2.186, 4.373, 4.373 max_d=4.373 avg_d=2.186 std_dev=2.186
OP1	B	0, 0.000, 2.301, 4.602, 4.602 max_d=4.602 avg_d=2.301 std_dev=2.301

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.23	0.00	0.16	0.15	0.31	0.22
C2	0.00	0.00	0.13	0.19	0.00	0.00	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.10	0.14	0.25	0.43	0.31
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.17	0.16	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.02	0.00	0.33	0.31	0.43	0.37
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.25	0.00	0.23	0.00	0.18	0.16	0.23	0.27	0.15	0.00	0.00	0.02	0.03	0.09	0.07	0.04
C4	0.01	0.00	0.01	0.25	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.10	0.03	0.10	0.32	0.45	0.32
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.01	0.04	0.04	0.23	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.13	0.23	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.34	0.14	0.04	0.08	0.30	0.42	0.28
C5'	0.08	0.10	0.17	0.00	0.07	0.00	0.04	0.00	0.03	0.07	0.09	0.07	0.12	0.05	0.18	0.01	0.00	0.07	0.00	0.00
C6	0.02	0.01	0.16	0.18	0.00	0.07	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.07	0.07	0.10	0.25	0.38	0.26
N1	0.01	0.00	0.01	0.16	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.05	0.02	0.14	0.22	0.38	0.27
N3	0.01	0.00	0.09	0.23	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.02	0.09	0.13	0.30	0.46	0.33
N4	0.01	0.00	0.01	0.27	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.14	0.03	0.09	0.35	0.45	0.32
O2	0.00	0.00	0.24	0.15	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.17	0.15	0.16	0.23	0.42	0.31
O2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.26	0.23	0.34	0.05	0.31	0.16	0.15	0.28	0.10	0.00	0.03	0.16	0.23	0.19	0.46	0.28
O3'	0.23	0.07	0.02	0.00	0.10	0.00	0.14	0.18	0.07	0.05	0.02	0.14	0.17	0.03	0.00	0.17	0.21	0.42	0.25	0.25
O4'	0.00	0.10	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.15	0.16	0.17	0.00	0.02	0.01	0.15	0.09
O5'	0.16	0.14	0.33	0.03	0.10	0.00	0.08	0.00	0.10	0.14	0.13	0.09	0.16	0.23	0.21	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.15	0.25	0.31	0.09	0.32	0.06	0.30	0.07	0.25	0.22	0.30	0.35	0.23	0.19	0.42	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.31	0.43	0.43	0.07	0.45	0.04	0.42	0.00	0.38	0.38	0.46	0.45	0.42	0.46	0.25	0.15	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.22	0.31	0.37	0.04	0.32	0.03	0.28	0.00	0.26	0.27	0.33	0.32	0.31	0.28	0.25	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.06	0.23	0.22	0.16	0.09	0.34	0.07	0.41	0.29	0.27	0.12	0.00	0.40	0.15	0.30	0.20	0.01	0.69	0.52	0.77	1.04	0.76
C2	0.03	0.04	0.22	0.22	0.09	0.10	0.23	0.10	0.24	0.24	0.11	0.17	0.07	0.30	0.11	0.28	0.18	0.00	0.69	0.30	0.78	0.98	0.75
C2'	0.30	0.31	0.44	0.44	0.38	0.32	0.49	0.24	0.54	0.45	0.46	0.13	0.27	0.52	0.36	0.54	0.47	0.23	0.85	0.60	0.87	1.14	0.89
C3'	0.45	0.60	0.54	0.51	0.66	0.44	0.90	0.42	1.05	0.77	0.91	0.35	0.48	0.93	0.61	0.55	0.46	0.40	1.08	1.20	1.13	1.49	1.18
C4	0.01	0.31	0.17	0.20	0.09	0.14	0.03	0.15	0.06	0.21	0.23	0.39	0.25	0.22	0.04	0.14	0.14	0.08	0.87	0.01	1.06	1.21	0.98
C4'	0.17	0.36	0.26	0.24	0.39	0.18	0.63	0.18	0.78	0.50	0.65	0.19	0.24	0.67	0.33	0.26	0.18	0.14	0.83	0.97	0.93	1.25	0.95
C5	0.03	0.33	0.18	0.20	0.05	0.14	0.10	0.14	0.02	0.26	0.22	0.46	0.25	0.31	0.07	0.17	0.15	0.08	0.89	0.12	1.10	1.30	1.03
C5'	0.09	0.23	0.16	0.14	0.29	0.12	0.54	0.11	0.68	0.43	0.52	0.05	0.12	0.60	0.25	0.13	0.08	0.10	0.81	0.90	0.96	1.27	0.96
C6	0.04	0.22	0.20	0.20	0.04	0.12	0.22	0.11	0.20	0.29	0.04	0.40	0.18	0.37	0.11	0.22	0.16	0.05	0.83	0.32	0.99	1.23	0.95
N1	0.04	0.07	0.22	0.21	0.11	0.11	0.28	0.09	0.31	0.28	0.13	0.25	0.09	0.37	0.13	0.27	0.18	0.02	0.75	0.40	0.85	1.09	0.83
N3	0.01	0.17	0.21	0.21	0.01	0.13	0.10	0.13	0.07	0.20	0.07	0.25	0.17	0.22	0.06	0.22	0.16	0.04	0.76	0.12	0.89	1.03	0.83
N4	0.00	0.37	0.13	0.18	0.19	0.17	0.15	0.19	0.25	0.13	0.35	0.41	0.29	0.06	0.02	0.05	0.12	0.13	0.94	0.21	1.18	1.28	1.07
O2	0.02	0.11	0.23	0.22	0.15	0.08	0.26	0.08	0.30	0.21	0.23	0.02	0.05	0.28	0.12	0.32	0.20	0.04	0.58	0.34	0.63	0.82	0.61
O2'	0.07	0.16	0.15	0.15	0.08	0.05	0.01	0.17	0.04	0.00	0.04	0.30	0.17	0.04	0.07	0.34	0.25	0.19	0.40	0.10	0.38	0.66	0.40
O3'	0.25	0.63	0.31	0.26	0.59	0.22	0.88	0.22	1.12	0.67	1.02	0.44	0.41	0.89	0.47	0.28	0.17	0.20	0.84	1.35	0.87	1.30	0.96
O4'	0.02	0.13	0.11	0.09	0.18	0.02	0.41	0.03	0.53	0.31	0.39	0.03	0.02	0.46	0.14	0.12	0.03	0.04	0.67	0.70	0.79	1.08	0.78
O5'	0.05	0.03	0.13	0.12	0.19	0.09	0.44	0.10	0.54	0.39	0.31	0.18	0.01	0.55	0.19	0.09	0.06	0.08	0.84	0.77	1.02	1.32	1.00
OP1	0.08	0.04	0.07	0.07	0.06	0.04	0.28	0.06	0.38	0.22	0.19	0.20	0.10	0.37	0.05	0.12	0.12	0.02	0.71	0.61	0.94	1.20	0.90
OP2	0.27	0.34	0.24	0.24	0.17	0.20	0.06	0.18	0.13	0.07	0.11	0.50	0.36	0.22	0.15	0.32	0.31	0.18	0.61	0.38	0.89	1.15	0.83
P	0.15	0.15	0.11	0.11	0.01	0.10	0.23	0.09	0.32	0.19	0.10	0.32	0.20	0.34	0.01	0.17	0.18	0.09	0.68	0.56	0.92	1.19	0.88

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.37	0.01	0.35	0.40	0.34
C2	0.04	0.00	0.12	0.11	0.00	0.01	0.01	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.27	0.23	0.05	0.39	0.00	0.31	0.55	0.35
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.04	0.08	0.08	0.15	0.12	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.32	0.02	0.39	0.30	0.30
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.14	0.05	0.16	0.12	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.15	0.05	0.02
C4	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00	0.05	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.11	0.04	0.42	0.01	0.38	0.58	0.40
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.10	0.14	0.06	0.02	0.01	0.15	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.09	0.05	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.04	0.04	0.42	0.00	0.40	0.62	0.42
C5'	0.06	0.20	0.03	0.00	0.21	0.00	0.29	0.00	0.31	0.28	0.27	0.16	0.15	0.33	0.18	0.02	0.02	0.01	0.00	0.35	0.24	0.17	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.10	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.18	0.09	0.04	0.40	0.00	0.37	0.62	0.40
C8	0.02	0.00	0.08	0.14	0.00	0.14	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.00	0.46	0.00	0.48	0.63	0.49
N1	0.03	0.00	0.08	0.05	0.00	0.06	0.01	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.24	0.17	0.06	0.39	0.00	0.33	0.59	0.37
N2	0.06	0.00	0.15	0.16	0.00	0.02	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.31	0.31	0.05	0.38	0.01	0.28	0.54	0.33
N3	0.05	0.00	0.12	0.12	0.00	0.01	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.22	0.04	0.40	0.00	0.33	0.54	0.36
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.15	0.00	0.33	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.43	0.00	0.46	0.66	0.47
N9	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.02	0.01	0.45	0.00	0.42	0.56	0.43
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.17	0.00	0.13	0.02	0.18	0.02	0.24	0.31	0.25	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.28	0.16	0.36	0.31	0.28
O3'	0.03	0.23	0.01	0.00	0.11	0.01	0.04	0.02	0.09	0.09	0.17	0.31	0.22	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.13	0.06	0.05	0.17	0.13
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.04	0.00	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.32	0.04	0.27	0.32	0.28
O5'	0.37	0.39	0.32	0.02	0.42	0.00	0.42	0.00	0.40	0.46	0.39	0.38	0.40	0.43	0.45	0.28	0.13	0.32	0.00	0.39	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.12	0.00	0.35	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.06	0.04	0.39	0.00	0.38	0.63	0.40
OP1	0.35	0.31	0.39	0.15	0.38	0.09	0.40	0.24	0.37	0.48	0.33	0.28	0.33	0.46	0.42	0.36	0.05	0.27	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00
OP2	0.40	0.55	0.30	0.05	0.58	0.05	0.62	0.17	0.62	0.63	0.59	0.54	0.54	0.66	0.56	0.31	0.17	0.32	0.01	0.63	0.00	0.00	0.00
P	0.34	0.35	0.30	0.02	0.40	0.01	0.42	0.01	0.40	0.49	0.37	0.33	0.36	0.47	0.43	0.28	0.13	0.28	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00