Doublet Group distance statistics: 52108

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 11, 10, 11, 14, 7, 5, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.004, 0.006, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.010, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.007, 0.012, 0.017, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.005
O2	A	0, 0.019, 0.033, 0.047, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.033 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.032 std_dev=0.018
O2'	A	0, 0.119, 0.209, 0.300, 0.555 max_d=0.555 avg_d=0.209 std_dev=0.090
C2'	A	0, 0.027, 0.128, 0.230, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.128 std_dev=0.102
O4'	A	0, 0.003, 0.115, 0.227, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.115 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.019, 0.182, 0.344, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.182 std_dev=0.162
O5'	A	0, 0.153, 0.317, 0.480, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.317 std_dev=0.163
C3'	A	0, 0.028, 0.197, 0.366, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.197 std_dev=0.169
N1	B	0, 0.348, 0.533, 0.718, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.533 std_dev=0.185
C5	B	0, 0.278, 0.470, 0.663, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.470 std_dev=0.193
C6	B	0, 0.288, 0.483, 0.677, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.483 std_dev=0.195
C2	B	0, 0.373, 0.569, 0.765, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.569 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.300, 0.501, 0.703, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.501 std_dev=0.202
N3	B	0, 0.343, 0.552, 0.762, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.552 std_dev=0.209
C1'	B	0, 0.398, 0.614, 0.830, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.614 std_dev=0.216
P	A	0, 0.274, 0.505, 0.737, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.505 std_dev=0.231
N4	B	0, 0.299, 0.539, 0.779, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.539 std_dev=0.240
O3'	A	0, 0.043, 0.285, 0.527, 1.401 max_d=1.401 avg_d=0.285 std_dev=0.242
O3'	B	0, 0.492, 0.738, 0.984, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.738 std_dev=0.246
O2	B	0, 0.399, 0.653, 0.907, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.653 std_dev=0.254
O4'	B	0, 0.477, 0.735, 0.993, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.735 std_dev=0.258
C5'	A	0, 0.054, 0.320, 0.585, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.320 std_dev=0.265
OP2	A	0, 0.321, 0.593, 0.866, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.593 std_dev=0.273
OP1	A	0, 0.291, 0.573, 0.854, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.573 std_dev=0.282
C4'	B	0, 0.580, 0.866, 1.152, 1.584 max_d=1.584 avg_d=0.866 std_dev=0.286
C3'	B	0, 0.517, 0.818, 1.118, 1.526 max_d=1.526 avg_d=0.818 std_dev=0.300
O5'	B	0, 0.519, 0.873, 1.227, 1.998 max_d=1.998 avg_d=0.873 std_dev=0.354
P	B	0, 0.664, 1.044, 1.424, 2.443 max_d=2.443 avg_d=1.044 std_dev=0.380
C5'	B	0, 0.639, 1.033, 1.426, 2.071 max_d=2.071 avg_d=1.033 std_dev=0.393
OP1	B	0, 0.737, 1.135, 1.533, 2.516 max_d=2.516 avg_d=1.135 std_dev=0.398
C2'	B	0, 0.314, 0.724, 1.133, 2.287 max_d=2.287 avg_d=0.724 std_dev=0.410
OP2	B	0, 0.641, 1.067, 1.492, 2.558 max_d=2.558 avg_d=1.067 std_dev=0.425
O2'	B	0, 0.026, 0.704, 1.381, 3.479 max_d=3.479 avg_d=0.704 std_dev=0.678

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.06	0.04
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.06	0.08	0.09	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.06	0.04	0.09	0.00	0.01	0.00	0.05	0.13	0.12	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.07	0.07	0.10	0.01	0.00	0.01	0.07	0.17	0.14	0.10
C4	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.01	0.09	0.11	0.14	0.10
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.12	0.14	0.11
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.04	0.05	0.07	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.09	0.10	0.11	0.09
N1	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.08	0.08	0.06
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02	0.07	0.10	0.12	0.08
N4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02	0.10	0.12	0.15	0.12
O2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.12	0.03	0.05	0.08	0.09	0.05
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.04	0.08	0.00	0.02	0.03	0.03	0.13	0.09	0.05
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.07	0.04	0.09	0.09	0.12	0.02	0.00	0.01	0.09	0.22	0.17	0.14
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.06	0.06	0.07	0.08
O5'	0.04	0.06	0.05	0.07	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.06	0.07	0.10	0.05	0.03	0.09	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.08	0.13	0.17	0.11	0.07	0.12	0.05	0.10	0.08	0.10	0.12	0.08	0.13	0.22	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.09	0.12	0.14	0.14	0.03	0.14	0.01	0.11	0.08	0.12	0.15	0.09	0.09	0.17	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.06	0.07	0.10	0.10	0.01	0.11	0.01	0.09	0.06	0.08	0.12	0.05	0.05	0.14	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.18	0.14	0.26	0.19	0.22	0.17	0.33	0.14	0.12	0.22	0.26	0.22	0.36	0.13	0.16	0.11	0.15	0.22	0.14
C2	0.11	0.17	0.19	0.27	0.15	0.19	0.18	0.26	0.15	0.11	0.18	0.18	0.23	0.23	0.12	0.13	0.11	0.13	0.22	0.13
C2'	0.11	0.19	0.12	0.21	0.20	0.18	0.17	0.25	0.15	0.13	0.24	0.27	0.23	0.35	0.11	0.15	0.14	0.15	0.22	0.14
C3'	0.11	0.19	0.16	0.17	0.21	0.19	0.13	0.27	0.12	0.13	0.24	0.29	0.22	0.46	0.10	0.17	0.13	0.15	0.20	0.13
C4	0.12	0.17	0.23	0.29	0.10	0.22	0.14	0.29	0.13	0.11	0.15	0.11	0.23	0.25	0.13	0.15	0.12	0.15	0.21	0.14
C4'	0.12	0.20	0.16	0.23	0.21	0.26	0.14	0.39	0.12	0.13	0.24	0.29	0.22	0.49	0.13	0.21	0.12	0.19	0.22	0.16
C5	0.13	0.18	0.19	0.30	0.15	0.27	0.15	0.37	0.14	0.13	0.18	0.17	0.22	0.41	0.15	0.20	0.13	0.14	0.20	0.14
C5'	0.13	0.20	0.20	0.22	0.23	0.30	0.15	0.45	0.13	0.14	0.24	0.31	0.22	0.57	0.13	0.25	0.15	0.24	0.24	0.20
C6	0.12	0.18	0.16	0.28	0.18	0.27	0.17	0.37	0.14	0.13	0.20	0.22	0.22	0.43	0.15	0.20	0.12	0.14	0.20	0.14
N1	0.11	0.18	0.16	0.27	0.17	0.23	0.17	0.32	0.14	0.12	0.20	0.22	0.22	0.34	0.13	0.16	0.11	0.14	0.21	0.14
N3	0.11	0.16	0.23	0.27	0.11	0.19	0.17	0.24	0.15	0.10	0.15	0.13	0.23	0.19	0.12	0.12	0.11	0.14	0.22	0.13
N4	0.13	0.18	0.31	0.31	0.10	0.23	0.12	0.28	0.12	0.12	0.15	0.11	0.25	0.20	0.14	0.15	0.14	0.18	0.22	0.16
O2	0.11	0.17	0.19	0.26	0.16	0.17	0.20	0.23	0.16	0.12	0.18	0.21	0.23	0.19	0.12	0.12	0.12	0.14	0.23	0.14
O2'	0.12	0.21	0.12	0.22	0.22	0.18	0.19	0.24	0.17	0.14	0.25	0.28	0.25	0.31	0.11	0.15	0.15	0.15	0.22	0.14
O3'	0.13	0.20	0.19	0.16	0.21	0.18	0.13	0.25	0.13	0.14	0.25	0.30	0.23	0.46	0.11	0.17	0.17	0.17	0.21	0.14
O4'	0.12	0.19	0.17	0.29	0.20	0.29	0.15	0.42	0.13	0.13	0.22	0.26	0.22	0.45	0.16	0.22	0.13	0.20	0.24	0.18
O5'	0.12	0.17	0.23	0.20	0.23	0.28	0.16	0.44	0.12	0.12	0.22	0.31	0.19	0.62	0.11	0.24	0.13	0.21	0.20	0.16
OP1	0.12	0.15	0.30	0.16	0.22	0.25	0.17	0.43	0.12	0.11	0.20	0.30	0.15	0.69	0.12	0.22	0.14	0.27	0.17	0.17
OP2	0.12	0.13	0.32	0.15	0.21	0.26	0.18	0.44	0.12	0.10	0.18	0.28	0.13	0.71	0.12	0.22	0.12	0.21	0.12	0.12
P	0.12	0.15	0.28	0.17	0.22	0.27	0.17	0.45	0.11	0.11	0.20	0.30	0.16	0.69	0.12	0.23	0.12	0.21	0.14	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.16	0.00	0.08	0.20	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.14	0.07	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.12	0.12	0.11	0.13	0.23	0.10
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.09	0.11	0.03	0.12	0.06	0.23	0.00	0.02	0.02	0.37	0.52	0.38	0.42
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.01	0.11	0.07	0.10	0.13	0.05	0.01	0.01	0.01	0.26	0.46	0.25	0.33
C4	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.07	0.02	0.12	0.14	0.38	0.21
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.14	0.03	0.04	0.06	0.13	0.10	0.02	0.00	0.01	0.15	0.09	0.04
C5	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.13	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.07	0.11	0.14	0.20	0.41	0.25
C5'	0.03	0.09	0.09	0.01	0.10	0.01	0.20	0.00	0.20	0.07	0.08	0.11	0.18	0.04	0.09	0.02	0.01	0.05	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.11	0.11	0.01	0.14	0.00	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.29	0.07	0.14	0.13	0.15	0.33	0.21
N1	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.09	0.11	0.22	0.11
N3	0.02	0.00	0.12	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.08	0.11	0.10	0.30	0.14
N4	0.02	0.01	0.06	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.07	0.02	0.13	0.18	0.42	0.24
O2	0.04	0.00	0.23	0.05	0.01	0.13	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.36	0.16	0.20	0.12	0.20	0.17	0.09
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.13	0.10	0.27	0.04	0.29	0.08	0.11	0.14	0.36	0.00	0.03	0.05	0.32	0.56	0.47	0.43
O3'	0.16	0.12	0.02	0.01	0.07	0.02	0.07	0.09	0.07	0.11	0.10	0.07	0.16	0.03	0.00	0.10	0.14	0.38	0.20	0.24
O4'	0.00	0.12	0.02	0.01	0.02	0.00	0.11	0.02	0.14	0.01	0.08	0.02	0.20	0.05	0.10	0.00	0.14	0.06	0.28	0.15
O5'	0.08	0.11	0.37	0.26	0.12	0.01	0.14	0.01	0.13	0.09	0.11	0.13	0.12	0.32	0.14	0.14	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.20	0.13	0.52	0.46	0.14	0.15	0.20	0.05	0.15	0.11	0.10	0.18	0.20	0.56	0.38	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.23	0.38	0.25	0.38	0.09	0.41	0.14	0.33	0.22	0.30	0.42	0.17	0.47	0.20	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.10	0.42	0.33	0.21	0.04	0.25	0.01	0.21	0.11	0.14	0.24	0.09	0.43	0.24	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00