Doublet Group distance statistics: 52109

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 16, 21, 8, 5, 5, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.015 std_dev=0.012
O2	A	0, 0.018, 0.043, 0.068, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.043 std_dev=0.025
N4	A	0, 0.015, 0.048, 0.081, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.048 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.025, 0.064, 0.104, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.064 std_dev=0.039
C2'	A	0, 0.027, 0.068, 0.110, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.068 std_dev=0.041
O2'	A	0, 0.054, 0.119, 0.183, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.119 std_dev=0.065
C4'	A	0, 0.041, 0.110, 0.179, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.110 std_dev=0.069
C3'	A	0, 0.060, 0.134, 0.207, 0.408 max_d=0.408 avg_d=0.134 std_dev=0.073
C5'	A	0, 0.077, 0.179, 0.281, 0.611 max_d=0.611 avg_d=0.179 std_dev=0.102
O5'	A	0, 0.098, 0.206, 0.314, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.206 std_dev=0.108
O3'	A	0, 0.104, 0.222, 0.340, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.222 std_dev=0.118
C5	B	0, 0.157, 0.300, 0.444, 0.913 max_d=0.913 avg_d=0.300 std_dev=0.144
C6	B	0, 0.145, 0.295, 0.446, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.295 std_dev=0.150
C4	B	0, 0.098, 0.249, 0.399, 0.939 max_d=0.939 avg_d=0.249 std_dev=0.151
P	B	0, 0.148, 0.302, 0.456, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.302 std_dev=0.154
N4	B	0, 0.137, 0.300, 0.463, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.300 std_dev=0.163
N3	B	0, 0.076, 0.245, 0.413, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.245 std_dev=0.168
C2	B	0, 0.125, 0.300, 0.474, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.300 std_dev=0.175
N1	B	0, 0.105, 0.284, 0.462, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.284 std_dev=0.179
OP1	B	0, 0.176, 0.360, 0.543, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.360 std_dev=0.184
O5'	B	0, 0.182, 0.366, 0.551, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.366 std_dev=0.184
P	A	0, 0.119, 0.304, 0.490, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.304 std_dev=0.185
O2	B	0, 0.229, 0.419, 0.609, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.419 std_dev=0.190
C2'	B	0, 0.094, 0.287, 0.479, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.287 std_dev=0.192
OP2	A	0, 0.134, 0.336, 0.538, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.336 std_dev=0.202
C1'	B	0, 0.134, 0.345, 0.556, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.345 std_dev=0.211
O2'	B	0, 0.107, 0.331, 0.554, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.331 std_dev=0.224
C5'	B	0, 0.173, 0.401, 0.629, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.401 std_dev=0.228
OP2	B	0, 0.172, 0.402, 0.633, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.402 std_dev=0.231
O4'	B	0, 0.187, 0.422, 0.656, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.422 std_dev=0.234
C3'	B	0, 0.108, 0.349, 0.589, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.349 std_dev=0.240
C4'	B	0, 0.141, 0.390, 0.639, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.390 std_dev=0.249
OP1	A	0, 0.111, 0.383, 0.655, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.383 std_dev=0.272
O3'	B	0, 0.114, 0.419, 0.723, 1.442 max_d=1.442 avg_d=0.419 std_dev=0.304

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.05	0.04
C2	0.02	0.00	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.04	0.06	0.07	0.06
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.10	0.06	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.05	0.06	0.06	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.06	0.08	0.11	0.09
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.07	0.09	0.12	0.10
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.06	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.03	0.06	0.06	0.09	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.06	0.05
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.05	0.06	0.09	0.07
N4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.07	0.10	0.13	0.11
O2	0.03	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.03	0.05	0.07	0.07	0.05
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.00	0.03	0.03	0.04	0.12	0.06	0.04
O3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.06	0.07	0.07	0.03	0.00	0.01	0.05	0.18	0.10	0.09
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.06
O5'	0.04	0.04	0.03	0.03	0.06	0.02	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.07	0.05	0.04	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.06	0.06	0.10	0.13	0.08	0.06	0.09	0.05	0.06	0.05	0.06	0.10	0.07	0.12	0.18	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.07	0.06	0.07	0.11	0.03	0.12	0.01	0.09	0.06	0.09	0.13	0.07	0.06	0.10	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.06	0.04	0.06	0.09	0.02	0.10	0.01	0.07	0.05	0.07	0.11	0.05	0.04	0.09	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.10	0.09	0.09	0.10	0.07	0.13	0.05	0.12	0.08	0.11	0.11	0.12	0.13	0.10	0.09	0.07	0.15	0.02	0.05
C2	0.08	0.09	0.08	0.08	0.09	0.06	0.14	0.08	0.13	0.08	0.09	0.11	0.12	0.12	0.09	0.07	0.13	0.21	0.08	0.10
C2'	0.09	0.10	0.09	0.08	0.10	0.06	0.12	0.05	0.11	0.09	0.11	0.11	0.11	0.12	0.08	0.10	0.08	0.16	0.06	0.07
C3'	0.06	0.07	0.07	0.06	0.08	0.06	0.10	0.05	0.10	0.06	0.08	0.09	0.09	0.09	0.06	0.09	0.05	0.08	0.03	0.01
C4	0.14	0.10	0.13	0.13	0.16	0.13	0.20	0.12	0.18	0.14	0.12	0.17	0.11	0.15	0.14	0.14	0.14	0.19	0.08	0.09
C4'	0.09	0.08	0.10	0.11	0.09	0.10	0.12	0.09	0.12	0.08	0.09	0.10	0.10	0.13	0.11	0.12	0.07	0.07	0.07	0.02
C5	0.16	0.13	0.15	0.16	0.15	0.15	0.19	0.13	0.19	0.15	0.13	0.16	0.14	0.18	0.17	0.16	0.13	0.17	0.09	0.09
C5'	0.12	0.09	0.13	0.15	0.09	0.14	0.12	0.14	0.13	0.10	0.09	0.10	0.10	0.14	0.15	0.14	0.11	0.05	0.14	0.06
C6	0.13	0.11	0.13	0.13	0.13	0.12	0.17	0.11	0.17	0.12	0.12	0.14	0.13	0.16	0.14	0.13	0.11	0.17	0.08	0.08
N1	0.08	0.09	0.09	0.09	0.10	0.07	0.15	0.06	0.14	0.08	0.10	0.12	0.12	0.13	0.10	0.08	0.10	0.17	0.05	0.06
N3	0.10	0.08	0.10	0.10	0.12	0.09	0.17	0.10	0.15	0.10	0.07	0.14	0.11	0.13	0.11	0.09	0.14	0.20	0.09	0.10
N4	0.18	0.15	0.16	0.16	0.19	0.16	0.22	0.15	0.21	0.18	0.16	0.21	0.14	0.17	0.18	0.17	0.16	0.19	0.10	0.10
O2	0.10	0.12	0.09	0.08	0.11	0.08	0.14	0.11	0.12	0.10	0.12	0.11	0.14	0.13	0.09	0.09	0.15	0.24	0.13	0.13
O2'	0.10	0.11	0.09	0.08	0.12	0.07	0.13	0.06	0.12	0.10	0.12	0.13	0.12	0.11	0.08	0.11	0.08	0.16	0.10	0.08
O3'	0.05	0.06	0.06	0.05	0.08	0.03	0.09	0.03	0.07	0.05	0.07	0.09	0.07	0.08	0.05	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00
O4'	0.11	0.10	0.12	0.12	0.10	0.11	0.13	0.09	0.13	0.10	0.10	0.11	0.12	0.16	0.13	0.12	0.07	0.11	0.05	0.01
O5'	0.13	0.10	0.15	0.18	0.09	0.17	0.12	0.16	0.14	0.11	0.09	0.10	0.11	0.15	0.18	0.15	0.11	0.08	0.15	0.07
OP1	0.12	0.12	0.12	0.14	0.11	0.14	0.13	0.15	0.14	0.12	0.11	0.11	0.13	0.12	0.14	0.13	0.15	0.16	0.17	0.14
OP2	0.15	0.11	0.14	0.18	0.10	0.17	0.12	0.14	0.13	0.12	0.10	0.10	0.13	0.15	0.22	0.15	0.10	0.15	0.13	0.08
P	0.13	0.10	0.13	0.15	0.10	0.14	0.12	0.12	0.13	0.11	0.10	0.10	0.13	0.15	0.18	0.13	0.09	0.11	0.13	0.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.08	0.17	0.05	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.03	0.15	0.18	0.09	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.03	0.03	0.07	0.00	0.01	0.01	0.06	0.17	0.06	0.06
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.13	0.07	0.04
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02	0.19	0.20	0.13	0.12
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.06	0.03
C5	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.03	0.19	0.21	0.14	0.12
C5'	0.03	0.07	0.03	0.01	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.07	0.08	0.11	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.04	0.18	0.20	0.11	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.18	0.09	0.08
N3	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.03	0.17	0.19	0.11	0.10
N4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.03	0.03	0.19	0.20	0.15	0.13
O2	0.03	0.01	0.07	0.05	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.05	0.04	0.13	0.17	0.08	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.02	0.06	0.07	0.11	0.00	0.04	0.01	0.06	0.18	0.07	0.07
O3'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.00	0.03	0.04	0.13	0.09	0.04
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.17	0.06	0.07
O5'	0.08	0.15	0.06	0.04	0.19	0.01	0.19	0.01	0.18	0.15	0.17	0.19	0.13	0.06	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.17	0.18	0.17	0.13	0.20	0.12	0.21	0.07	0.20	0.18	0.19	0.20	0.17	0.18	0.13	0.17	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.09	0.06	0.07	0.13	0.06	0.14	0.06	0.11	0.09	0.11	0.15	0.08	0.07	0.09	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.06	0.04	0.12	0.03	0.12	0.02	0.10	0.08	0.10	0.13	0.08	0.07	0.04	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00