Doublet Group distance statistics: 52115

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 2, 4, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.010, 0.034, 0.059, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N4	A	0, 0.012, 0.038, 0.063, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.038 std_dev=0.025
C5	B	0, 0.159, 0.270, 0.382, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.270 std_dev=0.111
C6	B	0, 0.158, 0.271, 0.384, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.271 std_dev=0.113
O4'	A	0, 0.073, 0.192, 0.311, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.192 std_dev=0.119
C2'	A	0, 0.101, 0.225, 0.350, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.225 std_dev=0.125
N1	B	0, 0.188, 0.335, 0.481, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.335 std_dev=0.146
C4	B	0, 0.124, 0.287, 0.450, 0.728 max_d=0.728 avg_d=0.287 std_dev=0.163
O2'	A	0, 0.159, 0.322, 0.486, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.322 std_dev=0.163
C2	B	0, 0.196, 0.372, 0.547, 0.720 max_d=0.720 avg_d=0.372 std_dev=0.176
N3	B	0, 0.156, 0.336, 0.517, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.336 std_dev=0.180
C4'	A	0, 0.105, 0.289, 0.473, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.289 std_dev=0.184
C3'	A	0, 0.152, 0.346, 0.541, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.346 std_dev=0.194
C1'	B	0, 0.236, 0.438, 0.640, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.438 std_dev=0.202
C2'	B	0, 0.245, 0.448, 0.651, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.448 std_dev=0.203
N4	B	0, 0.125, 0.335, 0.545, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.335 std_dev=0.210
O5'	B	0, 0.303, 0.524, 0.744, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.524 std_dev=0.220
O2	B	0, 0.244, 0.473, 0.701, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.473 std_dev=0.228
O4'	B	0, 0.265, 0.499, 0.733, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.499 std_dev=0.234
P	B	0, 0.284, 0.523, 0.762, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.523 std_dev=0.239
C3'	B	0, 0.295, 0.542, 0.789, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.542 std_dev=0.247
O2'	B	0, 0.293, 0.559, 0.824, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.559 std_dev=0.265
O5'	A	0, 0.209, 0.482, 0.755, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.482 std_dev=0.273
P	A	0, 0.367, 0.646, 0.924, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.646 std_dev=0.278
O3'	A	0, 0.228, 0.510, 0.792, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.510 std_dev=0.282
C4'	B	0, 0.314, 0.602, 0.890, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.602 std_dev=0.288
O3'	B	0, 0.317, 0.621, 0.925, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.621 std_dev=0.304
C5'	A	0, 0.187, 0.491, 0.795, 1.259 max_d=1.259 avg_d=0.491 std_dev=0.304
OP2	A	0, 0.334, 0.651, 0.969, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.651 std_dev=0.318
OP1	A	0, 0.439, 0.789, 1.139, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.789 std_dev=0.350
C5'	B	0, 0.276, 0.721, 1.167, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.721 std_dev=0.446
OP2	B	0, 0.151, 0.940, 1.730, 2.566 max_d=2.566 avg_d=0.940 std_dev=0.790
OP1	B	0, 0.176, 1.071, 1.965, 2.988 max_d=2.988 avg_d=1.071 std_dev=0.895

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.08	0.06
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.04	0.05	0.08	0.09	0.14	0.09
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.17	0.07	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.05	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.20	0.12	0.10
C4	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.08	0.03	0.10	0.13	0.17	0.12
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.10	0.14	0.17	0.13
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.08	0.01	0.08	0.00	0.07	0.06	0.08	0.09	0.09	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.02	0.10	0.12	0.13	0.11
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.09	0.12	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.04	0.09	0.11	0.17	0.11
N4	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03	0.11	0.13	0.18	0.13
O2	0.03	0.00	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.03	0.08	0.08	0.09	0.13	0.08
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.00	0.03	0.03	0.02	0.20	0.08	0.07
O3'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.08	0.05	0.06	0.10	0.03	0.03	0.00	0.01	0.04	0.31	0.23	0.19
O4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.08	0.03	0.01	0.00	0.04	0.02	0.12	0.10
O5'	0.03	0.08	0.02	0.03	0.10	0.01	0.10	0.01	0.10	0.07	0.09	0.11	0.08	0.02	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.07	0.09	0.17	0.20	0.13	0.11	0.14	0.04	0.12	0.09	0.11	0.13	0.09	0.20	0.31	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.14	0.07	0.12	0.17	0.02	0.17	0.01	0.13	0.12	0.17	0.18	0.13	0.08	0.23	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.09	0.06	0.10	0.12	0.02	0.13	0.01	0.11	0.09	0.11	0.13	0.08	0.07	0.19	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.14	0.16	0.12	0.18	0.23	0.19	0.46	0.16	0.13	0.16	0.19	0.13	0.30	0.13	0.13	0.11	0.45	0.46	0.06
C2	0.14	0.18	0.17	0.13	0.19	0.16	0.17	0.39	0.15	0.15	0.19	0.19	0.18	0.31	0.17	0.10	0.13	0.60	0.68	0.05
C2'	0.12	0.14	0.20	0.17	0.15	0.24	0.18	0.44	0.16	0.13	0.14	0.15	0.13	0.30	0.16	0.14	0.20	0.52	0.52	0.11
C3'	0.06	0.08	0.17	0.10	0.12	0.23	0.15	0.46	0.14	0.09	0.09	0.13	0.07	0.30	0.11	0.14	0.03	0.21	0.25	0.01
C4	0.16	0.13	0.15	0.14	0.07	0.12	0.09	0.30	0.11	0.13	0.10	0.10	0.17	0.28	0.22	0.10	0.11	0.62	0.71	0.12
C4'	0.06	0.07	0.13	0.08	0.12	0.26	0.15	0.49	0.13	0.08	0.09	0.14	0.07	0.29	0.08	0.16	0.11	0.06	0.09	0.04
C5	0.14	0.09	0.15	0.14	0.05	0.13	0.06	0.31	0.09	0.10	0.07	0.09	0.12	0.30	0.21	0.09	0.13	0.54	0.63	0.15
C5'	0.11	0.08	0.14	0.13	0.11	0.31	0.15	0.52	0.15	0.10	0.08	0.12	0.08	0.28	0.10	0.22	0.28	0.18	0.20	0.14
C6	0.12	0.11	0.16	0.13	0.08	0.16	0.09	0.38	0.11	0.10	0.10	0.09	0.12	0.32	0.17	0.09	0.12	0.48	0.57	0.12
N1	0.12	0.15	0.16	0.13	0.16	0.18	0.16	0.41	0.14	0.13	0.15	0.15	0.14	0.31	0.15	0.10	0.11	0.52	0.59	0.06
N3	0.15	0.17	0.16	0.13	0.14	0.13	0.12	0.34	0.13	0.14	0.17	0.14	0.19	0.29	0.19	0.09	0.12	0.64	0.73	0.07
N4	0.19	0.15	0.16	0.16	0.11	0.13	0.12	0.25	0.13	0.14	0.10	0.15	0.20	0.26	0.26	0.14	0.13	0.65	0.74	0.14
O2	0.15	0.20	0.17	0.14	0.24	0.19	0.20	0.41	0.17	0.17	0.23	0.26	0.20	0.32	0.16	0.12	0.17	0.63	0.67	0.09
O2'	0.13	0.15	0.20	0.18	0.18	0.25	0.19	0.42	0.17	0.15	0.16	0.18	0.14	0.30	0.17	0.16	0.25	0.59	0.43	0.20
O3'	0.08	0.10	0.21	0.13	0.14	0.17	0.16	0.33	0.16	0.12	0.11	0.14	0.09	0.31	0.13	0.10	0.02	0.02	0.01	0.00
O4'	0.06	0.09	0.11	0.11	0.15	0.26	0.16	0.51	0.12	0.08	0.12	0.17	0.09	0.28	0.10	0.15	0.05	0.23	0.24	0.01
O5'	0.14	0.11	0.15	0.14	0.13	0.29	0.17	0.50	0.18	0.14	0.11	0.13	0.11	0.29	0.10	0.21	0.32	0.22	0.14	0.18
OP1	0.18	0.16	0.22	0.16	0.16	0.14	0.20	0.21	0.21	0.18	0.15	0.16	0.18	0.31	0.17	0.14	0.52	0.55	0.47	0.36
OP2	0.14	0.17	0.14	0.11	0.18	0.11	0.17	0.26	0.17	0.16	0.18	0.18	0.19	0.30	0.22	0.09	0.41	0.35	0.31	0.31
P	0.14	0.15	0.16	0.07	0.15	0.14	0.17	0.31	0.18	0.15	0.15	0.15	0.16	0.31	0.13	0.11	0.40	0.34	0.26	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.54	0.58	0.18
C2	0.01	0.00	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.07	0.03	0.08	0.69	0.82	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.07	0.07	0.01	0.04	0.02	0.12	0.00	0.02	0.01	0.30	0.50	0.44	0.32
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.28	0.40	0.20	0.24
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.18	0.80	0.96	0.09
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.03	0.02	0.06	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.30	0.16	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.02	0.06	0.21	0.80	0.97	0.09
C5'	0.05	0.12	0.07	0.02	0.18	0.00	0.19	0.00	0.16	0.12	0.15	0.19	0.08	0.06	0.03	0.01	0.01	0.27	0.08	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.03	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.02	0.07	0.16	0.74	0.90	0.14
N1	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.08	0.66	0.79	0.17
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.13	0.75	0.91	0.12
N4	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.03	0.20	0.83	0.99	0.07
O2	0.01	0.00	0.12	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.19	0.10	0.07	0.05	0.64	0.75	0.17
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.10	0.06	0.10	0.03	0.04	0.06	0.19	0.00	0.04	0.01	0.33	0.52	0.46	0.36
O3'	0.03	0.07	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.07	0.05	0.10	0.04	0.00	0.03	0.17	0.35	0.16	0.16
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.03	0.00	0.13	0.48	0.52	0.12
O5'	0.05	0.08	0.30	0.28	0.18	0.01	0.21	0.01	0.16	0.08	0.13	0.20	0.05	0.33	0.17	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.54	0.69	0.50	0.40	0.80	0.30	0.80	0.27	0.74	0.66	0.75	0.83	0.64	0.52	0.35	0.48	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.58	0.82	0.44	0.20	0.96	0.16	0.97	0.08	0.90	0.79	0.91	0.99	0.75	0.46	0.16	0.52	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.15	0.32	0.24	0.09	0.05	0.09	0.01	0.14	0.17	0.12	0.07	0.17	0.36	0.16	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00