Doublet Group distance statistics: 52122

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.015, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N4	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
O2	A	0, 0.000, 0.045, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.045 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.000, 0.056, 0.113, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.056 std_dev=0.056
C2'	A	0, 0.000, 0.155, 0.309, 0.309 max_d=0.309 avg_d=0.155 std_dev=0.155
N1	B	0, 0.000, 0.323, 0.645, 0.645 max_d=0.645 avg_d=0.323 std_dev=0.323
C4'	A	0, 0.000, 0.323, 0.646, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.323 std_dev=0.323
C6	B	0, 0.000, 0.349, 0.699, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.349 std_dev=0.349
C2	B	0, 0.000, 0.391, 0.781, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.391 std_dev=0.391
C5	B	0, 0.000, 0.417, 0.834, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.417 std_dev=0.417
N3	B	0, 0.000, 0.451, 0.903, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.451 std_dev=0.451
C5'	A	0, 0.000, 0.452, 0.903, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.452 std_dev=0.452
C4	B	0, 0.000, 0.452, 0.904, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.452 std_dev=0.452
C1'	B	0, 0.000, 0.598, 1.196, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.598 std_dev=0.598
C3'	A	0, 0.000, 0.630, 1.260, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.630 std_dev=0.630
O2	B	0, 0.000, 0.631, 1.261, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.631 std_dev=0.631
O4'	B	0, 0.000, 0.663, 1.325, 1.325 max_d=1.325 avg_d=0.663 std_dev=0.663
N4	B	0, 0.000, 0.723, 1.445, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.723 std_dev=0.723
O2'	A	0, 0.000, 0.833, 1.665, 1.665 max_d=1.665 avg_d=0.833 std_dev=0.833
O5'	A	0, 0.000, 0.972, 1.944, 1.944 max_d=1.944 avg_d=0.972 std_dev=0.972
O5'	B	0, 0.000, 1.020, 2.040, 2.040 max_d=2.040 avg_d=1.020 std_dev=1.020
C4'	B	0, 0.000, 1.043, 2.086, 2.086 max_d=2.086 avg_d=1.043 std_dev=1.043
C2'	B	0, 0.000, 1.051, 2.102, 2.102 max_d=2.102 avg_d=1.051 std_dev=1.051
OP2	B	0, 0.000, 1.052, 2.105, 2.105 max_d=2.105 avg_d=1.052 std_dev=1.052
C3'	B	0, 0.000, 1.202, 2.403, 2.403 max_d=2.403 avg_d=1.202 std_dev=1.202
O3'	A	0, 0.000, 1.241, 2.482, 2.482 max_d=2.482 avg_d=1.241 std_dev=1.241
P	B	0, 0.000, 1.252, 2.505, 2.505 max_d=2.505 avg_d=1.252 std_dev=1.252
C5'	B	0, 0.000, 1.272, 2.545, 2.545 max_d=2.545 avg_d=1.272 std_dev=1.272
O2'	B	0, 0.000, 1.299, 2.598, 2.598 max_d=2.598 avg_d=1.299 std_dev=1.299
OP1	B	0, 0.000, 1.521, 3.043, 3.043 max_d=3.043 avg_d=1.521 std_dev=1.521
O3'	B	0, 0.000, 1.631, 3.262, 3.262 max_d=3.262 avg_d=1.631 std_dev=1.631
P	A	0, 0.000, 1.702, 3.405, 3.405 max_d=3.405 avg_d=1.702 std_dev=1.702
OP1	A	0, 0.000, 2.258, 4.515, 4.515 max_d=4.515 avg_d=2.258 std_dev=2.258
OP2	A	0, 0.000, 2.592, 5.183, 5.183 max_d=5.183 avg_d=2.592 std_dev=2.592

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.25	0.01	0.38	0.15	0.87	0.50
C2	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.21	0.29	0.04	0.40	0.24	1.17	0.63
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.15	0.08	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.01	0.02	0.52	0.35	0.93	0.62
C3'	0.03	0.05	0.00	0.00	0.18	0.00	0.26	0.02	0.25	0.11	0.10	0.19	0.05	0.00	0.01	0.01	0.14	0.05	0.25	0.16
C4	0.01	0.00	0.05	0.18	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.07	0.04	0.50	0.58	1.51	0.86
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.13	0.06	0.06	0.11	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.15	0.15	0.04
C5	0.00	0.00	0.08	0.26	0.00	0.14	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.36	0.08	0.03	0.54	0.72	1.59	0.95
C5'	0.02	0.08	0.15	0.02	0.15	0.00	0.15	0.00	0.12	0.07	0.12	0.17	0.05	0.06	0.09	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.25	0.00	0.13	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.29	0.08	0.03	0.54	0.62	1.44	0.88
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.21	0.14	0.03	0.45	0.34	1.19	0.69
N3	0.02	0.00	0.01	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.29	0.23	0.04	0.44	0.37	1.35	0.73
N4	0.00	0.01	0.05	0.19	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.39	0.06	0.04	0.51	0.65	1.59	0.91
O2	0.04	0.00	0.07	0.05	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.09	0.46	0.04	0.32	0.03	0.99	0.48
O2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.36	0.21	0.36	0.06	0.29	0.21	0.29	0.39	0.09	0.00	0.04	0.14	0.23	0.03	0.70	0.32
O3'	0.25	0.29	0.01	0.01	0.07	0.01	0.08	0.09	0.08	0.14	0.23	0.06	0.46	0.04	0.00	0.14	0.25	0.39	0.24	0.25
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.14	0.14	0.00	0.25	0.02	0.63	0.35
O5'	0.38	0.40	0.52	0.14	0.50	0.01	0.54	0.00	0.54	0.45	0.44	0.51	0.32	0.23	0.25	0.25	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.15	0.24	0.35	0.05	0.58	0.15	0.72	0.03	0.62	0.34	0.37	0.65	0.03	0.03	0.39	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.87	1.17	0.93	0.25	1.51	0.15	1.59	0.01	1.44	1.19	1.35	1.59	0.99	0.70	0.24	0.63	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.50	0.63	0.62	0.16	0.86	0.04	0.95	0.01	0.88	0.69	0.73	0.91	0.48	0.32	0.25	0.35	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.04	0.28	0.36	0.17	0.34	0.09	0.33	0.23	0.14	0.18	0.38	0.06	0.28	0.39	0.32	0.39	0.41	0.54	0.50
C2	0.20	0.02	0.21	0.18	0.05	0.16	0.17	0.07	0.25	0.15	0.08	0.19	0.02	0.21	0.17	0.21	0.15	0.09	0.28	0.21
C2'	0.21	0.06	0.27	0.37	0.21	0.37	0.02	0.40	0.17	0.10	0.20	0.42	0.08	0.27	0.41	0.33	0.43	0.47	0.51	0.54
C3'	0.38	0.06	0.48	0.68	0.29	0.70	0.05	0.82	0.29	0.20	0.28	0.60	0.08	0.48	0.77	0.57	0.85	1.06	1.06	1.07
C4	0.29	0.13	0.40	0.29	0.04	0.14	0.03	0.08	0.18	0.21	0.02	0.15	0.15	0.42	0.31	0.18	0.02	0.16	0.03	0.04
C4'	0.33	0.04	0.43	0.57	0.21	0.55	0.07	0.61	0.26	0.18	0.22	0.47	0.06	0.43	0.65	0.46	0.66	0.81	0.86	0.84
C5	0.35	0.11	0.51	0.50	0.12	0.33	0.03	0.14	0.18	0.22	0.03	0.27	0.15	0.53	0.57	0.29	0.18	0.05	0.17	0.14
C5'	0.34	0.02	0.50	0.64	0.24	0.56	0.00	0.59	0.21	0.17	0.21	0.48	0.02	0.51	0.77	0.43	0.62	0.80	0.78	0.78
C6	0.33	0.06	0.45	0.49	0.16	0.38	0.01	0.29	0.21	0.20	0.10	0.34	0.07	0.47	0.55	0.33	0.34	0.28	0.41	0.37
N1	0.26	0.01	0.32	0.35	0.13	0.30	0.08	0.23	0.24	0.17	0.12	0.32	0.00	0.33	0.38	0.30	0.30	0.26	0.42	0.37
N3	0.21	0.09	0.23	0.12	0.01	0.06	0.14	0.09	0.22	0.18	0.01	0.08	0.07	0.24	0.11	0.15	0.01	0.11	0.11	0.02
N4	0.27	0.18	0.43	0.20	0.00	0.00	0.00	0.30	0.11	0.20	0.09	0.08	0.23	0.46	0.23	0.08	0.23	0.41	0.16	0.26
O2	0.14	0.03	0.09	0.08	0.01	0.11	0.25	0.05	0.25	0.12	0.10	0.09	0.09	0.08	0.05	0.18	0.15	0.11	0.31	0.24
O2'	0.37	0.57	0.32	0.20	0.65	0.19	0.47	0.12	0.37	0.45	0.66	0.74	0.60	0.33	0.15	0.24	0.09	0.03	0.06	0.07
O3'	0.15	0.39	0.19	0.45	0.60	0.57	0.17	0.78	0.08	0.06	0.64	0.95	0.44	0.19	0.53	0.44	0.82	1.16	1.10	1.14
O4'	0.28	0.01	0.36	0.44	0.15	0.40	0.09	0.38	0.25	0.17	0.16	0.36	0.03	0.36	0.49	0.36	0.45	0.50	0.63	0.58
O5'	0.31	0.58	0.16	0.03	0.73	0.12	0.58	0.10	0.42	0.44	0.70	0.88	0.57	0.14	0.10	0.24	0.08	0.12	0.05	0.08
OP1	0.46	0.52	0.30	0.28	0.56	0.46	0.54	0.55	0.50	0.49	0.55	0.59	0.51	0.30	0.18	0.51	0.51	0.55	0.49	0.49
OP2	1.29	1.43	1.14	1.07	1.48	1.19	1.44	1.20	1.36	1.37	1.47	1.50	1.43	1.12	0.94	1.27	1.18	0.99	1.08	1.03
P	0.65	0.83	0.50	0.43	0.92	0.56	0.84	0.59	0.74	0.75	0.90	1.00	0.82	0.48	0.31	0.64	0.56	0.44	0.47	0.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.07	0.03	0.07
C2	0.00	0.00	0.10	0.12	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.12	0.15	0.11	0.12
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.08	0.04	0.16	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.14	0.06
C3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.12	0.08	0.16	0.02	0.01	0.02	0.10	0.10	0.23	0.13
C4	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.02	0.14	0.20	0.17	0.15
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.05	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01
C5	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.14	0.20	0.17	0.15
C5'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.11	0.00	0.11	0.00	0.08	0.06	0.10	0.12	0.07	0.06	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00
C6	0.00	0.00	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.12	0.16	0.12	0.13
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.10	0.13	0.09	0.11
N3	0.00	0.00	0.08	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.13	0.18	0.15	0.14
N4	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.01	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.03	0.15	0.21	0.20	0.15
O2	0.01	0.00	0.16	0.16	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.18	0.02	0.11	0.13	0.10	0.12
O2'	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.03	0.06	0.05	0.02	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.03	0.07	0.08	0.14	0.06
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.13	0.10	0.18	0.02	0.00	0.02	0.15	0.19	0.32	0.21
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.06	0.10	0.07	0.10
O5'	0.05	0.12	0.04	0.10	0.14	0.01	0.14	0.00	0.12	0.10	0.13	0.15	0.11	0.07	0.15	0.06	0.00	0.03	0.02	0.00
OP1	0.07	0.15	0.05	0.10	0.20	0.02	0.20	0.04	0.16	0.13	0.18	0.21	0.13	0.08	0.19	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.03	0.11	0.14	0.23	0.17	0.04	0.17	0.02	0.12	0.09	0.15	0.20	0.10	0.14	0.32	0.07	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.12	0.06	0.13	0.15	0.01	0.15	0.00	0.13	0.11	0.14	0.15	0.12	0.06	0.21	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00