Doublet Group distance statistics: 52126

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 4, 5, 16, 11, 16, 18, 15, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.007, 0.012, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.007 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.017, 0.049, 0.082, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.049 std_dev=0.033
O2	A	0, 0.013, 0.050, 0.087, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.050 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.049, 0.154, 0.259, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.154 std_dev=0.105
C2'	A	0, 0.084, 0.198, 0.312, 0.593 max_d=0.593 avg_d=0.198 std_dev=0.114
C4'	A	0, 0.094, 0.237, 0.380, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.237 std_dev=0.143
O2'	A	0, 0.136, 0.291, 0.445, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.291 std_dev=0.154
C5	B	0, 0.279, 0.440, 0.600, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.440 std_dev=0.161
C4	B	0, 0.268, 0.431, 0.595, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.431 std_dev=0.163
C3'	A	0, 0.130, 0.302, 0.473, 0.908 max_d=0.908 avg_d=0.302 std_dev=0.172
C8	B	0, 0.230, 0.402, 0.574, 0.805 max_d=0.805 avg_d=0.402 std_dev=0.172
N9	B	0, 0.232, 0.406, 0.580, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.406 std_dev=0.174
C6	B	0, 0.317, 0.506, 0.695, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.506 std_dev=0.189
N7	B	0, 0.254, 0.447, 0.641, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.447 std_dev=0.193
N1	B	0, 0.337, 0.549, 0.760, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.549 std_dev=0.212
N3	B	0, 0.291, 0.512, 0.733, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.512 std_dev=0.221
O5'	A	0, 0.175, 0.399, 0.622, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.399 std_dev=0.224
C2	B	0, 0.321, 0.555, 0.789, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.555 std_dev=0.234
N6	B	0, 0.337, 0.581, 0.824, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.581 std_dev=0.244
O3'	A	0, 0.229, 0.479, 0.728, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.479 std_dev=0.250
C1'	B	0, 0.274, 0.523, 0.773, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.523 std_dev=0.250
C5'	A	0, 0.155, 0.408, 0.662, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.408 std_dev=0.253
P	A	0, 0.199, 0.479, 0.759, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.479 std_dev=0.280
O4'	B	0, 0.288, 0.593, 0.898, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.593 std_dev=0.305
C2'	B	0, 0.317, 0.630, 0.942, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.630 std_dev=0.312
P	B	0, 0.307, 0.638, 0.969, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.638 std_dev=0.331
O5'	B	0, 0.341, 0.739, 1.137, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.739 std_dev=0.398
C4'	B	0, 0.356, 0.762, 1.167, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.762 std_dev=0.406
OP2	B	0, 0.242, 0.661, 1.080, 2.491 max_d=2.491 avg_d=0.661 std_dev=0.419
C3'	B	0, 0.364, 0.792, 1.219, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.792 std_dev=0.427
C5'	B	0, 0.382, 0.812, 1.241, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.812 std_dev=0.430
O2'	B	0, 0.341, 0.792, 1.242, 2.580 max_d=2.580 avg_d=0.792 std_dev=0.451
OP1	B	0, 0.405, 0.883, 1.362, 2.577 max_d=2.577 avg_d=0.883 std_dev=0.478
O3'	B	0, 0.454, 1.011, 1.569, 2.227 max_d=2.227 avg_d=1.011 std_dev=0.558
OP1	A	0, 0.083, 0.695, 1.307, 3.181 max_d=3.181 avg_d=0.695 std_dev=0.612
OP2	A	0, -0.091, 0.578, 1.246, 3.558 max_d=3.558 avg_d=0.578 std_dev=0.669

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.24	0.15	0.09
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.06	0.04	0.09	0.43	0.14	0.12
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.05	0.03	0.09	0.00	0.02	0.01	0.04	0.14	0.08	0.05
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.09	0.04	0.05	0.06	0.07	0.02	0.01	0.01	0.06	0.10	0.08	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.13	0.56	0.25	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.19	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.03	0.14	0.55	0.28	0.14
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.09	0.06	0.08	0.11	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.17	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.03	0.12	0.45	0.17	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.09	0.38	0.12	0.11
N3	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.11	0.51	0.18	0.13
N4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.14	0.60	0.31	0.16
O2	0.04	0.00	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.09	0.06	0.08	0.39	0.15	0.13
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.02	0.06	0.04	0.11	0.00	0.04	0.04	0.04	0.09	0.13	0.05
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.06	0.02	0.10	0.03	0.10	0.04	0.06	0.07	0.09	0.04	0.00	0.02	0.09	0.21	0.13	0.11
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.02	0.00	0.06	0.19	0.26	0.12
O5'	0.05	0.09	0.04	0.06	0.13	0.01	0.14	0.01	0.12	0.09	0.11	0.14	0.08	0.04	0.09	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.24	0.43	0.14	0.10	0.56	0.06	0.55	0.17	0.45	0.38	0.51	0.60	0.39	0.09	0.21	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.14	0.08	0.08	0.25	0.19	0.28	0.20	0.17	0.12	0.18	0.31	0.15	0.13	0.13	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.12	0.05	0.06	0.14	0.03	0.14	0.01	0.12	0.11	0.13	0.16	0.13	0.05	0.11	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.21	0.26	0.23	0.17	0.17	0.20	0.15	0.24	0.16	0.24	0.18	0.29	0.21	0.14	0.40	0.28	0.17	0.11	0.27	0.10	0.06
C2	0.19	0.24	0.28	0.26	0.17	0.17	0.17	0.15	0.23	0.14	0.25	0.21	0.28	0.15	0.15	0.43	0.31	0.16	0.15	0.38	0.10	0.12
C2'	0.16	0.20	0.23	0.18	0.17	0.14	0.22	0.13	0.26	0.17	0.24	0.17	0.30	0.24	0.14	0.33	0.22	0.17	0.09	0.28	0.10	0.10
C3'	0.12	0.18	0.21	0.15	0.16	0.13	0.22	0.14	0.24	0.19	0.22	0.15	0.28	0.26	0.12	0.31	0.20	0.16	0.09	0.15	0.09	0.02
C4	0.24	0.24	0.32	0.33	0.16	0.24	0.11	0.18	0.17	0.16	0.22	0.22	0.24	0.14	0.18	0.47	0.40	0.21	0.15	0.38	0.11	0.12
C4'	0.12	0.20	0.22	0.19	0.17	0.16	0.22	0.18	0.24	0.19	0.23	0.17	0.28	0.25	0.13	0.34	0.25	0.16	0.13	0.09	0.22	0.07
C5	0.26	0.24	0.34	0.36	0.17	0.28	0.16	0.23	0.22	0.16	0.24	0.23	0.25	0.16	0.18	0.50	0.43	0.24	0.15	0.36	0.15	0.13
C5'	0.13	0.23	0.20	0.21	0.20	0.20	0.24	0.24	0.26	0.22	0.25	0.20	0.28	0.26	0.16	0.33	0.28	0.17	0.19	0.08	0.35	0.14
C6	0.24	0.23	0.33	0.33	0.17	0.26	0.18	0.22	0.23	0.17	0.24	0.21	0.25	0.19	0.17	0.48	0.38	0.24	0.14	0.34	0.16	0.13
N1	0.20	0.22	0.29	0.27	0.16	0.19	0.18	0.16	0.23	0.15	0.24	0.20	0.27	0.18	0.15	0.44	0.32	0.19	0.12	0.33	0.10	0.09
N3	0.22	0.25	0.29	0.29	0.17	0.20	0.13	0.16	0.19	0.16	0.25	0.23	0.24	0.14	0.17	0.44	0.35	0.18	0.16	0.39	0.10	0.13
N4	0.26	0.24	0.33	0.35	0.17	0.26	0.12	0.20	0.15	0.18	0.20	0.24	0.25	0.17	0.20	0.47	0.43	0.22	0.16	0.39	0.11	0.13
O2	0.18	0.25	0.25	0.23	0.18	0.15	0.19	0.16	0.26	0.15	0.28	0.21	0.31	0.17	0.15	0.40	0.27	0.15	0.18	0.40	0.14	0.16
O2'	0.15	0.21	0.22	0.16	0.18	0.13	0.24	0.13	0.28	0.17	0.26	0.18	0.33	0.25	0.15	0.32	0.20	0.17	0.08	0.25	0.16	0.12
O3'	0.10	0.16	0.19	0.10	0.15	0.10	0.22	0.12	0.24	0.20	0.21	0.13	0.28	0.26	0.12	0.25	0.15	0.14	0.02	0.02	0.02	0.01
O4'	0.16	0.21	0.25	0.24	0.16	0.19	0.20	0.18	0.23	0.16	0.23	0.18	0.27	0.22	0.12	0.40	0.30	0.17	0.13	0.17	0.18	0.03
O5'	0.12	0.25	0.20	0.26	0.21	0.23	0.25	0.26	0.28	0.23	0.27	0.22	0.30	0.27	0.16	0.35	0.32	0.17	0.19	0.16	0.30	0.12
OP1	0.30	0.49	0.29	0.25	0.42	0.27	0.42	0.35	0.45	0.37	0.48	0.46	0.45	0.39	0.36	0.48	0.41	0.24	0.29	0.22	0.49	0.26
OP2	0.46	0.59	0.46	0.48	0.52	0.44	0.48	0.39	0.51	0.40	0.56	0.58	0.48	0.42	0.45	0.59	0.55	0.43	0.29	0.29	0.33	0.20
P	0.12	0.28	0.16	0.24	0.23	0.23	0.25	0.28	0.27	0.24	0.29	0.25	0.28	0.26	0.18	0.32	0.33	0.16	0.21	0.18	0.35	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.16	0.00	0.10	0.32	0.08	0.12
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.31	0.05	0.17	0.39	0.14	0.17
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.06	0.06	0.08	0.09	0.06	0.05	0.02	0.00	0.05	0.02	0.20	0.30	0.18	0.18
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.10	0.08	0.10	0.06	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.10	0.21	0.14	0.09
C4	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.21	0.03	0.19	0.38	0.14	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.05	0.11	0.02	0.05	0.08	0.10	0.04	0.06	0.03	0.00	0.01	0.19	0.07	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.17	0.05	0.25	0.42	0.22	0.23
C5'	0.03	0.06	0.08	0.02	0.09	0.01	0.16	0.00	0.15	0.20	0.11	0.05	0.19	0.21	0.10	0.05	0.07	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.21	0.05	0.25	0.44	0.23	0.25
C8	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.11	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.10	0.06	0.06	0.28	0.39	0.21	0.23
N1	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.02	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.27	0.05	0.21	0.42	0.19	0.21
N3	0.03	0.00	0.09	0.10	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.14	0.30	0.05	0.15	0.36	0.11	0.14
N6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.19	0.19	0.07	0.29	0.47	0.28	0.29
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.10	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.09	0.06	0.30	0.44	0.26	0.28
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.07	0.14	0.02	0.19	0.35	0.13	0.15
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.11	0.06	0.14	0.05	0.17	0.10	0.18	0.14	0.19	0.14	0.07	0.00	0.06	0.04	0.20	0.32	0.20	0.20
O3'	0.16	0.31	0.05	0.01	0.21	0.03	0.17	0.07	0.21	0.06	0.27	0.30	0.19	0.09	0.14	0.06	0.00	0.11	0.09	0.22	0.16	0.11
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.05	0.07	0.06	0.02	0.04	0.11	0.00	0.06	0.32	0.12	0.15
O5'	0.10	0.17	0.20	0.10	0.19	0.01	0.25	0.01	0.25	0.28	0.21	0.15	0.29	0.30	0.19	0.20	0.09	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.32	0.39	0.30	0.21	0.38	0.19	0.42	0.10	0.44	0.39	0.42	0.36	0.47	0.44	0.35	0.32	0.22	0.32	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.14	0.18	0.14	0.14	0.07	0.22	0.10	0.23	0.21	0.19	0.11	0.28	0.26	0.13	0.20	0.16	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.17	0.18	0.09	0.17	0.07	0.23	0.02	0.25	0.23	0.21	0.14	0.29	0.28	0.15	0.20	0.11	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00