Doublet Group distance statistics: 52131

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 0, 10, 8, 3, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.012, 0.018, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.014, 0.022, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.022 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.028, 0.039, 0.050, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.039 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.024, 0.035, 0.046, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.035 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.031, 0.044, 0.057, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.044 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.027, 0.041, 0.054, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.041 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.022, 0.042, 0.061, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.042 std_dev=0.019
N4	A	0, 0.051, 0.077, 0.103, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.077 std_dev=0.026
C4	B	0, 0.129, 0.255, 0.380, 0.513 max_d=0.513 avg_d=0.255 std_dev=0.126
N3	B	0, 0.236, 0.391, 0.546, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.391 std_dev=0.155
N9	B	0, 0.082, 0.243, 0.404, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.243 std_dev=0.161
C2'	A	0, 0.240, 0.428, 0.615, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.428 std_dev=0.187
C5	B	0, 0.139, 0.330, 0.522, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.330 std_dev=0.191
O4'	A	0, 0.249, 0.453, 0.657, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.453 std_dev=0.204
O2'	A	0, 0.297, 0.508, 0.719, 0.740 max_d=0.740 avg_d=0.508 std_dev=0.211
C2	B	0, 0.283, 0.501, 0.719, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.501 std_dev=0.218
C8	B	0, 0.127, 0.349, 0.570, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.349 std_dev=0.221
C1'	B	0, 0.142, 0.379, 0.616, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.379 std_dev=0.237
N7	B	0, 0.164, 0.405, 0.645, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.405 std_dev=0.241
C6	B	0, 0.208, 0.457, 0.705, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.457 std_dev=0.248
N1	B	0, 0.265, 0.525, 0.785, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.525 std_dev=0.260
C4'	A	0, 0.361, 0.653, 0.945, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.653 std_dev=0.292
C3'	A	0, 0.371, 0.677, 0.983, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.677 std_dev=0.306
N6	B	0, 0.309, 0.647, 0.984, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.647 std_dev=0.338
O4'	B	0, 0.622, 1.025, 1.428, 1.724 max_d=1.724 avg_d=1.025 std_dev=0.403
O3'	A	0, 0.493, 0.917, 1.341, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.917 std_dev=0.424
O5'	A	0, 0.566, 1.007, 1.448, 1.598 max_d=1.598 avg_d=1.007 std_dev=0.441
C5'	A	0, 0.644, 1.150, 1.657, 1.787 max_d=1.787 avg_d=1.150 std_dev=0.507
C4'	B	0, 0.949, 1.556, 2.164, 2.416 max_d=2.416 avg_d=1.556 std_dev=0.608
O3'	B	0, 0.981, 1.612, 2.243, 2.491 max_d=2.491 avg_d=1.612 std_dev=0.631
C3'	B	0, 0.997, 1.664, 2.332, 2.453 max_d=2.453 avg_d=1.664 std_dev=0.668
C2'	B	0, 0.976, 1.699, 2.422, 3.129 max_d=3.129 avg_d=1.699 std_dev=0.723
OP1	A	0, 0.926, 1.668, 2.411, 2.676 max_d=2.676 avg_d=1.668 std_dev=0.743
P	A	0, 1.026, 1.806, 2.586, 2.742 max_d=2.742 avg_d=1.806 std_dev=0.780
OP2	A	0, 1.437, 2.400, 3.363, 3.455 max_d=3.455 avg_d=2.400 std_dev=0.963
C5'	B	0, 1.506, 2.517, 3.529, 3.595 max_d=3.595 avg_d=2.517 std_dev=1.011
O5'	B	0, 1.513, 2.559, 3.605, 3.645 max_d=3.645 avg_d=2.559 std_dev=1.046
O2'	B	0, 1.369, 2.461, 3.554, 4.776 max_d=4.776 avg_d=2.461 std_dev=1.093
P	B	0, 1.726, 2.924, 4.122, 4.199 max_d=4.199 avg_d=2.924 std_dev=1.198
OP1	B	0, 1.821, 3.067, 4.312, 4.466 max_d=4.466 avg_d=3.067 std_dev=1.246
OP2	B	0, 1.759, 3.017, 4.275, 4.414 max_d=4.414 avg_d=3.017 std_dev=1.258

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.05	0.03
C2	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.09	0.03	0.10	0.10	0.13	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.11	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.09	0.04
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.07	0.02	0.07	0.05	0.11	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.10	0.05
C4	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.06	0.00	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.04	0.14	0.13	0.15	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.05	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.06	0.12	0.10	0.11	0.11
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.12	0.01	0.11	0.00	0.08	0.05	0.10	0.13	0.04	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02	0.05	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.08	0.06	0.08	0.06	0.10	0.06
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.06	0.07	0.05
N3	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.08	0.03	0.14	0.14	0.16	0.14
N4	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.04	0.16	0.16	0.18	0.18
O2	0.04	0.00	0.11	0.11	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.14	0.06	0.09	0.10	0.14	0.09
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.04	0.07	0.00	0.03	0.04	0.03	0.07	0.08	0.04
O3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.03	0.08	0.02	0.08	0.06	0.14	0.03	0.00	0.01	0.10	0.11	0.14	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.03	0.04	0.06	0.04	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.06
O5'	0.03	0.10	0.04	0.07	0.14	0.01	0.12	0.01	0.08	0.07	0.14	0.16	0.09	0.03	0.10	0.04	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.04	0.10	0.06	0.07	0.13	0.05	0.10	0.05	0.06	0.06	0.14	0.16	0.10	0.07	0.11	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.13	0.09	0.10	0.15	0.04	0.11	0.04	0.10	0.07	0.16	0.18	0.14	0.08	0.14	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.03	0.09	0.04	0.05	0.15	0.02	0.11	0.01	0.06	0.05	0.14	0.18	0.09	0.04	0.08	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.17	0.28	0.43	0.11	0.23	0.13	0.27	0.09	0.20	0.15	0.13	0.16	0.21	0.14	0.20	0.23	0.16	0.35	0.40	0.52	0.44
C2	0.13	0.13	0.40	0.46	0.11	0.23	0.14	0.27	0.14	0.16	0.09	0.12	0.21	0.19	0.13	0.14	0.24	0.16	0.35	0.37	0.50	0.42
C2'	0.11	0.20	0.22	0.32	0.08	0.13	0.14	0.15	0.10	0.22	0.16	0.14	0.22	0.25	0.13	0.16	0.14	0.16	0.19	0.22	0.30	0.24
C3'	0.15	0.33	0.20	0.34	0.15	0.18	0.12	0.20	0.16	0.21	0.33	0.24	0.12	0.21	0.15	0.23	0.17	0.16	0.24	0.27	0.37	0.31
C4	0.14	0.10	0.35	0.49	0.11	0.29	0.11	0.36	0.10	0.14	0.09	0.11	0.13	0.14	0.13	0.19	0.26	0.18	0.44	0.44	0.60	0.51
C4'	0.22	0.33	0.27	0.46	0.21	0.31	0.21	0.36	0.26	0.24	0.34	0.26	0.27	0.23	0.21	0.30	0.29	0.23	0.43	0.49	0.64	0.55
C5	0.17	0.12	0.22	0.45	0.12	0.30	0.12	0.38	0.12	0.18	0.13	0.12	0.17	0.17	0.16	0.38	0.26	0.20	0.46	0.48	0.66	0.56
C5'	0.31	0.44	0.31	0.54	0.34	0.44	0.35	0.51	0.43	0.33	0.48	0.37	0.49	0.33	0.32	0.38	0.39	0.36	0.58	0.65	0.83	0.72
C6	0.17	0.16	0.22	0.43	0.12	0.27	0.13	0.33	0.12	0.20	0.16	0.13	0.17	0.19	0.16	0.35	0.25	0.18	0.41	0.45	0.61	0.51
N1	0.15	0.16	0.30	0.44	0.11	0.24	0.13	0.29	0.10	0.19	0.13	0.13	0.16	0.20	0.15	0.19	0.24	0.17	0.37	0.40	0.54	0.46
N3	0.13	0.11	0.44	0.49	0.11	0.25	0.13	0.30	0.14	0.14	0.11	0.12	0.19	0.15	0.12	0.17	0.25	0.16	0.38	0.39	0.52	0.44
N4	0.13	0.13	0.42	0.53	0.11	0.33	0.10	0.41	0.10	0.12	0.11	0.14	0.11	0.11	0.12	0.20	0.28	0.19	0.49	0.46	0.62	0.54
O2	0.14	0.14	0.45	0.47	0.12	0.22	0.16	0.25	0.18	0.16	0.12	0.14	0.28	0.20	0.13	0.22	0.24	0.16	0.32	0.34	0.45	0.38
O2'	0.12	0.17	0.23	0.31	0.10	0.12	0.17	0.14	0.15	0.23	0.14	0.12	0.27	0.26	0.14	0.15	0.14	0.19	0.18	0.21	0.27	0.22
O3'	0.14	0.34	0.18	0.28	0.13	0.15	0.11	0.18	0.15	0.22	0.34	0.24	0.09	0.22	0.13	0.22	0.13	0.15	0.21	0.22	0.25	0.22
O4'	0.20	0.24	0.29	0.49	0.17	0.32	0.17	0.39	0.17	0.23	0.24	0.19	0.19	0.22	0.19	0.30	0.31	0.22	0.48	0.54	0.70	0.60
O5'	0.33	0.48	0.31	0.55	0.38	0.47	0.40	0.53	0.50	0.34	0.53	0.41	0.58	0.35	0.34	0.41	0.40	0.39	0.59	0.64	0.83	0.73
OP1	0.43	0.61	0.34	0.56	0.51	0.57	0.56	0.65	0.67	0.46	0.67	0.54	0.78	0.52	0.46	0.52	0.44	0.55	0.69	0.76	1.00	0.88
OP2	0.49	0.69	0.35	0.59	0.63	0.64	0.72	0.72	0.81	0.57	0.77	0.63	0.93	0.69	0.55	0.53	0.45	0.64	0.76	0.77	1.08	0.94
P	0.46	0.60	0.36	0.63	0.54	0.63	0.60	0.73	0.69	0.51	0.67	0.54	0.81	0.58	0.49	0.49	0.49	0.59	0.79	0.84	1.11	0.97

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.25	0.00	0.07	0.18	0.13	0.10
C2	0.04	0.00	0.29	0.13	0.01	0.17	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.27	0.24	0.25	0.18	0.20	0.21	0.15
C2'	0.01	0.29	0.00	0.00	0.15	0.01	0.08	0.10	0.15	0.14	0.23	0.28	0.12	0.07	0.02	0.00	0.03	0.03	0.23	0.46	0.24	0.26
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.13	0.01	0.19	0.02	0.20	0.18	0.16	0.10	0.24	0.21	0.12	0.01	0.00	0.02	0.07	0.29	0.15	0.12
C4	0.02	0.01	0.15	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.14	0.12	0.17	0.24	0.17
C4'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.05	0.16	0.12	0.16	0.06	0.12	0.04	0.20	0.02	0.00	0.01	0.14	0.07	0.05
C5	0.01	0.01	0.08	0.19	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.10	0.07	0.15	0.20	0.34	0.26
C5'	0.03	0.23	0.10	0.02	0.11	0.00	0.08	0.00	0.10	0.18	0.18	0.21	0.11	0.15	0.04	0.10	0.16	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.15	0.20	0.00	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.11	0.12	0.15	0.21	0.34	0.25
C8	0.03	0.01	0.14	0.18	0.00	0.16	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.35	0.07	0.14	0.21	0.22	0.41	0.35
N1	0.03	0.00	0.23	0.16	0.01	0.12	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.16	0.18	0.20	0.16	0.18	0.27	0.18
N3	0.05	0.00	0.28	0.10	0.01	0.16	0.02	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.27	0.26	0.25	0.17	0.21	0.18	0.14
N6	0.02	0.01	0.12	0.24	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.15	0.09	0.08	0.20	0.28	0.43	0.32
N7	0.03	0.02	0.07	0.21	0.01	0.12	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.32	0.08	0.08	0.21	0.27	0.45	0.37
N9	0.01	0.02	0.02	0.12	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.14	0.02	0.10	0.15	0.24	0.19
O2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.09	0.20	0.15	0.10	0.12	0.35	0.16	0.27	0.15	0.32	0.14	0.00	0.04	0.12	0.14	0.44	0.26	0.21
O3'	0.25	0.24	0.03	0.00	0.17	0.02	0.10	0.16	0.11	0.07	0.18	0.26	0.09	0.08	0.14	0.04	0.00	0.15	0.19	0.26	0.22	0.20
O4'	0.00	0.25	0.03	0.02	0.14	0.00	0.07	0.01	0.12	0.14	0.20	0.25	0.08	0.08	0.02	0.12	0.15	0.00	0.07	0.13	0.18	0.17
O5'	0.07	0.18	0.23	0.07	0.12	0.01	0.15	0.01	0.15	0.21	0.16	0.17	0.20	0.21	0.10	0.14	0.19	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.18	0.20	0.46	0.29	0.17	0.14	0.20	0.09	0.21	0.22	0.18	0.21	0.28	0.27	0.15	0.44	0.26	0.13	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.21	0.24	0.15	0.24	0.07	0.34	0.04	0.34	0.41	0.27	0.18	0.43	0.45	0.24	0.26	0.22	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.15	0.26	0.12	0.17	0.05	0.26	0.01	0.25	0.35	0.18	0.14	0.32	0.37	0.19	0.21	0.20	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00