Doublet Group distance statistics: 52135

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 2, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.003, 0.004, 0.005 max_d=0.005 avg_d=0.003 std_dev=0.001
N3	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.001, 0.006, 0.011, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.001, 0.007, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.002, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.001, 0.007, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.004, 0.023, 0.043, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.023 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.004, 0.086, 0.167, 0.277 max_d=0.277 avg_d=0.086 std_dev=0.081
C2'	A	0, -0.003, 0.093, 0.188, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.093 std_dev=0.096
C4'	A	0, 0.014, 0.138, 0.261, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.138 std_dev=0.124
O2'	A	0, -0.002, 0.136, 0.273, 0.493 max_d=0.493 avg_d=0.136 std_dev=0.137
C3'	A	0, 0.008, 0.153, 0.298, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.153 std_dev=0.145
C2	B	0, 0.083, 0.279, 0.476, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.279 std_dev=0.197
N3	B	0, 0.065, 0.269, 0.474, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.269 std_dev=0.205
N1	B	0, 0.053, 0.265, 0.477, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.265 std_dev=0.212
O3'	A	0, 0.015, 0.230, 0.444, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.230 std_dev=0.214
C5'	A	0, 0.013, 0.232, 0.450, 0.760 max_d=0.760 avg_d=0.232 std_dev=0.218
C6	B	0, 0.051, 0.270, 0.488, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.270 std_dev=0.219
C4	B	0, 0.034, 0.261, 0.487, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.261 std_dev=0.227
C5	B	0, 0.050, 0.286, 0.522, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.286 std_dev=0.236
O5'	A	0, 0.004, 0.257, 0.511, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.257 std_dev=0.254
N6	B	0, 0.067, 0.341, 0.615, 0.987 max_d=0.987 avg_d=0.341 std_dev=0.274
OP2	A	0, 0.061, 0.339, 0.617, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.339 std_dev=0.278
O4'	B	0, 0.230, 0.513, 0.797, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.513 std_dev=0.284
N9	B	0, 0.062, 0.353, 0.643, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.353 std_dev=0.291
P	A	0, 0.007, 0.317, 0.627, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.317 std_dev=0.310
N7	B	0, 0.074, 0.394, 0.715, 0.970 max_d=0.970 avg_d=0.394 std_dev=0.320
C8	B	0, 0.085, 0.423, 0.762, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.423 std_dev=0.339
C1'	B	0, 0.063, 0.421, 0.780, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.421 std_dev=0.359
C5'	B	0, 0.227, 0.588, 0.949, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.588 std_dev=0.361
C4'	B	0, 0.212, 0.576, 0.941, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.576 std_dev=0.365
OP1	A	0, 0.018, 0.399, 0.779, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.399 std_dev=0.380
O5'	B	0, 0.193, 0.616, 1.040, 1.664 max_d=1.664 avg_d=0.616 std_dev=0.424
OP1	B	0, 0.242, 0.681, 1.119, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.681 std_dev=0.439
P	B	0, 0.206, 0.654, 1.103, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.654 std_dev=0.448
C2'	B	0, 0.012, 0.477, 0.943, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.477 std_dev=0.466
C3'	B	0, 0.134, 0.615, 1.095, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.615 std_dev=0.481
OP2	B	0, 0.209, 0.701, 1.193, 1.946 max_d=1.946 avg_d=0.701 std_dev=0.492
O3'	B	0, 0.091, 0.688, 1.285, 2.258 max_d=2.258 avg_d=0.688 std_dev=0.597
O2'	B	0, -0.215, 0.425, 1.066, 2.387 max_d=2.387 avg_d=0.425 std_dev=0.641

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.05	0.03
C2	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.03	0.07	0.07	0.10	0.08
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.08	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.03	0.05	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.03
C4	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.11	0.13	0.14	0.12
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.00	0.00	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.12	0.13	0.14	0.12
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.07	0.05	0.06	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00
C6	0.00	0.00	0.05	0.08	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.10	0.02	0.11	0.10	0.10	0.09
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.07	0.08	0.07
N3	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.02	0.09	0.10	0.12	0.10
N4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.12	0.15	0.16	0.14
O2	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.08	0.04	0.06	0.05	0.09	0.06
O2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.03	0.01
O3'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.10	0.03	0.04	0.06	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.05	0.03
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03
O5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.07	0.09	0.12	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.07	0.06	0.06	0.13	0.05	0.13	0.04	0.10	0.07	0.10	0.15	0.05	0.06	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.10	0.04	0.03	0.14	0.02	0.14	0.01	0.10	0.08	0.12	0.16	0.09	0.03	0.05	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.08	0.03	0.03	0.12	0.01	0.12	0.00	0.09	0.07	0.10	0.14	0.06	0.01	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.17	0.26	0.26	0.21	0.28	0.23	0.30	0.14	0.34	0.12	0.18	0.18	0.34	0.27	0.24	0.26	0.28	0.30	0.34	0.30	0.29
C2	0.21	0.17	0.15	0.17	0.18	0.22	0.22	0.24	0.16	0.28	0.10	0.16	0.21	0.29	0.22	0.11	0.20	0.25	0.25	0.30	0.28	0.26
C2'	0.23	0.14	0.23	0.23	0.19	0.24	0.21	0.27	0.15	0.28	0.11	0.15	0.18	0.29	0.23	0.21	0.21	0.25	0.28	0.30	0.28	0.27
C3'	0.29	0.18	0.31	0.31	0.24	0.31	0.26	0.34	0.18	0.34	0.15	0.20	0.18	0.34	0.29	0.31	0.29	0.30	0.35	0.36	0.33	0.33
C4	0.21	0.20	0.13	0.16	0.14	0.22	0.17	0.22	0.11	0.27	0.10	0.18	0.19	0.28	0.20	0.09	0.20	0.25	0.22	0.30	0.28	0.24
C4'	0.35	0.19	0.37	0.37	0.27	0.36	0.28	0.38	0.18	0.41	0.15	0.22	0.18	0.40	0.34	0.38	0.36	0.35	0.40	0.42	0.38	0.39
C5	0.29	0.23	0.24	0.26	0.18	0.28	0.15	0.27	0.07	0.30	0.16	0.22	0.18	0.29	0.26	0.22	0.29	0.29	0.26	0.33	0.29	0.27
C5'	0.40	0.22	0.44	0.44	0.30	0.42	0.30	0.44	0.18	0.47	0.17	0.26	0.18	0.44	0.39	0.46	0.43	0.39	0.46	0.48	0.46	0.46
C6	0.30	0.22	0.28	0.29	0.21	0.30	0.19	0.30	0.07	0.33	0.16	0.22	0.15	0.31	0.28	0.27	0.30	0.30	0.29	0.35	0.30	0.29
N1	0.26	0.19	0.23	0.24	0.20	0.27	0.22	0.28	0.12	0.32	0.13	0.19	0.18	0.32	0.26	0.20	0.24	0.28	0.28	0.33	0.29	0.28
N3	0.19	0.17	0.12	0.14	0.16	0.20	0.20	0.22	0.15	0.26	0.07	0.15	0.20	0.27	0.20	0.10	0.19	0.24	0.23	0.29	0.28	0.25
N4	0.17	0.16	0.12	0.12	0.10	0.19	0.19	0.19	0.14	0.27	0.09	0.14	0.20	0.29	0.18	0.15	0.18	0.22	0.20	0.27	0.29	0.23
O2	0.19	0.16	0.14	0.16	0.18	0.21	0.23	0.24	0.19	0.27	0.13	0.16	0.24	0.29	0.21	0.10	0.20	0.24	0.26	0.30	0.28	0.26
O2'	0.21	0.12	0.22	0.21	0.17	0.22	0.20	0.25	0.14	0.27	0.10	0.13	0.17	0.27	0.22	0.20	0.20	0.23	0.27	0.30	0.28	0.26
O3'	0.27	0.17	0.31	0.30	0.23	0.29	0.24	0.33	0.18	0.31	0.15	0.19	0.18	0.31	0.27	0.31	0.28	0.27	0.36	0.36	0.34	0.34
O4'	0.35	0.19	0.36	0.36	0.26	0.36	0.28	0.37	0.16	0.42	0.13	0.22	0.19	0.41	0.34	0.35	0.35	0.35	0.37	0.42	0.36	0.37
O5'	0.42	0.24	0.46	0.46	0.31	0.43	0.30	0.45	0.17	0.48	0.18	0.27	0.17	0.46	0.40	0.47	0.45	0.41	0.46	0.48	0.45	0.46
OP1	0.48	0.25	0.55	0.56	0.33	0.52	0.31	0.55	0.20	0.52	0.21	0.30	0.16	0.46	0.44	0.57	0.55	0.47	0.57	0.58	0.61	0.59
OP2	0.48	0.24	0.53	0.54	0.31	0.50	0.26	0.51	0.13	0.51	0.18	0.28	0.12	0.42	0.43	0.56	0.54	0.45	0.51	0.53	0.51	0.51
P	0.46	0.24	0.52	0.52	0.31	0.49	0.29	0.50	0.16	0.51	0.18	0.28	0.14	0.45	0.42	0.54	0.52	0.44	0.51	0.54	0.54	0.53

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.13	0.21	0.18	0.14
C2	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.13	0.13	0.21	0.24	0.28	0.22
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.07	0.04	0.06	0.06	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.28	0.24	0.20
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.29	0.17	0.17
C4	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.09	0.07	0.20	0.24	0.29	0.22
C4'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.06	0.08	0.10	0.05	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.02	0.04
C5	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.04	0.20	0.25	0.34	0.25
C5'	0.04	0.15	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.11	0.12	0.13	0.14	0.11	0.11	0.07	0.05	0.04	0.01	0.01	0.10	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.10	0.06	0.21	0.25	0.34	0.25
C8	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.05	0.07	0.21	0.27	0.36	0.28
N1	0.01	0.00	0.06	0.03	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.12	0.10	0.22	0.25	0.31	0.23
N3	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.12	0.13	0.20	0.24	0.26	0.20
N6	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.05	0.21	0.27	0.36	0.27
N7	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.05	0.21	0.28	0.39	0.29
N9	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.18	0.23	0.28	0.22
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.09	0.02	0.06	0.05	0.09	0.11	0.15	0.17	0.08	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.14	0.33	0.30	0.23
O3'	0.06	0.13	0.02	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.10	0.05	0.12	0.12	0.09	0.05	0.06	0.03	0.00	0.05	0.08	0.35	0.17	0.18
O4'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.10	0.13	0.05	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.09	0.13	0.14	0.09
O5'	0.13	0.21	0.14	0.07	0.20	0.01	0.20	0.01	0.21	0.21	0.22	0.20	0.21	0.21	0.18	0.14	0.08	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.21	0.24	0.28	0.29	0.24	0.17	0.25	0.10	0.25	0.27	0.25	0.24	0.27	0.28	0.23	0.33	0.35	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.28	0.24	0.17	0.29	0.02	0.34	0.04	0.34	0.36	0.31	0.26	0.36	0.39	0.28	0.30	0.17	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.22	0.20	0.17	0.22	0.04	0.25	0.01	0.25	0.28	0.23	0.20	0.27	0.29	0.22	0.23	0.18	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00