Doublet Group distance statistics: 52137

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.003, 0.006, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.009
N1	A	0, -0.003, 0.015, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.015 std_dev=0.018
C6	A	0, -0.005, 0.020, 0.044, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.020 std_dev=0.024
C1'	A	0, -0.005, 0.021, 0.046, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.021 std_dev=0.026
C4	A	0, -0.005, 0.021, 0.047, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.021 std_dev=0.026
C2	A	0, -0.005, 0.022, 0.048, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.022 std_dev=0.027
O2	A	0, -0.012, 0.058, 0.128, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.058 std_dev=0.070
N4	A	0, -0.016, 0.061, 0.139, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.061 std_dev=0.077
C2'	A	0, 0.030, 0.108, 0.186, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.108 std_dev=0.078
O4'	A	0, 0.035, 0.120, 0.204, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.120 std_dev=0.084
C2'	B	0, 0.108, 0.290, 0.472, 0.453 max_d=0.453 avg_d=0.290 std_dev=0.182
C1'	B	0, 0.104, 0.356, 0.607, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.356 std_dev=0.252
N9	B	0, 0.127, 0.411, 0.694, 0.750 max_d=0.750 avg_d=0.411 std_dev=0.284
O4'	B	0, 0.114, 0.405, 0.696, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.405 std_dev=0.291
C8	B	0, 0.205, 0.537, 0.870, 0.854 max_d=0.854 avg_d=0.537 std_dev=0.332
C4	B	0, 0.078, 0.433, 0.789, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.433 std_dev=0.356
C5	B	0, 0.151, 0.540, 0.928, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.540 std_dev=0.389
N7	B	0, 0.228, 0.620, 1.012, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.620 std_dev=0.392
N3	B	0, 0.032, 0.454, 0.876, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.454 std_dev=0.422
C4'	A	0, 0.031, 0.469, 0.907, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.469 std_dev=0.438
C5'	A	0, 0.045, 0.491, 0.937, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.491 std_dev=0.446
C6	B	0, 0.133, 0.595, 1.057, 1.190 max_d=1.190 avg_d=0.595 std_dev=0.462
C2	B	0, 0.044, 0.539, 1.035, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.539 std_dev=0.496
N6	B	0, 0.205, 0.719, 1.234, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.719 std_dev=0.515
N1	B	0, 0.056, 0.573, 1.090, 1.316 max_d=1.316 avg_d=0.573 std_dev=0.517
C4'	B	0, 0.098, 0.634, 1.169, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.634 std_dev=0.536
C5'	B	0, 0.037, 0.602, 1.166, 1.424 max_d=1.424 avg_d=0.602 std_dev=0.564
O5'	A	0, 0.096, 0.866, 1.635, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.866 std_dev=0.769
P	A	0, 0.085, 0.861, 1.638, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.861 std_dev=0.777
O2'	A	0, 0.057, 0.839, 1.621, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.839 std_dev=0.782
O5'	B	0, 0.009, 0.816, 1.623, 1.925 max_d=1.925 avg_d=0.816 std_dev=0.807
C3'	A	0, 0.020, 0.834, 1.648, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.834 std_dev=0.814
C3'	B	0, 0.094, 0.920, 1.747, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.920 std_dev=0.826
O2'	B	0, 0.148, 1.041, 1.934, 1.957 max_d=1.957 avg_d=1.041 std_dev=0.893
P	B	0, 0.044, 0.989, 1.934, 2.072 max_d=2.072 avg_d=0.989 std_dev=0.945
OP1	A	0, 0.138, 1.133, 2.128, 2.150 max_d=2.150 avg_d=1.133 std_dev=0.995
OP1	B	0, 0.054, 1.103, 2.151, 2.316 max_d=2.316 avg_d=1.103 std_dev=1.048
O3'	A	0, 0.026, 1.580, 3.134, 3.196 max_d=3.196 avg_d=1.580 std_dev=1.554
OP2	A	0, 0.115, 1.739, 3.363, 3.402 max_d=3.402 avg_d=1.739 std_dev=1.624
O3'	B	0, 0.106, 1.765, 3.424, 3.507 max_d=3.507 avg_d=1.765 std_dev=1.659
OP2	B	0, 0.116, 1.927, 3.738, 3.846 max_d=3.846 avg_d=1.927 std_dev=1.811

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.32	0.00	0.10	0.73	0.08	0.28
C2	0.01	0.00	0.03	0.11	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.35	0.02	0.16	0.91	0.42	0.09
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.03	0.02	0.41	0.67	0.26	0.52
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.35	0.01	0.47	0.01	0.46	0.22	0.21	0.38	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.09	0.08	0.02
C4	0.01	0.00	0.02	0.35	0.00	0.18	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.40	0.03	0.05	0.37	0.98	0.81	0.07
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.18	0.00	0.24	0.00	0.23	0.10	0.10	0.19	0.05	0.33	0.02	0.01	0.01	0.10	0.18	0.04
C5	0.01	0.00	0.02	0.47	0.00	0.24	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.37	0.27	0.05	0.37	0.99	0.79	0.05
C5'	0.05	0.08	0.18	0.01	0.21	0.00	0.23	0.00	0.18	0.08	0.14	0.25	0.01	0.14	0.23	0.00	0.01	0.14	0.34	0.01
C6	0.00	0.01	0.01	0.46	0.00	0.23	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.25	0.04	0.25	0.96	0.52	0.12
N1	0.00	0.01	0.01	0.22	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.12	0.02	0.12	0.89	0.32	0.16
N3	0.01	0.00	0.02	0.21	0.00	0.10	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.35	0.23	0.03	0.28	0.96	0.64	0.02
N4	0.01	0.00	0.02	0.38	0.00	0.19	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.43	0.06	0.06	0.43	0.97	0.96	0.14
O2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.64	0.02	0.08	0.85	0.29	0.13
O2'	0.02	0.25	0.00	0.03	0.40	0.33	0.37	0.14	0.29	0.22	0.35	0.43	0.15	0.00	0.03	0.22	0.27	0.47	0.20	0.39
O3'	0.32	0.35	0.03	0.01	0.03	0.02	0.27	0.23	0.25	0.12	0.23	0.06	0.64	0.03	0.00	0.19	0.23	0.57	0.33	0.35
O4'	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.03	0.06	0.02	0.22	0.19	0.00	0.03	0.60	0.13	0.16
O5'	0.10	0.16	0.41	0.01	0.37	0.01	0.37	0.01	0.25	0.12	0.28	0.43	0.08	0.27	0.23	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.73	0.91	0.67	0.09	0.98	0.10	0.99	0.14	0.96	0.89	0.96	0.97	0.85	0.47	0.57	0.60	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.42	0.26	0.08	0.81	0.18	0.79	0.34	0.52	0.32	0.64	0.96	0.29	0.20	0.33	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.28	0.09	0.52	0.02	0.07	0.04	0.05	0.01	0.12	0.16	0.02	0.14	0.13	0.39	0.35	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.22	0.12	0.69	0.14	0.34	0.16	0.20	0.22	0.09	0.24	0.18	0.24	0.13	0.06	0.47	1.01	0.05	0.08	0.57	0.53	0.31
C2	0.10	0.20	0.12	0.55	0.06	0.23	0.05	0.13	0.14	0.14	0.21	0.14	0.16	0.12	0.06	0.62	0.66	0.05	0.10	0.74	0.75	0.24
C2'	0.11	0.25	0.14	0.80	0.20	0.43	0.22	0.30	0.25	0.14	0.27	0.22	0.26	0.19	0.14	0.29	1.09	0.12	0.22	0.57	0.58	0.24
C3'	0.60	0.34	0.73	0.13	0.39	0.22	0.27	0.27	0.20	0.38	0.25	0.42	0.13	0.24	0.48	0.93	0.56	0.51	0.43	0.47	0.06	0.64
C4	0.11	0.21	0.07	0.35	0.10	0.10	0.18	0.03	0.20	0.21	0.22	0.14	0.23	0.24	0.12	0.68	0.28	0.10	0.10	0.84	0.61	0.29
C4'	0.31	0.13	0.41	0.35	0.15	0.06	0.11	0.10	0.10	0.18	0.10	0.16	0.13	0.13	0.22	0.68	0.94	0.23	0.35	0.38	0.19	0.68
C5	0.11	0.21	0.08	0.34	0.14	0.09	0.20	0.05	0.20	0.22	0.21	0.17	0.21	0.25	0.14	0.68	0.30	0.11	0.18	0.84	0.41	0.38
C5'	0.17	0.14	0.28	0.41	0.10	0.23	0.09	0.09	0.11	0.09	0.12	0.15	0.13	0.12	0.10	0.55	1.13	0.06	0.28	0.04	0.30	0.53
C6	0.08	0.20	0.10	0.50	0.09	0.18	0.12	0.04	0.16	0.16	0.19	0.16	0.16	0.16	0.06	0.60	0.60	0.06	0.16	0.79	0.37	0.41
N1	0.08	0.21	0.12	0.59	0.09	0.25	0.10	0.12	0.17	0.11	0.21	0.16	0.18	0.11	0.03	0.57	0.76	0.03	0.08	0.72	0.57	0.32
N3	0.10	0.20	0.10	0.45	0.04	0.17	0.07	0.08	0.12	0.17	0.20	0.13	0.15	0.18	0.08	0.66	0.45	0.07	0.08	0.80	0.75	0.23
N4	0.12	0.23	0.06	0.25	0.16	0.05	0.25	0.04	0.30	0.23	0.28	0.16	0.35	0.28	0.16	0.69	0.10	0.12	0.11	0.87	0.63	0.27
O2	0.11	0.20	0.13	0.60	0.08	0.27	0.08	0.19	0.15	0.15	0.21	0.14	0.17	0.13	0.09	0.60	0.76	0.07	0.15	0.69	0.85	0.20
O2'	0.51	0.84	0.33	0.95	0.79	0.66	0.89	0.49	0.93	0.73	0.91	0.77	0.96	0.88	0.67	0.18	1.17	0.51	0.50	0.44	0.94	0.11
O3'	0.92	0.28	1.07	0.48	0.42	0.82	0.18	0.98	0.09	0.48	0.10	0.46	0.27	0.18	0.64	1.18	0.12	0.97	1.04	0.98	0.64	1.34
O4'	0.06	0.17	0.13	0.62	0.09	0.29	0.11	0.11	0.16	0.08	0.18	0.13	0.19	0.11	0.02	0.51	1.09	0.03	0.13	0.45	0.17	0.49
O5'	0.04	0.22	0.20	0.58	0.11	0.49	0.11	0.42	0.13	0.18	0.18	0.19	0.13	0.18	0.06	0.56	1.22	0.20	0.12	0.29	0.11	0.13
OP1	0.54	0.94	0.51	0.52	0.86	0.36	0.90	0.17	0.96	0.72	0.98	0.87	0.98	0.82	0.73	0.33	1.12	0.43	0.36	0.17	0.57	0.56
OP2	0.56	0.99	0.61	0.09	0.74	0.12	0.65	0.16	0.76	0.35	0.92	0.93	0.69	0.43	0.55	0.96	0.69	0.22	0.23	0.28	0.20	0.23
P	0.29	0.16	0.20	0.69	0.25	0.68	0.28	0.49	0.23	0.41	0.17	0.18	0.25	0.38	0.32	0.14	1.45	0.47	0.15	0.35	0.07	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.36	0.00	0.15	0.63	0.10	0.18
C2	0.02	0.00	0.12	0.09	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.45	0.47	0.06	0.08	0.68	0.75	0.07
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.22	0.05	0.05	0.09	0.12	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.46	0.65	0.29	0.51
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.20	0.01	0.33	0.02	0.30	0.44	0.19	0.06	0.37	0.45	0.25	0.02	0.00	0.02	0.04	0.07	0.09	0.05
C4	0.01	0.00	0.07	0.20	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.36	0.24	0.03	0.13	0.68	0.71	0.07
C4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.13	0.24	0.06	0.03	0.18	0.24	0.11	0.29	0.01	0.00	0.02	0.13	0.19	0.03
C5	0.00	0.00	0.03	0.33	0.00	0.15	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.41	0.05	0.02	0.29	0.67	1.04	0.21
C5'	0.07	0.04	0.22	0.02	0.09	0.00	0.19	0.00	0.19	0.25	0.11	0.03	0.25	0.29	0.10	0.08	0.21	0.01	0.01	0.12	0.39	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.30	0.00	0.13	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.47	0.11	0.01	0.29	0.65	1.14	0.24
C8	0.01	0.00	0.05	0.44	0.00	0.24	0.00	0.25	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.20	0.06	0.34	0.68	0.87	0.18
N1	0.01	0.00	0.09	0.19	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.48	0.30	0.04	0.19	0.67	0.99	0.16
N3	0.02	0.00	0.12	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.39	0.51	0.07	0.04	0.68	0.57	0.05
N6	0.01	0.00	0.04	0.37	0.00	0.18	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.48	0.04	0.02	0.38	0.61	1.35	0.35
N7	0.00	0.00	0.03	0.45	0.00	0.24	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.35	0.20	0.05	0.41	0.65	1.18	0.30
N9	0.00	0.00	0.02	0.25	0.00	0.11	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.12	0.01	0.12	0.69	0.54	0.03
O2'	0.01	0.45	0.01	0.02	0.36	0.29	0.41	0.08	0.47	0.25	0.48	0.39	0.48	0.35	0.23	0.00	0.05	0.21	0.35	0.50	0.29	0.43
O3'	0.36	0.47	0.04	0.00	0.24	0.01	0.05	0.21	0.11	0.20	0.30	0.51	0.04	0.20	0.12	0.05	0.00	0.24	0.22	0.43	0.20	0.26
O4'	0.00	0.06	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.04	0.07	0.02	0.05	0.01	0.21	0.24	0.00	0.03	0.51	0.04	0.09
O5'	0.15	0.08	0.46	0.04	0.13	0.02	0.29	0.01	0.29	0.34	0.19	0.04	0.38	0.41	0.12	0.35	0.22	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.63	0.68	0.65	0.07	0.68	0.13	0.67	0.12	0.65	0.68	0.67	0.68	0.61	0.65	0.69	0.50	0.43	0.51	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.75	0.29	0.09	0.71	0.19	1.04	0.39	1.14	0.87	0.99	0.57	1.35	1.18	0.54	0.29	0.20	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.07	0.51	0.05	0.07	0.03	0.21	0.01	0.24	0.18	0.16	0.05	0.35	0.30	0.03	0.43	0.26	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00