Doublet Group distance statistics: 52141

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.012, 0.024, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N4	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.000, 0.021, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
O2	A	0, 0.000, 0.032, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.032
O2'	A	0, 0.000, 0.088, 0.176, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.088 std_dev=0.088
P	B	0, 0.000, 0.104, 0.208, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.104 std_dev=0.104
O4'	A	0, 0.000, 0.111, 0.223, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.111 std_dev=0.111
C2'	A	0, 0.000, 0.131, 0.261, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.131 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.000, 0.176, 0.352, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.176 std_dev=0.176
C3'	A	0, 0.000, 0.201, 0.402, 0.402 max_d=0.402 avg_d=0.201 std_dev=0.201
O3'	A	0, 0.000, 0.297, 0.594, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.297 std_dev=0.297
C5'	A	0, 0.000, 0.312, 0.623, 0.623 max_d=0.623 avg_d=0.312 std_dev=0.312
O4'	B	0, 0.000, 0.382, 0.764, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.382 std_dev=0.382
C4'	B	0, 0.000, 0.443, 0.886, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.443 std_dev=0.443
N3	B	0, 0.000, 0.464, 0.929, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.464 std_dev=0.464
C4	B	0, 0.000, 0.522, 1.044, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.522 std_dev=0.522
C5'	B	0, 0.000, 0.533, 1.066, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.533 std_dev=0.533
C1'	B	0, 0.000, 0.572, 1.143, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.572 std_dev=0.572
C2	B	0, 0.000, 0.577, 1.154, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.577 std_dev=0.577
N9	B	0, 0.000, 0.589, 1.178, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.589 std_dev=0.589
N1	B	0, 0.000, 0.645, 1.290, 1.290 max_d=1.290 avg_d=0.645 std_dev=0.645
O5'	B	0, 0.000, 0.659, 1.318, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.659 std_dev=0.659
O5'	A	0, 0.000, 0.682, 1.363, 1.363 max_d=1.363 avg_d=0.682 std_dev=0.682
C5	B	0, 0.000, 0.702, 1.405, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.702 std_dev=0.702
OP1	B	0, 0.000, 0.722, 1.444, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.722 std_dev=0.722
C6	B	0, 0.000, 0.744, 1.489, 1.489 max_d=1.489 avg_d=0.744 std_dev=0.744
OP2	B	0, 0.000, 0.754, 1.508, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.754 std_dev=0.754
C8	B	0, 0.000, 0.826, 1.652, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.826 std_dev=0.826
N7	B	0, 0.000, 0.912, 1.824, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.912 std_dev=0.912
N6	B	0, 0.000, 0.956, 1.912, 1.912 max_d=1.912 avg_d=0.956 std_dev=0.956
C3'	B	0, 0.000, 0.982, 1.964, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.982 std_dev=0.982
C2'	B	0, 0.000, 1.035, 2.070, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.035 std_dev=1.035
O2'	B	0, 0.000, 1.336, 2.673, 2.673 max_d=2.673 avg_d=1.336 std_dev=1.336
P	A	0, 0.000, 1.366, 2.732, 2.732 max_d=2.732 avg_d=1.366 std_dev=1.366
O3'	B	0, 0.000, 1.378, 2.757, 2.757 max_d=2.757 avg_d=1.378 std_dev=1.378
OP2	A	0, 0.000, 1.577, 3.154, 3.154 max_d=3.154 avg_d=1.577 std_dev=1.577
OP1	A	0, 0.000, 1.732, 3.464, 3.464 max_d=3.464 avg_d=1.732 std_dev=1.732

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.05	0.29	0.45	0.21
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.16	0.38	0.61	0.34
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.14	0.54	0.67	0.42
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.00	0.00	0.22	0.66	0.63	0.51
C4	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.32	0.54	0.69	0.50
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.02	0.23	0.17	0.11
C5	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.37	0.57	0.68	0.55
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.15	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.32	0.51	0.64	0.48
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.18	0.39	0.57	0.34
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.23	0.45	0.66	0.41
N4	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.36	0.58	0.70	0.54
O2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.08	0.30	0.57	0.26
O2'	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.02	0.01	0.37	0.54	0.26
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.00	0.09	0.06	0.00	0.01	0.19	0.77	0.64	0.54
O4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.07	0.14	0.01
O5'	0.05	0.16	0.14	0.22	0.32	0.02	0.37	0.02	0.32	0.18	0.23	0.36	0.08	0.01	0.19	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.29	0.38	0.54	0.66	0.54	0.23	0.57	0.15	0.51	0.39	0.45	0.58	0.30	0.37	0.77	0.07	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.45	0.61	0.67	0.63	0.69	0.17	0.68	0.18	0.64	0.57	0.66	0.70	0.57	0.54	0.64	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.21	0.34	0.42	0.51	0.50	0.11	0.55	0.01	0.48	0.34	0.41	0.54	0.26	0.26	0.54	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.28	0.15	0.02	0.16	0.08	0.07	0.35	0.11	0.05	0.20	0.28	0.06	0.04	0.06	0.38	0.12	0.15	0.08	0.06	0.12	0.03
C2	0.02	0.38	0.08	0.07	0.19	0.19	0.13	0.35	0.23	0.12	0.33	0.32	0.19	0.04	0.01	0.28	0.05	0.25	0.20	0.02	0.26	0.02
C2'	0.15	0.27	0.16	0.02	0.20	0.04	0.13	0.34	0.16	0.04	0.21	0.29	0.12	0.05	0.12	0.33	0.13	0.08	0.00	0.04	0.23	0.08
C3'	0.00	0.13	0.07	0.23	0.04	0.15	0.02	0.40	0.01	0.09	0.07	0.13	0.02	0.08	0.02	0.10	0.14	0.14	0.15	0.07	0.01	0.01
C4	0.22	0.40	0.19	0.27	0.03	0.25	0.04	0.27	0.16	0.41	0.35	0.25	0.11	0.33	0.22	0.04	0.20	0.26	0.31	0.13	0.31	0.06
C4'	0.00	0.08	0.04	0.20	0.01	0.13	0.09	0.39	0.07	0.15	0.00	0.10	0.12	0.16	0.06	0.19	0.08	0.16	0.14	0.07	0.25	0.09
C5	0.22	0.36	0.24	0.33	0.05	0.24	0.16	0.25	0.01	0.41	0.25	0.22	0.06	0.38	0.25	0.07	0.26	0.24	0.32	0.19	0.26	0.06
C5'	0.13	0.08	0.21	0.38	0.17	0.21	0.25	0.40	0.24	0.28	0.17	0.06	0.30	0.31	0.20	0.03	0.27	0.22	0.26	0.12	0.48	0.17
C6	0.12	0.32	0.14	0.26	0.01	0.19	0.09	0.28	0.02	0.29	0.19	0.25	0.05	0.26	0.16	0.05	0.17	0.22	0.26	0.18	0.20	0.06
N1	0.01	0.33	0.03	0.12	0.13	0.16	0.04	0.33	0.13	0.15	0.24	0.30	0.07	0.11	0.03	0.24	0.01	0.22	0.20	0.08	0.20	0.04
N3	0.13	0.40	0.04	0.15	0.14	0.24	0.11	0.32	0.25	0.25	0.37	0.29	0.22	0.13	0.09	0.12	0.06	0.27	0.27	0.05	0.30	0.03
N4	0.27	0.39	0.27	0.31	0.02	0.27	0.08	0.24	0.19	0.50	0.40	0.21	0.16	0.44	0.28	0.16	0.28	0.26	0.34	0.14	0.34	0.07
O2	0.08	0.37	0.24	0.07	0.24	0.14	0.20	0.37	0.27	0.01	0.34	0.32	0.24	0.07	0.11	0.47	0.21	0.22	0.14	0.05	0.24	0.01
O2'	0.30	0.26	0.37	0.23	0.26	0.11	0.20	0.31	0.20	0.17	0.22	0.29	0.17	0.16	0.24	0.57	0.38	0.03	0.16	0.08	0.14	0.05
O3'	0.04	0.09	0.05	0.20	0.06	0.09	0.02	0.37	0.04	0.02	0.06	0.11	0.01	0.01	0.03	0.06	0.15	0.05	0.01	0.03	0.03	0.00
O4'	0.03	0.19	0.05	0.12	0.05	0.11	0.04	0.38	0.01	0.13	0.09	0.19	0.07	0.13	0.03	0.30	0.02	0.17	0.13	0.07	0.11	0.05
O5'	0.25	0.55	0.17	0.00	0.34	0.12	0.24	0.06	0.29	0.12	0.43	0.52	0.21	0.12	0.23	0.36	0.07	0.15	0.04	0.39	0.01	0.16
OP1	0.80	1.00	0.71	0.61	0.83	0.80	0.69	0.74	0.68	0.62	0.81	1.02	0.55	0.59	0.76	0.83	0.64	0.81	0.75	1.19	0.63	0.86
OP2	0.88	1.05	0.76	0.60	0.91	0.80	0.75	0.70	0.68	0.73	0.79	1.11	0.52	0.66	0.85	0.90	0.61	0.88	0.52	0.85	0.61	0.68
P	0.63	0.94	0.54	0.40	0.71	0.57	0.58	0.47	0.59	0.47	0.75	0.92	0.47	0.45	0.61	0.68	0.43	0.61	0.44	0.85	0.46	0.60

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.07	0.07	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.13	0.03	0.50	0.15
C2	0.07	0.00	0.37	0.50	0.02	0.14	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.25	0.56	0.06	0.45	0.14	0.29	0.04
C2'	0.00	0.37	0.00	0.01	0.21	0.03	0.14	0.01	0.21	0.10	0.32	0.36	0.17	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.24	0.19	0.31	0.02
C3'	0.01	0.50	0.01	0.00	0.25	0.00	0.17	0.00	0.26	0.09	0.42	0.47	0.22	0.01	0.06	0.03	0.00	0.01	0.32	0.35	0.14	0.16
C4	0.03	0.02	0.21	0.25	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.27	0.08	0.29	0.12	0.46	0.12
C4'	0.01	0.14	0.03	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.11	0.13	0.04	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.03	0.10	0.40	0.08
C5	0.03	0.00	0.14	0.17	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.20	0.06	0.29	0.13	0.42	0.10
C5'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.08	0.11	0.06	0.12	0.04	0.01	0.01	0.21	0.30	0.04
C6	0.04	0.02	0.21	0.26	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.31	0.06	0.35	0.16	0.35	0.08
C8	0.01	0.02	0.10	0.09	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.08	0.09	0.02	0.17	0.08	0.48	0.13
N1	0.07	0.01	0.32	0.42	0.03	0.11	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.22	0.48	0.05	0.42	0.15	0.27	0.04
N3	0.07	0.01	0.36	0.47	0.01	0.13	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.23	0.49	0.07	0.40	0.13	0.43	0.09
N6	0.04	0.02	0.17	0.22	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.27	0.05	0.35	0.15	0.32	0.06
N7	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.22	0.11	0.45	0.12
N9	0.02	0.03	0.05	0.06	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.06	0.05	0.20	0.09	0.50	0.14
O2'	0.01	0.25	0.01	0.03	0.13	0.10	0.09	0.12	0.13	0.08	0.22	0.23	0.11	0.02	0.03	0.00	0.02	0.04	0.16	0.19	0.37	0.04
O3'	0.01	0.56	0.01	0.00	0.27	0.00	0.20	0.04	0.31	0.09	0.48	0.49	0.27	0.00	0.06	0.02	0.00	0.00	0.25	0.46	0.07	0.18
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.08	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.07	0.05	0.04	0.05	0.04	0.00	0.00	0.07	0.07	0.55	0.17
O5'	0.13	0.45	0.24	0.32	0.29	0.03	0.29	0.01	0.35	0.17	0.42	0.40	0.35	0.22	0.20	0.16	0.25	0.07	0.00	0.04	0.00	0.00
OP1	0.03	0.14	0.19	0.35	0.12	0.10	0.13	0.21	0.16	0.08	0.15	0.13	0.15	0.11	0.09	0.19	0.46	0.07	0.04	0.00	0.00	0.00
OP2	0.50	0.29	0.31	0.14	0.46	0.40	0.42	0.30	0.35	0.48	0.27	0.43	0.32	0.45	0.50	0.37	0.07	0.55	0.00	0.00	0.00	0.01
P	0.15	0.04	0.02	0.16	0.12	0.08	0.10	0.04	0.08	0.13	0.04	0.09	0.06	0.12	0.14	0.04	0.18	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00