Doublet Group distance statistics: 52163

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 4, 4, 6, 3, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C2	A	0, -0.002, 0.010, 0.021, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.010 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.001, 0.017, 0.032, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.017 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.014, 0.033, 0.052, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.033 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.012, 0.033, 0.053, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.033 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.016, 0.039, 0.061, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.039 std_dev=0.022
N2	A	0, -0.001, 0.026, 0.053, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.026 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.061, 0.136, 0.211, 0.326 max_d=0.326 avg_d=0.136 std_dev=0.075
C2'	A	0, 0.053, 0.130, 0.208, 0.284 max_d=0.284 avg_d=0.130 std_dev=0.078
O2'	A	0, 0.077, 0.178, 0.280, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.178 std_dev=0.101
C3'	A	0, 0.089, 0.223, 0.357, 0.558 max_d=0.558 avg_d=0.223 std_dev=0.134
C4'	A	0, 0.075, 0.213, 0.351, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.213 std_dev=0.138
C2'	B	0, 0.281, 0.462, 0.643, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.462 std_dev=0.181
O3'	A	0, 0.115, 0.311, 0.507, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.311 std_dev=0.196
C3'	B	0, 0.159, 0.366, 0.572, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.366 std_dev=0.206
O2'	B	0, 0.374, 0.608, 0.841, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.608 std_dev=0.234
N3	B	0, 0.486, 0.746, 1.007, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.746 std_dev=0.261
C1'	B	0, 0.285, 0.546, 0.807, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.546 std_dev=0.261
C4	B	0, 0.389, 0.651, 0.913, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.651 std_dev=0.262
C5'	A	0, 0.143, 0.416, 0.689, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.416 std_dev=0.273
N9	B	0, 0.283, 0.559, 0.836, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.559 std_dev=0.276
C4'	B	0, 0.277, 0.563, 0.848, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.563 std_dev=0.285
O5'	B	0, 0.797, 1.093, 1.390, 1.514 max_d=1.514 avg_d=1.093 std_dev=0.297
P	B	0, 0.257, 0.554, 0.851, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.554 std_dev=0.297
C5	B	0, 0.430, 0.731, 1.032, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.731 std_dev=0.301
O3'	B	0, 0.106, 0.408, 0.709, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.408 std_dev=0.301
C8	B	0, 0.337, 0.641, 0.945, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.641 std_dev=0.304
O5'	A	0, 0.189, 0.493, 0.798, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.493 std_dev=0.304
N7	B	0, 0.413, 0.729, 1.046, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.729 std_dev=0.317
OP1	B	0, 0.692, 1.013, 1.334, 1.556 max_d=1.556 avg_d=1.013 std_dev=0.321
C2	B	0, 0.572, 0.897, 1.222, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.897 std_dev=0.325
C6	B	0, 0.540, 0.881, 1.222, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.881 std_dev=0.341
O4'	B	0, 0.272, 0.627, 0.982, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.627 std_dev=0.355
N1	B	0, 0.591, 0.957, 1.323, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.957 std_dev=0.366
N6	B	0, 0.615, 1.002, 1.388, 1.553 max_d=1.553 avg_d=1.002 std_dev=0.386
OP2	B	0, 0.240, 0.660, 1.079, 1.894 max_d=1.894 avg_d=0.660 std_dev=0.420
P	A	0, 0.255, 0.696, 1.138, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.696 std_dev=0.442
C5'	B	0, 0.386, 0.831, 1.276, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.831 std_dev=0.445
OP2	A	0, 0.317, 0.809, 1.301, 2.055 max_d=2.055 avg_d=0.809 std_dev=0.492
OP1	A	0, 0.254, 0.882, 1.510, 2.486 max_d=2.486 avg_d=0.882 std_dev=0.628

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.02	0.09	0.16	0.11
C2	0.03	0.00	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.10	0.03	0.21	0.01	0.23	0.39	0.25
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.03	0.06	0.08	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.09	0.08	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.11	0.09	0.10	0.09	0.08	0.10	0.06	0.02	0.00	0.01	0.03	0.12	0.10	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.22	0.02	0.23	0.36	0.25
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.11	0.02	0.27	0.01	0.32	0.45	0.32
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.16	0.11	0.07	0.07	0.18	0.10	0.06	0.02	0.02	0.01	0.18	0.07	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.13	0.02	0.28	0.01	0.35	0.50	0.34
C8	0.01	0.01	0.03	0.09	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.27	0.02	0.29	0.38	0.29
N1	0.03	0.01	0.06	0.10	0.02	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.11	0.03	0.25	0.01	0.29	0.46	0.30
N2	0.04	0.00	0.08	0.09	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.10	0.11	0.05	0.19	0.01	0.20	0.38	0.23
N3	0.03	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.19	0.01	0.19	0.34	0.22
N7	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.08	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.03	0.29	0.02	0.35	0.48	0.35
N9	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.20	0.02	0.20	0.30	0.21
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.06	0.02	0.08	0.10	0.08	0.02	0.02	0.00	0.04	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06
O3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.08	0.02	0.11	0.02	0.13	0.10	0.11	0.11	0.08	0.12	0.06	0.04	0.00	0.02	0.09	0.14	0.10	0.10	0.05
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.08	0.03	0.06	0.12	0.08
O5'	0.10	0.21	0.05	0.03	0.22	0.02	0.27	0.01	0.28	0.27	0.25	0.19	0.19	0.29	0.20	0.05	0.09	0.08	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.12	0.02	0.08	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.14	0.03	0.31	0.00	0.40	0.55	0.39
OP1	0.09	0.23	0.09	0.10	0.23	0.07	0.32	0.07	0.35	0.29	0.29	0.20	0.19	0.35	0.20	0.06	0.10	0.06	0.01	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.39	0.08	0.04	0.36	0.03	0.45	0.01	0.50	0.38	0.46	0.38	0.34	0.48	0.30	0.06	0.10	0.12	0.01	0.55	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.25	0.06	0.03	0.25	0.02	0.32	0.01	0.34	0.29	0.30	0.23	0.22	0.35	0.21	0.06	0.05	0.08	0.00	0.39	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.26	0.22	0.18	0.22	0.27	0.22	0.25	0.20	0.30	0.23	0.24	0.20	0.27	0.26	0.24	0.14	0.33	0.41	0.31	0.26	0.21
C2	0.27	0.24	0.25	0.21	0.22	0.25	0.22	0.24	0.20	0.29	0.21	0.24	0.20	0.27	0.25	0.30	0.18	0.29	0.39	0.40	0.17	0.22
C2'	0.25	0.26	0.21	0.17	0.21	0.24	0.20	0.22	0.19	0.28	0.22	0.24	0.19	0.26	0.24	0.24	0.14	0.30	0.38	0.26	0.29	0.19
C3'	0.21	0.24	0.17	0.14	0.18	0.20	0.18	0.19	0.17	0.25	0.20	0.21	0.17	0.23	0.20	0.19	0.10	0.27	0.33	0.16	0.31	0.12
C4	0.27	0.23	0.22	0.19	0.21	0.26	0.22	0.23	0.20	0.31	0.20	0.23	0.20	0.28	0.26	0.25	0.15	0.31	0.41	0.33	0.22	0.21
C4'	0.26	0.26	0.20	0.17	0.22	0.26	0.22	0.26	0.21	0.30	0.23	0.24	0.21	0.27	0.25	0.21	0.12	0.33	0.36	0.22	0.29	0.15
C5	0.27	0.23	0.21	0.20	0.23	0.27	0.24	0.26	0.22	0.32	0.21	0.23	0.23	0.30	0.26	0.23	0.18	0.32	0.41	0.31	0.22	0.20
C5'	0.23	0.23	0.17	0.15	0.19	0.24	0.20	0.26	0.19	0.28	0.21	0.21	0.20	0.26	0.23	0.19	0.11	0.31	0.32	0.17	0.37	0.16
C6	0.28	0.25	0.23	0.22	0.25	0.26	0.26	0.23	0.24	0.33	0.23	0.25	0.26	0.32	0.27	0.24	0.20	0.32	0.42	0.33	0.18	0.21
C8	0.25	0.23	0.19	0.20	0.22	0.29	0.23	0.32	0.21	0.32	0.21	0.22	0.22	0.30	0.26	0.20	0.16	0.33	0.40	0.27	0.27	0.20
N1	0.27	0.25	0.25	0.22	0.24	0.27	0.24	0.24	0.22	0.30	0.23	0.26	0.23	0.29	0.26	0.27	0.18	0.30	0.40	0.39	0.16	0.22
N2	0.27	0.26	0.27	0.22	0.23	0.26	0.22	0.30	0.21	0.28	0.23	0.26	0.21	0.26	0.25	0.33	0.23	0.27	0.37	0.44	0.16	0.24
N3	0.27	0.24	0.24	0.19	0.21	0.24	0.21	0.22	0.19	0.29	0.21	0.23	0.19	0.27	0.25	0.29	0.16	0.30	0.40	0.37	0.20	0.22
N7	0.26	0.23	0.19	0.21	0.23	0.29	0.25	0.33	0.23	0.34	0.21	0.23	0.25	0.32	0.27	0.21	0.19	0.32	0.40	0.26	0.26	0.20
N9	0.26	0.24	0.21	0.19	0.21	0.27	0.22	0.26	0.20	0.31	0.21	0.23	0.20	0.28	0.25	0.22	0.14	0.33	0.41	0.30	0.25	0.20
O2'	0.31	0.30	0.27	0.22	0.26	0.28	0.25	0.25	0.24	0.32	0.27	0.28	0.23	0.29	0.29	0.30	0.20	0.34	0.44	0.34	0.29	0.25
O3'	0.20	0.25	0.18	0.14	0.18	0.18	0.18	0.17	0.17	0.24	0.21	0.23	0.17	0.22	0.20	0.20	0.11	0.25	0.30	0.11	0.33	0.09
O4'	0.29	0.26	0.22	0.20	0.24	0.30	0.24	0.31	0.22	0.33	0.24	0.24	0.22	0.30	0.28	0.23	0.14	0.38	0.41	0.31	0.27	0.20
O5'	0.26	0.27	0.23	0.20	0.24	0.24	0.25	0.26	0.24	0.31	0.25	0.25	0.24	0.30	0.26	0.26	0.18	0.30	0.32	0.23	0.47	0.26
O6	0.30	0.28	0.22	0.23	0.28	0.27	0.30	0.25	0.29	0.36	0.27	0.29	0.31	0.35	0.30	0.24	0.27	0.34	0.42	0.31	0.17	0.21
OP1	0.25	0.23	0.23	0.20	0.22	0.22	0.23	0.25	0.22	0.31	0.22	0.21	0.23	0.30	0.25	0.27	0.19	0.28	0.34	0.39	0.67	0.43
OP2	0.47	0.48	0.47	0.37	0.46	0.33	0.46	0.29	0.46	0.48	0.47	0.47	0.46	0.47	0.46	0.54	0.34	0.41	0.43	0.52	0.75	0.54
P	0.27	0.28	0.27	0.20	0.25	0.21	0.26	0.24	0.25	0.31	0.26	0.26	0.26	0.30	0.27	0.32	0.20	0.27	0.31	0.33	0.59	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.30	0.14	0.12
C2	0.05	0.00	0.18	0.26	0.01	0.11	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.32	0.06	0.20	0.51	0.26	0.26
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.10	0.14	0.19	0.06	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.49	0.13	0.19
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.14	0.00	0.11	0.01	0.15	0.18	0.21	0.24	0.14	0.15	0.07	0.02	0.01	0.01	0.32	0.59	0.29	0.34
C4	0.03	0.01	0.09	0.14	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.03	0.21	0.49	0.27	0.25
C4'	0.00	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.10	0.14	0.11	0.11	0.12	0.13	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.21	0.10	0.04
C5	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.01	0.28	0.57	0.39	0.35
C5'	0.03	0.17	0.01	0.01	0.14	0.00	0.19	0.00	0.21	0.23	0.19	0.14	0.24	0.24	0.13	0.04	0.03	0.01	0.01	0.12	0.23	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.15	0.01	0.10	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.29	0.60	0.42	0.38
C8	0.02	0.01	0.10	0.18	0.01	0.14	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.20	0.05	0.29	0.52	0.37	0.33
N1	0.04	0.00	0.14	0.21	0.01	0.11	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.27	0.04	0.25	0.57	0.35	0.33
N3	0.06	0.00	0.19	0.24	0.00	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.29	0.06	0.18	0.46	0.21	0.21
N6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.12	0.01	0.24	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.17	0.02	0.34	0.65	0.51	0.45
N7	0.01	0.01	0.07	0.15	0.00	0.13	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.18	0.04	0.33	0.60	0.47	0.41
N9	0.01	0.02	0.02	0.07	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.20	0.44	0.23	0.22
O2'	0.01	0.15	0.00	0.02	0.07	0.04	0.04	0.04	0.07	0.06	0.12	0.15	0.06	0.04	0.01	0.00	0.04	0.05	0.09	0.36	0.16	0.10
O3'	0.01	0.32	0.02	0.01	0.16	0.02	0.13	0.03	0.18	0.20	0.27	0.29	0.17	0.18	0.07	0.04	0.00	0.02	0.54	0.71	0.40	0.50
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.31	0.21	0.21	0.24
O5'	0.15	0.20	0.13	0.32	0.21	0.01	0.28	0.01	0.29	0.29	0.25	0.18	0.34	0.33	0.20	0.09	0.54	0.31	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.30	0.51	0.49	0.59	0.49	0.21	0.57	0.12	0.60	0.52	0.57	0.46	0.65	0.60	0.44	0.36	0.71	0.21	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.26	0.13	0.29	0.27	0.10	0.39	0.23	0.42	0.37	0.35	0.21	0.51	0.47	0.23	0.16	0.40	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.26	0.19	0.34	0.25	0.04	0.35	0.01	0.38	0.33	0.33	0.21	0.45	0.41	0.22	0.10	0.50	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00