Doublet Group distance statistics: 52164

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 2, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.014, 0.029, 0.044, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.025 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.032 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.018, 0.034, 0.051, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.034 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.010, 0.028, 0.045, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.032 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.020, 0.039, 0.059, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.039 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.033, 0.065, 0.096, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.065 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.014, 0.045, 0.077, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.045 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.040, 0.072, 0.105, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.072 std_dev=0.032
O6	A	0, 0.024, 0.064, 0.103, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.064 std_dev=0.040
O4'	A	0, 0.083, 0.222, 0.362, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.222 std_dev=0.140
C2'	A	0, 0.131, 0.280, 0.429, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.280 std_dev=0.149
C3'	A	0, 0.179, 0.357, 0.536, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.357 std_dev=0.178
C4'	A	0, 0.166, 0.363, 0.560, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.363 std_dev=0.197
O3'	A	0, 0.144, 0.349, 0.555, 0.662 max_d=0.662 avg_d=0.349 std_dev=0.206
O4'	B	0, 0.183, 0.402, 0.621, 0.702 max_d=0.702 avg_d=0.402 std_dev=0.219
O2'	A	0, 0.219, 0.464, 0.709, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.464 std_dev=0.245
C6	B	0, 0.252, 0.511, 0.770, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.511 std_dev=0.259
C4	B	0, 0.127, 0.390, 0.653, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.390 std_dev=0.263
P	B	0, 0.218, 0.486, 0.755, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.486 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.248, 0.525, 0.802, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.525 std_dev=0.277
C1'	B	0, 0.167, 0.453, 0.738, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.453 std_dev=0.285
C4'	B	0, 0.269, 0.559, 0.850, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.559 std_dev=0.291
N9	B	0, 0.174, 0.465, 0.756, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.465 std_dev=0.291
O5'	A	0, 0.270, 0.562, 0.855, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.562 std_dev=0.292
C5'	A	0, 0.262, 0.560, 0.858, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.560 std_dev=0.298
O5'	B	0, 0.256, 0.566, 0.877, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.566 std_dev=0.310
C5'	B	0, 0.280, 0.600, 0.921, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.600 std_dev=0.321
N1	B	0, 0.091, 0.415, 0.739, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.415 std_dev=0.324
C2'	B	0, 0.350, 0.690, 1.029, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.690 std_dev=0.340
N6	B	0, 0.366, 0.721, 1.075, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.721 std_dev=0.354
N3	B	0, 0.129, 0.483, 0.837, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.483 std_dev=0.354
C3'	B	0, 0.375, 0.732, 1.089, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.732 std_dev=0.357
C8	B	0, 0.313, 0.704, 1.095, 1.380 max_d=1.380 avg_d=0.704 std_dev=0.391
C2	B	0, 0.103, 0.502, 0.901, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.502 std_dev=0.399
OP2	A	0, 0.091, 0.493, 0.895, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.493 std_dev=0.402
N7	B	0, 0.379, 0.781, 1.183, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.781 std_dev=0.402
O3'	B	0, 0.399, 0.808, 1.216, 1.372 max_d=1.372 avg_d=0.808 std_dev=0.408
P	A	0, 0.114, 0.527, 0.940, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.527 std_dev=0.413
OP2	B	0, 0.147, 0.566, 0.984, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.566 std_dev=0.418
O2'	B	0, 0.490, 0.911, 1.332, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.911 std_dev=0.421
OP1	B	0, 0.184, 0.614, 1.045, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.614 std_dev=0.431
OP1	A	0, 0.054, 0.650, 1.246, 2.059 max_d=2.059 avg_d=0.650 std_dev=0.596

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.07	0.06	0.04	0.01	0.03	0.08	0.01	0.08	0.02	0.23	0.11	0.13
C2	0.06	0.00	0.06	0.08	0.02	0.11	0.03	0.16	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.13	0.16	0.12	0.24	0.03	0.58	0.40	0.41
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.06	0.08	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.04	0.19	0.11	0.12
C3'	0.03	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.05	0.06	0.10	0.08	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.14	0.08	0.09
C4	0.03	0.02	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.06	0.22	0.01	0.49	0.26	0.33
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.05	0.09	0.14	0.10	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.09	0.09	0.06
C5	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03	0.25	0.02	0.57	0.23	0.36
C5'	0.02	0.16	0.03	0.02	0.10	0.01	0.10	0.00	0.13	0.09	0.15	0.19	0.14	0.09	0.06	0.03	0.03	0.02	0.01	0.14	0.02	0.05	0.01
C6	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.11	0.12	0.06	0.27	0.01	0.64	0.30	0.42
C8	0.03	0.03	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.05	0.21	0.04	0.38	0.10	0.20
N1	0.05	0.01	0.06	0.06	0.02	0.09	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.12	0.15	0.10	0.26	0.02	0.63	0.38	0.43
N2	0.07	0.01	0.08	0.10	0.03	0.14	0.03	0.19	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.16	0.18	0.15	0.25	0.04	0.58	0.45	0.43
N3	0.06	0.01	0.07	0.08	0.01	0.10	0.02	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.13	0.15	0.12	0.21	0.02	0.49	0.34	0.35
N7	0.04	0.03	0.06	0.05	0.02	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.13	0.10	0.04	0.24	0.04	0.51	0.11	0.29
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.00	0.06	0.09	0.01	0.18	0.02	0.36	0.15	0.22
O2'	0.03	0.13	0.01	0.02	0.08	0.02	0.10	0.03	0.11	0.12	0.12	0.16	0.13	0.13	0.06	0.00	0.05	0.03	0.09	0.11	0.26	0.14	0.16
O3'	0.08	0.16	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.03	0.12	0.09	0.15	0.18	0.15	0.10	0.09	0.05	0.00	0.04	0.06	0.11	0.14	0.08	0.08
O4'	0.01	0.12	0.02	0.01	0.06	0.01	0.03	0.02	0.06	0.05	0.10	0.15	0.12	0.04	0.01	0.03	0.04	0.00	0.09	0.05	0.20	0.14	0.13
O5'	0.08	0.24	0.05	0.06	0.22	0.02	0.25	0.01	0.27	0.21	0.26	0.25	0.21	0.24	0.18	0.09	0.06	0.09	0.00	0.30	0.02	0.03	0.01
O6	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.05	0.02	0.14	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.11	0.11	0.05	0.30	0.00	0.68	0.29	0.44
OP1	0.23	0.58	0.19	0.14	0.49	0.09	0.57	0.02	0.64	0.38	0.63	0.58	0.49	0.51	0.36	0.26	0.14	0.20	0.02	0.68	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.40	0.11	0.08	0.26	0.09	0.23	0.05	0.30	0.10	0.38	0.45	0.34	0.11	0.15	0.14	0.08	0.14	0.03	0.29	0.02	0.00	0.01
P	0.13	0.41	0.12	0.09	0.33	0.06	0.36	0.01	0.42	0.20	0.43	0.43	0.35	0.29	0.22	0.16	0.08	0.13	0.01	0.44	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.30	0.11	0.12	0.11	0.15	0.15	0.21	0.20	0.25	0.29	0.21	0.23	0.26	0.11	0.12	0.16	0.12	0.40	0.15	0.29	0.10
C2	0.13	0.35	0.15	0.16	0.20	0.18	0.16	0.24	0.23	0.20	0.33	0.30	0.20	0.16	0.13	0.14	0.17	0.15	0.37	0.18	0.41	0.17
C2'	0.12	0.26	0.13	0.15	0.06	0.18	0.09	0.22	0.12	0.25	0.24	0.17	0.15	0.24	0.11	0.13	0.20	0.16	0.41	0.18	0.28	0.13
C3'	0.11	0.26	0.13	0.13	0.06	0.15	0.10	0.19	0.12	0.26	0.23	0.17	0.14	0.26	0.11	0.13	0.17	0.13	0.42	0.16	0.23	0.10
C4	0.12	0.34	0.14	0.16	0.14	0.19	0.16	0.24	0.23	0.28	0.33	0.25	0.22	0.26	0.13	0.13	0.19	0.16	0.37	0.17	0.39	0.15
C4'	0.10	0.32	0.11	0.09	0.14	0.10	0.16	0.15	0.20	0.26	0.30	0.24	0.21	0.26	0.13	0.13	0.11	0.09	0.40	0.12	0.25	0.06
C5	0.14	0.36	0.15	0.19	0.11	0.22	0.15	0.26	0.22	0.30	0.34	0.25	0.22	0.28	0.14	0.15	0.23	0.20	0.39	0.18	0.41	0.19
C5'	0.12	0.38	0.12	0.10	0.18	0.11	0.18	0.17	0.23	0.25	0.34	0.30	0.22	0.26	0.15	0.15	0.10	0.11	0.38	0.12	0.30	0.08
C6	0.14	0.38	0.16	0.19	0.13	0.23	0.12	0.26	0.20	0.29	0.34	0.29	0.17	0.24	0.13	0.14	0.23	0.21	0.40	0.21	0.42	0.22
C8	0.15	0.31	0.15	0.18	0.10	0.22	0.18	0.25	0.22	0.31	0.31	0.20	0.27	0.32	0.16	0.16	0.23	0.19	0.38	0.15	0.38	0.15
N1	0.11	0.36	0.14	0.16	0.18	0.20	0.14	0.24	0.22	0.23	0.33	0.31	0.17	0.17	0.10	0.11	0.19	0.17	0.40	0.21	0.42	0.21
N2	0.16	0.33	0.19	0.19	0.22	0.19	0.18	0.24	0.23	0.14	0.30	0.29	0.20	0.11	0.16	0.18	0.19	0.16	0.33	0.20	0.42	0.17
N3	0.13	0.34	0.15	0.16	0.17	0.18	0.16	0.24	0.23	0.24	0.33	0.27	0.21	0.21	0.13	0.14	0.18	0.15	0.35	0.18	0.38	0.14
N7	0.17	0.33	0.17	0.20	0.10	0.24	0.18	0.27	0.22	0.32	0.32	0.20	0.26	0.32	0.17	0.17	0.26	0.22	0.39	0.17	0.41	0.19
N9	0.13	0.31	0.14	0.16	0.11	0.20	0.16	0.24	0.22	0.29	0.31	0.22	0.25	0.29	0.14	0.14	0.20	0.17	0.38	0.16	0.36	0.14
O2'	0.17	0.17	0.17	0.19	0.08	0.22	0.11	0.25	0.06	0.26	0.14	0.12	0.11	0.25	0.16	0.17	0.25	0.21	0.47	0.23	0.26	0.20
O3'	0.20	0.16	0.22	0.22	0.08	0.23	0.14	0.26	0.07	0.33	0.14	0.09	0.14	0.32	0.19	0.22	0.25	0.22	0.45	0.24	0.22	0.17
O4'	0.11	0.34	0.12	0.09	0.17	0.10	0.20	0.16	0.24	0.27	0.32	0.25	0.26	0.28	0.15	0.14	0.12	0.09	0.39	0.12	0.29	0.05
O5'	0.21	0.48	0.21	0.22	0.28	0.25	0.23	0.31	0.29	0.22	0.42	0.41	0.25	0.24	0.21	0.21	0.22	0.23	0.33	0.22	0.43	0.19
O6	0.21	0.38	0.21	0.25	0.11	0.27	0.11	0.28	0.17	0.31	0.32	0.28	0.14	0.24	0.19	0.21	0.27	0.26	0.43	0.27	0.42	0.26
OP1	0.57	0.69	0.57	0.59	0.58	0.62	0.54	0.65	0.55	0.53	0.63	0.66	0.52	0.53	0.55	0.55	0.58	0.61	0.36	0.51	0.80	0.52
OP2	0.30	0.48	0.31	0.31	0.34	0.34	0.30	0.42	0.33	0.28	0.43	0.44	0.30	0.29	0.30	0.30	0.27	0.33	0.37	0.35	0.62	0.37
P	0.37	0.55	0.38	0.39	0.40	0.41	0.37	0.47	0.39	0.35	0.49	0.50	0.36	0.36	0.36	0.36	0.37	0.40	0.32	0.35	0.62	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.16	0.17	0.34	0.04
C2	0.07	0.00	0.10	0.10	0.02	0.10	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.21	0.20	0.13	0.27	0.17	0.31	0.12
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.01	0.04	0.04	0.05	0.06	0.08	0.10	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.19	0.33	0.12
C3'	0.02	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.09	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.18	0.26	0.30	0.09
C4	0.03	0.02	0.06	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.11	0.12	0.05	0.30	0.18	0.30	0.11
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.08	0.10	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.28	0.32	0.03
C5	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.09	0.02	0.39	0.21	0.25	0.17
C5'	0.02	0.11	0.04	0.02	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.09	0.10	0.11	0.09	0.10	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.31	0.28	0.03
C6	0.04	0.01	0.05	0.04	0.02	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.12	0.04	0.39	0.21	0.25	0.18
C8	0.03	0.02	0.06	0.07	0.02	0.07	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.04	0.11	0.41	0.23	0.25	0.15
N1	0.07	0.01	0.08	0.07	0.03	0.08	0.02	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.17	0.17	0.10	0.33	0.19	0.28	0.15
N3	0.07	0.01	0.10	0.09	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.20	0.19	0.13	0.23	0.16	0.33	0.10
N6	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.08	0.11	0.03	0.44	0.23	0.22	0.21
N7	0.01	0.02	0.05	0.06	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.06	0.04	0.08	0.45	0.25	0.21	0.20
N9	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.07	0.03	0.29	0.18	0.31	0.09
O2'	0.02	0.21	0.01	0.02	0.11	0.02	0.07	0.04	0.10	0.07	0.17	0.20	0.08	0.06	0.03	0.00	0.03	0.02	0.16	0.21	0.34	0.18
O3'	0.07	0.20	0.02	0.01	0.12	0.01	0.09	0.03	0.12	0.04	0.17	0.19	0.11	0.04	0.07	0.03	0.00	0.04	0.16	0.29	0.31	0.07
O4'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.11	0.10	0.13	0.03	0.08	0.03	0.02	0.04	0.00	0.27	0.23	0.32	0.07
O5'	0.16	0.27	0.11	0.18	0.30	0.02	0.39	0.01	0.39	0.41	0.33	0.23	0.44	0.45	0.29	0.16	0.16	0.27	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.17	0.17	0.19	0.26	0.18	0.28	0.21	0.31	0.21	0.23	0.19	0.16	0.23	0.25	0.18	0.21	0.29	0.23	0.02	0.00	0.03	0.02
OP2	0.34	0.31	0.33	0.30	0.30	0.32	0.25	0.28	0.25	0.25	0.28	0.33	0.22	0.21	0.31	0.34	0.31	0.32	0.03	0.03	0.00	0.02
P	0.04	0.12	0.12	0.09	0.11	0.03	0.17	0.03	0.18	0.15	0.15	0.10	0.21	0.20	0.09	0.18	0.07	0.07	0.01	0.02	0.02	0.00