Doublet Group distance statistics: 52170

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N9	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N1	A	0, -0.001, 0.011, 0.023, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.012
C8	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.012
C5	A	0, -0.003, 0.013, 0.029, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.016
N7	A	0, -0.001, 0.016, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C4	A	0, -0.003, 0.015, 0.033, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.018
C1'	A	0, -0.004, 0.019, 0.042, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.019 std_dev=0.023
N3	A	0, -0.005, 0.020, 0.045, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.020 std_dev=0.025
C2	A	0, -0.004, 0.021, 0.047, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.021 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.000, 0.034, 0.069, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.034 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.005, 0.058, 0.111, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.058 std_dev=0.053
N2	A	0, -0.006, 0.054, 0.114, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.054 std_dev=0.060
C2'	A	0, 0.011, 0.131, 0.251, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.131 std_dev=0.120
C4'	A	0, 0.011, 0.165, 0.320, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.165 std_dev=0.154
C3'	A	0, 0.022, 0.197, 0.372, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.197 std_dev=0.175
O2'	A	0, 0.011, 0.204, 0.396, 0.399 max_d=0.399 avg_d=0.204 std_dev=0.192
C2'	B	0, 0.014, 0.212, 0.410, 0.517 max_d=0.517 avg_d=0.212 std_dev=0.198
C1'	B	0, -0.005, 0.206, 0.418, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.206 std_dev=0.212
C5'	A	0, 0.009, 0.227, 0.446, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.227 std_dev=0.218
N9	B	0, 0.022, 0.264, 0.506, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.264 std_dev=0.242
O4'	B	0, 0.011, 0.257, 0.503, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.257 std_dev=0.246
C4	B	0, 0.014, 0.280, 0.547, 0.605 max_d=0.605 avg_d=0.280 std_dev=0.267
C3'	B	0, 0.010, 0.288, 0.566, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.288 std_dev=0.278
O3'	A	0, 0.037, 0.318, 0.599, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.318 std_dev=0.281
N3	B	0, 0.012, 0.294, 0.577, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.294 std_dev=0.283
O2'	B	0, -0.040, 0.251, 0.543, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.251 std_dev=0.292
C4'	B	0, 0.005, 0.299, 0.594, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.299 std_dev=0.294
O5'	A	0, 0.010, 0.315, 0.621, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.315 std_dev=0.306
O3'	B	0, 0.015, 0.349, 0.682, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.349 std_dev=0.334
C5'	B	0, 0.028, 0.418, 0.807, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.418 std_dev=0.389
O5'	B	0, 0.050, 0.442, 0.834, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.442 std_dev=0.392
C8	B	0, 0.007, 0.401, 0.794, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.401 std_dev=0.394
C5	B	0, -0.005, 0.400, 0.804, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.400 std_dev=0.404
C2	B	0, 0.003, 0.417, 0.831, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.417 std_dev=0.414
P	A	0, 0.012, 0.490, 0.969, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.490 std_dev=0.478
N7	B	0, -0.019, 0.462, 0.943, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.462 std_dev=0.481
C6	B	0, -0.006, 0.489, 0.985, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.489 std_dev=0.496
N1	B	0, 0.005, 0.502, 0.999, 1.181 max_d=1.181 avg_d=0.502 std_dev=0.497
P	B	0, 0.044, 0.611, 1.178, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.611 std_dev=0.567
OP1	A	0, 0.011, 0.602, 1.193, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.602 std_dev=0.591
OP2	A	0, 0.003, 0.608, 1.212, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.608 std_dev=0.604
N6	B	0, -0.024, 0.611, 1.245, 1.568 max_d=1.568 avg_d=0.611 std_dev=0.635
OP1	B	0, 0.013, 0.667, 1.321, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.667 std_dev=0.654
OP2	B	0, -0.006, 0.830, 1.665, 2.016 max_d=2.016 avg_d=0.830 std_dev=0.835

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.02
C2	0.05	0.00	0.07	0.07	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.08	0.04	0.03	0.01	0.04	0.06	0.03
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.07	0.04	0.11	0.06	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.11	0.06	0.04
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.07	0.11	0.05	0.11	0.06	0.11	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.13	0.07	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.05
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.08	0.03	0.10	0.06	0.08	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.06	0.07	0.03	0.01
C5	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.02	0.08	0.01	0.08	0.13	0.10
C5'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.06	0.00	0.06	0.09	0.02	0.08	0.04	0.10	0.03	0.03	0.05	0.01	0.01	0.09	0.05	0.01	0.01
C6	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.02	0.08	0.01	0.09	0.13	0.11
C8	0.02	0.02	0.07	0.11	0.01	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.05	0.12	0.03	0.11	0.03	0.12	0.15	0.13
N1	0.03	0.00	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.03	0.01	0.03	0.08	0.06
N2	0.07	0.00	0.11	0.11	0.02	0.10	0.01	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.13	0.12	0.07	0.07	0.02	0.09	0.07	0.05
N3	0.05	0.00	0.06	0.06	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.07	0.07	0.04	0.04	0.01	0.06	0.07	0.04
N7	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.13	0.03	0.15	0.19	0.16
N9	0.00	0.02	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.03	0.02	0.02	0.08	0.05
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.13	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.09	0.05	0.03
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.06	0.03	0.10	0.05	0.10	0.12	0.08	0.12	0.07	0.13	0.06	0.01	0.00	0.02	0.06	0.12	0.18	0.09	0.09
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.07	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.04	0.06	0.02
O5'	0.05	0.03	0.05	0.05	0.02	0.01	0.08	0.01	0.08	0.11	0.03	0.07	0.04	0.13	0.03	0.03	0.06	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.12	0.04	0.12	0.00	0.14	0.17	0.15
OP1	0.05	0.04	0.11	0.13	0.01	0.07	0.08	0.05	0.09	0.12	0.03	0.09	0.06	0.15	0.02	0.09	0.18	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.06	0.06	0.07	0.08	0.03	0.13	0.01	0.13	0.15	0.08	0.07	0.07	0.19	0.08	0.05	0.09	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.03	0.04	0.06	0.05	0.01	0.10	0.01	0.11	0.13	0.06	0.05	0.04	0.16	0.05	0.03	0.09	0.02	0.01	0.15	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.09	0.08	0.10	0.04	0.12	0.05	0.14	0.14	0.06	0.14	0.08	0.25	0.06	0.07	0.12	0.17	0.13	0.12	0.35	0.19	0.18
C2	0.13	0.11	0.06	0.09	0.12	0.12	0.19	0.17	0.23	0.10	0.18	0.11	0.30	0.19	0.10	0.11	0.14	0.14	0.15	0.42	0.26	0.24
C2'	0.13	0.10	0.09	0.11	0.04	0.15	0.03	0.18	0.13	0.11	0.16	0.07	0.25	0.09	0.09	0.08	0.14	0.17	0.13	0.29	0.12	0.13
C3'	0.14	0.05	0.11	0.13	0.07	0.16	0.10	0.19	0.08	0.17	0.09	0.04	0.15	0.17	0.13	0.09	0.14	0.17	0.14	0.28	0.10	0.11
C4	0.12	0.05	0.08	0.10	0.03	0.09	0.08	0.13	0.16	0.02	0.12	0.07	0.25	0.09	0.05	0.14	0.17	0.10	0.15	0.43	0.25	0.23
C4'	0.12	0.04	0.09	0.11	0.05	0.12	0.07	0.16	0.09	0.13	0.09	0.03	0.16	0.13	0.10	0.10	0.15	0.14	0.12	0.32	0.14	0.14
C5	0.11	0.07	0.09	0.11	0.04	0.06	0.11	0.09	0.17	0.05	0.15	0.06	0.22	0.11	0.04	0.18	0.20	0.06	0.15	0.48	0.27	0.26
C5'	0.09	0.05	0.07	0.08	0.06	0.10	0.11	0.16	0.11	0.14	0.10	0.01	0.17	0.15	0.09	0.09	0.13	0.10	0.14	0.35	0.16	0.16
C6	0.13	0.10	0.12	0.13	0.04	0.07	0.10	0.07	0.14	0.03	0.13	0.09	0.18	0.09	0.04	0.21	0.21	0.05	0.15	0.50	0.29	0.28
C8	0.09	0.07	0.08	0.10	0.06	0.06	0.13	0.10	0.20	0.09	0.18	0.04	0.26	0.14	0.05	0.16	0.19	0.05	0.15	0.45	0.25	0.24
N1	0.15	0.02	0.10	0.11	0.06	0.09	0.12	0.11	0.14	0.08	0.09	0.07	0.20	0.13	0.08	0.17	0.17	0.10	0.14	0.48	0.28	0.27
N2	0.12	0.16	0.03	0.10	0.17	0.16	0.28	0.24	0.31	0.20	0.23	0.13	0.38	0.31	0.13	0.06	0.10	0.17	0.17	0.39	0.26	0.23
N3	0.12	0.13	0.06	0.08	0.09	0.12	0.16	0.17	0.23	0.04	0.19	0.11	0.32	0.14	0.07	0.11	0.14	0.13	0.16	0.39	0.24	0.22
N7	0.08	0.15	0.08	0.11	0.09	0.05	0.16	0.09	0.23	0.09	0.24	0.08	0.27	0.15	0.06	0.18	0.20	0.03	0.16	0.48	0.27	0.26
N9	0.11	0.05	0.07	0.09	0.01	0.08	0.08	0.13	0.16	0.05	0.13	0.05	0.25	0.10	0.05	0.13	0.17	0.09	0.15	0.41	0.23	0.22
O2'	0.12	0.13	0.06	0.10	0.06	0.14	0.06	0.16	0.17	0.07	0.18	0.09	0.29	0.03	0.08	0.05	0.13	0.17	0.12	0.27	0.13	0.13
O3'	0.17	0.03	0.16	0.17	0.11	0.21	0.15	0.24	0.10	0.24	0.07	0.04	0.15	0.24	0.17	0.10	0.14	0.21	0.18	0.22	0.09	0.10
O4'	0.11	0.07	0.07	0.09	0.02	0.09	0.04	0.13	0.11	0.07	0.12	0.06	0.20	0.07	0.06	0.13	0.17	0.10	0.13	0.36	0.20	0.19
O5'	0.05	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06	0.12	0.15	0.13	0.13	0.10	0.02	0.18	0.16	0.07	0.10	0.11	0.08	0.16	0.40	0.19	0.20
O6	0.12	0.20	0.15	0.17	0.10	0.09	0.12	0.06	0.17	0.03	0.20	0.16	0.18	0.09	0.04	0.26	0.26	0.02	0.16	0.52	0.31	0.29
OP1	0.04	0.06	0.03	0.04	0.06	0.06	0.10	0.15	0.11	0.11	0.09	0.04	0.15	0.13	0.06	0.09	0.10	0.08	0.17	0.42	0.20	0.22
OP2	0.05	0.06	0.05	0.06	0.07	0.07	0.12	0.14	0.13	0.12	0.11	0.04	0.18	0.15	0.07	0.14	0.13	0.10	0.15	0.38	0.17	0.19
P	0.06	0.07	0.05	0.05	0.08	0.08	0.13	0.16	0.14	0.13	0.11	0.04	0.18	0.16	0.08	0.11	0.11	0.10	0.16	0.38	0.18	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.12	0.37	0.13	0.18
C2	0.03	0.00	0.09	0.08	0.00	0.02	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.12	0.06	0.18	0.50	0.22	0.27
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.02	0.06	0.03	0.06	0.07	0.09	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.24	0.09	0.12
C3'	0.02	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.02	0.06	0.06	0.07	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.15	0.08	0.04
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.06	0.04	0.19	0.49	0.21	0.27
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.06	0.07	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.21	0.10	0.08
C5	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.03	0.25	0.55	0.26	0.34
C5'	0.05	0.10	0.06	0.03	0.11	0.01	0.16	0.00	0.16	0.16	0.13	0.07	0.20	0.18	0.10	0.05	0.03	0.03	0.01	0.06	0.13	0.03
C6	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.06	0.04	0.25	0.58	0.29	0.35
C8	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.05	0.04	0.24	0.49	0.23	0.31
N1	0.02	0.01	0.07	0.06	0.01	0.02	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.11	0.05	0.22	0.55	0.26	0.32
N3	0.03	0.00	0.09	0.07	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.11	0.06	0.16	0.46	0.19	0.24
N6	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.20	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.05	0.04	0.29	0.62	0.33	0.40
N7	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.27	0.55	0.28	0.36
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.18	0.44	0.18	0.25
O2'	0.02	0.18	0.00	0.03	0.09	0.03	0.05	0.05	0.09	0.07	0.15	0.17	0.05	0.04	0.02	0.00	0.08	0.02	0.11	0.25	0.13	0.13
O3'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.05	0.11	0.11	0.05	0.04	0.03	0.08	0.00	0.04	0.03	0.20	0.07	0.04
O4'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.11	0.39	0.20	0.22
O5'	0.12	0.18	0.11	0.03	0.19	0.02	0.25	0.01	0.25	0.24	0.22	0.16	0.29	0.27	0.18	0.11	0.03	0.11	0.00	0.04	0.02	0.01
OP1	0.37	0.50	0.24	0.15	0.49	0.21	0.55	0.06	0.58	0.49	0.55	0.46	0.62	0.55	0.44	0.25	0.20	0.39	0.04	0.00	0.03	0.01
OP2	0.13	0.22	0.09	0.08	0.21	0.10	0.26	0.13	0.29	0.23	0.26	0.19	0.33	0.28	0.18	0.13	0.07	0.20	0.02	0.03	0.00	0.01
P	0.18	0.27	0.12	0.04	0.27	0.08	0.34	0.03	0.35	0.31	0.32	0.24	0.40	0.36	0.25	0.13	0.04	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00