Doublet Group distance statistics: 52171

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.020, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.010, 0.026, 0.043, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.012, 0.033, 0.055, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.006, 0.028, 0.050, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.028 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.030 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.013, 0.042, 0.071, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.042 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.004, 0.034, 0.063, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.034 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.069, 0.165, 0.261, 0.242 max_d=0.242 avg_d=0.165 std_dev=0.096
C2'	A	0, 0.079, 0.194, 0.309, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.194 std_dev=0.115
O3'	A	0, 0.096, 0.239, 0.381, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.239 std_dev=0.142
C3'	A	0, 0.110, 0.261, 0.412, 0.371 max_d=0.371 avg_d=0.261 std_dev=0.151
O2'	A	0, 0.129, 0.316, 0.503, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.316 std_dev=0.187
C4'	A	0, 0.135, 0.326, 0.517, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.326 std_dev=0.191
P	A	0, 0.181, 0.440, 0.698, 0.644 max_d=0.644 avg_d=0.440 std_dev=0.258
O2'	B	0, 0.180, 0.464, 0.748, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.464 std_dev=0.284
C1'	B	0, 0.213, 0.516, 0.819, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.516 std_dev=0.303
OP2	A	0, 0.219, 0.523, 0.828, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.523 std_dev=0.305
OP1	A	0, 0.273, 0.658, 1.043, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.658 std_dev=0.385
O5'	A	0, 0.282, 0.686, 1.090, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.686 std_dev=0.404
C5'	A	0, 0.297, 0.708, 1.118, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.708 std_dev=0.411
C2'	B	0, 0.322, 0.772, 1.223, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.772 std_dev=0.450
O4'	B	0, 0.330, 0.816, 1.303, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.816 std_dev=0.486
N9	B	0, 0.429, 1.019, 1.608, 1.395 max_d=1.395 avg_d=1.019 std_dev=0.590
C4'	B	0, 0.537, 1.273, 2.009, 1.754 max_d=1.754 avg_d=1.273 std_dev=0.736
C3'	B	0, 0.539, 1.275, 2.011, 1.711 max_d=1.711 avg_d=1.275 std_dev=0.736
C4	B	0, 0.540, 1.287, 2.033, 1.824 max_d=1.824 avg_d=1.287 std_dev=0.747
N3	B	0, 0.538, 1.290, 2.043, 1.886 max_d=1.886 avg_d=1.290 std_dev=0.752
O3'	B	0, 0.592, 1.410, 2.227, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.410 std_dev=0.817
C8	B	0, 0.664, 1.573, 2.482, 2.170 max_d=2.170 avg_d=1.573 std_dev=0.909
O5'	B	0, 0.720, 1.709, 2.698, 2.366 max_d=2.366 avg_d=1.709 std_dev=0.989
C5'	B	0, 0.746, 1.770, 2.793, 2.440 max_d=2.440 avg_d=1.770 std_dev=1.023
C5	B	0, 0.782, 1.855, 2.927, 2.535 max_d=2.535 avg_d=1.855 std_dev=1.072
C2	B	0, 0.791, 1.880, 2.969, 2.650 max_d=2.650 avg_d=1.880 std_dev=1.089
N7	B	0, 0.845, 2.002, 3.159, 2.732 max_d=2.732 avg_d=2.002 std_dev=1.157
C6	B	0, 0.978, 2.318, 3.658, 3.170 max_d=3.170 avg_d=2.318 std_dev=1.340
N1	B	0, 0.978, 2.320, 3.661, 3.205 max_d=3.205 avg_d=2.320 std_dev=1.342
OP2	B	0, 1.044, 2.471, 3.899, 3.381 max_d=3.381 avg_d=2.471 std_dev=1.428
P	B	0, 1.151, 2.724, 4.298, 3.684 max_d=3.684 avg_d=2.724 std_dev=1.573
N6	B	0, 1.205, 2.854, 4.503, 3.866 max_d=3.866 avg_d=2.854 std_dev=1.649
OP1	B	0, 1.509, 3.571, 5.633, 4.792 max_d=4.792 avg_d=3.571 std_dev=2.062

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.02	0.05	0.13	0.02
C2	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.03	0.03	0.14	0.01	0.06	0.11	0.04
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.04	0.13	0.07	0.06
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.18	0.04	0.18	0.05	0.11
C4	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.14	0.01	0.05	0.12	0.04
C4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.06	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.06	0.16	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.03	0.02	0.15	0.01	0.05	0.11	0.05
C5'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.10	0.10	0.07	0.07	0.12	0.07	0.02	0.03	0.01	0.00	0.11	0.06	0.18	0.02
C6	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.16	0.00	0.05	0.10	0.05
C8	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.15	0.03	0.05	0.12	0.05
N1	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.03	0.15	0.01	0.05	0.10	0.05
N2	0.03	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.04	0.03	0.14	0.02	0.06	0.11	0.04
N3	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.13	0.00	0.06	0.12	0.04
N7	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.03	0.15	0.03	0.06	0.11	0.06
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.13	0.02	0.05	0.12	0.03
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.06	0.08	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.10	0.10	0.03
O3'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.00	0.03	0.15	0.04	0.20	0.04	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.03	0.03	0.17	0.06
O5'	0.08	0.14	0.13	0.18	0.14	0.01	0.15	0.00	0.16	0.15	0.15	0.14	0.13	0.15	0.13	0.05	0.15	0.04	0.00	0.16	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.06	0.04	0.03	0.16	0.00	0.04	0.07	0.04
OP1	0.05	0.06	0.13	0.18	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05	0.10	0.20	0.03	0.02	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.11	0.07	0.05	0.12	0.16	0.11	0.18	0.10	0.12	0.10	0.11	0.12	0.11	0.12	0.10	0.04	0.17	0.01	0.07	0.02	0.00	0.01
P	0.02	0.04	0.06	0.11	0.04	0.03	0.05	0.02	0.05	0.05	0.05	0.04	0.04	0.06	0.03	0.03	0.12	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.08	0.14	0.11	0.17	0.13	0.34	0.21	0.33	0.37	0.11	0.06	0.48	0.45	0.22	0.11	0.14	0.13	0.25	0.36	0.50	0.44
C2	0.06	0.03	0.09	0.08	0.14	0.06	0.23	0.07	0.22	0.24	0.11	0.03	0.26	0.29	0.15	0.11	0.18	0.05	0.12	0.10	0.29	0.21
C2'	0.13	0.05	0.14	0.10	0.25	0.13	0.45	0.23	0.50	0.44	0.27	0.05	0.70	0.55	0.27	0.11	0.16	0.14	0.26	0.40	0.52	0.47
C3'	0.10	0.15	0.12	0.10	0.16	0.11	0.35	0.21	0.36	0.39	0.10	0.11	0.60	0.50	0.21	0.13	0.18	0.12	0.26	0.44	0.53	0.49
C4	0.10	0.19	0.14	0.12	0.11	0.12	0.24	0.18	0.18	0.32	0.06	0.13	0.27	0.37	0.18	0.12	0.13	0.12	0.23	0.29	0.44	0.38
C4'	0.09	0.18	0.12	0.10	0.11	0.11	0.26	0.19	0.24	0.34	0.06	0.13	0.42	0.41	0.17	0.12	0.17	0.11	0.25	0.42	0.51	0.46
C5	0.11	0.33	0.16	0.16	0.08	0.16	0.10	0.22	0.06	0.28	0.27	0.22	0.03	0.28	0.14	0.13	0.10	0.14	0.27	0.34	0.47	0.41
C5'	0.12	0.35	0.11	0.11	0.12	0.10	0.15	0.15	0.10	0.26	0.25	0.26	0.21	0.31	0.12	0.15	0.21	0.12	0.23	0.42	0.47	0.44
C6	0.10	0.32	0.16	0.17	0.10	0.15	0.03	0.19	0.14	0.19	0.28	0.24	0.10	0.15	0.09	0.14	0.10	0.13	0.23	0.25	0.40	0.34
C8	0.12	0.33	0.17	0.17	0.09	0.18	0.17	0.27	0.07	0.33	0.27	0.21	0.13	0.36	0.17	0.13	0.10	0.17	0.32	0.46	0.56	0.51
N1	0.06	0.16	0.11	0.10	0.03	0.09	0.09	0.10	0.03	0.18	0.09	0.13	0.08	0.18	0.10	0.12	0.12	0.07	0.14	0.12	0.30	0.23
N2	0.03	0.17	0.08	0.11	0.18	0.08	0.26	0.04	0.28	0.21	0.24	0.12	0.31	0.26	0.15	0.13	0.25	0.03	0.09	0.05	0.20	0.11
N3	0.08	0.04	0.11	0.08	0.17	0.08	0.30	0.11	0.30	0.30	0.15	0.04	0.37	0.37	0.18	0.11	0.17	0.07	0.16	0.18	0.36	0.29
N7	0.12	0.40	0.18	0.20	0.11	0.20	0.09	0.28	0.17	0.29	0.39	0.26	0.09	0.28	0.15	0.13	0.10	0.18	0.32	0.45	0.56	0.51
N9	0.11	0.20	0.15	0.13	0.12	0.14	0.26	0.21	0.20	0.35	0.08	0.13	0.33	0.41	0.19	0.12	0.12	0.14	0.26	0.37	0.50	0.44
O2'	0.17	0.21	0.16	0.10	0.33	0.15	0.52	0.25	0.59	0.47	0.44	0.16	0.76	0.59	0.32	0.10	0.13	0.17	0.27	0.38	0.53	0.47
O3'	0.12	0.07	0.13	0.10	0.20	0.12	0.41	0.22	0.44	0.42	0.20	0.07	0.69	0.54	0.24	0.13	0.19	0.13	0.27	0.47	0.54	0.50
O4'	0.10	0.15	0.13	0.12	0.12	0.13	0.26	0.22	0.22	0.34	0.04	0.10	0.38	0.41	0.19	0.11	0.13	0.12	0.26	0.40	0.52	0.47
O5'	0.32	0.15	0.36	0.37	0.28	0.40	0.41	0.50	0.31	0.57	0.12	0.14	0.44	0.61	0.39	0.26	0.22	0.39	0.55	0.76	0.80	0.79
O6	0.11	0.38	0.18	0.22	0.21	0.19	0.21	0.22	0.32	0.09	0.40	0.30	0.30	0.03	0.09	0.16	0.14	0.16	0.26	0.28	0.41	0.36
OP1	0.22	0.28	0.25	0.27	0.17	0.31	0.23	0.40	0.15	0.40	0.24	0.19	0.19	0.42	0.26	0.19	0.17	0.30	0.45	0.72	0.68	0.69
OP2	0.18	0.47	0.19	0.22	0.18	0.25	0.16	0.35	0.23	0.33	0.46	0.33	0.16	0.32	0.19	0.17	0.14	0.25	0.41	0.68	0.68	0.67
P	0.22	0.32	0.24	0.26	0.17	0.30	0.22	0.39	0.14	0.40	0.27	0.22	0.17	0.42	0.25	0.19	0.17	0.29	0.45	0.69	0.70	0.69

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.12	0.11	0.10	0.08
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.02	0.14	0.08	0.13	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.12	0.15	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.09	0.03
C4	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.08	0.01	0.14	0.07	0.13	0.05
C4'	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.06	0.02	0.12	0.03	0.14	0.03
C5'	0.03	0.05	0.04	0.03	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.11	0.07	0.04	0.12	0.12	0.07	0.03	0.05	0.02	0.01	0.07	0.03	0.02
C6	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.12	0.04	0.14	0.03
C8	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.04	0.12	0.04	0.13	0.04
N1	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.01	0.13	0.05	0.14	0.04
N3	0.03	0.00	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.02	0.14	0.10	0.12	0.07
N6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.11	0.04	0.15	0.04
N7	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.04	0.11	0.02	0.15	0.03
N9	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.13	0.08	0.12	0.06
O2'	0.00	0.11	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.03	0.06	0.05	0.09	0.11	0.06	0.05	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.15	0.19	0.10
O3'	0.05	0.13	0.03	0.01	0.08	0.01	0.06	0.05	0.08	0.03	0.11	0.13	0.06	0.03	0.05	0.05	0.00	0.05	0.05	0.08	0.10	0.04
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.13	0.16	0.13	0.14
O5'	0.12	0.14	0.06	0.03	0.14	0.02	0.12	0.01	0.12	0.12	0.13	0.14	0.11	0.11	0.13	0.06	0.05	0.13	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.11	0.08	0.12	0.10	0.07	0.07	0.03	0.07	0.04	0.04	0.05	0.10	0.04	0.02	0.08	0.15	0.08	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.13	0.15	0.09	0.13	0.06	0.14	0.03	0.14	0.13	0.14	0.12	0.15	0.15	0.12	0.19	0.10	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.06	0.08	0.03	0.05	0.03	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.07	0.04	0.03	0.06	0.10	0.04	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00