Doublet Group distance statistics: 52183

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.000, 0.030, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C5	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C4	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
N3	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C6	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
N2	A	0, 0.000, 0.079, 0.158, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.079 std_dev=0.079
O6	A	0, 0.000, 0.088, 0.177, 0.177 max_d=0.177 avg_d=0.088 std_dev=0.088
OP1	A	0, 0.000, 0.090, 0.180, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.090 std_dev=0.090
O4'	A	0, 0.000, 0.115, 0.230, 0.230 max_d=0.230 avg_d=0.115 std_dev=0.115
C2'	A	0, 0.000, 0.161, 0.322, 0.322 max_d=0.322 avg_d=0.161 std_dev=0.161
O2'	A	0, 0.000, 0.225, 0.451, 0.451 max_d=0.451 avg_d=0.225 std_dev=0.225
C3'	A	0, 0.000, 0.240, 0.480, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.240 std_dev=0.240
C4'	A	0, 0.000, 0.265, 0.529, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.265 std_dev=0.265
O5'	A	0, 0.000, 0.324, 0.648, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.324 std_dev=0.324
O3'	A	0, 0.000, 0.356, 0.713, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.356 std_dev=0.356
C5'	A	0, 0.000, 0.423, 0.846, 0.846 max_d=0.846 avg_d=0.423 std_dev=0.423
O2'	B	0, 0.000, 0.426, 0.852, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.426 std_dev=0.426
P	A	0, 0.000, 0.598, 1.195, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.598 std_dev=0.598
C2'	B	0, 0.000, 0.780, 1.560, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.780 std_dev=0.780
N2	B	0, 0.000, 0.823, 1.646, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.823 std_dev=0.823
N3	B	0, 0.000, 0.897, 1.794, 1.794 max_d=1.794 avg_d=0.897 std_dev=0.897
C1'	B	0, 0.000, 0.918, 1.836, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.918 std_dev=0.918
C2	B	0, 0.000, 0.938, 1.875, 1.875 max_d=1.875 avg_d=0.938 std_dev=0.938
C4	B	0, 0.000, 1.035, 2.070, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.035 std_dev=1.035
N9	B	0, 0.000, 1.044, 2.088, 2.088 max_d=2.088 avg_d=1.044 std_dev=1.044
N1	B	0, 0.000, 1.108, 2.216, 2.216 max_d=2.216 avg_d=1.108 std_dev=1.108
O5'	B	0, 0.000, 1.207, 2.415, 2.415 max_d=2.415 avg_d=1.207 std_dev=1.207
C5	B	0, 0.000, 1.212, 2.424, 2.424 max_d=2.424 avg_d=1.212 std_dev=1.212
C8	B	0, 0.000, 1.232, 2.463, 2.463 max_d=2.463 avg_d=1.232 std_dev=1.232
C6	B	0, 0.000, 1.257, 2.515, 2.515 max_d=2.515 avg_d=1.257 std_dev=1.257
C3'	B	0, 0.000, 1.298, 2.596, 2.596 max_d=2.596 avg_d=1.298 std_dev=1.298
O4'	B	0, 0.000, 1.323, 2.646, 2.646 max_d=2.646 avg_d=1.323 std_dev=1.323
OP2	A	0, 0.000, 1.328, 2.657, 2.657 max_d=2.657 avg_d=1.328 std_dev=1.328
N7	B	0, 0.000, 1.329, 2.659, 2.659 max_d=2.659 avg_d=1.329 std_dev=1.329
O6	B	0, 0.000, 1.409, 2.818, 2.818 max_d=2.818 avg_d=1.409 std_dev=1.409
O3'	B	0, 0.000, 1.410, 2.819, 2.819 max_d=2.819 avg_d=1.410 std_dev=1.410
C4'	B	0, 0.000, 1.492, 2.984, 2.984 max_d=2.984 avg_d=1.492 std_dev=1.492
P	B	0, 0.000, 1.729, 3.458, 3.458 max_d=3.458 avg_d=1.729 std_dev=1.729
OP2	B	0, 0.000, 1.852, 3.703, 3.703 max_d=3.703 avg_d=1.852 std_dev=1.852
OP1	B	0, 0.000, 1.903, 3.806, 3.806 max_d=3.806 avg_d=1.903 std_dev=1.903
C5'	B	0, 0.000, 2.038, 4.075, 4.075 max_d=4.075 avg_d=2.038 std_dev=2.038

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.04	0.49	0.27
C2	0.03	0.00	0.08	0.05	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.01	0.06	0.68	0.24
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.04	0.12	0.08	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.05	0.19	0.10
C3'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.09	0.01	0.10	0.06	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.10	0.02	0.00
C4	0.00	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.03	0.07	0.68	0.25
C4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.09	0.11	0.04	0.05	0.03	0.12	0.03	0.04	0.00	0.00	0.01	0.13	0.10	0.12	0.10
C5	0.03	0.01	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.06	0.12	0.03	0.04	0.70	0.18
C5'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.17	0.15	0.11	0.01	0.02	0.18	0.06	0.04	0.02	0.00	0.00	0.23	0.15	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.09	0.01	0.17	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.07	0.15	0.01	0.02	0.68	0.13
C8	0.03	0.00	0.06	0.09	0.01	0.11	0.01	0.15	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.09	0.05	0.10	0.06	0.06	0.68	0.21
N1	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.04	0.10	0.00	0.04	0.68	0.18
N2	0.05	0.00	0.12	0.10	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.13	0.01	0.01	0.01	0.07	0.68	0.27
N3	0.03	0.00	0.08	0.06	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.08	0.00	0.01	0.02	0.07	0.67	0.27
N7	0.03	0.01	0.05	0.09	0.00	0.12	0.00	0.18	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.06	0.15	0.06	0.04	0.71	0.14
N9	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.07	0.64	0.27
O2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.16	0.10	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.12
O3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.03	0.09	0.03	0.13	0.08	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.07	0.18	0.27	0.12
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.05	0.04	0.01	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.10	0.04	0.50	0.32
O5'	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04	0.01	0.12	0.00	0.15	0.10	0.10	0.01	0.01	0.15	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.21	0.01	0.01	0.00
O6	0.05	0.01	0.04	0.09	0.03	0.13	0.03	0.23	0.01	0.06	0.00	0.01	0.02	0.06	0.06	0.01	0.07	0.10	0.21	0.00	0.03	0.62	0.05
OP1	0.04	0.06	0.05	0.10	0.07	0.10	0.04	0.15	0.02	0.06	0.04	0.07	0.07	0.04	0.07	0.06	0.18	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.49	0.68	0.19	0.02	0.68	0.12	0.70	0.03	0.68	0.68	0.68	0.68	0.67	0.71	0.64	0.16	0.27	0.50	0.01	0.62	0.01	0.00	0.00
P	0.27	0.24	0.10	0.00	0.25	0.10	0.18	0.01	0.13	0.21	0.18	0.27	0.27	0.14	0.27	0.12	0.12	0.32	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.30	0.01	0.06	0.27	0.32	0.29	0.37	0.32	0.26	0.33	0.31	0.27	0.29	0.25	0.07	0.00	0.41	0.25	0.35	0.25	0.21	0.30
C2	0.25	0.43	0.03	0.08	0.34	0.24	0.36	0.27	0.40	0.27	0.42	0.45	0.39	0.32	0.28	0.02	0.03	0.32	0.19	0.41	0.18	0.17	0.22
C2'	0.23	0.27	0.02	0.01	0.23	0.24	0.26	0.27	0.29	0.22	0.30	0.29	0.23	0.25	0.21	0.08	0.09	0.35	0.22	0.32	0.19	0.15	0.24
C3'	0.23	0.26	0.03	0.02	0.22	0.24	0.25	0.27	0.28	0.22	0.28	0.28	0.22	0.24	0.21	0.07	0.10	0.35	0.21	0.30	0.18	0.14	0.24
C4	0.27	0.32	0.04	0.09	0.28	0.31	0.30	0.35	0.32	0.26	0.33	0.34	0.30	0.28	0.26	0.08	0.04	0.39	0.24	0.33	0.23	0.20	0.28
C4'	0.25	0.30	0.01	0.03	0.27	0.30	0.30	0.36	0.34	0.26	0.34	0.31	0.26	0.29	0.24	0.05	0.04	0.40	0.23	0.37	0.24	0.20	0.29
C5	0.32	0.32	0.10	0.16	0.30	0.37	0.31	0.40	0.32	0.29	0.32	0.33	0.31	0.30	0.29	0.15	0.11	0.43	0.29	0.33	0.28	0.24	0.33
C5'	0.21	0.27	0.05	0.01	0.23	0.26	0.26	0.33	0.30	0.22	0.30	0.29	0.23	0.25	0.21	0.00	0.09	0.36	0.19	0.33	0.20	0.16	0.25
C6	0.35	0.35	0.16	0.22	0.34	0.39	0.34	0.41	0.35	0.32	0.35	0.36	0.35	0.33	0.33	0.19	0.18	0.43	0.31	0.36	0.29	0.26	0.34
C8	0.30	0.27	0.06	0.12	0.26	0.36	0.27	0.41	0.29	0.27	0.28	0.28	0.26	0.27	0.26	0.12	0.06	0.43	0.29	0.30	0.29	0.23	0.33
N1	0.33	0.41	0.13	0.17	0.37	0.32	0.37	0.34	0.39	0.32	0.41	0.41	0.39	0.34	0.33	0.12	0.12	0.38	0.25	0.40	0.23	0.22	0.28
N2	0.16	0.51	0.04	0.00	0.37	0.13	0.39	0.16	0.46	0.25	0.50	0.53	0.46	0.32	0.25	0.08	0.04	0.21	0.10	0.46	0.09	0.11	0.14
N3	0.23	0.37	0.00	0.05	0.29	0.25	0.31	0.29	0.36	0.25	0.38	0.40	0.32	0.28	0.24	0.03	0.00	0.33	0.19	0.37	0.19	0.16	0.23
N7	0.32	0.29	0.10	0.16	0.28	0.38	0.29	0.43	0.29	0.29	0.29	0.29	0.28	0.29	0.28	0.15	0.11	0.44	0.31	0.30	0.30	0.24	0.35
N9	0.26	0.28	0.02	0.07	0.25	0.32	0.27	0.36	0.29	0.25	0.30	0.30	0.26	0.26	0.24	0.08	0.01	0.39	0.24	0.31	0.24	0.19	0.29
O2'	0.24	0.29	0.01	0.00	0.25	0.25	0.28	0.28	0.32	0.24	0.32	0.29	0.24	0.27	0.23	0.08	0.08	0.36	0.23	0.35	0.21	0.17	0.26
O3'	0.22	0.25	0.03	0.04	0.22	0.22	0.24	0.23	0.28	0.21	0.28	0.27	0.21	0.23	0.20	0.08	0.13	0.33	0.21	0.30	0.17	0.13	0.23
O4'	0.27	0.31	0.01	0.08	0.28	0.35	0.30	0.42	0.34	0.27	0.33	0.31	0.27	0.30	0.26	0.06	0.02	0.43	0.25	0.36	0.28	0.23	0.32
O5'	0.22	0.23	0.05	0.01	0.20	0.26	0.22	0.32	0.25	0.20	0.25	0.24	0.20	0.22	0.19	0.02	0.09	0.36	0.19	0.27	0.19	0.15	0.25
O6	0.40	0.35	0.24	0.30	0.35	0.44	0.36	0.47	0.36	0.36	0.35	0.34	0.35	0.36	0.36	0.27	0.28	0.46	0.38	0.36	0.35	0.31	0.40
OP1	0.40	0.32	0.14	0.22	0.34	0.51	0.35	0.59	0.35	0.37	0.33	0.31	0.32	0.37	0.35	0.20	0.16	0.57	0.41	0.36	0.44	0.37	0.48
OP2	1.00	0.72	0.70	0.76	0.84	1.10	0.83	1.17	0.77	0.93	0.72	0.65	0.78	0.88	0.91	0.80	0.67	1.19	1.05	0.77	1.05	0.95	1.10
P	0.54	0.46	0.24	0.30	0.48	0.61	0.50	0.68	0.50	0.52	0.47	0.43	0.46	0.52	0.50	0.30	0.21	0.71	0.54	0.51	0.55	0.50	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.09	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.10	0.01
C2	0.07	0.00	0.07	0.20	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.25	0.08	0.07	0.00	0.05	0.10	0.00
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.02	0.12	0.04	0.15
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.16	0.00	0.15	0.01	0.18	0.04	0.20	0.20	0.17	0.09	0.08	0.00	0.00	0.01	0.34	0.18	0.18	0.05	0.22
C4	0.03	0.01	0.05	0.16	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.18	0.03	0.05	0.01	0.04	0.10	0.00
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.10	0.08	0.07	0.02	0.03	0.10	0.05	0.04	0.00	0.00	0.00	0.12	0.06	0.13	0.00
C5	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.18	0.01	0.03	0.01	0.07	0.12	0.03
C5'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.11	0.00	0.17	0.00	0.19	0.12	0.16	0.08	0.08	0.17	0.07	0.04	0.01	0.00	0.00	0.22	0.10	0.19	0.01
C6	0.03	0.00	0.03	0.18	0.01	0.10	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.23	0.01	0.03	0.00	0.09	0.13	0.04
C8	0.03	0.01	0.03	0.04	0.00	0.08	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.00	0.04	0.08	0.01
N1	0.05	0.00	0.05	0.20	0.01	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.26	0.05	0.05	0.01	0.07	0.12	0.02
N2	0.09	0.00	0.07	0.20	0.02	0.02	0.00	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.11	0.26	0.11	0.08	0.00	0.03	0.10	0.02
N3	0.07	0.01	0.08	0.17	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.21	0.08	0.07	0.01	0.02	0.09	0.02
N7	0.02	0.00	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.06	0.02	0.00	0.07	0.11	0.04
N9	0.00	0.02	0.01	0.08	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.02	0.08	0.01
O2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.04	0.04	0.04	0.06	0.01	0.08	0.11	0.06	0.02	0.01	0.00	0.05	0.05	0.05	0.06	0.00	0.06	0.03
O3'	0.00	0.25	0.01	0.00	0.18	0.00	0.18	0.01	0.23	0.04	0.26	0.26	0.21	0.11	0.08	0.05	0.00	0.01	0.38	0.23	0.23	0.07	0.26
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.11	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.00	0.16	0.01	0.15	0.19	0.11
O5'	0.00	0.07	0.20	0.34	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.03	0.05	0.08	0.07	0.02	0.05	0.05	0.38	0.16	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00
O6	0.02	0.00	0.02	0.18	0.01	0.12	0.01	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.23	0.01	0.02	0.00	0.12	0.15	0.07
OP1	0.04	0.05	0.12	0.18	0.04	0.06	0.07	0.10	0.09	0.04	0.07	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.23	0.15	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00
OP2	0.10	0.10	0.04	0.05	0.10	0.13	0.12	0.19	0.13	0.08	0.12	0.10	0.09	0.11	0.08	0.06	0.07	0.19	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.00	0.15	0.22	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.26	0.11	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00