Doublet Group distance statistics: 52189

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 5, 2, 5, 3, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.007 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.028, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C2	A	0, -0.002, 0.011, 0.025, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.011 std_dev=0.013
N3	A	0, -0.002, 0.014, 0.029, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.014 std_dev=0.016
C1'	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.001, 0.018, 0.036, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.002, 0.024, 0.047, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.024 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.001, 0.025, 0.049, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.025 std_dev=0.024
N2	A	0, -0.003, 0.022, 0.047, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.022 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.013, 0.041, 0.068, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.041 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.013, 0.044, 0.074, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.044 std_dev=0.031
O4'	A	0, -0.023, 0.120, 0.263, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.120 std_dev=0.143
O2'	B	0, 0.108, 0.300, 0.492, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.300 std_dev=0.192
C2'	A	0, -0.053, 0.141, 0.335, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.141 std_dev=0.194
C1'	B	0, 0.070, 0.344, 0.619, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.344 std_dev=0.275
C2'	B	0, 0.046, 0.326, 0.606, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.326 std_dev=0.280
C2	B	0, 0.117, 0.404, 0.692, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.404 std_dev=0.288
O2	B	0, 0.251, 0.545, 0.839, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.545 std_dev=0.294
N1	B	0, 0.039, 0.346, 0.652, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.346 std_dev=0.306
C4'	A	0, -0.135, 0.235, 0.606, 1.289 max_d=1.289 avg_d=0.235 std_dev=0.370
N3	B	0, 0.006, 0.430, 0.854, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.430 std_dev=0.424
C6	B	0, 0.087, 0.513, 0.938, 1.667 max_d=1.667 avg_d=0.513 std_dev=0.425
O4'	B	0, 0.032, 0.462, 0.892, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.462 std_dev=0.430
C3'	A	0, -0.162, 0.269, 0.700, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.269 std_dev=0.431
C3'	B	0, -0.008, 0.430, 0.868, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.430 std_dev=0.438
O5'	A	0, -0.105, 0.347, 0.799, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.347 std_dev=0.452
C5'	A	0, -0.121, 0.334, 0.790, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.334 std_dev=0.455
O3'	B	0, 0.020, 0.489, 0.957, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.489 std_dev=0.469
C4'	B	0, -0.013, 0.504, 1.021, 1.943 max_d=1.943 avg_d=0.504 std_dev=0.517
O2'	A	0, -0.235, 0.290, 0.815, 1.806 max_d=1.806 avg_d=0.290 std_dev=0.525
C5	B	0, 0.045, 0.589, 1.132, 2.080 max_d=2.080 avg_d=0.589 std_dev=0.543
C4	B	0, -0.097, 0.467, 1.032, 2.069 max_d=2.069 avg_d=0.467 std_dev=0.565
O5'	B	0, -0.097, 0.517, 1.131, 2.279 max_d=2.279 avg_d=0.517 std_dev=0.614
C5'	B	0, -0.056, 0.569, 1.193, 2.335 max_d=2.335 avg_d=0.569 std_dev=0.625
P	A	0, -0.168, 0.511, 1.190, 2.442 max_d=2.442 avg_d=0.511 std_dev=0.679
O4	B	0, -0.145, 0.553, 1.251, 2.538 max_d=2.538 avg_d=0.553 std_dev=0.698
OP2	A	0, -0.190, 0.555, 1.300, 2.655 max_d=2.655 avg_d=0.555 std_dev=0.745
OP2	B	0, -0.151, 0.599, 1.349, 2.568 max_d=2.568 avg_d=0.599 std_dev=0.750
P	B	0, -0.177, 0.599, 1.375, 2.796 max_d=2.796 avg_d=0.599 std_dev=0.776
O3'	A	0, -0.344, 0.455, 1.255, 2.763 max_d=2.763 avg_d=0.455 std_dev=0.800
OP1	A	0, -0.201, 0.618, 1.437, 2.962 max_d=2.962 avg_d=0.618 std_dev=0.819
OP1	B	0, -0.226, 0.715, 1.655, 3.229 max_d=3.229 avg_d=0.715 std_dev=0.940

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.22	0.00	0.06	0.01	0.07	0.40	0.24
C2	0.03	0.00	0.12	0.07	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.30	0.07	0.09	0.01	0.07	0.33	0.18
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.01	0.01	0.10	0.04	0.09	0.09	0.16	0.12	0.07	0.02	0.00	0.01	0.03	0.21	0.02	0.09	0.44	0.29
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.12	0.01	0.19	0.01	0.19	0.25	0.13	0.05	0.05	0.26	0.14	0.01	0.01	0.02	0.06	0.22	0.27	0.08	0.08
C4	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.16	0.03	0.12	0.01	0.06	0.33	0.16
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.06	0.16	0.02	0.09	0.06	0.15	0.06	0.20	0.02	0.00	0.01	0.10	0.13	0.16	0.08
C5	0.01	0.02	0.01	0.19	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.27	0.05	0.02	0.21	0.01	0.07	0.26	0.10
C5'	0.02	0.03	0.10	0.01	0.07	0.00	0.15	0.00	0.14	0.21	0.08	0.05	0.03	0.22	0.09	0.09	0.12	0.01	0.01	0.18	0.12	0.06	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.19	0.00	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.27	0.08	0.03	0.22	0.00	0.08	0.25	0.10
C8	0.02	0.02	0.09	0.25	0.01	0.16	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.28	0.13	0.06	0.23	0.02	0.06	0.28	0.08
N1	0.03	0.00	0.09	0.13	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.20	0.19	0.04	0.16	0.00	0.07	0.28	0.13
N2	0.04	0.00	0.16	0.05	0.01	0.09	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.39	0.08	0.06	0.01	0.08	0.35	0.20
N3	0.04	0.00	0.12	0.05	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.32	0.07	0.06	0.01	0.07	0.36	0.20
N7	0.01	0.02	0.07	0.26	0.00	0.15	0.01	0.22	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.32	0.12	0.05	0.27	0.03	0.09	0.22	0.08
N9	0.00	0.01	0.02	0.14	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.08	0.01	0.10	0.01	0.05	0.35	0.16
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.19	0.20	0.27	0.09	0.27	0.28	0.20	0.10	0.10	0.32	0.18	0.00	0.02	0.13	0.12	0.31	0.09	0.43	0.19
O3'	0.22	0.30	0.01	0.01	0.16	0.02	0.05	0.12	0.08	0.13	0.19	0.39	0.32	0.12	0.08	0.02	0.00	0.12	0.21	0.05	0.61	0.26	0.30
O4'	0.00	0.07	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.08	0.07	0.05	0.01	0.13	0.12	0.00	0.06	0.04	0.09	0.42	0.26
O5'	0.06	0.09	0.21	0.06	0.12	0.01	0.21	0.01	0.22	0.23	0.16	0.06	0.06	0.27	0.10	0.12	0.21	0.06	0.00	0.27	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.02	0.22	0.01	0.10	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.31	0.05	0.04	0.27	0.00	0.12	0.21	0.11
OP1	0.07	0.07	0.09	0.27	0.06	0.13	0.07	0.12	0.08	0.06	0.07	0.08	0.07	0.09	0.05	0.09	0.61	0.09	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00
OP2	0.40	0.33	0.44	0.08	0.33	0.16	0.26	0.06	0.25	0.28	0.28	0.35	0.36	0.22	0.35	0.43	0.26	0.42	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.18	0.29	0.08	0.16	0.08	0.10	0.02	0.10	0.08	0.13	0.20	0.20	0.08	0.16	0.19	0.30	0.26	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.13	0.16	0.20	0.21	0.27	0.42	0.35	0.35	0.16	0.12	0.26	0.08	0.11	0.21	0.26	0.40	0.49	0.59	0.49
C2	0.11	0.12	0.11	0.11	0.21	0.14	0.34	0.16	0.30	0.14	0.11	0.27	0.09	0.12	0.20	0.14	0.18	0.21	0.25	0.19
C2'	0.11	0.20	0.13	0.18	0.11	0.26	0.37	0.37	0.30	0.11	0.23	0.36	0.13	0.12	0.12	0.23	0.44	0.57	0.70	0.58
C3'	0.10	0.20	0.09	0.09	0.11	0.12	0.18	0.16	0.15	0.10	0.21	0.29	0.16	0.13	0.13	0.12	0.20	0.29	0.43	0.28
C4	0.10	0.17	0.13	0.16	0.13	0.21	0.32	0.26	0.28	0.10	0.19	0.29	0.09	0.10	0.16	0.19	0.30	0.37	0.44	0.35
C4'	0.11	0.13	0.11	0.14	0.12	0.19	0.26	0.23	0.23	0.11	0.14	0.23	0.09	0.11	0.14	0.18	0.27	0.36	0.46	0.34
C5	0.08	0.24	0.12	0.17	0.21	0.20	0.21	0.25	0.19	0.09	0.29	0.32	0.10	0.11	0.28	0.16	0.28	0.37	0.40	0.32
C5'	0.10	0.19	0.09	0.10	0.14	0.13	0.20	0.17	0.17	0.11	0.21	0.28	0.15	0.12	0.19	0.14	0.19	0.30	0.39	0.27
C6	0.08	0.26	0.09	0.13	0.24	0.14	0.22	0.17	0.18	0.12	0.29	0.32	0.11	0.09	0.27	0.10	0.18	0.28	0.25	0.20
C8	0.11	0.22	0.14	0.21	0.20	0.26	0.21	0.34	0.21	0.10	0.29	0.31	0.10	0.13	0.32	0.22	0.38	0.50	0.57	0.46
N1	0.08	0.19	0.09	0.10	0.13	0.10	0.22	0.12	0.22	0.09	0.18	0.31	0.10	0.10	0.14	0.09	0.13	0.20	0.19	0.14
N2	0.13	0.14	0.11	0.11	0.31	0.13	0.37	0.12	0.32	0.19	0.20	0.23	0.09	0.17	0.32	0.15	0.13	0.15	0.18	0.13
N3	0.12	0.11	0.13	0.14	0.26	0.18	0.42	0.22	0.35	0.16	0.10	0.26	0.09	0.11	0.26	0.19	0.26	0.29	0.37	0.29
N7	0.09	0.26	0.12	0.20	0.29	0.23	0.19	0.30	0.16	0.11	0.35	0.32	0.10	0.13	0.40	0.18	0.34	0.46	0.50	0.40
N9	0.12	0.16	0.15	0.19	0.13	0.25	0.32	0.32	0.29	0.12	0.20	0.28	0.09	0.12	0.17	0.23	0.37	0.45	0.54	0.44
O2'	0.52	0.31	0.52	0.59	0.66	0.73	0.94	0.87	0.83	0.56	0.31	0.18	0.29	0.42	0.66	0.71	0.93	1.03	1.13	1.06
O3'	0.26	0.20	0.28	0.29	0.27	0.32	0.35	0.31	0.33	0.27	0.19	0.18	0.22	0.24	0.26	0.32	0.34	0.36	0.49	0.37
O4'	0.14	0.13	0.16	0.19	0.17	0.25	0.35	0.32	0.30	0.15	0.13	0.24	0.08	0.12	0.17	0.24	0.36	0.44	0.53	0.43
O5'	0.16	0.29	0.14	0.11	0.25	0.10	0.20	0.12	0.17	0.18	0.33	0.36	0.24	0.17	0.32	0.12	0.13	0.26	0.35	0.21
O6	0.12	0.30	0.09	0.13	0.33	0.12	0.30	0.15	0.23	0.20	0.34	0.32	0.12	0.10	0.36	0.09	0.14	0.29	0.22	0.17
OP1	0.17	0.34	0.14	0.16	0.37	0.16	0.24	0.19	0.20	0.22	0.42	0.39	0.16	0.15	0.48	0.16	0.20	0.35	0.39	0.28
OP2	0.18	0.17	0.24	0.29	0.23	0.27	0.20	0.28	0.20	0.15	0.23	0.19	0.21	0.26	0.34	0.23	0.30	0.40	0.43	0.33
P	0.14	0.21	0.15	0.19	0.24	0.19	0.20	0.21	0.18	0.14	0.27	0.25	0.14	0.16	0.33	0.17	0.23	0.34	0.39	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.07	0.10	0.13	0.08
C2	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.05	0.01	0.06	0.10	0.12	0.26	0.13
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.08	0.04	0.09	0.02	0.04	0.09	0.00	0.02	0.05	0.01	0.09	0.16	0.13	0.11
C3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.11	0.10	0.07
C4	0.03	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.13	0.18	0.34	0.19
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01
C5	0.02	0.01	0.08	0.05	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.06	0.02	0.04	0.14	0.19	0.34	0.20
C5'	0.03	0.05	0.04	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.05	0.05	0.06	0.04	0.02	0.07	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.06	0.02	0.06	0.14	0.17	0.27	0.18
N1	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.11	0.13	0.23	0.13
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.04	0.12	0.15	0.31	0.17
O2	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.07	0.01	0.10	0.08	0.10	0.23	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.07	0.01	0.13	0.04	0.13	0.02	0.07	0.18	0.00	0.03	0.08	0.01	0.10	0.20	0.19	0.15
O3'	0.03	0.05	0.02	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.06	0.07	0.03	0.00	0.07	0.03	0.04	0.09	0.10	0.05
O4	0.03	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.03	0.13	0.18	0.36	0.19
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.04	0.10	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.02	0.08	0.04
O5'	0.07	0.10	0.09	0.05	0.13	0.01	0.14	0.01	0.14	0.11	0.12	0.08	0.10	0.04	0.13	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.10	0.12	0.16	0.11	0.18	0.05	0.19	0.04	0.17	0.13	0.15	0.10	0.20	0.09	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.26	0.13	0.10	0.34	0.02	0.34	0.02	0.27	0.23	0.31	0.23	0.19	0.10	0.36	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.11	0.07	0.19	0.01	0.20	0.01	0.18	0.13	0.17	0.11	0.15	0.05	0.19	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00