Doublet Group distance statistics: 52191

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.014, 0.032, 0.051, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.032 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.007, 0.025, 0.044, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.025 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.009, 0.028, 0.047, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.028 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.012, 0.035, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.035 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.013, 0.040, 0.066, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.040 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.020, 0.047, 0.074, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.047 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.022, 0.053, 0.085, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.053 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.025, 0.068, 0.110, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.068 std_dev=0.043
C8	A	0, 0.032, 0.083, 0.134, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.083 std_dev=0.051
O2'	B	0, 0.250, 0.558, 0.866, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.558 std_dev=0.308
C2'	B	0, 0.265, 0.639, 1.014, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.639 std_dev=0.375
C3'	B	0, 0.259, 0.887, 1.514, 1.842 max_d=1.842 avg_d=0.887 std_dev=0.628
C2'	A	0, -0.247, 0.708, 1.664, 2.594 max_d=2.594 avg_d=0.708 std_dev=0.955
O4'	A	0, -0.195, 0.767, 1.730, 2.661 max_d=2.661 avg_d=0.767 std_dev=0.963
O3'	B	0, 0.127, 1.092, 2.058, 2.800 max_d=2.800 avg_d=1.092 std_dev=0.966
O3'	A	0, 0.005, 1.279, 2.552, 3.726 max_d=3.726 avg_d=1.279 std_dev=1.273
C1'	B	0, 0.115, 1.405, 2.694, 3.434 max_d=3.434 avg_d=1.405 std_dev=1.290
C3'	A	0, -0.269, 1.027, 2.323, 3.578 max_d=3.578 avg_d=1.027 std_dev=1.296
O2'	A	0, -0.296, 1.024, 2.344, 3.622 max_d=3.622 avg_d=1.024 std_dev=1.320
C4'	A	0, -0.394, 0.953, 2.301, 3.592 max_d=3.592 avg_d=0.953 std_dev=1.348
C4'	B	0, 0.188, 1.552, 2.917, 3.597 max_d=3.597 avg_d=1.552 std_dev=1.364
O4'	B	0, 0.137, 1.894, 3.651, 4.459 max_d=4.459 avg_d=1.894 std_dev=1.757
C5'	B	0, 0.173, 2.140, 4.107, 4.839 max_d=4.839 avg_d=2.140 std_dev=1.967
N1	B	0, -0.037, 1.933, 3.903, 5.155 max_d=5.155 avg_d=1.933 std_dev=1.970
O5'	B	0, 0.169, 2.268, 4.368, 5.300 max_d=5.300 avg_d=2.268 std_dev=2.100
C6	B	0, 0.027, 2.343, 4.659, 5.323 max_d=5.323 avg_d=2.343 std_dev=2.316
C5'	A	0, -0.555, 1.816, 4.188, 6.482 max_d=6.482 avg_d=1.816 std_dev=2.371
C2	B	0, -0.449, 2.142, 4.733, 7.014 max_d=7.014 avg_d=2.142 std_dev=2.591
O2	B	0, -0.753, 1.863, 4.479, 7.035 max_d=7.035 avg_d=1.863 std_dev=2.616
O5'	A	0, -0.913, 1.791, 4.495, 7.179 max_d=7.179 avg_d=1.791 std_dev=2.704
OP1	B	0, 0.126, 3.011, 5.896, 7.407 max_d=7.407 avg_d=3.011 std_dev=2.885
P	B	0, 0.042, 2.982, 5.922, 7.123 max_d=7.123 avg_d=2.982 std_dev=2.940
C5	B	0, -0.103, 2.946, 5.995, 7.122 max_d=7.122 avg_d=2.946 std_dev=3.049
OP2	B	0, -0.078, 3.281, 6.640, 8.063 max_d=8.063 avg_d=3.281 std_dev=3.359
N3	B	0, -0.596, 2.790, 6.176, 9.008 max_d=9.008 avg_d=2.790 std_dev=3.386
C4	B	0, -0.384, 3.223, 6.830, 9.196 max_d=9.196 avg_d=3.223 std_dev=3.607
P	A	0, -1.779, 2.146, 6.072, 9.992 max_d=9.992 avg_d=2.146 std_dev=3.925
OP1	A	0, -1.642, 2.411, 6.465, 10.503 max_d=10.503 avg_d=2.411 std_dev=4.053
O4	B	0, -0.558, 3.841, 8.241, 11.214 max_d=11.214 avg_d=3.841 std_dev=4.399
OP2	A	0, -2.120, 2.600, 7.320, 12.031 max_d=12.031 avg_d=2.600 std_dev=4.720

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.01	0.21	0.01	0.44	0.19	0.26
C2	0.02	0.00	0.19	0.55	0.00	0.56	0.00	0.79	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.22	0.45	0.38	0.64	0.01	0.79	0.87	0.85
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.08	0.01	0.03	0.07	0.05	0.15	0.12	0.24	0.19	0.11	0.03	0.00	0.03	0.01	0.17	0.04	0.40	0.11	0.16
C3'	0.00	0.55	0.00	0.00	0.21	0.00	0.14	0.01	0.18	0.45	0.38	0.74	0.54	0.36	0.13	0.01	0.00	0.01	0.12	0.16	0.38	0.10	0.09
C4	0.01	0.00	0.08	0.21	0.00	0.18	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.16	0.20	0.12	0.01	0.14	0.05	0.07
C4'	0.01	0.56	0.01	0.00	0.18	0.00	0.04	0.00	0.11	0.47	0.37	0.75	0.54	0.35	0.11	0.10	0.02	0.01	0.01	0.04	0.44	0.04	0.12
C5	0.01	0.00	0.03	0.14	0.00	0.04	0.00	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.04	0.11	0.45	0.01	0.22	0.47	0.37
C5'	0.10	0.79	0.07	0.01	0.13	0.00	0.26	0.00	0.08	0.94	0.45	1.17	0.73	0.80	0.34	0.06	0.08	0.01	0.01	0.21	0.23	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.18	0.01	0.11	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.14	0.18	0.23	0.00	0.28	0.21	0.13
C8	0.01	0.00	0.15	0.45	0.00	0.47	0.00	0.94	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.20	0.28	0.17	1.09	0.01	0.80	1.17	1.03
N1	0.02	0.00	0.12	0.38	0.00	0.37	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.16	0.32	0.30	0.31	0.00	0.63	0.44	0.50
N2	0.03	0.00	0.24	0.74	0.01	0.75	0.00	1.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.29	0.61	0.45	1.03	0.01	1.17	1.45	1.35
N3	0.02	0.00	0.19	0.54	0.00	0.54	0.00	0.73	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.41	0.38	0.56	0.01	0.53	0.71	0.67
N7	0.01	0.00	0.11	0.36	0.00	0.35	0.00	0.80	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.20	0.08	0.99	0.01	0.63	1.14	0.95
N9	0.00	0.01	0.03	0.13	0.00	0.11	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.02	0.49	0.01	0.44	0.47	0.45
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.10	0.10	0.09	0.06	0.10	0.20	0.16	0.29	0.21	0.16	0.08	0.00	0.07	0.10	0.14	0.10	0.51	0.08	0.17
O3'	0.12	0.45	0.03	0.00	0.16	0.02	0.04	0.08	0.14	0.28	0.32	0.61	0.41	0.20	0.05	0.07	0.00	0.06	0.09	0.09	0.46	0.16	0.10
O4'	0.01	0.38	0.01	0.01	0.20	0.01	0.11	0.01	0.18	0.17	0.30	0.45	0.38	0.08	0.02	0.10	0.06	0.00	0.05	0.14	0.43	0.10	0.18
O5'	0.21	0.64	0.17	0.12	0.12	0.01	0.45	0.01	0.23	1.09	0.31	1.03	0.56	0.99	0.49	0.14	0.09	0.05	0.00	0.39	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.04	0.16	0.01	0.04	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.14	0.39	0.00	0.25	0.45	0.28
OP1	0.44	0.79	0.40	0.38	0.14	0.44	0.22	0.23	0.28	0.80	0.63	1.17	0.53	0.63	0.44	0.51	0.46	0.43	0.01	0.25	0.00	0.00	0.00
OP2	0.19	0.87	0.11	0.10	0.05	0.04	0.47	0.04	0.21	1.17	0.44	1.45	0.71	1.14	0.47	0.08	0.16	0.10	0.01	0.45	0.00	0.00	0.00
P	0.26	0.85	0.16	0.09	0.07	0.12	0.37	0.01	0.13	1.03	0.50	1.35	0.67	0.95	0.45	0.17	0.10	0.18	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.72	0.58	0.16	0.14	0.64	0.67	0.73	0.82	0.75	0.69	0.56	0.47	0.17	0.30	0.62	1.04	0.75	0.83	0.71	0.86
C2	0.58	0.65	0.07	0.10	0.56	0.36	0.49	0.38	0.49	0.57	0.63	0.75	0.23	0.40	0.58	0.69	0.34	0.35	0.26	0.36
C2'	0.73	0.72	0.13	0.18	0.90	0.66	0.94	0.84	0.90	0.80	0.79	0.58	0.10	0.23	0.93	1.02	0.84	0.91	0.80	0.94
C3'	0.67	0.70	0.42	0.44	0.76	0.63	0.75	0.74	0.72	0.70	0.74	0.66	0.38	0.52	0.80	0.87	0.70	0.74	0.51	0.71
C4	0.76	0.62	0.19	0.16	0.66	0.69	0.74	0.81	0.77	0.72	0.60	0.52	0.13	0.25	0.63	1.05	0.74	0.80	0.71	0.82
C4'	0.69	0.58	0.37	0.41	0.53	0.69	0.53	0.76	0.56	0.60	0.55	0.61	0.33	0.48	0.54	0.93	0.64	0.68	0.38	0.64
C5	0.86	0.84	0.29	0.27	0.95	0.88	0.97	1.03	0.96	0.88	0.90	0.77	0.06	0.22	0.97	1.22	0.93	1.01	0.94	1.03
C5'	0.68	0.58	0.55	0.61	0.55	0.72	0.52	0.75	0.52	0.57	0.56	0.63	0.54	0.68	0.61	0.85	0.64	0.64	0.41	0.56
C6	0.88	0.90	0.33	0.29	0.98	0.87	0.97	0.96	0.95	0.90	0.96	0.84	0.06	0.24	1.00	1.19	0.86	0.91	0.87	0.92
C8	0.87	0.86	0.28	0.30	1.04	0.95	1.07	1.18	1.04	0.91	0.97	0.78	0.06	0.21	1.08	1.29	1.08	1.21	1.10	1.23
N1	0.71	0.56	0.20	0.12	0.53	0.54	0.57	0.57	0.61	0.63	0.51	0.53	0.12	0.25	0.49	0.87	0.51	0.53	0.49	0.54
N2	0.41	0.96	0.11	0.25	0.90	0.15	0.64	0.13	0.49	0.62	1.04	1.17	0.32	0.60	1.00	0.34	0.06	0.07	0.15	0.06
N3	0.63	0.65	0.08	0.09	0.61	0.46	0.59	0.52	0.59	0.62	0.64	0.67	0.21	0.38	0.63	0.81	0.47	0.49	0.40	0.52
N7	0.92	1.05	0.33	0.35	1.25	1.03	1.21	1.26	1.14	1.01	1.21	1.01	0.05	0.26	1.32	1.35	1.14	1.28	1.19	1.29
N9	0.78	0.64	0.20	0.19	0.74	0.77	0.83	0.94	0.85	0.76	0.65	0.52	0.12	0.23	0.72	1.13	0.86	0.95	0.84	0.97
O2'	0.82	0.82	0.28	0.31	1.10	0.76	1.16	0.97	1.08	0.92	0.93	0.61	0.38	0.39	1.17	1.13	1.00	1.11	1.08	1.17
O3'	0.63	0.74	0.40	0.40	0.87	0.58	0.82	0.71	0.76	0.71	0.84	0.70	0.34	0.48	0.95	0.84	0.70	0.75	0.55	0.73
O4'	0.74	0.56	0.24	0.28	0.47	0.74	0.52	0.82	0.59	0.63	0.48	0.57	0.22	0.36	0.44	1.04	0.68	0.73	0.46	0.71
O5'	0.58	0.27	0.33	0.38	0.21	0.64	0.15	0.62	0.16	0.31	0.14	0.44	0.47	0.49	0.34	0.80	0.40	0.40	0.15	0.31
O6	0.96	1.34	0.43	0.43	1.44	1.07	1.31	1.18	1.20	1.15	1.48	1.33	0.15	0.39	1.50	1.32	1.03	1.10	1.10	1.10
OP1	0.97	0.68	0.80	0.83	0.54	1.08	0.53	1.04	0.54	0.69	0.53	0.89	1.05	0.89	0.64	1.15	0.83	0.89	0.61	0.77
OP2	0.67	0.53	0.63	0.71	0.75	0.78	0.71	0.75	0.55	0.52	0.60	0.64	0.77	0.79	0.93	0.79	0.68	0.72	0.72	0.64
P	0.76	0.53	0.64	0.69	0.54	0.85	0.51	0.81	0.44	0.52	0.46	0.72	0.81	0.76	0.66	0.91	0.65	0.68	0.53	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.31	0.16
C2	0.01	0.00	0.11	0.12	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.14	0.01	0.06	0.06	0.20	0.44	0.25
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.09	0.18	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.05	0.19	0.09
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.02	0.07	0.05	0.12	0.16	0.01	0.00	0.10	0.00	0.03	0.11	0.06	0.03
C4	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.03	0.08	0.30	0.41	0.25
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.06	0.00	0.01	0.10	0.12	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.07	0.26	0.32	0.17
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.05	0.03	0.07	0.05	0.04	0.03	0.09	0.01	0.00	0.11	0.04	0.00
C6	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.04	0.18	0.29	0.14
N1	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.05	0.15	0.36	0.20
N3	0.01	0.00	0.09	0.12	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.14	0.01	0.06	0.08	0.27	0.46	0.28
O2	0.01	0.00	0.18	0.16	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.20	0.01	0.09	0.06	0.18	0.45	0.26
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.08	0.15	0.00	0.02	0.05	0.04	0.01	0.12	0.18	0.06
O3'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.10	0.02	0.07	0.03	0.08	0.05	0.14	0.20	0.02	0.00	0.12	0.01	0.05	0.21	0.10	0.08
O4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.05	0.10	0.36	0.43	0.28
O4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.06	0.09	0.04	0.01	0.05	0.00	0.03	0.03	0.29	0.15
O5'	0.04	0.06	0.04	0.03	0.08	0.01	0.07	0.00	0.04	0.05	0.08	0.06	0.01	0.05	0.10	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.20	0.05	0.11	0.30	0.10	0.26	0.11	0.18	0.15	0.27	0.18	0.12	0.21	0.36	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.31	0.44	0.19	0.06	0.41	0.12	0.32	0.04	0.29	0.36	0.46	0.45	0.18	0.10	0.43	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.16	0.25	0.09	0.03	0.25	0.05	0.17	0.00	0.14	0.20	0.28	0.26	0.06	0.08	0.28	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00