Doublet Group distance statistics: 52196

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 1, 8, 9, 6, 2, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.005, 0.008, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.005 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C2	A	0, -0.001, 0.005, 0.012, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.005 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, -0.002, 0.007, 0.017, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.007 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.003, 0.014, 0.024, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.001, 0.013, 0.026, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N9	A	0, -0.002, 0.011, 0.024, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.011 std_dev=0.013
C8	A	0, -0.001, 0.015, 0.032, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.015 std_dev=0.017
O4'	A	0, -0.037, 0.098, 0.232, 0.628 max_d=0.628 avg_d=0.098 std_dev=0.134
C2'	A	0, -0.028, 0.140, 0.308, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.140 std_dev=0.168
O3'	B	0, 0.191, 0.363, 0.535, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.363 std_dev=0.172
O2'	B	0, 0.181, 0.359, 0.537, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.359 std_dev=0.178
O5'	A	0, 0.103, 0.291, 0.478, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.291 std_dev=0.187
P	A	0, 0.123, 0.319, 0.515, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.319 std_dev=0.196
C5'	A	0, 0.028, 0.243, 0.459, 1.077 max_d=1.077 avg_d=0.243 std_dev=0.216
OP1	A	0, 0.122, 0.353, 0.583, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.353 std_dev=0.230
C3'	B	0, 0.151, 0.387, 0.624, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.387 std_dev=0.236
C4'	A	0, -0.064, 0.173, 0.411, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.173 std_dev=0.237
C2'	B	0, 0.124, 0.392, 0.660, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.392 std_dev=0.268
OP2	A	0, 0.124, 0.408, 0.692, 1.514 max_d=1.514 avg_d=0.408 std_dev=0.284
C3'	A	0, -0.079, 0.232, 0.543, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.232 std_dev=0.311
O2'	A	0, -0.110, 0.247, 0.604, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.247 std_dev=0.357
C4'	B	0, 0.080, 0.504, 0.928, 1.972 max_d=1.972 avg_d=0.504 std_dev=0.424
C1'	B	0, 0.070, 0.558, 1.045, 2.060 max_d=2.060 avg_d=0.558 std_dev=0.488
C6	B	0, 0.122, 0.657, 1.191, 2.777 max_d=2.777 avg_d=0.657 std_dev=0.534
O4'	B	0, 0.082, 0.620, 1.157, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.620 std_dev=0.537
O3'	A	0, -0.197, 0.387, 0.971, 2.603 max_d=2.603 avg_d=0.387 std_dev=0.584
C5'	B	0, 0.054, 0.640, 1.225, 2.822 max_d=2.822 avg_d=0.640 std_dev=0.585
O5'	B	0, 0.111, 0.737, 1.364, 3.171 max_d=3.171 avg_d=0.737 std_dev=0.627
N1	B	0, 0.029, 0.665, 1.301, 2.606 max_d=2.606 avg_d=0.665 std_dev=0.636
C5	B	0, 0.095, 0.784, 1.474, 3.377 max_d=3.377 avg_d=0.784 std_dev=0.690
P	B	0, 0.061, 0.851, 1.642, 3.727 max_d=3.727 avg_d=0.851 std_dev=0.791
OP1	B	0, 0.026, 0.854, 1.682, 3.894 max_d=3.894 avg_d=0.854 std_dev=0.828
OP2	B	0, 0.064, 0.938, 1.812, 4.120 max_d=4.120 avg_d=0.938 std_dev=0.874
C2	B	0, -0.147, 0.812, 1.771, 4.088 max_d=4.088 avg_d=0.812 std_dev=0.959
C4	B	0, -0.069, 0.953, 1.975, 4.124 max_d=4.124 avg_d=0.953 std_dev=1.022
O2	B	0, -0.267, 0.841, 1.950, 4.853 max_d=4.853 avg_d=0.841 std_dev=1.109
N3	B	0, -0.192, 0.954, 2.100, 4.854 max_d=4.854 avg_d=0.954 std_dev=1.146
O4	B	0, -0.141, 1.094, 2.329, 5.082 max_d=5.082 avg_d=1.094 std_dev=1.235

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.00	0.10	0.07	0.18	0.12
C2	0.01	0.00	0.12	0.14	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.03	0.10	0.09	0.21	0.12
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.13	0.05	0.07	0.09	0.12	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.26	0.22	0.38	0.31
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.14	0.00	0.17	0.02	0.18	0.15	0.17	0.12	0.20	0.18	0.11	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.06	0.05
C4	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.06	0.02	0.12	0.09	0.18	0.11
C4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.04	0.06	0.06	0.04	0.15	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.17	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.07	0.02	0.16	0.11	0.18	0.12
C5'	0.05	0.05	0.13	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.09	0.06	0.04	0.09	0.09	0.06	0.03	0.11	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.07	0.03	0.15	0.11	0.19	0.12
C8	0.02	0.01	0.07	0.15	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.08	0.02	0.18	0.11	0.16	0.12
N1	0.01	0.00	0.09	0.17	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.06	0.03	0.13	0.10	0.20	0.12
N3	0.01	0.00	0.12	0.12	0.00	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.03	0.09	0.08	0.20	0.11
N6	0.01	0.01	0.04	0.20	0.00	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.10	0.03	0.18	0.13	0.20	0.14
N7	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.10	0.03	0.19	0.12	0.17	0.13
N9	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.06	0.01	0.12	0.08	0.17	0.10
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.14	0.15	0.18	0.03	0.19	0.15	0.17	0.11	0.21	0.18	0.11	0.00	0.02	0.10	0.22	0.15	0.45	0.29
O3'	0.16	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.11	0.07	0.08	0.06	0.11	0.10	0.10	0.06	0.02	0.00	0.12	0.11	0.17	0.17	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.10	0.12	0.00	0.07	0.11	0.05	0.05
O5'	0.10	0.10	0.26	0.04	0.12	0.01	0.16	0.01	0.15	0.18	0.13	0.09	0.18	0.19	0.12	0.22	0.11	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.09	0.22	0.04	0.09	0.06	0.11	0.05	0.11	0.11	0.10	0.08	0.13	0.12	0.08	0.15	0.17	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.21	0.38	0.06	0.18	0.03	0.18	0.05	0.19	0.16	0.20	0.20	0.20	0.17	0.17	0.45	0.17	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.12	0.31	0.05	0.11	0.02	0.12	0.01	0.12	0.12	0.12	0.11	0.14	0.13	0.10	0.29	0.12	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.13	0.13	0.14	0.15	0.26	0.14	0.38	0.14	0.12	0.15	0.14	0.16	0.17	0.17	0.20	0.33	0.42	0.32	0.36
C2	0.24	0.36	0.23	0.10	0.32	0.11	0.26	0.16	0.24	0.28	0.37	0.41	0.21	0.16	0.34	0.18	0.13	0.21	0.13	0.14
C2'	0.19	0.17	0.15	0.27	0.20	0.38	0.20	0.53	0.22	0.16	0.21	0.19	0.15	0.32	0.23	0.29	0.49	0.58	0.50	0.53
C3'	0.13	0.32	0.22	0.08	0.37	0.26	0.28	0.45	0.21	0.22	0.39	0.33	0.25	0.10	0.43	0.16	0.38	0.52	0.39	0.44
C4	0.19	0.27	0.20	0.10	0.25	0.12	0.22	0.19	0.20	0.22	0.28	0.31	0.20	0.15	0.26	0.14	0.15	0.22	0.13	0.17
C4'	0.16	0.10	0.11	0.15	0.14	0.38	0.13	0.55	0.12	0.10	0.13	0.11	0.16	0.11	0.18	0.31	0.47	0.58	0.47	0.52
C5	0.25	0.33	0.24	0.12	0.28	0.11	0.25	0.11	0.24	0.27	0.32	0.38	0.21	0.15	0.29	0.20	0.12	0.14	0.14	0.12
C5'	0.21	0.09	0.10	0.19	0.10	0.42	0.10	0.59	0.13	0.12	0.09	0.12	0.12	0.12	0.14	0.36	0.52	0.56	0.50	0.54
C6	0.31	0.41	0.26	0.14	0.34	0.14	0.30	0.11	0.29	0.34	0.40	0.48	0.22	0.15	0.35	0.27	0.16	0.14	0.20	0.15
C8	0.15	0.18	0.18	0.09	0.18	0.12	0.18	0.17	0.17	0.17	0.19	0.20	0.19	0.14	0.19	0.12	0.13	0.18	0.12	0.15
N1	0.29	0.41	0.25	0.12	0.35	0.12	0.30	0.12	0.28	0.33	0.41	0.48	0.21	0.15	0.37	0.24	0.13	0.15	0.16	0.13
N3	0.19	0.29	0.20	0.10	0.27	0.13	0.22	0.22	0.21	0.23	0.31	0.33	0.20	0.16	0.29	0.14	0.17	0.27	0.16	0.20
N6	0.37	0.47	0.28	0.17	0.38	0.19	0.34	0.17	0.33	0.39	0.44	0.56	0.21	0.15	0.38	0.35	0.23	0.19	0.30	0.23
N7	0.23	0.27	0.23	0.12	0.24	0.11	0.22	0.10	0.22	0.24	0.26	0.31	0.21	0.14	0.24	0.20	0.12	0.13	0.15	0.12
N9	0.14	0.19	0.17	0.10	0.19	0.17	0.17	0.25	0.16	0.16	0.21	0.21	0.19	0.15	0.21	0.13	0.20	0.27	0.18	0.22
O2'	0.20	0.14	0.16	0.27	0.18	0.35	0.21	0.48	0.23	0.17	0.17	0.15	0.17	0.30	0.20	0.28	0.45	0.51	0.47	0.48
O3'	0.13	0.36	0.25	0.07	0.47	0.25	0.38	0.44	0.28	0.26	0.46	0.34	0.25	0.08	0.55	0.16	0.33	0.49	0.32	0.39
O4'	0.17	0.10	0.12	0.13	0.10	0.31	0.12	0.43	0.13	0.12	0.09	0.12	0.16	0.10	0.11	0.27	0.36	0.44	0.35	0.40
O5'	0.10	0.26	0.19	0.03	0.31	0.16	0.25	0.31	0.19	0.18	0.32	0.26	0.21	0.01	0.35	0.09	0.27	0.30	0.28	0.29
OP1	0.18	0.10	0.12	0.17	0.08	0.26	0.09	0.36	0.13	0.12	0.08	0.13	0.08	0.01	0.10	0.28	0.41	0.26	0.43	0.37
OP2	0.23	0.47	0.21	0.13	0.53	0.09	0.45	0.10	0.37	0.37	0.54	0.45	0.13	0.02	0.58	0.15	0.15	0.25	0.18	0.18
P	0.04	0.19	0.08	0.01	0.25	0.09	0.21	0.17	0.16	0.13	0.25	0.19	0.08	0.01	0.29	0.05	0.16	0.13	0.16	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.07	0.04	0.11	0.04
C2	0.03	0.00	0.07	0.08	0.02	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.02	0.08	0.14	0.10	0.25	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.05	0.12	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.08	0.05	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.01	0.11	0.07	0.11	0.08	0.01	0.01	0.12	0.01	0.03	0.10	0.04	0.04
C4	0.02	0.02	0.03	0.11	0.00	0.08	0.00	0.18	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.10	0.00	0.02	0.31	0.33	0.50	0.32
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.08	0.00	0.13	0.00	0.13	0.04	0.03	0.11	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.13	0.00	0.26	0.00	0.02	0.00	0.02	0.12	0.12	0.01	0.07	0.37	0.41	0.54	0.40
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.18	0.00	0.26	0.00	0.23	0.09	0.09	0.11	0.06	0.02	0.19	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.10	0.11	0.00	0.13	0.00	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.01	0.10	0.33	0.33	0.40	0.31
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.02	0.04	0.02	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.17	0.14	0.24	0.14
N3	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.06	0.22	0.19	0.37	0.20
O2	0.05	0.00	0.12	0.08	0.01	0.11	0.02	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.10	0.02	0.16	0.07	0.11	0.17	0.09
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.10	0.07	0.12	0.06	0.11	0.04	0.07	0.10	0.00	0.04	0.11	0.08	0.05	0.09	0.05	0.04
O3'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.10	0.01	0.12	0.02	0.10	0.05	0.10	0.10	0.04	0.00	0.12	0.01	0.04	0.13	0.06	0.05
O4	0.02	0.02	0.04	0.12	0.00	0.08	0.01	0.19	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.12	0.00	0.03	0.33	0.38	0.56	0.36
O4'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.06	0.16	0.08	0.01	0.03	0.00	0.05	0.07	0.08	0.06
O5'	0.07	0.14	0.04	0.03	0.31	0.01	0.37	0.01	0.33	0.17	0.22	0.07	0.05	0.04	0.33	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.10	0.08	0.10	0.33	0.05	0.41	0.06	0.33	0.14	0.19	0.11	0.09	0.13	0.38	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.25	0.05	0.04	0.50	0.02	0.54	0.01	0.40	0.24	0.37	0.17	0.05	0.06	0.56	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.11	0.04	0.04	0.32	0.02	0.40	0.01	0.31	0.14	0.20	0.09	0.04	0.05	0.36	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00