Doublet Group distance statistics: 52197

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 5, 6, 4, 2, 0, 0, 1, 0, 1, 4, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.014, 0.023, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.003, 0.015, 0.027, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.015 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.028, 0.141, 0.254, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.141 std_dev=0.113
O4'	A	0, -0.016, 0.098, 0.212, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.098 std_dev=0.114
O2'	A	0, 0.079, 0.217, 0.354, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.217 std_dev=0.137
C4'	A	0, 0.027, 0.189, 0.350, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.189 std_dev=0.161
C3'	A	0, 0.063, 0.231, 0.400, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.231 std_dev=0.168
O3'	A	0, 0.149, 0.389, 0.629, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.389 std_dev=0.240
O5'	A	0, 0.146, 0.416, 0.685, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.416 std_dev=0.269
C5'	A	0, 0.056, 0.333, 0.611, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.333 std_dev=0.278
P	A	0, 0.081, 0.368, 0.654, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.368 std_dev=0.287
O4'	B	0, 0.106, 0.401, 0.696, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.401 std_dev=0.295
C4'	B	0, 0.101, 0.404, 0.707, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.404 std_dev=0.303
OP2	A	0, 0.164, 0.473, 0.782, 1.233 max_d=1.233 avg_d=0.473 std_dev=0.309
C3'	B	0, 0.093, 0.411, 0.730, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.411 std_dev=0.318
C1'	B	0, 0.094, 0.421, 0.748, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.421 std_dev=0.327
C5'	B	0, 0.131, 0.472, 0.813, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.472 std_dev=0.341
C2'	B	0, 0.119, 0.478, 0.836, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.478 std_dev=0.359
OP1	A	0, 0.221, 0.622, 1.022, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.622 std_dev=0.401
O3'	B	0, 0.051, 0.459, 0.867, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.459 std_dev=0.408
N1	B	0, 0.064, 0.492, 0.921, 1.282 max_d=1.282 avg_d=0.492 std_dev=0.429
C6	B	0, 0.083, 0.559, 1.036, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.559 std_dev=0.476
O2'	B	0, 0.124, 0.601, 1.077, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.601 std_dev=0.477
C2	B	0, 0.054, 0.660, 1.266, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.660 std_dev=0.606
C5	B	0, 0.087, 0.734, 1.381, 1.957 max_d=1.957 avg_d=0.734 std_dev=0.647
O2	B	0, 0.068, 0.770, 1.472, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.770 std_dev=0.702
N3	B	0, 0.061, 0.804, 1.547, 2.230 max_d=2.230 avg_d=0.804 std_dev=0.743
C4	B	0, 0.066, 0.837, 1.608, 2.346 max_d=2.346 avg_d=0.837 std_dev=0.771
O4	B	0, 0.079, 1.028, 1.977, 2.869 max_d=2.869 avg_d=1.028 std_dev=0.949
O5'	B	0, -0.057, 1.240, 2.536, 3.544 max_d=3.544 avg_d=1.240 std_dev=1.296
OP1	B	0, 0.165, 1.646, 3.127, 4.224 max_d=4.224 avg_d=1.646 std_dev=1.481
P	B	0, -0.076, 1.731, 3.537, 4.664 max_d=4.664 avg_d=1.731 std_dev=1.807
OP2	B	0, -0.029, 2.044, 4.118, 5.409 max_d=5.409 avg_d=2.044 std_dev=2.073

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.18	0.28	0.07
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.03	0.19	0.21	0.31	0.18
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.05	0.06	0.08	0.10	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.13	0.42	0.16
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.08	0.02	0.08	0.13	0.09	0.09	0.10	0.12	0.06	0.01	0.01	0.01	0.16	0.17	0.46	0.22
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.02	0.20	0.21	0.30	0.18
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.04	0.04	0.06	0.08	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.16	0.27	0.06
C5	0.00	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.02	0.26	0.27	0.30	0.23
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.09	0.00	0.12	0.00	0.12	0.14	0.10	0.07	0.14	0.15	0.08	0.02	0.03	0.01	0.01	0.20	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.26	0.29	0.30	0.25
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.14	0.03	0.26	0.24	0.28	0.20
N1	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.02	0.23	0.26	0.31	0.22
N3	0.02	0.00	0.10	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.11	0.03	0.17	0.19	0.31	0.15
N6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.12	0.03	0.28	0.34	0.30	0.28
N7	0.01	0.01	0.05	0.12	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.15	0.03	0.29	0.30	0.29	0.26
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.18	0.19	0.29	0.14
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.02	0.06	0.04	0.10	0.11	0.05	0.03	0.01	0.00	0.06	0.03	0.06	0.13	0.42	0.13
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.09	0.03	0.10	0.14	0.10	0.11	0.12	0.15	0.05	0.06	0.00	0.02	0.15	0.22	0.57	0.28
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.25	0.19	0.09
O5'	0.08	0.19	0.12	0.16	0.20	0.01	0.26	0.01	0.26	0.26	0.23	0.17	0.28	0.29	0.18	0.06	0.15	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.21	0.13	0.17	0.21	0.16	0.27	0.20	0.29	0.24	0.26	0.19	0.34	0.30	0.19	0.13	0.22	0.25	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.31	0.42	0.46	0.30	0.27	0.30	0.16	0.30	0.28	0.31	0.31	0.30	0.29	0.29	0.42	0.57	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.18	0.16	0.22	0.18	0.06	0.23	0.01	0.25	0.20	0.22	0.15	0.28	0.26	0.14	0.13	0.28	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.54	0.29	0.11	0.54	0.19	0.40	0.22	0.33	0.37	0.60	0.62	0.49	0.10	0.60	0.15	0.23	0.46	0.38	0.17
C2	0.11	0.38	0.14	0.14	0.56	0.25	0.45	0.26	0.32	0.27	0.53	0.36	0.28	0.19	0.66	0.19	0.37	0.41	0.31	0.37
C2'	0.20	0.55	0.25	0.11	0.56	0.21	0.40	0.23	0.30	0.35	0.63	0.64	0.44	0.15	0.63	0.14	0.12	0.38	0.55	0.18
C3'	0.17	0.49	0.22	0.14	0.47	0.24	0.31	0.26	0.23	0.30	0.56	0.61	0.41	0.19	0.53	0.16	0.14	0.37	0.71	0.27
C4	0.15	0.45	0.18	0.12	0.54	0.23	0.42	0.25	0.32	0.31	0.56	0.48	0.35	0.16	0.61	0.16	0.31	0.41	0.16	0.27
C4'	0.22	0.49	0.27	0.11	0.43	0.20	0.28	0.24	0.23	0.31	0.52	0.61	0.48	0.11	0.47	0.14	0.15	0.47	0.67	0.19
C5	0.12	0.40	0.14	0.16	0.51	0.26	0.41	0.26	0.31	0.27	0.51	0.39	0.27	0.22	0.58	0.18	0.35	0.38	0.30	0.35
C5'	0.19	0.42	0.26	0.11	0.32	0.20	0.20	0.26	0.17	0.25	0.42	0.55	0.47	0.13	0.35	0.14	0.13	0.47	0.75	0.21
C6	0.10	0.31	0.11	0.19	0.50	0.28	0.43	0.28	0.31	0.23	0.45	0.27	0.20	0.25	0.59	0.22	0.41	0.39	0.50	0.45
C8	0.22	0.50	0.23	0.10	0.49	0.21	0.39	0.24	0.31	0.35	0.55	0.56	0.41	0.14	0.54	0.14	0.25	0.39	0.16	0.19
N1	0.10	0.32	0.11	0.18	0.53	0.27	0.44	0.27	0.32	0.23	0.47	0.27	0.22	0.23	0.63	0.22	0.41	0.40	0.47	0.45
N3	0.14	0.44	0.18	0.11	0.56	0.23	0.44	0.25	0.33	0.30	0.57	0.45	0.35	0.15	0.65	0.16	0.33	0.42	0.17	0.29
N6	0.14	0.22	0.13	0.24	0.46	0.30	0.42	0.29	0.30	0.19	0.37	0.24	0.14	0.29	0.55	0.26	0.45	0.38	0.71	0.55
N7	0.15	0.43	0.15	0.16	0.48	0.25	0.39	0.26	0.31	0.30	0.50	0.45	0.30	0.23	0.53	0.16	0.32	0.36	0.24	0.30
N9	0.21	0.51	0.24	0.09	0.53	0.21	0.41	0.23	0.32	0.35	0.58	0.57	0.43	0.11	0.59	0.14	0.26	0.42	0.20	0.19
O2'	0.21	0.55	0.25	0.11	0.57	0.20	0.40	0.23	0.30	0.35	0.64	0.64	0.44	0.13	0.65	0.14	0.14	0.43	0.59	0.19
O3'	0.16	0.45	0.18	0.22	0.43	0.30	0.27	0.32	0.20	0.25	0.52	0.57	0.32	0.28	0.49	0.22	0.19	0.38	0.85	0.37
O4'	0.32	0.54	0.36	0.18	0.50	0.19	0.38	0.23	0.33	0.39	0.58	0.65	0.56	0.19	0.54	0.18	0.25	0.52	0.48	0.20
O5'	0.17	0.42	0.24	0.03	0.31	0.21	0.16	0.26	0.12	0.23	0.42	0.56	0.48	0.01	0.33	0.13	0.16	0.44	0.71	0.26
OP1	0.14	0.05	0.15	0.22	0.19	0.36	0.32	0.48	0.32	0.16	0.07	0.17	0.13	0.01	0.20	0.29	0.38	0.72	0.57	0.32
OP2	0.22	0.40	0.30	0.19	0.32	0.13	0.23	0.20	0.19	0.27	0.40	0.50	0.36	0.02	0.33	0.13	0.64	0.53	1.41	0.91
P	0.08	0.23	0.12	0.02	0.11	0.14	0.05	0.17	0.05	0.09	0.21	0.35	0.24	0.01	0.12	0.08	0.18	0.37	0.85	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.20	0.13	0.25	0.11
C2	0.01	0.00	0.11	0.06	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.10	0.01	0.06	0.24	0.21	0.50	0.16
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.06	0.12	0.01	0.07	0.20	0.00	0.02	0.03	0.01	0.52	0.30	0.39	0.48
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.10	0.03	0.10	0.02	0.04	0.13	0.01	0.01	0.06	0.01	0.38	0.26	0.57	0.43
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.07	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.02	0.17	0.26	1.05	0.28
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.09	0.04	0.04	0.05	0.01	0.02	0.07	0.00	0.01	0.09	0.13	0.02
C5	0.01	0.00	0.10	0.10	0.00	0.09	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.04	0.01	0.05	0.14	0.26	1.25	0.36
C5'	0.04	0.08	0.06	0.03	0.18	0.01	0.21	0.00	0.19	0.11	0.13	0.04	0.06	0.03	0.19	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02
C6	0.01	0.00	0.12	0.10	0.01	0.09	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.05	0.01	0.06	0.13	0.19	1.02	0.28
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.20	0.16	0.58	0.12
N3	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.08	0.00	0.05	0.22	0.24	0.73	0.19
O2	0.01	0.00	0.20	0.13	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.16	0.01	0.10	0.29	0.23	0.29	0.22
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.04	0.01	0.11	0.06	0.12	0.03	0.12	0.32	0.00	0.03	0.05	0.01	0.57	0.36	0.57	0.60
O3'	0.05	0.10	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.08	0.16	0.03	0.00	0.03	0.04	0.21	0.25	0.59	0.33
O4	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.07	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.18	0.30	1.15	0.32
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.10	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.04	0.41	0.18
O5'	0.20	0.24	0.52	0.38	0.17	0.01	0.14	0.01	0.13	0.20	0.22	0.29	0.57	0.21	0.18	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.13	0.21	0.30	0.26	0.26	0.09	0.26	0.05	0.19	0.16	0.24	0.23	0.36	0.25	0.30	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.50	0.39	0.57	1.05	0.13	1.25	0.13	1.02	0.58	0.73	0.29	0.57	0.59	1.15	0.41	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.16	0.48	0.43	0.28	0.02	0.36	0.02	0.28	0.12	0.19	0.22	0.60	0.33	0.32	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00