Doublet Group distance statistics: 52198

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 5, 7, 5, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.003, 0.008, 0.019, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.008 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.027 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.010, 0.030, 0.051, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.030 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.033 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.014, 0.091, 0.168, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.091 std_dev=0.077
O4'	A	0, -0.007, 0.071, 0.149, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.071 std_dev=0.078
C2'	B	0, 0.205, 0.354, 0.504, 0.594 max_d=0.594 avg_d=0.354 std_dev=0.150
C4'	A	0, -0.030, 0.130, 0.290, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.130 std_dev=0.160
C3'	B	0, 0.151, 0.358, 0.566, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.358 std_dev=0.207
O2'	B	0, 0.142, 0.351, 0.560, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.351 std_dev=0.209
O3'	B	0, 0.118, 0.328, 0.539, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.328 std_dev=0.211
C5'	A	0, -0.013, 0.218, 0.449, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.218 std_dev=0.231
C3'	A	0, -0.078, 0.170, 0.418, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.170 std_dev=0.248
O2'	A	0, -0.102, 0.160, 0.422, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.160 std_dev=0.262
P	A	0, 0.076, 0.372, 0.668, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.372 std_dev=0.296
C1'	B	0, 0.150, 0.454, 0.758, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.454 std_dev=0.304
O5'	A	0, 0.018, 0.324, 0.630, 1.408 max_d=1.408 avg_d=0.324 std_dev=0.306
O4'	B	0, 0.146, 0.479, 0.811, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.479 std_dev=0.332
O5'	B	0, 0.156, 0.499, 0.843, 2.040 max_d=2.040 avg_d=0.499 std_dev=0.344
C4'	B	0, 0.067, 0.425, 0.782, 2.145 max_d=2.145 avg_d=0.425 std_dev=0.357
OP2	A	0, 0.093, 0.502, 0.911, 1.977 max_d=1.977 avg_d=0.502 std_dev=0.409
OP1	A	0, 0.058, 0.478, 0.898, 2.326 max_d=2.326 avg_d=0.478 std_dev=0.420
C6	B	0, 0.165, 0.642, 1.119, 2.418 max_d=2.418 avg_d=0.642 std_dev=0.477
C5'	B	0, 0.005, 0.494, 0.984, 2.921 max_d=2.921 avg_d=0.494 std_dev=0.490
N1	B	0, 0.068, 0.560, 1.051, 2.659 max_d=2.659 avg_d=0.560 std_dev=0.491
O3'	A	0, -0.233, 0.269, 0.771, 2.777 max_d=2.777 avg_d=0.269 std_dev=0.502
P	B	0, 0.056, 0.634, 1.212, 3.275 max_d=3.275 avg_d=0.634 std_dev=0.578
OP2	B	0, 0.103, 0.688, 1.272, 3.248 max_d=3.248 avg_d=0.688 std_dev=0.584
C5	B	0, 0.036, 0.777, 1.519, 3.891 max_d=3.891 avg_d=0.777 std_dev=0.741
C2	B	0, -0.169, 0.619, 1.407, 4.278 max_d=4.278 avg_d=0.619 std_dev=0.788
O2	B	0, -0.262, 0.596, 1.454, 4.633 max_d=4.633 avg_d=0.596 std_dev=0.858
OP1	B	0, -0.206, 0.691, 1.587, 5.103 max_d=5.103 avg_d=0.691 std_dev=0.896
N3	B	0, -0.287, 0.751, 1.788, 5.624 max_d=5.624 avg_d=0.751 std_dev=1.038
C4	B	0, -0.207, 0.833, 1.874, 5.608 max_d=5.608 avg_d=0.833 std_dev=1.041
O4	B	0, -0.342, 0.970, 2.282, 7.071 max_d=7.071 avg_d=0.970 std_dev=1.312

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.00	0.08	0.06	0.30	0.11
C2	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.18	0.14	0.03	0.21	0.17	0.39	0.21
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.13	0.05	0.03	0.06	0.07	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.40	0.17
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.11	0.00	0.14	0.04	0.15	0.13	0.14	0.10	0.17	0.15	0.09	0.01	0.00	0.01	0.14	0.12	0.14	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.01	0.18	0.14	0.35	0.18
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.06	0.07	0.05	0.08	0.07	0.04	0.12	0.02	0.00	0.02	0.08	0.19	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.09	0.02	0.22	0.19	0.36	0.21
C5'	0.06	0.12	0.13	0.04	0.11	0.01	0.13	0.00	0.14	0.11	0.14	0.10	0.16	0.13	0.08	0.04	0.06	0.02	0.01	0.10	0.20	0.02
C6	0.01	0.00	0.05	0.15	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.11	0.02	0.24	0.22	0.40	0.24
C8	0.01	0.01	0.03	0.13	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.07	0.02	0.18	0.13	0.28	0.16
N1	0.02	0.00	0.06	0.14	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.20	0.13	0.02	0.23	0.21	0.41	0.23
N3	0.02	0.00	0.07	0.10	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.14	0.02	0.18	0.14	0.37	0.18
N6	0.01	0.00	0.04	0.17	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.13	0.02	0.26	0.26	0.41	0.27
N7	0.01	0.01	0.03	0.15	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.09	0.02	0.21	0.19	0.32	0.21
N9	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.04	0.01	0.14	0.10	0.31	0.14
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.15	0.12	0.17	0.04	0.19	0.11	0.20	0.16	0.20	0.15	0.10	0.00	0.03	0.08	0.06	0.06	0.40	0.12
O3'	0.12	0.14	0.01	0.00	0.08	0.02	0.09	0.06	0.11	0.07	0.13	0.14	0.13	0.09	0.04	0.03	0.00	0.09	0.19	0.24	0.06	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.09	0.00	0.08	0.08	0.23	0.08
O5'	0.08	0.21	0.06	0.14	0.18	0.02	0.22	0.01	0.24	0.18	0.23	0.18	0.26	0.21	0.14	0.06	0.19	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.17	0.10	0.12	0.14	0.08	0.19	0.10	0.22	0.13	0.21	0.14	0.26	0.19	0.10	0.06	0.24	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.39	0.40	0.14	0.35	0.19	0.36	0.20	0.40	0.28	0.41	0.37	0.41	0.32	0.31	0.40	0.06	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.21	0.17	0.06	0.18	0.03	0.21	0.02	0.24	0.16	0.23	0.18	0.27	0.21	0.14	0.12	0.14	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.45	0.11	0.07	0.38	0.10	0.28	0.19	0.24	0.31	0.46	0.55	0.21	0.07	0.41	0.19	0.18	0.34	0.20	0.23
C2	0.17	0.38	0.12	0.06	0.37	0.10	0.26	0.16	0.20	0.25	0.43	0.45	0.18	0.11	0.42	0.10	0.11	0.23	0.13	0.14
C2'	0.22	0.36	0.09	0.10	0.31	0.14	0.24	0.22	0.21	0.25	0.37	0.46	0.18	0.11	0.33	0.19	0.23	0.40	0.29	0.30
C3'	0.25	0.32	0.18	0.09	0.21	0.10	0.14	0.15	0.14	0.22	0.29	0.44	0.27	0.11	0.21	0.19	0.19	0.37	0.24	0.26
C4	0.18	0.38	0.12	0.05	0.35	0.09	0.25	0.16	0.20	0.25	0.41	0.46	0.19	0.11	0.38	0.11	0.12	0.23	0.13	0.15
C4'	0.25	0.35	0.09	0.06	0.27	0.12	0.22	0.19	0.20	0.25	0.33	0.45	0.18	0.06	0.28	0.22	0.21	0.40	0.28	0.30
C5	0.16	0.32	0.12	0.07	0.31	0.10	0.22	0.13	0.18	0.22	0.35	0.38	0.17	0.14	0.34	0.10	0.11	0.19	0.15	0.12
C5'	0.26	0.28	0.11	0.08	0.20	0.14	0.18	0.10	0.16	0.21	0.25	0.37	0.16	0.09	0.22	0.23	0.18	0.31	0.25	0.23
C6	0.15	0.32	0.13	0.08	0.32	0.11	0.24	0.13	0.19	0.22	0.36	0.37	0.15	0.16	0.36	0.10	0.11	0.19	0.18	0.13
C8	0.19	0.33	0.11	0.06	0.28	0.09	0.21	0.14	0.18	0.23	0.33	0.40	0.20	0.11	0.30	0.12	0.12	0.20	0.12	0.13
N1	0.16	0.35	0.13	0.07	0.35	0.10	0.25	0.14	0.19	0.23	0.40	0.40	0.16	0.14	0.40	0.10	0.10	0.20	0.16	0.12
N3	0.19	0.41	0.12	0.05	0.38	0.10	0.27	0.17	0.21	0.27	0.45	0.49	0.19	0.09	0.43	0.12	0.13	0.26	0.13	0.16
N6	0.16	0.31	0.14	0.11	0.33	0.12	0.26	0.13	0.20	0.22	0.35	0.35	0.14	0.19	0.37	0.12	0.13	0.21	0.24	0.16
N7	0.15	0.28	0.12	0.08	0.26	0.10	0.19	0.13	0.16	0.20	0.30	0.34	0.17	0.16	0.28	0.10	0.11	0.18	0.16	0.12
N9	0.21	0.39	0.11	0.06	0.34	0.09	0.25	0.17	0.21	0.27	0.41	0.49	0.20	0.08	0.37	0.14	0.14	0.25	0.14	0.17
O2'	0.26	0.44	0.08	0.07	0.38	0.10	0.29	0.13	0.25	0.31	0.45	0.53	0.17	0.07	0.41	0.22	0.16	0.31	0.21	0.21
O3'	0.23	0.29	0.16	0.09	0.18	0.13	0.14	0.16	0.13	0.20	0.26	0.41	0.22	0.12	0.19	0.20	0.19	0.36	0.25	0.26
O4'	0.27	0.43	0.11	0.08	0.36	0.11	0.27	0.20	0.24	0.31	0.43	0.53	0.20	0.07	0.37	0.21	0.19	0.35	0.22	0.25
O5'	0.16	0.16	0.06	0.08	0.18	0.19	0.22	0.29	0.20	0.14	0.15	0.24	0.11	0.02	0.19	0.19	0.30	0.44	0.35	0.37
OP1	0.13	0.22	0.08	0.08	0.37	0.14	0.37	0.17	0.29	0.20	0.30	0.20	0.06	0.01	0.41	0.14	0.29	0.22	0.34	0.27
OP2	0.19	0.28	0.23	0.13	0.36	0.07	0.34	0.09	0.29	0.26	0.32	0.27	0.22	0.02	0.39	0.13	0.24	0.13	0.27	0.19
P	0.08	0.10	0.07	0.01	0.20	0.06	0.22	0.11	0.17	0.09	0.14	0.12	0.09	0.01	0.23	0.06	0.22	0.18	0.23	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.02	0.00	0.09	0.08	0.09	0.05
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.11	0.01	0.02	0.13	0.12	0.13	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.07	0.08	0.02	0.05	0.11	0.00	0.01	0.05	0.02	0.16	0.20	0.24	0.18
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.14	0.00	0.15	0.01	0.13	0.08	0.11	0.07	0.01	0.01	0.15	0.02	0.05	0.09	0.06	0.04
C4	0.02	0.01	0.04	0.14	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.11	0.00	0.04	0.22	0.22	0.25	0.21
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.05	0.03	0.11	0.01	0.10	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.15	0.00	0.11	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.12	0.01	0.06	0.24	0.23	0.26	0.22
C5'	0.02	0.07	0.07	0.01	0.15	0.01	0.17	0.00	0.14	0.07	0.10	0.04	0.05	0.08	0.16	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.10	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.10	0.01	0.06	0.20	0.17	0.17	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.10	0.08	0.02	0.02	0.13	0.10	0.11	0.08
N3	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.10	0.01	0.02	0.17	0.16	0.19	0.15
O2	0.02	0.01	0.11	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.08	0.17	0.01	0.03	0.10	0.10	0.11	0.08
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.16	0.11	0.17	0.05	0.14	0.10	0.13	0.08	0.00	0.03	0.17	0.06	0.11	0.16	0.26	0.14
O3'	0.12	0.11	0.01	0.01	0.11	0.01	0.12	0.08	0.10	0.08	0.10	0.17	0.03	0.00	0.12	0.06	0.12	0.10	0.09	0.10
O4	0.02	0.01	0.05	0.15	0.00	0.10	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.17	0.12	0.00	0.05	0.24	0.26	0.30	0.24
O4'	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.06	0.06	0.05	0.00	0.08	0.06	0.07	0.06
O5'	0.09	0.13	0.16	0.05	0.22	0.02	0.24	0.01	0.20	0.13	0.17	0.10	0.11	0.12	0.24	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.08	0.12	0.20	0.09	0.22	0.06	0.23	0.06	0.17	0.10	0.16	0.10	0.16	0.10	0.26	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.13	0.24	0.06	0.25	0.03	0.26	0.02	0.17	0.11	0.19	0.11	0.26	0.09	0.30	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.10	0.18	0.04	0.21	0.02	0.22	0.01	0.15	0.08	0.15	0.08	0.14	0.10	0.24	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00