Doublet Group distance statistics: 52199

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 5, 9, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.014, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.014 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.009, 0.015, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.013, 0.019, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.019 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.010, 0.016, 0.022, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.016 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.013, 0.020, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.020 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.017 std_dev=0.007
N9	A	0, 0.012, 0.020, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.020 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N6	A	0, 0.019, 0.028, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.028 std_dev=0.008
N7	A	0, 0.019, 0.029, 0.040, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.018, 0.030, 0.042, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.012
O4'	A	0, 0.009, 0.112, 0.216, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.112 std_dev=0.103
C2'	A	0, 0.031, 0.150, 0.269, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.150 std_dev=0.119
C3'	A	0, 0.037, 0.158, 0.278, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.158 std_dev=0.120
C4'	A	0, 0.046, 0.173, 0.301, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.173 std_dev=0.127
P	B	0, 0.112, 0.279, 0.446, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.279 std_dev=0.167
C5'	A	0, 0.180, 0.367, 0.554, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.367 std_dev=0.187
O5'	A	0, 0.200, 0.403, 0.605, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.403 std_dev=0.203
OP1	B	0, 0.119, 0.329, 0.539, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.329 std_dev=0.210
O2'	A	0, 0.008, 0.233, 0.459, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.233 std_dev=0.226
C3'	B	0, 0.133, 0.371, 0.609, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.371 std_dev=0.238
O3'	B	0, 0.206, 0.446, 0.687, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.446 std_dev=0.240
OP2	B	0, 0.182, 0.427, 0.673, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.427 std_dev=0.245
P	A	0, 0.217, 0.477, 0.737, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.477 std_dev=0.260
O2'	B	0, 0.146, 0.411, 0.676, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.411 std_dev=0.265
C2'	B	0, 0.068, 0.337, 0.606, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.337 std_dev=0.269
OP2	A	0, 0.257, 0.533, 0.809, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.533 std_dev=0.276
C4'	B	0, 0.087, 0.376, 0.666, 1.310 max_d=1.310 avg_d=0.376 std_dev=0.290
C5'	B	0, 0.042, 0.354, 0.666, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.354 std_dev=0.312
OP1	A	0, 0.276, 0.590, 0.905, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.590 std_dev=0.315
C1'	B	0, 0.088, 0.413, 0.739, 1.476 max_d=1.476 avg_d=0.413 std_dev=0.325
O4'	B	0, 0.069, 0.406, 0.743, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.406 std_dev=0.337
O3'	A	0, -0.103, 0.283, 0.669, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.283 std_dev=0.386
C6	B	0, 0.050, 0.443, 0.836, 1.783 max_d=1.783 avg_d=0.443 std_dev=0.393
O5'	B	0, -0.009, 0.388, 0.784, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.388 std_dev=0.397
N1	B	0, 0.058, 0.454, 0.851, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.454 std_dev=0.397
C5	B	0, 0.050, 0.515, 0.981, 2.045 max_d=2.045 avg_d=0.515 std_dev=0.465
C2	B	0, 0.085, 0.571, 1.057, 2.014 max_d=2.014 avg_d=0.571 std_dev=0.486
O2	B	0, 0.132, 0.654, 1.176, 2.058 max_d=2.058 avg_d=0.654 std_dev=0.522
C4	B	0, 0.043, 0.592, 1.142, 2.310 max_d=2.310 avg_d=0.592 std_dev=0.549
N3	B	0, 0.067, 0.622, 1.177, 2.282 max_d=2.282 avg_d=0.622 std_dev=0.555
O4	B	0, 0.037, 0.671, 1.306, 2.611 max_d=2.611 avg_d=0.671 std_dev=0.634

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.00	0.04	0.04	0.07	0.04
C2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.11	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.08	0.08	0.20	0.20	0.24	0.21
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.06	0.05	0.04	0.07	0.09	0.04	0.03	0.02	0.00	0.07	0.02	0.06	0.08	0.13	0.09
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.08	0.09	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.03
C4	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.12	0.05	0.11	0.08	0.13	0.09
C4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.09	0.10	0.05	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.15	0.02	0.10	0.07	0.12	0.07
C5'	0.02	0.18	0.06	0.02	0.11	0.00	0.09	0.00	0.12	0.04	0.16	0.17	0.11	0.05	0.05	0.05	0.06	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.11	0.04	0.12	0.10	0.16	0.11
C8	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.26	0.04	0.08	0.10	0.08	0.07
N1	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.08	0.06	0.17	0.17	0.21	0.17
N3	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.07	0.09	0.18	0.16	0.20	0.17
N6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.11	0.10	0.15	0.10
N7	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.22	0.02	0.08	0.09	0.08	0.06
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.20	0.01	0.06	0.05	0.08	0.04
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.12	0.01	0.08	0.05	0.13	0.06	0.18	0.21	0.11	0.03	0.03	0.00	0.07	0.01	0.05	0.07	0.15	0.10
O3'	0.21	0.08	0.07	0.01	0.12	0.05	0.15	0.06	0.11	0.26	0.08	0.07	0.13	0.22	0.20	0.07	0.00	0.16	0.04	0.06	0.13	0.05
O4'	0.00	0.08	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.06	0.09	0.03	0.02	0.01	0.01	0.16	0.00	0.04	0.04	0.05	0.04
O5'	0.04	0.20	0.06	0.02	0.11	0.01	0.10	0.01	0.12	0.08	0.17	0.18	0.11	0.08	0.06	0.05	0.04	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.04	0.20	0.08	0.02	0.08	0.02	0.07	0.02	0.10	0.10	0.17	0.16	0.10	0.09	0.05	0.07	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.24	0.13	0.07	0.13	0.03	0.12	0.04	0.16	0.08	0.21	0.20	0.15	0.08	0.08	0.15	0.13	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.21	0.09	0.03	0.09	0.02	0.07	0.01	0.11	0.07	0.17	0.17	0.10	0.06	0.04	0.10	0.05	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.11	0.10	0.13	0.12	0.14	0.14	0.20	0.13	0.10	0.12	0.13	0.16	0.14	0.13	0.13	0.34	0.20	0.13	0.10
C2	0.17	0.20	0.17	0.17	0.18	0.16	0.18	0.18	0.17	0.17	0.20	0.24	0.23	0.21	0.19	0.16	0.33	0.20	0.20	0.10
C2'	0.10	0.12	0.09	0.11	0.14	0.14	0.15	0.20	0.14	0.11	0.13	0.12	0.15	0.13	0.15	0.13	0.32	0.12	0.20	0.05
C3'	0.12	0.14	0.16	0.12	0.17	0.08	0.17	0.10	0.16	0.14	0.16	0.14	0.23	0.14	0.18	0.09	0.20	0.09	0.21	0.01
C4	0.18	0.21	0.18	0.17	0.19	0.17	0.19	0.20	0.19	0.19	0.21	0.24	0.22	0.20	0.19	0.18	0.34	0.21	0.16	0.09
C4'	0.09	0.08	0.13	0.12	0.10	0.10	0.12	0.14	0.11	0.08	0.09	0.09	0.21	0.14	0.12	0.09	0.24	0.21	0.14	0.09
C5	0.23	0.28	0.22	0.20	0.25	0.20	0.25	0.21	0.24	0.25	0.28	0.32	0.26	0.23	0.26	0.21	0.35	0.21	0.16	0.10
C5'	0.09	0.08	0.12	0.11	0.11	0.09	0.13	0.11	0.12	0.08	0.09	0.09	0.21	0.13	0.12	0.09	0.21	0.20	0.19	0.07
C6	0.24	0.29	0.22	0.20	0.27	0.19	0.25	0.20	0.24	0.25	0.29	0.34	0.26	0.24	0.27	0.21	0.35	0.21	0.17	0.09
C8	0.24	0.27	0.23	0.21	0.26	0.22	0.26	0.23	0.26	0.26	0.27	0.30	0.25	0.21	0.26	0.23	0.35	0.22	0.14	0.12
N1	0.21	0.25	0.19	0.18	0.22	0.18	0.21	0.19	0.21	0.21	0.25	0.30	0.25	0.23	0.23	0.19	0.34	0.21	0.19	0.09
N3	0.15	0.17	0.15	0.16	0.16	0.15	0.16	0.18	0.16	0.15	0.17	0.20	0.21	0.20	0.17	0.15	0.33	0.20	0.19	0.09
N6	0.27	0.34	0.24	0.21	0.32	0.21	0.29	0.21	0.28	0.29	0.35	0.39	0.28	0.25	0.33	0.24	0.35	0.21	0.17	0.10
N7	0.27	0.32	0.25	0.22	0.30	0.23	0.29	0.23	0.29	0.29	0.32	0.36	0.28	0.24	0.30	0.25	0.35	0.22	0.15	0.12
N9	0.18	0.19	0.17	0.17	0.18	0.18	0.19	0.21	0.19	0.18	0.19	0.22	0.21	0.18	0.18	0.18	0.35	0.21	0.14	0.10
O2'	0.23	0.24	0.21	0.23	0.26	0.27	0.26	0.32	0.26	0.24	0.25	0.22	0.19	0.21	0.26	0.26	0.41	0.14	0.21	0.13
O3'	0.41	0.42	0.49	0.39	0.38	0.26	0.37	0.10	0.39	0.41	0.41	0.42	0.55	0.38	0.37	0.29	0.01	0.02	0.02	0.00
O4'	0.14	0.13	0.14	0.15	0.13	0.16	0.15	0.20	0.16	0.13	0.13	0.15	0.21	0.16	0.14	0.16	0.32	0.25	0.11	0.12
O5'	0.13	0.12	0.15	0.14	0.14	0.13	0.18	0.14	0.17	0.13	0.12	0.13	0.22	0.16	0.15	0.14	0.23	0.22	0.16	0.09
OP1	0.18	0.18	0.18	0.16	0.22	0.15	0.25	0.15	0.24	0.19	0.19	0.18	0.25	0.18	0.23	0.17	0.22	0.21	0.17	0.10
OP2	0.11	0.11	0.13	0.11	0.14	0.10	0.16	0.13	0.15	0.11	0.12	0.12	0.21	0.14	0.16	0.10	0.21	0.20	0.20	0.09
P	0.15	0.14	0.16	0.13	0.17	0.12	0.21	0.13	0.20	0.15	0.15	0.15	0.23	0.16	0.18	0.14	0.23	0.21	0.17	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.11	0.08	0.12
C2	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.07	0.01	0.05	0.08	0.19	0.13	0.15
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.01	0.04	0.08	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.12	0.15	0.17
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.09	0.09	0.15	0.12
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.05	0.00	0.01	0.13	0.26	0.22	0.20
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.06	0.06
C5	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.04	0.01	0.04	0.14	0.26	0.23	0.21
C5'	0.02	0.03	0.03	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.04	0.04	0.06	0.03	0.02	0.07	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01
C6	0.00	0.01	0.05	0.03	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.09	0.04	0.01	0.05	0.13	0.22	0.19	0.18
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.09	0.17	0.13	0.15
N3	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.10	0.23	0.17	0.17
O2	0.02	0.00	0.08	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.09	0.01	0.08	0.07	0.16	0.10	0.13
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.03	0.01	0.08	0.03	0.09	0.02	0.06	0.15	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.16	0.20	0.20
O3'	0.04	0.07	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.06	0.09	0.02	0.00	0.05	0.03	0.08	0.09	0.14	0.11
O4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.13	0.28	0.24	0.21
O4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.08	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.09	0.10	0.07
O5'	0.05	0.08	0.07	0.09	0.13	0.01	0.14	0.01	0.13	0.09	0.10	0.07	0.08	0.08	0.13	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.19	0.12	0.09	0.26	0.04	0.26	0.03	0.22	0.17	0.23	0.16	0.16	0.09	0.28	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.13	0.15	0.15	0.22	0.06	0.23	0.07	0.19	0.13	0.17	0.10	0.20	0.14	0.24	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.15	0.17	0.12	0.20	0.06	0.21	0.01	0.18	0.15	0.17	0.13	0.20	0.11	0.21	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00