Doublet Group distance statistics: 52200

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 8, 3, 5, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.008, 0.014, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.006, 0.012, 0.019, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.007, 0.014, 0.022, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.009, 0.020, 0.030, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.006, 0.026, 0.047, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.015, 0.037, 0.059, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.037 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.023, 0.077, 0.131, 0.271 max_d=0.271 avg_d=0.077 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.039, 0.120, 0.201, 0.443 max_d=0.443 avg_d=0.120 std_dev=0.081
O2'	A	0, 0.060, 0.161, 0.263, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.161 std_dev=0.101
P	A	0, 0.115, 0.216, 0.318, 0.487 max_d=0.487 avg_d=0.216 std_dev=0.102
C3'	A	0, 0.057, 0.161, 0.264, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.161 std_dev=0.103
C4'	A	0, 0.021, 0.126, 0.232, 0.574 max_d=0.574 avg_d=0.126 std_dev=0.106
OP2	A	0, 0.149, 0.260, 0.371, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.260 std_dev=0.111
OP1	A	0, 0.129, 0.279, 0.430, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.279 std_dev=0.151
O3'	A	0, 0.091, 0.248, 0.405, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.248 std_dev=0.157
C5'	A	0, 0.036, 0.215, 0.395, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.215 std_dev=0.180
O2'	B	0, 0.077, 0.269, 0.460, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.269 std_dev=0.192
C2'	B	0, 0.065, 0.261, 0.457, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.261 std_dev=0.196
O5'	A	0, -0.001, 0.214, 0.428, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.214 std_dev=0.214
C3'	B	0, 0.064, 0.288, 0.513, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.288 std_dev=0.225
O3'	B	0, -0.004, 0.313, 0.630, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.313 std_dev=0.317
C1'	B	0, -0.058, 0.323, 0.704, 1.996 max_d=1.996 avg_d=0.323 std_dev=0.381
C4'	B	0, -0.039, 0.357, 0.753, 2.101 max_d=2.101 avg_d=0.357 std_dev=0.396
O4'	B	0, -0.082, 0.381, 0.844, 2.439 max_d=2.439 avg_d=0.381 std_dev=0.463
C5'	B	0, -0.105, 0.440, 0.985, 2.873 max_d=2.873 avg_d=0.440 std_dev=0.545
N1	B	0, -0.208, 0.364, 0.935, 2.962 max_d=2.962 avg_d=0.364 std_dev=0.571
O2	B	0, -0.270, 0.372, 1.015, 3.314 max_d=3.314 avg_d=0.372 std_dev=0.643
C6	B	0, -0.245, 0.426, 1.097, 3.491 max_d=3.491 avg_d=0.426 std_dev=0.671
C2	B	0, -0.315, 0.374, 1.062, 3.528 max_d=3.528 avg_d=0.374 std_dev=0.689
C5	B	0, -0.353, 0.488, 1.329, 4.353 max_d=4.353 avg_d=0.488 std_dev=0.841
O5'	B	0, -0.315, 0.552, 1.419, 4.538 max_d=4.538 avg_d=0.552 std_dev=0.867
N3	B	0, -0.449, 0.441, 1.331, 4.539 max_d=4.539 avg_d=0.441 std_dev=0.890
C4	B	0, -0.463, 0.499, 1.461, 4.932 max_d=4.932 avg_d=0.499 std_dev=0.962
P	B	0, -0.428, 0.676, 1.781, 5.743 max_d=5.743 avg_d=0.676 std_dev=1.104
OP2	B	0, -0.416, 0.705, 1.826, 5.834 max_d=5.834 avg_d=0.705 std_dev=1.121
O4	B	0, -0.541, 0.588, 1.717, 5.810 max_d=5.810 avg_d=0.588 std_dev=1.129
OP1	B	0, -0.499, 0.777, 2.054, 6.627 max_d=6.627 avg_d=0.777 std_dev=1.277

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.09	0.09	0.11
C2	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.08	0.13	0.16	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.08	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.04	0.07	0.09	0.04	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.13	0.06	0.03
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.08	0.12	0.14	0.14
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.04	0.05	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.02	0.07	0.04	0.04
C5	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.04	0.01	0.13	0.14	0.16	0.14
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.05	0.00	0.09	0.00	0.09	0.11	0.07	0.04	0.11	0.12	0.05	0.06	0.03	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.13	0.15	0.17	0.15
C8	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.14	0.13	0.13	0.13
N1	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.09	0.01	0.11	0.15	0.17	0.15
N3	0.01	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.07	0.12	0.15	0.14
N6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.16	0.17	0.18	0.15
N7	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.16	0.15	0.15	0.14
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.11	0.12	0.13
O2'	0.01	0.05	0.00	0.02	0.03	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.03	0.02	0.00	0.03	0.03	0.04	0.09	0.07	0.05
O3'	0.02	0.12	0.01	0.01	0.06	0.02	0.04	0.03	0.06	0.04	0.09	0.10	0.05	0.04	0.02	0.03	0.00	0.04	0.10	0.18	0.07	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.13	0.11	0.14
O5'	0.03	0.08	0.02	0.06	0.08	0.02	0.13	0.00	0.13	0.14	0.11	0.07	0.16	0.16	0.08	0.04	0.10	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.09	0.13	0.11	0.13	0.12	0.07	0.14	0.05	0.15	0.13	0.15	0.12	0.17	0.15	0.11	0.09	0.18	0.13	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.16	0.08	0.06	0.14	0.04	0.16	0.01	0.17	0.13	0.17	0.15	0.18	0.15	0.12	0.07	0.07	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.15	0.05	0.03	0.14	0.04	0.14	0.01	0.15	0.13	0.15	0.14	0.15	0.14	0.13	0.05	0.05	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.37	0.13	0.22	0.39	0.28	0.29	0.36	0.23	0.25	0.43	0.42	0.12	0.34	0.43	0.18	0.31	0.27	0.38	0.24
C2	0.30	0.62	0.17	0.21	0.73	0.21	0.59	0.26	0.48	0.47	0.76	0.64	0.14	0.35	0.81	0.24	0.23	0.32	0.29	0.32
C2'	0.18	0.44	0.15	0.13	0.48	0.22	0.37	0.31	0.29	0.31	0.52	0.47	0.11	0.24	0.54	0.14	0.27	0.30	0.38	0.24
C3'	0.15	0.38	0.16	0.08	0.40	0.19	0.30	0.32	0.23	0.26	0.44	0.42	0.14	0.17	0.44	0.10	0.31	0.38	0.46	0.31
C4	0.26	0.54	0.16	0.21	0.58	0.22	0.46	0.27	0.38	0.40	0.62	0.57	0.13	0.36	0.62	0.20	0.21	0.28	0.29	0.26
C4'	0.12	0.31	0.14	0.10	0.30	0.23	0.22	0.36	0.17	0.20	0.35	0.37	0.16	0.18	0.33	0.13	0.37	0.36	0.46	0.32
C5	0.31	0.59	0.18	0.21	0.62	0.20	0.51	0.24	0.44	0.45	0.66	0.62	0.13	0.33	0.65	0.25	0.25	0.36	0.29	0.34
C5'	0.15	0.31	0.22	0.03	0.27	0.17	0.20	0.33	0.16	0.21	0.33	0.37	0.28	0.07	0.29	0.08	0.36	0.39	0.47	0.34
C6	0.36	0.67	0.19	0.21	0.75	0.21	0.62	0.24	0.53	0.52	0.79	0.68	0.13	0.32	0.80	0.30	0.32	0.43	0.33	0.43
C8	0.21	0.40	0.14	0.22	0.38	0.22	0.31	0.29	0.27	0.30	0.42	0.44	0.11	0.36	0.39	0.18	0.22	0.27	0.31	0.24
N1	0.34	0.67	0.18	0.21	0.79	0.20	0.65	0.24	0.53	0.52	0.81	0.67	0.14	0.33	0.86	0.29	0.29	0.40	0.33	0.41
N3	0.26	0.57	0.16	0.21	0.64	0.22	0.51	0.28	0.41	0.41	0.67	0.60	0.14	0.36	0.71	0.20	0.21	0.28	0.29	0.26
N6	0.41	0.72	0.20	0.21	0.82	0.24	0.70	0.27	0.60	0.58	0.86	0.70	0.13	0.28	0.86	0.37	0.42	0.54	0.41	0.55
N7	0.29	0.51	0.17	0.21	0.48	0.20	0.41	0.24	0.38	0.40	0.53	0.55	0.12	0.33	0.49	0.23	0.24	0.35	0.29	0.33
N9	0.20	0.43	0.14	0.22	0.45	0.24	0.35	0.31	0.29	0.31	0.49	0.48	0.12	0.36	0.48	0.17	0.24	0.25	0.32	0.23
O2'	0.16	0.41	0.13	0.17	0.47	0.27	0.35	0.37	0.26	0.27	0.50	0.45	0.12	0.27	0.54	0.18	0.34	0.35	0.43	0.29
O3'	0.14	0.37	0.17	0.06	0.38	0.19	0.27	0.33	0.21	0.24	0.42	0.42	0.17	0.12	0.42	0.09	0.35	0.47	0.52	0.37
O4'	0.12	0.26	0.10	0.24	0.25	0.33	0.18	0.42	0.15	0.16	0.30	0.32	0.09	0.35	0.28	0.21	0.40	0.31	0.45	0.31
O5'	0.27	0.42	0.32	0.09	0.37	0.08	0.30	0.25	0.27	0.33	0.42	0.46	0.35	0.01	0.38	0.11	0.23	0.33	0.41	0.26
OP1	0.16	0.10	0.04	0.14	0.15	0.38	0.20	0.58	0.21	0.15	0.12	0.07	0.07	0.01	0.17	0.33	0.61	0.79	0.86	0.72
OP2	0.18	0.28	0.20	0.07	0.29	0.05	0.26	0.20	0.24	0.24	0.30	0.29	0.19	0.01	0.29	0.06	0.16	0.37	0.47	0.28
P	0.07	0.16	0.14	0.01	0.17	0.15	0.14	0.30	0.12	0.12	0.18	0.18	0.15	0.01	0.18	0.07	0.28	0.40	0.53	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.35	0.13	0.24
C2	0.02	0.00	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.15	0.33	0.22	0.26
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.27	0.14	0.16
C3'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.02	0.13	0.19	0.07
C4	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.24	0.30	0.34	0.29
C4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.06	0.00	0.03	0.21	0.11	0.10
C5	0.02	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.26	0.29	0.36	0.28
C5'	0.02	0.06	0.02	0.03	0.11	0.01	0.11	0.00	0.09	0.06	0.08	0.04	0.02	0.06	0.12	0.01	0.01	0.06	0.17	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.22	0.26	0.28	0.24
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.15	0.30	0.20	0.24
N3	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.19	0.31	0.28	0.27
O2	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.01	0.02	0.10	0.37	0.19	0.27
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.08	0.00	0.03	0.04	0.02	0.03	0.34	0.09	0.19
O3'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.07	0.04	0.08	0.06	0.07	0.03	0.05	0.05	0.03	0.00	0.09	0.03	0.07	0.06	0.24	0.04
O4	0.02	0.01	0.03	0.07	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.03	0.26	0.32	0.38	0.31
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.05	0.36	0.11	0.23
O5'	0.07	0.15	0.04	0.02	0.24	0.03	0.26	0.01	0.22	0.15	0.19	0.10	0.03	0.07	0.26	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.35	0.33	0.27	0.13	0.30	0.21	0.29	0.06	0.26	0.30	0.31	0.37	0.34	0.06	0.32	0.36	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.22	0.14	0.19	0.34	0.11	0.36	0.17	0.28	0.20	0.28	0.19	0.09	0.24	0.38	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.24	0.26	0.16	0.07	0.29	0.10	0.28	0.02	0.24	0.24	0.27	0.27	0.19	0.04	0.31	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00