Doublet Group distance statistics: 52201

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 4, 4, 3, 2, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.011, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.011, 0.017, 0.024, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.011, 0.018, 0.026, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.024, 0.043, 0.062, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.043 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.022, 0.047, 0.072, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.047 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.025, 0.051, 0.077, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.051 std_dev=0.026
C2'	A	0, 0.056, 0.161, 0.267, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.161 std_dev=0.106
O4'	A	0, 0.012, 0.127, 0.242, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.127 std_dev=0.115
O2'	A	0, 0.081, 0.205, 0.329, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.205 std_dev=0.124
C3'	A	0, 0.051, 0.223, 0.396, 0.655 max_d=0.655 avg_d=0.223 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.003, 0.175, 0.348, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.175 std_dev=0.173
N1	B	0, 0.302, 0.518, 0.734, 1.035 max_d=1.035 avg_d=0.518 std_dev=0.216
C6	B	0, 0.341, 0.558, 0.774, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.558 std_dev=0.216
C1'	B	0, 0.244, 0.465, 0.685, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.465 std_dev=0.220
P	A	0, 0.283, 0.511, 0.740, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.511 std_dev=0.228
O4'	B	0, 0.250, 0.479, 0.708, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.479 std_dev=0.229
C2'	B	0, 0.321, 0.553, 0.785, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.553 std_dev=0.232
C5	B	0, 0.389, 0.624, 0.858, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.624 std_dev=0.235
C4	B	0, 0.410, 0.650, 0.890, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.650 std_dev=0.240
OP2	A	0, 0.408, 0.654, 0.900, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.654 std_dev=0.246
C3'	B	0, 0.248, 0.496, 0.745, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.496 std_dev=0.249
C4'	B	0, 0.231, 0.483, 0.735, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.483 std_dev=0.252
OP1	A	0, 0.425, 0.685, 0.945, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.685 std_dev=0.260
O4	B	0, 0.438, 0.702, 0.966, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.702 std_dev=0.264
O3'	A	0, 0.065, 0.330, 0.595, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.330 std_dev=0.265
C2	B	0, 0.283, 0.556, 0.828, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.556 std_dev=0.273
N3	B	0, 0.343, 0.616, 0.890, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.616 std_dev=0.274
O2'	B	0, 0.341, 0.618, 0.895, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.618 std_dev=0.277
O3'	B	0, 0.151, 0.431, 0.711, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.431 std_dev=0.280
C5'	A	0, 0.082, 0.362, 0.643, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.362 std_dev=0.281
O5'	A	0, 0.155, 0.436, 0.718, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.436 std_dev=0.281
O5'	B	0, 0.455, 0.774, 1.093, 1.504 max_d=1.504 avg_d=0.774 std_dev=0.319
C5'	B	0, 0.289, 0.634, 0.980, 1.760 max_d=1.760 avg_d=0.634 std_dev=0.346
O2	B	0, 0.207, 0.555, 0.903, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.555 std_dev=0.348
P	B	0, 0.382, 0.776, 1.171, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.776 std_dev=0.394
OP2	B	0, 0.271, 0.870, 1.469, 2.922 max_d=2.922 avg_d=0.870 std_dev=0.599
OP1	B	0, 0.240, 0.847, 1.455, 2.959 max_d=2.959 avg_d=0.847 std_dev=0.607

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.10	0.06
C2	0.02	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.14	0.02	0.07	0.07	0.13	0.09
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.09	0.10	0.07	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.09	0.06	0.02
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.05	0.08	0.09	0.05	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.12	0.06	0.03
C4	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.01	0.08	0.07	0.13	0.08
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.08	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.01	0.10	0.09	0.15	0.10
C5'	0.03	0.04	0.02	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.10	0.05	0.03	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	0.09	0.03	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.06	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.10	0.09	0.15	0.11
C8	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.12	0.08	0.15	0.09
N1	0.02	0.01	0.09	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.12	0.02	0.09	0.08	0.15	0.10
N3	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.12	0.02	0.07	0.07	0.13	0.08
N6	0.02	0.01	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.08	0.02	0.11	0.11	0.16	0.12
N7	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.02	0.12	0.10	0.16	0.11
N9	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.07	0.13	0.07
O2'	0.01	0.11	0.00	0.03	0.07	0.04	0.05	0.04	0.08	0.01	0.10	0.11	0.08	0.02	0.02	0.00	0.06	0.04	0.04	0.11	0.04	0.03
O3'	0.01	0.14	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.09	0.05	0.12	0.12	0.08	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.16	0.10	0.06
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.10	0.12	0.09
O5'	0.05	0.07	0.04	0.03	0.08	0.01	0.10	0.01	0.10	0.12	0.09	0.07	0.11	0.12	0.08	0.04	0.05	0.05	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.08	0.07	0.09	0.12	0.07	0.08	0.09	0.09	0.09	0.08	0.08	0.07	0.11	0.10	0.07	0.11	0.16	0.10	0.03	0.00	0.02	0.02
OP2	0.10	0.13	0.06	0.06	0.13	0.05	0.15	0.03	0.15	0.15	0.15	0.13	0.16	0.16	0.13	0.04	0.10	0.12	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.09	0.02	0.03	0.08	0.03	0.10	0.02	0.11	0.09	0.10	0.08	0.12	0.11	0.07	0.03	0.06	0.09	0.01	0.02	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.20	0.16	0.11	0.19	0.07	0.17	0.07	0.16	0.17	0.20	0.22	0.26	0.12	0.19	0.19	0.11	0.15	0.37	0.15
C2	0.12	0.15	0.09	0.08	0.14	0.09	0.12	0.11	0.12	0.13	0.16	0.18	0.18	0.10	0.15	0.20	0.14	0.13	0.43	0.14
C2'	0.12	0.18	0.13	0.10	0.17	0.06	0.15	0.07	0.14	0.14	0.18	0.21	0.24	0.10	0.17	0.17	0.08	0.13	0.33	0.13
C3'	0.09	0.12	0.10	0.08	0.10	0.09	0.10	0.12	0.10	0.10	0.12	0.16	0.20	0.09	0.11	0.16	0.10	0.11	0.29	0.12
C4	0.12	0.17	0.11	0.08	0.15	0.07	0.13	0.09	0.12	0.13	0.18	0.21	0.21	0.09	0.17	0.19	0.14	0.13	0.42	0.15
C4'	0.08	0.10	0.10	0.09	0.10	0.06	0.11	0.09	0.10	0.09	0.09	0.13	0.20	0.12	0.10	0.16	0.09	0.11	0.29	0.12
C5	0.12	0.18	0.09	0.08	0.15	0.09	0.11	0.10	0.11	0.13	0.19	0.23	0.18	0.11	0.17	0.19	0.16	0.13	0.45	0.15
C5'	0.09	0.07	0.06	0.07	0.10	0.12	0.13	0.15	0.12	0.09	0.08	0.08	0.13	0.08	0.10	0.18	0.14	0.11	0.27	0.13
C6	0.13	0.18	0.08	0.09	0.14	0.10	0.11	0.12	0.11	0.13	0.19	0.23	0.15	0.13	0.17	0.20	0.18	0.13	0.46	0.15
C8	0.14	0.21	0.12	0.08	0.18	0.08	0.14	0.08	0.13	0.15	0.21	0.26	0.24	0.09	0.19	0.18	0.15	0.14	0.42	0.16
N1	0.13	0.16	0.08	0.08	0.14	0.10	0.11	0.12	0.11	0.13	0.17	0.20	0.16	0.11	0.16	0.21	0.16	0.13	0.45	0.14
N3	0.12	0.16	0.10	0.08	0.15	0.08	0.13	0.10	0.13	0.13	0.16	0.18	0.20	0.09	0.16	0.20	0.13	0.14	0.41	0.14
N6	0.15	0.20	0.09	0.11	0.16	0.12	0.12	0.14	0.12	0.14	0.21	0.26	0.13	0.16	0.19	0.20	0.20	0.13	0.48	0.16
N7	0.13	0.21	0.09	0.09	0.16	0.10	0.12	0.10	0.11	0.14	0.21	0.27	0.18	0.13	0.18	0.19	0.17	0.13	0.45	0.16
N9	0.13	0.20	0.13	0.09	0.18	0.07	0.15	0.07	0.14	0.15	0.20	0.23	0.24	0.09	0.18	0.19	0.13	0.15	0.40	0.15
O2'	0.14	0.18	0.13	0.09	0.19	0.07	0.18	0.07	0.17	0.16	0.19	0.21	0.24	0.11	0.19	0.19	0.08	0.12	0.31	0.13
O3'	0.07	0.10	0.08	0.08	0.09	0.10	0.09	0.15	0.09	0.08	0.10	0.14	0.18	0.07	0.09	0.16	0.13	0.11	0.27	0.13
O4'	0.13	0.15	0.17	0.14	0.14	0.08	0.14	0.07	0.14	0.14	0.14	0.17	0.27	0.17	0.13	0.17	0.10	0.15	0.34	0.15
O5'	0.10	0.07	0.09	0.10	0.09	0.14	0.12	0.18	0.12	0.10	0.08	0.08	0.13	0.07	0.09	0.17	0.14	0.12	0.30	0.13
OP1	0.22	0.22	0.17	0.17	0.20	0.25	0.20	0.28	0.20	0.21	0.22	0.23	0.21	0.22	0.20	0.26	0.16	0.34	0.31	0.22
OP2	0.14	0.20	0.19	0.10	0.21	0.11	0.21	0.20	0.20	0.18	0.21	0.23	0.30	0.04	0.22	0.09	0.18	0.24	0.37	0.20
P	0.07	0.11	0.07	0.02	0.07	0.10	0.07	0.18	0.07	0.07	0.10	0.16	0.17	0.12	0.07	0.10	0.10	0.18	0.31	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.01	0.20	0.21	0.32	0.09
C2	0.02	0.00	0.08	0.05	0.01	0.03	0.01	0.18	0.02	0.01	0.01	0.01	0.13	0.05	0.02	0.04	0.23	0.31	0.34	0.10
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.07	0.10	0.07	0.01	0.06	0.13	0.01	0.02	0.03	0.01	0.18	0.10	0.45	0.15
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.04	0.10	0.03	0.01	0.05	0.02	0.07	0.14	0.39	0.16
C4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.00	0.10	0.01	0.28	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.06	0.01	0.03	0.20	0.41	0.23	0.11
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.10	0.00	0.12	0.01	0.10	0.05	0.06	0.04	0.02	0.03	0.10	0.00	0.02	0.11	0.22	0.08
C5	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.12	0.00	0.30	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.08	0.01	0.03	0.19	0.42	0.19	0.13
C5'	0.09	0.18	0.10	0.01	0.28	0.01	0.30	0.00	0.27	0.19	0.22	0.13	0.09	0.04	0.30	0.02	0.02	0.21	0.10	0.02
C6	0.01	0.02	0.07	0.07	0.02	0.10	0.01	0.27	0.00	0.01	0.02	0.02	0.08	0.08	0.02	0.04	0.22	0.37	0.20	0.11
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.23	0.30	0.29	0.09
N3	0.02	0.01	0.06	0.04	0.00	0.06	0.01	0.22	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.04	0.01	0.04	0.23	0.36	0.30	0.10
O2	0.03	0.01	0.13	0.10	0.02	0.04	0.02	0.13	0.02	0.02	0.02	0.00	0.22	0.09	0.02	0.06	0.24	0.28	0.40	0.13
O2'	0.03	0.13	0.01	0.03	0.05	0.02	0.08	0.09	0.08	0.04	0.11	0.22	0.00	0.06	0.06	0.02	0.18	0.14	0.54	0.19
O3'	0.05	0.05	0.02	0.01	0.06	0.03	0.08	0.04	0.08	0.05	0.04	0.09	0.06	0.00	0.06	0.10	0.06	0.15	0.40	0.16
O4	0.02	0.02	0.03	0.05	0.01	0.10	0.01	0.30	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.06	0.00	0.03	0.19	0.43	0.22	0.12
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.02	0.10	0.03	0.00	0.18	0.28	0.20	0.12
O5'	0.20	0.23	0.18	0.07	0.20	0.02	0.19	0.02	0.22	0.23	0.23	0.24	0.18	0.06	0.19	0.18	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.21	0.31	0.10	0.14	0.41	0.11	0.42	0.21	0.37	0.30	0.36	0.28	0.14	0.15	0.43	0.28	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.34	0.45	0.39	0.23	0.22	0.19	0.10	0.20	0.29	0.30	0.40	0.54	0.40	0.22	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.10	0.15	0.16	0.11	0.08	0.13	0.02	0.11	0.09	0.10	0.13	0.19	0.16	0.12	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00