Doublet Group distance statistics: 52202

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 0, 1, 3, 0, 1, 3, 0, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.013 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.008, 0.023, 0.037, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.017, 0.034, 0.052, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.034 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.025, 0.043, 0.061, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.043 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.017, 0.036, 0.055, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.036 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.006, 0.036, 0.065, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.036 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.006, 0.037, 0.068, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.037 std_dev=0.031
C2	A	0, -0.002, 0.033, 0.068, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.033 std_dev=0.035
N6	A	0, 0.002, 0.053, 0.104, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.053 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.024, 0.129, 0.234, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.129 std_dev=0.105
C2'	A	0, 0.054, 0.164, 0.273, 0.412 max_d=0.412 avg_d=0.164 std_dev=0.109
C4'	A	0, 0.044, 0.183, 0.322, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.183 std_dev=0.139
O2'	A	0, 0.069, 0.232, 0.395, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.232 std_dev=0.163
C3'	A	0, 0.028, 0.208, 0.388, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.208 std_dev=0.180
O3'	A	0, 0.054, 0.319, 0.585, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.319 std_dev=0.265
P	A	0, 0.200, 0.477, 0.754, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.477 std_dev=0.277
C5'	A	0, 0.034, 0.321, 0.608, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.321 std_dev=0.287
O3'	B	0, 0.267, 0.555, 0.842, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.555 std_dev=0.287
O5'	A	0, 0.024, 0.367, 0.710, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.367 std_dev=0.343
O2'	B	0, 0.324, 0.671, 1.018, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.671 std_dev=0.347
C3'	B	0, 0.315, 0.682, 1.049, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.682 std_dev=0.367
OP1	A	0, 0.221, 0.609, 0.998, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.609 std_dev=0.388
C2'	B	0, 0.356, 0.750, 1.145, 1.338 max_d=1.338 avg_d=0.750 std_dev=0.394
C4'	B	0, 0.395, 0.825, 1.255, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.825 std_dev=0.430
OP2	A	0, 0.218, 0.668, 1.119, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.668 std_dev=0.451
C5'	B	0, 0.409, 0.874, 1.339, 1.737 max_d=1.737 avg_d=0.874 std_dev=0.465
C1'	B	0, 0.473, 0.988, 1.504, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.988 std_dev=0.516
O4'	B	0, 0.486, 1.009, 1.532, 1.779 max_d=1.779 avg_d=1.009 std_dev=0.523
O5'	B	0, 0.366, 0.942, 1.518, 2.010 max_d=2.010 avg_d=0.942 std_dev=0.576
N1	B	0, 0.551, 1.129, 1.707, 1.964 max_d=1.964 avg_d=1.129 std_dev=0.578
C2	B	0, 0.710, 1.319, 1.928, 2.164 max_d=2.164 avg_d=1.319 std_dev=0.609
C6	B	0, 0.517, 1.151, 1.784, 2.314 max_d=2.314 avg_d=1.151 std_dev=0.634
O2	B	0, 0.792, 1.428, 2.063, 2.653 max_d=2.653 avg_d=1.428 std_dev=0.636
N3	B	0, 0.741, 1.420, 2.099, 2.317 max_d=2.317 avg_d=1.420 std_dev=0.679
C5	B	0, 0.544, 1.252, 1.959, 2.598 max_d=2.598 avg_d=1.252 std_dev=0.707
P	B	0, 0.432, 1.153, 1.874, 2.538 max_d=2.538 avg_d=1.153 std_dev=0.721
C4	B	0, 0.641, 1.369, 2.096, 2.601 max_d=2.601 avg_d=1.369 std_dev=0.728
OP1	B	0, 0.454, 1.238, 2.021, 2.816 max_d=2.816 avg_d=1.238 std_dev=0.784
OP2	B	0, 0.409, 1.193, 1.977, 2.731 max_d=2.731 avg_d=1.193 std_dev=0.784
O4	B	0, 0.667, 1.479, 2.291, 2.885 max_d=2.885 avg_d=1.479 std_dev=0.812

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.06	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.15	0.48	0.19
C2	0.08	0.00	0.11	0.09	0.03	0.07	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.13	0.13	0.07	0.26	0.12	0.45	0.14
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.06	0.05	0.09	0.11	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.19	0.13	0.39	0.07
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.10	0.07	0.09	0.07	0.10	0.04	0.02	0.01	0.01	0.26	0.23	0.29	0.07
C4	0.03	0.03	0.06	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.06	0.02	0.25	0.12	0.46	0.14
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.16	0.39	0.10
C5	0.02	0.02	0.05	0.06	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.29	0.15	0.42	0.12
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.08	0.08	0.08	0.11	0.09	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.21	0.31	0.02
C6	0.03	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.08	0.02	0.29	0.17	0.41	0.12
C8	0.02	0.03	0.05	0.10	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.03	0.11	0.04	0.28	0.13	0.44	0.13
N1	0.06	0.01	0.09	0.07	0.02	0.05	0.02	0.08	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.11	0.10	0.04	0.29	0.14	0.43	0.13
N3	0.08	0.01	0.11	0.09	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.12	0.12	0.07	0.24	0.12	0.46	0.15
N6	0.03	0.02	0.06	0.07	0.02	0.05	0.03	0.11	0.01	0.06	0.02	0.02	0.00	0.06	0.04	0.06	0.09	0.05	0.30	0.23	0.37	0.14
N7	0.01	0.03	0.05	0.10	0.02	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.00	0.02	0.03	0.12	0.04	0.30	0.17	0.39	0.12
N9	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.22	0.12	0.46	0.15
O2'	0.01	0.13	0.01	0.02	0.06	0.05	0.05	0.05	0.07	0.03	0.11	0.12	0.06	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.10	0.17	0.39	0.10
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.11	0.10	0.12	0.09	0.12	0.04	0.04	0.00	0.02	0.25	0.34	0.23	0.15
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.07	0.05	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.10	0.21	0.51	0.26
O5'	0.10	0.26	0.19	0.26	0.25	0.02	0.29	0.01	0.29	0.28	0.29	0.24	0.30	0.30	0.22	0.10	0.25	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.15	0.12	0.13	0.23	0.12	0.16	0.15	0.21	0.17	0.13	0.14	0.12	0.23	0.17	0.12	0.17	0.34	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.48	0.45	0.39	0.29	0.46	0.39	0.42	0.31	0.41	0.44	0.43	0.46	0.37	0.39	0.46	0.39	0.23	0.51	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.14	0.07	0.07	0.14	0.10	0.12	0.02	0.12	0.13	0.13	0.15	0.14	0.12	0.15	0.10	0.15	0.26	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.17	0.14	0.22	0.15	0.19	0.18	0.25	0.18	0.14	0.16	0.26	0.16	0.29	0.17	0.14	0.28	0.45	0.33	0.33
C2	0.21	0.28	0.15	0.17	0.33	0.13	0.35	0.15	0.32	0.26	0.30	0.34	0.15	0.24	0.34	0.17	0.20	0.28	0.25	0.20
C2'	0.15	0.18	0.14	0.15	0.17	0.13	0.21	0.20	0.21	0.15	0.17	0.27	0.18	0.19	0.18	0.11	0.23	0.41	0.29	0.28
C3'	0.22	0.22	0.22	0.14	0.19	0.13	0.24	0.16	0.25	0.21	0.20	0.29	0.27	0.14	0.20	0.15	0.18	0.37	0.25	0.23
C4	0.20	0.23	0.15	0.17	0.25	0.12	0.29	0.15	0.28	0.22	0.24	0.31	0.18	0.24	0.26	0.15	0.22	0.31	0.26	0.22
C4'	0.12	0.14	0.13	0.10	0.08	0.11	0.11	0.19	0.12	0.09	0.13	0.23	0.21	0.13	0.12	0.09	0.22	0.45	0.33	0.31
C5	0.24	0.26	0.16	0.15	0.28	0.13	0.34	0.14	0.32	0.26	0.26	0.35	0.22	0.19	0.29	0.20	0.22	0.27	0.27	0.22
C5'	0.20	0.17	0.22	0.13	0.13	0.17	0.12	0.17	0.14	0.14	0.17	0.25	0.32	0.14	0.17	0.17	0.15	0.37	0.29	0.24
C6	0.27	0.30	0.16	0.14	0.35	0.14	0.39	0.14	0.37	0.30	0.32	0.37	0.20	0.18	0.36	0.23	0.23	0.25	0.28	0.22
C8	0.19	0.17	0.16	0.16	0.17	0.13	0.24	0.16	0.24	0.17	0.16	0.28	0.26	0.21	0.18	0.15	0.25	0.33	0.28	0.25
N1	0.24	0.30	0.14	0.15	0.36	0.12	0.39	0.13	0.35	0.29	0.33	0.35	0.16	0.21	0.38	0.20	0.20	0.25	0.27	0.20
N3	0.19	0.25	0.15	0.18	0.27	0.13	0.30	0.17	0.28	0.23	0.26	0.32	0.16	0.25	0.28	0.15	0.21	0.32	0.25	0.22
N6	0.32	0.36	0.19	0.16	0.40	0.19	0.45	0.18	0.42	0.35	0.37	0.42	0.24	0.17	0.41	0.29	0.27	0.27	0.34	0.28
N7	0.26	0.23	0.19	0.15	0.23	0.15	0.31	0.15	0.31	0.25	0.20	0.33	0.29	0.17	0.23	0.22	0.25	0.28	0.28	0.24
N9	0.17	0.19	0.15	0.19	0.19	0.13	0.24	0.18	0.23	0.18	0.19	0.28	0.18	0.25	0.21	0.13	0.24	0.36	0.28	0.26
O2'	0.13	0.17	0.13	0.18	0.14	0.20	0.17	0.26	0.17	0.13	0.16	0.26	0.15	0.23	0.16	0.15	0.27	0.48	0.32	0.34
O3'	0.22	0.23	0.24	0.15	0.22	0.12	0.27	0.16	0.27	0.22	0.23	0.30	0.26	0.13	0.24	0.15	0.17	0.36	0.23	0.22
O4'	0.13	0.16	0.13	0.22	0.14	0.19	0.15	0.26	0.15	0.12	0.15	0.23	0.16	0.29	0.16	0.14	0.31	0.49	0.38	0.37
O5'	0.15	0.19	0.22	0.03	0.14	0.09	0.13	0.25	0.14	0.13	0.19	0.27	0.28	0.02	0.17	0.04	0.32	0.60	0.41	0.43
OP1	0.23	0.44	0.16	0.17	0.53	0.26	0.45	0.38	0.37	0.35	0.52	0.44	0.06	0.02	0.58	0.27	0.41	0.52	0.54	0.49
OP2	0.15	0.26	0.19	0.14	0.26	0.20	0.33	0.38	0.33	0.19	0.28	0.37	0.22	0.02	0.29	0.18	0.48	0.59	0.53	0.52
P	0.04	0.21	0.10	0.02	0.19	0.11	0.13	0.23	0.11	0.09	0.24	0.28	0.11	0.01	0.24	0.07	0.27	0.41	0.30	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.12	0.07
C2	0.02	0.00	0.12	0.12	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.03	0.04	0.10	0.09	0.14	0.11
C2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.10	0.18	0.01	0.01	0.08	0.01	0.09	0.11	0.10	0.07
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.11	0.01	0.08	0.02	0.07	0.05	0.13	0.16	0.02	0.01	0.13	0.02	0.14	0.16	0.11	0.11
C4	0.04	0.02	0.07	0.11	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.13	0.01	0.04	0.19	0.18	0.21	0.19
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.05	0.05	0.04	0.02	0.07	0.01	0.02	0.05	0.10	0.03
C5	0.03	0.02	0.05	0.08	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.09	0.02	0.06	0.21	0.20	0.23	0.22
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.07	0.05	0.05	0.03	0.11	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01
C6	0.03	0.02	0.07	0.07	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.08	0.02	0.07	0.18	0.15	0.17	0.17
N1	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.04	0.01	0.10	0.09	0.13	0.10
N3	0.03	0.01	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.16	0.02	0.04	0.14	0.14	0.17	0.15
O2	0.03	0.01	0.18	0.16	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.14	0.20	0.03	0.07	0.08	0.08	0.14	0.10
O2'	0.02	0.08	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05	0.05	0.06	0.02	0.07	0.14	0.00	0.04	0.06	0.04	0.03	0.09	0.09	0.03
O3'	0.01	0.15	0.01	0.01	0.13	0.02	0.09	0.03	0.08	0.06	0.16	0.20	0.04	0.00	0.16	0.02	0.14	0.22	0.14	0.14
O4	0.04	0.03	0.08	0.13	0.01	0.07	0.02	0.11	0.02	0.04	0.02	0.03	0.06	0.16	0.00	0.05	0.20	0.21	0.24	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.07	0.04	0.02	0.05	0.00	0.11	0.08	0.17	0.12
O5'	0.04	0.10	0.09	0.14	0.19	0.02	0.21	0.01	0.18	0.10	0.14	0.08	0.03	0.14	0.20	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.04	0.09	0.11	0.16	0.18	0.05	0.20	0.05	0.15	0.09	0.14	0.08	0.09	0.22	0.21	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.14	0.10	0.11	0.21	0.10	0.23	0.11	0.17	0.13	0.17	0.14	0.09	0.14	0.24	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.11	0.07	0.11	0.19	0.03	0.22	0.01	0.17	0.10	0.15	0.10	0.03	0.14	0.22	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00