Doublet Group distance statistics: 52206

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 4, 3, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.008 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C2	A	0, -0.003, 0.012, 0.026, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.012 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.004, 0.024, 0.044, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.024 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.004, 0.027, 0.051, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.027 std_dev=0.023
N6	A	0, -0.005, 0.029, 0.063, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.029 std_dev=0.034
C2'	B	0, 0.094, 0.249, 0.403, 0.530 max_d=0.530 avg_d=0.249 std_dev=0.154
C2'	A	0, -0.037, 0.136, 0.308, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.136 std_dev=0.172
O3'	A	0, -0.062, 0.134, 0.330, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.134 std_dev=0.196
O4'	A	0, -0.062, 0.155, 0.373, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.155 std_dev=0.217
C3'	A	0, -0.088, 0.151, 0.389, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.151 std_dev=0.239
O2'	A	0, -0.022, 0.232, 0.485, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.232 std_dev=0.254
C1'	B	0, 0.047, 0.325, 0.603, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.325 std_dev=0.278
C4'	A	0, -0.097, 0.186, 0.468, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.186 std_dev=0.282
O2'	B	0, -0.009, 0.289, 0.587, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.289 std_dev=0.298
N1	B	0, 0.049, 0.399, 0.749, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.399 std_dev=0.350
C5'	A	0, -0.125, 0.290, 0.705, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.290 std_dev=0.415
C3'	B	0, -0.078, 0.343, 0.764, 1.802 max_d=1.802 avg_d=0.343 std_dev=0.421
O3'	B	0, -0.074, 0.357, 0.788, 1.569 max_d=1.569 avg_d=0.357 std_dev=0.431
O5'	A	0, -0.082, 0.354, 0.790, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.354 std_dev=0.436
O4'	B	0, -0.102, 0.443, 0.988, 2.409 max_d=2.409 avg_d=0.443 std_dev=0.545
P	A	0, -0.154, 0.411, 0.977, 2.002 max_d=2.002 avg_d=0.411 std_dev=0.565
C4'	B	0, -0.254, 0.411, 1.076, 2.928 max_d=2.928 avg_d=0.411 std_dev=0.665
C6	B	0, -0.064, 0.605, 1.274, 2.295 max_d=2.295 avg_d=0.605 std_dev=0.669
C4	B	0, -0.060, 0.652, 1.364, 2.683 max_d=2.683 avg_d=0.652 std_dev=0.712
OP2	A	0, -0.159, 0.572, 1.304, 2.581 max_d=2.581 avg_d=0.572 std_dev=0.732
C2	B	0, -0.042, 0.693, 1.428, 2.518 max_d=2.518 avg_d=0.693 std_dev=0.735
N3	B	0, -0.012, 0.786, 1.584, 2.652 max_d=2.652 avg_d=0.786 std_dev=0.798
C5	B	0, -0.080, 0.721, 1.521, 2.580 max_d=2.580 avg_d=0.721 std_dev=0.800
O5'	B	0, -0.313, 0.564, 1.442, 3.665 max_d=3.665 avg_d=0.564 std_dev=0.877
O4	B	0, -0.084, 0.811, 1.707, 3.423 max_d=3.423 avg_d=0.811 std_dev=0.896
OP1	A	0, -0.273, 0.664, 1.601, 3.326 max_d=3.326 avg_d=0.664 std_dev=0.937
C5'	B	0, -0.436, 0.503, 1.442, 4.098 max_d=4.098 avg_d=0.503 std_dev=0.939
P	B	0, -0.467, 0.766, 2.000, 5.078 max_d=5.078 avg_d=0.766 std_dev=1.233
O2	B	0, -0.299, 0.938, 2.175, 4.676 max_d=4.676 avg_d=0.938 std_dev=1.237
OP1	B	0, -0.271, 1.102, 2.475, 4.967 max_d=4.967 avg_d=1.102 std_dev=1.373
OP2	B	0, -0.600, 0.913, 2.425, 6.444 max_d=6.444 avg_d=0.913 std_dev=1.513

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.00	0.08	0.11	0.49	0.22
C2	0.03	0.00	0.11	0.03	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.07	0.11	0.13	0.26	0.69	0.33
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.10	0.06	0.10	0.10	0.10	0.06	0.04	0.00	0.02	0.02	0.07	0.15	0.36	0.16
C3'	0.02	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.05	0.04	0.02	0.07	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.19	0.22	0.09
C4	0.01	0.01	0.08	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.06	0.05	0.14	0.26	0.67	0.32
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.05	0.05	0.06	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.16	0.24	0.08
C5	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.11	0.06	0.02	0.19	0.35	0.72	0.37
C5'	0.02	0.07	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.06	0.06	0.08	0.08	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.20	0.10	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.06	0.05	0.19	0.38	0.75	0.39
C8	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.06	0.07	0.19	0.32	0.65	0.34
N1	0.02	0.00	0.10	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.06	0.09	0.16	0.33	0.73	0.37
N3	0.03	0.00	0.10	0.02	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.07	0.11	0.11	0.21	0.64	0.30
N6	0.01	0.01	0.10	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.14	0.06	0.03	0.22	0.45	0.77	0.42
N7	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.08	0.06	0.04	0.21	0.39	0.70	0.38
N9	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.14	0.22	0.61	0.30
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.12	0.01	0.11	0.04	0.14	0.08	0.18	0.18	0.14	0.08	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.19	0.34	0.17
O3'	0.06	0.07	0.02	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.06	0.06	0.04	0.00	0.06	0.05	0.22	0.21	0.08
O4'	0.00	0.11	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.09	0.11	0.03	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.05	0.47	0.23
O5'	0.08	0.13	0.07	0.04	0.14	0.02	0.19	0.01	0.19	0.19	0.16	0.11	0.22	0.21	0.14	0.07	0.05	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.11	0.26	0.15	0.19	0.26	0.16	0.35	0.20	0.38	0.32	0.33	0.21	0.45	0.39	0.22	0.19	0.22	0.05	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.49	0.69	0.36	0.22	0.67	0.24	0.72	0.10	0.75	0.65	0.73	0.64	0.77	0.70	0.61	0.34	0.21	0.47	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.22	0.33	0.16	0.09	0.32	0.08	0.37	0.01	0.39	0.34	0.37	0.30	0.42	0.38	0.30	0.17	0.08	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.35	0.12	0.30	0.27	0.44	0.48	0.57	0.45	0.13	0.32	0.69	0.27	0.31	0.34	0.27	0.50	0.94	0.85	0.57
C2	0.14	0.45	0.14	0.39	0.48	0.60	0.75	0.86	0.66	0.22	0.47	0.86	0.33	0.35	0.59	0.39	0.73	1.08	1.40	0.88
C2'	0.11	0.28	0.20	0.19	0.29	0.32	0.50	0.43	0.48	0.17	0.26	0.56	0.35	0.17	0.34	0.21	0.46	1.05	0.64	0.54
C3'	0.07	0.24	0.13	0.13	0.22	0.23	0.37	0.29	0.35	0.12	0.22	0.48	0.26	0.15	0.27	0.14	0.33	0.89	0.52	0.41
C4	0.13	0.42	0.13	0.38	0.40	0.57	0.67	0.80	0.61	0.19	0.41	0.82	0.33	0.35	0.49	0.37	0.68	1.03	1.22	0.78
C4'	0.10	0.29	0.08	0.20	0.21	0.28	0.31	0.33	0.28	0.12	0.25	0.52	0.18	0.24	0.26	0.18	0.27	0.69	0.56	0.32
C5	0.14	0.46	0.13	0.40	0.44	0.62	0.74	0.88	0.67	0.21	0.45	0.89	0.35	0.37	0.53	0.41	0.74	1.04	1.35	0.87
C5'	0.10	0.20	0.08	0.10	0.19	0.19	0.26	0.19	0.24	0.12	0.18	0.37	0.19	0.18	0.22	0.13	0.16	0.58	0.39	0.20
C6	0.15	0.49	0.12	0.40	0.50	0.64	0.80	0.93	0.71	0.23	0.50	0.93	0.34	0.37	0.60	0.43	0.79	1.07	1.51	0.97
C8	0.13	0.40	0.13	0.38	0.32	0.57	0.60	0.75	0.57	0.16	0.36	0.80	0.34	0.37	0.39	0.37	0.62	0.96	1.00	0.67
N1	0.15	0.48	0.13	0.40	0.51	0.63	0.80	0.92	0.70	0.23	0.50	0.91	0.34	0.36	0.63	0.42	0.78	1.09	1.50	0.95
N3	0.12	0.42	0.14	0.37	0.43	0.56	0.68	0.80	0.61	0.19	0.43	0.81	0.32	0.34	0.52	0.36	0.68	1.05	1.26	0.80
N6	0.15	0.52	0.11	0.41	0.52	0.65	0.84	0.96	0.74	0.23	0.54	0.98	0.34	0.38	0.64	0.45	0.83	1.08	1.61	1.05
N7	0.15	0.46	0.12	0.40	0.40	0.62	0.70	0.88	0.66	0.20	0.43	0.89	0.35	0.37	0.47	0.42	0.73	1.00	1.24	0.82
N9	0.11	0.39	0.13	0.36	0.33	0.53	0.58	0.71	0.55	0.16	0.36	0.76	0.31	0.35	0.40	0.34	0.59	0.98	1.02	0.67
O2'	0.14	0.30	0.24	0.20	0.33	0.33	0.56	0.46	0.54	0.21	0.29	0.60	0.38	0.15	0.37	0.23	0.55	1.21	0.68	0.66
O3'	0.08	0.28	0.12	0.14	0.23	0.23	0.38	0.29	0.35	0.12	0.25	0.53	0.23	0.17	0.29	0.15	0.34	0.92	0.57	0.44
O4'	0.16	0.37	0.14	0.37	0.23	0.45	0.36	0.54	0.32	0.14	0.32	0.66	0.18	0.39	0.29	0.30	0.44	0.71	0.79	0.48
O5'	0.15	0.19	0.28	0.15	0.28	0.07	0.39	0.08	0.38	0.21	0.21	0.30	0.41	0.03	0.30	0.05	0.30	0.76	0.30	0.37
OP1	0.25	0.29	0.09	0.09	0.27	0.32	0.26	0.32	0.25	0.26	0.29	0.31	0.12	0.02	0.28	0.36	0.18	0.53	0.50	0.21
OP2	0.08	0.13	0.08	0.05	0.07	0.21	0.18	0.22	0.19	0.08	0.10	0.26	0.17	0.02	0.07	0.18	0.21	0.70	0.40	0.25
P	0.08	0.09	0.08	0.03	0.10	0.17	0.14	0.16	0.15	0.09	0.08	0.15	0.17	0.01	0.10	0.16	0.14	0.57	0.36	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.06	0.04	0.00	0.07	0.16	0.14	0.09
C2	0.03	0.00	0.21	0.13	0.01	0.13	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.07	0.01	0.17	0.34	0.36	0.53	0.36
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.04	0.01	0.19	0.06	0.24	0.03	0.14	0.40	0.00	0.03	0.05	0.02	0.11	0.27	0.16	0.13
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.04	0.00	0.13	0.02	0.15	0.03	0.09	0.25	0.01	0.01	0.04	0.01	0.12	0.35	0.18	0.14
C4	0.03	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.21	0.50	0.36	0.31
C4'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.11	0.03	0.11	0.23	0.01	0.02	0.05	0.00	0.01	0.25	0.13	0.03
C5	0.02	0.01	0.19	0.13	0.01	0.09	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.11	0.01	0.10	0.35	0.72	0.45	0.52
C5'	0.04	0.23	0.06	0.02	0.14	0.01	0.22	0.00	0.23	0.10	0.20	0.38	0.06	0.04	0.16	0.01	0.00	0.27	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.24	0.15	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.00	0.01	0.01	0.30	0.11	0.02	0.14	0.37	0.64	0.44	0.50
N1	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.03	0.14	0.29	0.24	0.18
N3	0.04	0.00	0.14	0.09	0.01	0.11	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.01	0.13	0.30	0.37	0.51	0.32
O2	0.05	0.00	0.40	0.25	0.01	0.23	0.01	0.38	0.01	0.01	0.01	0.00	0.46	0.08	0.01	0.29	0.59	0.64	0.86	0.67
O2'	0.02	0.24	0.00	0.01	0.07	0.01	0.26	0.06	0.30	0.04	0.15	0.46	0.00	0.04	0.09	0.02	0.15	0.41	0.24	0.19
O3'	0.06	0.07	0.03	0.01	0.09	0.02	0.11	0.04	0.11	0.07	0.08	0.08	0.04	0.00	0.11	0.04	0.11	0.42	0.22	0.15
O4	0.04	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.01	0.16	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.04	0.23	0.55	0.38	0.33
O4'	0.00	0.17	0.02	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.14	0.03	0.13	0.29	0.02	0.04	0.04	0.00	0.12	0.32	0.27	0.14
O5'	0.07	0.34	0.11	0.12	0.21	0.01	0.35	0.00	0.37	0.14	0.30	0.59	0.15	0.11	0.23	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.16	0.36	0.27	0.35	0.50	0.25	0.72	0.27	0.64	0.29	0.37	0.64	0.41	0.42	0.55	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.53	0.16	0.18	0.36	0.13	0.45	0.20	0.44	0.24	0.51	0.86	0.24	0.22	0.38	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.36	0.13	0.14	0.31	0.03	0.52	0.01	0.50	0.18	0.32	0.67	0.19	0.15	0.33	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00