Doublet Group distance statistics: 52207

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 4, 4, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.009, 0.014, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.014, 0.022, 0.030, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.022 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.018, 0.027, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.027 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.022, 0.036, 0.050, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.036 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.029, 0.043, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.043 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.023, 0.039, 0.054, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.039 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.034, 0.054, 0.074, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.054 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.039, 0.061, 0.083, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.061 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.053, 0.078, 0.103, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.078 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.063, 0.094, 0.125, 0.123 max_d=0.123 avg_d=0.094 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.074, 0.112, 0.151, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.112 std_dev=0.039
C2'	A	0, 0.118, 0.216, 0.315, 0.426 max_d=0.426 avg_d=0.216 std_dev=0.099
O4'	A	0, 0.108, 0.210, 0.312, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.210 std_dev=0.102
O2'	A	0, 0.116, 0.232, 0.348, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.232 std_dev=0.116
C4'	A	0, 0.206, 0.349, 0.492, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.349 std_dev=0.143
C3'	A	0, 0.218, 0.374, 0.530, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.374 std_dev=0.156
C1'	B	0, 0.351, 0.548, 0.745, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.548 std_dev=0.197
C2'	B	0, 0.365, 0.573, 0.782, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.573 std_dev=0.208
C3'	B	0, 0.402, 0.623, 0.844, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.623 std_dev=0.221
O3'	A	0, 0.355, 0.578, 0.801, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.578 std_dev=0.223
N1	B	0, 0.313, 0.539, 0.765, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.539 std_dev=0.226
O2'	B	0, 0.323, 0.572, 0.821, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.572 std_dev=0.249
C5'	A	0, 0.219, 0.473, 0.727, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.473 std_dev=0.254
O4'	B	0, 0.426, 0.682, 0.937, 1.191 max_d=1.191 avg_d=0.682 std_dev=0.255
O3'	B	0, 0.313, 0.570, 0.826, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.570 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.446, 0.720, 0.993, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.720 std_dev=0.274
P	A	0, 0.178, 0.482, 0.787, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.482 std_dev=0.304
C4'	B	0, 0.479, 0.788, 1.097, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.788 std_dev=0.309
O5'	A	0, 0.003, 0.371, 0.738, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.371 std_dev=0.368
OP1	A	0, 0.524, 0.903, 1.283, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.903 std_dev=0.379
C5'	B	0, 0.602, 1.020, 1.438, 2.177 max_d=2.177 avg_d=1.020 std_dev=0.418
OP2	A	0, 0.471, 0.903, 1.335, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.903 std_dev=0.432
C5	B	0, 0.244, 0.684, 1.124, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.684 std_dev=0.440
C2	B	0, 0.009, 0.521, 1.033, 1.968 max_d=1.968 avg_d=0.521 std_dev=0.512
OP1	B	0, 1.063, 1.717, 2.371, 2.926 max_d=2.926 avg_d=1.717 std_dev=0.654
O5'	B	0, 0.512, 1.167, 1.822, 3.085 max_d=3.085 avg_d=1.167 std_dev=0.655
O2	B	0, -0.073, 0.583, 1.240, 2.670 max_d=2.670 avg_d=0.583 std_dev=0.656
C4	B	0, -0.035, 0.632, 1.298, 2.341 max_d=2.341 avg_d=0.632 std_dev=0.667
N3	B	0, -0.037, 0.655, 1.348, 2.592 max_d=2.592 avg_d=0.655 std_dev=0.692
O4	B	0, 0.001, 0.860, 1.718, 3.011 max_d=3.011 avg_d=0.860 std_dev=0.858
P	B	0, 0.685, 1.580, 2.475, 4.010 max_d=4.010 avg_d=1.580 std_dev=0.895
OP2	B	0, 0.455, 1.637, 2.819, 4.941 max_d=4.941 avg_d=1.637 std_dev=1.182

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.16	0.30	0.10
C2	0.01	0.00	0.11	0.13	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.17	0.03	0.03	0.14	0.27	0.12
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.10	0.11	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.08	0.42	0.14
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.06	0.12	0.11	0.09	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.44	0.17
C4	0.00	0.00	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.10	0.01	0.04	0.14	0.27	0.11
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.27	0.08
C5	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.05	0.14	0.24	0.12
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.04	0.14	0.23	0.12
C8	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.04	0.09	0.14	0.24	0.11
N1	0.00	0.00	0.10	0.12	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.16	0.02	0.04	0.14	0.25	0.13
N3	0.01	0.00	0.11	0.11	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.15	0.03	0.03	0.14	0.29	0.12
N6	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.12	0.02	0.05	0.14	0.21	0.12
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.03	0.07	0.14	0.21	0.11
N9	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.14	0.28	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.08	0.08	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.09	0.42	0.13
O3'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.10	0.01	0.09	0.02	0.12	0.07	0.16	0.15	0.12	0.07	0.04	0.02	0.00	0.01	0.06	0.13	0.50	0.21
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.22	0.21	0.11
O5'	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.09	0.04	0.03	0.05	0.07	0.06	0.02	0.06	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.16	0.14	0.08	0.07	0.14	0.11	0.14	0.11	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.09	0.13	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.27	0.42	0.44	0.27	0.27	0.24	0.12	0.23	0.24	0.25	0.29	0.21	0.21	0.28	0.42	0.50	0.21	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.12	0.14	0.17	0.11	0.08	0.12	0.01	0.12	0.11	0.13	0.12	0.12	0.11	0.11	0.13	0.21	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.22	0.13	0.26	0.22	0.48	0.13	0.56	0.10	0.12	0.27	0.30	0.26	0.22	0.26	0.35	0.46	0.49	0.17	0.38
C2	0.16	0.16	0.13	0.26	0.25	0.45	0.19	0.52	0.13	0.12	0.23	0.19	0.17	0.23	0.32	0.38	0.42	0.46	0.40	0.49
C2'	0.07	0.31	0.09	0.17	0.31	0.39	0.18	0.44	0.11	0.15	0.38	0.40	0.31	0.20	0.37	0.28	0.29	0.31	0.31	0.18
C3'	0.06	0.34	0.11	0.13	0.30	0.31	0.16	0.34	0.10	0.16	0.39	0.45	0.33	0.19	0.36	0.21	0.18	0.21	0.49	0.12
C4	0.15	0.18	0.12	0.26	0.23	0.46	0.16	0.52	0.11	0.11	0.24	0.20	0.20	0.23	0.28	0.37	0.41	0.44	0.28	0.43
C4'	0.07	0.26	0.10	0.16	0.20	0.34	0.09	0.41	0.08	0.11	0.29	0.38	0.28	0.15	0.24	0.23	0.34	0.35	0.39	0.18
C5	0.17	0.15	0.13	0.26	0.21	0.44	0.16	0.48	0.11	0.11	0.20	0.17	0.14	0.22	0.25	0.37	0.38	0.40	0.38	0.44
C5'	0.07	0.28	0.12	0.08	0.18	0.23	0.07	0.30	0.06	0.12	0.28	0.41	0.30	0.07	0.20	0.14	0.25	0.26	0.54	0.11
C6	0.18	0.14	0.14	0.25	0.21	0.41	0.18	0.45	0.13	0.12	0.18	0.23	0.11	0.22	0.26	0.36	0.36	0.39	0.50	0.48
C8	0.13	0.19	0.12	0.27	0.19	0.46	0.13	0.50	0.10	0.11	0.23	0.24	0.19	0.23	0.22	0.35	0.39	0.40	0.19	0.36
N1	0.18	0.15	0.14	0.25	0.23	0.43	0.20	0.48	0.13	0.12	0.20	0.22	0.13	0.23	0.30	0.37	0.38	0.43	0.50	0.50
N3	0.15	0.18	0.12	0.26	0.25	0.47	0.18	0.54	0.12	0.12	0.26	0.20	0.20	0.23	0.31	0.38	0.43	0.47	0.30	0.46
N6	0.19	0.18	0.15	0.23	0.18	0.36	0.19	0.39	0.13	0.13	0.14	0.36	0.09	0.20	0.23	0.33	0.31	0.35	0.62	0.48
N7	0.16	0.15	0.14	0.26	0.18	0.43	0.14	0.46	0.11	0.11	0.19	0.16	0.13	0.22	0.21	0.36	0.36	0.37	0.32	0.39
N9	0.14	0.20	0.12	0.26	0.22	0.47	0.14	0.53	0.10	0.12	0.25	0.25	0.22	0.23	0.26	0.36	0.42	0.44	0.19	0.39
O2'	0.08	0.30	0.09	0.19	0.31	0.42	0.17	0.49	0.10	0.14	0.38	0.39	0.31	0.20	0.38	0.30	0.35	0.39	0.32	0.24
O3'	0.09	0.37	0.15	0.15	0.34	0.28	0.19	0.30	0.12	0.18	0.43	0.49	0.34	0.20	0.40	0.19	0.12	0.19	0.67	0.22
O4'	0.15	0.20	0.18	0.29	0.16	0.47	0.12	0.57	0.14	0.13	0.22	0.29	0.26	0.24	0.18	0.34	0.51	0.52	0.19	0.40
O5'	0.10	0.31	0.14	0.05	0.20	0.22	0.08	0.26	0.05	0.15	0.30	0.44	0.33	0.01	0.22	0.15	0.19	0.20	0.53	0.15
OP1	0.09	0.09	0.14	0.16	0.13	0.18	0.21	0.26	0.21	0.11	0.08	0.19	0.10	0.01	0.13	0.14	0.23	0.26	0.59	0.17
OP2	0.16	0.29	0.26	0.17	0.25	0.10	0.27	0.17	0.26	0.21	0.28	0.40	0.32	0.01	0.27	0.10	0.42	0.47	1.06	0.67
P	0.05	0.18	0.08	0.01	0.08	0.08	0.08	0.09	0.09	0.07	0.16	0.30	0.16	0.00	0.09	0.05	0.10	0.17	0.70	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.13	0.05	0.24	0.05
C2	0.01	0.00	0.12	0.06	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.09	0.01	0.11	0.17	0.09	0.47	0.12
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.03	0.13	0.01	0.09	0.22	0.00	0.01	0.03	0.00	0.29	0.16	0.25	0.26
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.04	0.12	0.01	0.00	0.03	0.00	0.21	0.17	0.44	0.27
C4	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.03	0.00	0.01	0.16	0.20	0.89	0.27
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.04	0.09	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.16	0.04
C5	0.00	0.00	0.10	0.06	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.04	0.01	0.08	0.14	0.22	1.00	0.31
C5'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.07	0.10	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.07	0.13	0.01
C6	0.00	0.01	0.13	0.07	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.05	0.01	0.12	0.14	0.17	0.83	0.25
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.15	0.09	0.51	0.13
N3	0.01	0.00	0.09	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.17	0.07	0.00	0.08	0.17	0.14	0.66	0.19
O2	0.01	0.00	0.22	0.12	0.00	0.09	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.41	0.15	0.01	0.18	0.17	0.08	0.30	0.10
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.04	0.01	0.15	0.03	0.18	0.02	0.17	0.41	0.00	0.02	0.05	0.01	0.32	0.20	0.38	0.34
O3'	0.03	0.09	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.07	0.15	0.02	0.00	0.03	0.03	0.12	0.15	0.48	0.23
O4	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.15	0.22	0.96	0.30
O4'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.08	0.18	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.07	0.32	0.16
O5'	0.13	0.17	0.29	0.21	0.16	0.01	0.14	0.01	0.14	0.15	0.17	0.17	0.32	0.12	0.15	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.05	0.09	0.16	0.17	0.20	0.06	0.22	0.07	0.17	0.09	0.14	0.08	0.20	0.15	0.22	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.24	0.47	0.25	0.44	0.89	0.16	1.00	0.13	0.83	0.51	0.66	0.30	0.38	0.48	0.96	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.12	0.26	0.27	0.27	0.04	0.31	0.01	0.25	0.13	0.19	0.10	0.34	0.23	0.30	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00