Doublet Group distance statistics: 52208

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 3, 2, 1, 1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.009, 0.026, 0.044, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.018, 0.042, 0.065, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.042 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.012, 0.038, 0.064, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.038 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.013, 0.043, 0.073, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.043 std_dev=0.030
O4'	A	0, 0.021, 0.089, 0.158, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.089 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.019, 0.108, 0.198, 0.352 max_d=0.352 avg_d=0.108 std_dev=0.090
O2'	A	0, 0.051, 0.168, 0.285, 0.470 max_d=0.470 avg_d=0.168 std_dev=0.117
C3'	A	0, 0.041, 0.164, 0.287, 0.474 max_d=0.474 avg_d=0.164 std_dev=0.123
C4'	A	0, 0.022, 0.151, 0.280, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.151 std_dev=0.129
O3'	A	0, 0.097, 0.249, 0.401, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.249 std_dev=0.152
O2'	B	0, 0.113, 0.292, 0.471, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.292 std_dev=0.179
C5'	A	0, 0.012, 0.297, 0.583, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.297 std_dev=0.285
C2'	B	0, 0.040, 0.357, 0.674, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.357 std_dev=0.317
O5'	A	0, -0.015, 0.383, 0.781, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.383 std_dev=0.398
C1'	B	0, 0.017, 0.429, 0.842, 1.419 max_d=1.419 avg_d=0.429 std_dev=0.413
O2	B	0, 0.042, 0.533, 1.025, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.533 std_dev=0.492
O3'	B	0, -0.065, 0.468, 1.001, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.468 std_dev=0.533
C2	B	0, 0.004, 0.556, 1.107, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.556 std_dev=0.551
P	A	0, -0.071, 0.522, 1.116, 2.215 max_d=2.215 avg_d=0.522 std_dev=0.593
N1	B	0, -0.035, 0.571, 1.177, 1.955 max_d=1.955 avg_d=0.571 std_dev=0.606
C3'	B	0, -0.084, 0.551, 1.187, 2.189 max_d=2.189 avg_d=0.551 std_dev=0.635
OP2	A	0, -0.070, 0.653, 1.377, 2.675 max_d=2.675 avg_d=0.653 std_dev=0.723
OP1	A	0, -0.110, 0.618, 1.346, 2.715 max_d=2.715 avg_d=0.618 std_dev=0.728
O4'	B	0, -0.114, 0.664, 1.443, 2.738 max_d=2.738 avg_d=0.664 std_dev=0.778
N3	B	0, -0.077, 0.756, 1.590, 2.453 max_d=2.453 avg_d=0.756 std_dev=0.834
C4'	B	0, -0.159, 0.700, 1.559, 2.991 max_d=2.991 avg_d=0.700 std_dev=0.859
C6	B	0, -0.153, 0.847, 1.847, 3.411 max_d=3.411 avg_d=0.847 std_dev=1.000
C4	B	0, -0.182, 0.954, 2.091, 3.583 max_d=3.583 avg_d=0.954 std_dev=1.136
O5'	B	0, -0.214, 0.996, 2.205, 3.633 max_d=3.633 avg_d=0.996 std_dev=1.210
C5	B	0, -0.212, 1.017, 2.245, 4.113 max_d=4.113 avg_d=1.017 std_dev=1.229
C5'	B	0, -0.315, 1.066, 2.446, 4.703 max_d=4.703 avg_d=1.066 std_dev=1.381
O4	B	0, -0.260, 1.141, 2.541, 4.399 max_d=4.399 avg_d=1.141 std_dev=1.400
P	B	0, -0.305, 1.411, 3.126, 5.414 max_d=5.414 avg_d=1.411 std_dev=1.716
OP2	B	0, -0.307, 1.524, 3.355, 5.784 max_d=5.784 avg_d=1.524 std_dev=1.831
OP1	B	0, -0.330, 1.621, 3.571, 6.356 max_d=6.356 avg_d=1.621 std_dev=1.950

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.07	0.05	0.20	0.11
C2	0.04	0.00	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.09	0.10	0.03	0.20	0.26	0.49	0.32
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.06	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.06	0.21	0.12
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.02	0.07	0.05	0.08	0.08	0.08	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.04	0.13	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.17	0.23	0.41	0.28
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.05	0.05	0.04	0.07	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.19	0.31	0.45	0.33
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.11	0.01	0.14	0.00	0.15	0.13	0.13	0.09	0.17	0.15	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.07	0.10	0.03	0.21	0.35	0.51	0.37
C8	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.05	0.02	0.13	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.13	0.23	0.29	0.24
N1	0.03	0.00	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.10	0.03	0.22	0.32	0.52	0.36
N3	0.04	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.08	0.09	0.03	0.18	0.21	0.43	0.27
N6	0.03	0.01	0.05	0.08	0.02	0.07	0.02	0.17	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.07	0.11	0.04	0.22	0.40	0.52	0.39
N7	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.06	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.08	0.03	0.17	0.31	0.39	0.32
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.13	0.17	0.30	0.21
O2'	0.02	0.09	0.01	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.03	0.08	0.08	0.07	0.04	0.03	0.00	0.04	0.04	0.05	0.04	0.17	0.07
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.02	0.10	0.06	0.10	0.09	0.11	0.08	0.04	0.04	0.00	0.02	0.05	0.05	0.08	0.04
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.08	0.04
O5'	0.07	0.20	0.08	0.06	0.17	0.01	0.19	0.01	0.21	0.13	0.22	0.18	0.22	0.17	0.13	0.05	0.05	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.05	0.26	0.06	0.04	0.23	0.05	0.31	0.06	0.35	0.23	0.32	0.21	0.40	0.31	0.17	0.04	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.49	0.21	0.13	0.41	0.05	0.45	0.02	0.51	0.29	0.52	0.43	0.52	0.39	0.30	0.17	0.08	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.32	0.12	0.08	0.28	0.02	0.33	0.02	0.37	0.24	0.36	0.27	0.39	0.32	0.21	0.07	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.16	0.17	0.15	0.24	0.12	0.23	0.13	0.19	0.15	0.21	0.13	0.13	0.15	0.29	0.13	0.23	0.19	0.22	0.19
C2	0.20	0.34	0.27	0.34	0.58	0.19	0.56	0.25	0.45	0.34	0.47	0.22	0.18	0.30	0.68	0.19	0.16	0.23	0.42	0.21
C2'	0.11	0.11	0.13	0.14	0.21	0.12	0.23	0.12	0.18	0.12	0.16	0.09	0.12	0.14	0.26	0.12	0.21	0.17	0.22	0.17
C3'	0.07	0.08	0.07	0.09	0.16	0.12	0.19	0.13	0.15	0.07	0.12	0.13	0.10	0.10	0.21	0.11	0.18	0.15	0.20	0.15
C4	0.19	0.27	0.25	0.31	0.46	0.19	0.46	0.23	0.38	0.29	0.37	0.17	0.18	0.29	0.53	0.18	0.16	0.21	0.37	0.19
C4'	0.09	0.07	0.08	0.06	0.14	0.11	0.14	0.12	0.12	0.08	0.10	0.08	0.11	0.06	0.17	0.12	0.25	0.20	0.22	0.22
C5	0.24	0.32	0.30	0.40	0.55	0.25	0.57	0.35	0.48	0.36	0.44	0.17	0.21	0.35	0.63	0.23	0.21	0.31	0.49	0.28
C5'	0.09	0.08	0.06	0.05	0.15	0.14	0.16	0.13	0.14	0.09	0.12	0.09	0.10	0.04	0.18	0.14	0.21	0.15	0.21	0.17
C6	0.26	0.39	0.32	0.43	0.67	0.27	0.68	0.40	0.56	0.42	0.53	0.21	0.22	0.37	0.77	0.25	0.24	0.36	0.58	0.34
C8	0.19	0.19	0.24	0.32	0.35	0.22	0.39	0.27	0.34	0.25	0.26	0.10	0.18	0.31	0.39	0.20	0.16	0.23	0.36	0.20
N1	0.24	0.39	0.30	0.40	0.67	0.23	0.66	0.34	0.53	0.40	0.54	0.24	0.20	0.34	0.78	0.22	0.20	0.31	0.53	0.29
N3	0.18	0.29	0.24	0.29	0.48	0.17	0.46	0.20	0.37	0.28	0.39	0.20	0.16	0.26	0.56	0.17	0.17	0.19	0.34	0.17
N6	0.31	0.45	0.35	0.49	0.78	0.34	0.79	0.50	0.66	0.49	0.62	0.23	0.25	0.40	0.89	0.32	0.33	0.47	0.70	0.45
N7	0.25	0.28	0.30	0.42	0.49	0.29	0.54	0.39	0.48	0.35	0.37	0.12	0.22	0.37	0.55	0.26	0.24	0.35	0.50	0.32
N9	0.16	0.20	0.21	0.26	0.34	0.16	0.35	0.18	0.30	0.22	0.27	0.13	0.16	0.24	0.39	0.16	0.16	0.17	0.29	0.16
O2'	0.10	0.13	0.13	0.11	0.20	0.11	0.19	0.14	0.15	0.12	0.17	0.12	0.12	0.10	0.25	0.11	0.29	0.25	0.23	0.26
O3'	0.06	0.10	0.05	0.06	0.18	0.12	0.19	0.14	0.14	0.07	0.14	0.16	0.09	0.07	0.22	0.11	0.19	0.17	0.18	0.16
O4'	0.10	0.11	0.12	0.08	0.15	0.12	0.14	0.16	0.11	0.10	0.13	0.10	0.13	0.08	0.18	0.12	0.27	0.23	0.23	0.24
O5'	0.05	0.18	0.09	0.02	0.19	0.09	0.18	0.15	0.14	0.10	0.19	0.25	0.13	0.02	0.21	0.04	0.13	0.15	0.16	0.09
OP1	0.09	0.15	0.05	0.05	0.19	0.24	0.19	0.32	0.17	0.12	0.18	0.19	0.06	0.02	0.21	0.18	0.12	0.22	0.19	0.14
OP2	0.17	0.32	0.22	0.07	0.28	0.12	0.26	0.31	0.22	0.22	0.32	0.43	0.25	0.02	0.30	0.09	0.27	0.30	0.26	0.23
P	0.03	0.17	0.09	0.01	0.18	0.13	0.18	0.23	0.15	0.10	0.19	0.24	0.11	0.01	0.20	0.07	0.16	0.20	0.17	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.14	0.15	0.10
C2	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.02	0.01	0.25	0.21	0.17	0.20
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.04	0.02	0.06	0.10	0.01	0.02	0.06	0.01	0.19	0.18	0.10	0.14
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.00	0.10	0.04	0.09	0.06	0.09	0.11	0.02	0.01	0.12	0.01	0.26	0.22	0.09	0.18
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.01	0.02	0.34	0.28	0.25	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.05	0.06	0.02	0.08	0.00	0.02	0.10	0.20	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.09	0.00	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.03	0.35	0.28	0.26	0.29
C5'	0.03	0.10	0.03	0.04	0.18	0.01	0.20	0.00	0.17	0.10	0.14	0.06	0.06	0.03	0.20	0.01	0.01	0.14	0.28	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.03	0.31	0.24	0.21	0.23
N1	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.24	0.20	0.17	0.18
N3	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.01	0.30	0.25	0.21	0.25
O2	0.03	0.01	0.10	0.11	0.02	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.10	0.15	0.02	0.03	0.21	0.18	0.16	0.17
O2'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.04	0.06	0.03	0.06	0.02	0.03	0.05	0.10	0.00	0.05	0.04	0.05	0.09	0.11	0.14	0.10
O3'	0.02	0.10	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.03	0.10	0.06	0.12	0.15	0.05	0.00	0.14	0.01	0.21	0.21	0.09	0.15
O4	0.01	0.02	0.06	0.12	0.01	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.14	0.00	0.02	0.35	0.29	0.27	0.30
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.00	0.10	0.11	0.20	0.07
O5'	0.13	0.25	0.19	0.26	0.34	0.02	0.35	0.01	0.31	0.24	0.30	0.21	0.09	0.21	0.35	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.14	0.21	0.18	0.22	0.28	0.10	0.28	0.14	0.24	0.20	0.25	0.18	0.11	0.21	0.29	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.17	0.10	0.09	0.25	0.20	0.26	0.28	0.21	0.17	0.21	0.16	0.14	0.09	0.27	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.20	0.14	0.18	0.28	0.02	0.29	0.01	0.23	0.18	0.25	0.17	0.10	0.15	0.30	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00