Doublet Group distance statistics: 52210

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 6, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.013 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.003, 0.018, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.002, 0.020, 0.039, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.020 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.006, 0.030, 0.053, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.030 std_dev=0.024
O2'	B	0, 0.106, 0.299, 0.491, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.299 std_dev=0.192
C2'	B	0, 0.071, 0.311, 0.550, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.311 std_dev=0.240
O5'	A	0, -0.049, 0.218, 0.485, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.218 std_dev=0.267
O2	B	0, 0.039, 0.368, 0.696, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.368 std_dev=0.328
O4'	A	0, -0.215, 0.153, 0.522, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.153 std_dev=0.369
C1'	B	0, -0.058, 0.333, 0.724, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.333 std_dev=0.391
C2'	A	0, -0.219, 0.194, 0.608, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.194 std_dev=0.413
C3'	B	0, -0.061, 0.365, 0.792, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.365 std_dev=0.426
N1	B	0, -0.078, 0.376, 0.831, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.376 std_dev=0.454
C2	B	0, -0.059, 0.405, 0.869, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.405 std_dev=0.464
P	A	0, -0.161, 0.336, 0.833, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.336 std_dev=0.497
OP2	A	0, -0.132, 0.374, 0.881, 1.942 max_d=1.942 avg_d=0.374 std_dev=0.507
C3'	A	0, -0.285, 0.250, 0.785, 1.935 max_d=1.935 avg_d=0.250 std_dev=0.535
C4'	A	0, -0.300, 0.256, 0.812, 2.005 max_d=2.005 avg_d=0.256 std_dev=0.556
O3'	B	0, -0.233, 0.397, 1.028, 2.370 max_d=2.370 avg_d=0.397 std_dev=0.631
C6	B	0, -0.183, 0.457, 1.097, 2.450 max_d=2.450 avg_d=0.457 std_dev=0.640
OP1	B	0, -0.005, 0.647, 1.299, 2.627 max_d=2.627 avg_d=0.647 std_dev=0.652
O2'	A	0, -0.328, 0.339, 1.005, 2.428 max_d=2.428 avg_d=0.339 std_dev=0.666
O4'	B	0, -0.274, 0.429, 1.132, 2.632 max_d=2.632 avg_d=0.429 std_dev=0.703
C4'	B	0, -0.260, 0.445, 1.150, 2.651 max_d=2.651 avg_d=0.445 std_dev=0.705
O3'	A	0, -0.402, 0.311, 1.024, 2.561 max_d=2.561 avg_d=0.311 std_dev=0.713
N3	B	0, -0.209, 0.532, 1.273, 2.841 max_d=2.841 avg_d=0.532 std_dev=0.741
C5'	A	0, -0.416, 0.359, 1.134, 2.796 max_d=2.796 avg_d=0.359 std_dev=0.775
C5'	B	0, -0.279, 0.536, 1.350, 3.073 max_d=3.073 avg_d=0.536 std_dev=0.814
P	B	0, -0.251, 0.600, 1.451, 3.251 max_d=3.251 avg_d=0.600 std_dev=0.851
O5'	B	0, -0.270, 0.585, 1.439, 3.235 max_d=3.235 avg_d=0.585 std_dev=0.854
C5	B	0, -0.293, 0.570, 1.433, 3.263 max_d=3.263 avg_d=0.570 std_dev=0.863
OP2	B	0, -0.267, 0.659, 1.585, 3.539 max_d=3.539 avg_d=0.659 std_dev=0.926
C4	B	0, -0.329, 0.622, 1.573, 3.591 max_d=3.591 avg_d=0.622 std_dev=0.951
OP1	A	0, -0.546, 0.550, 1.645, 3.995 max_d=3.995 avg_d=0.550 std_dev=1.095
O4	B	0, -0.479, 0.748, 1.975, 4.586 max_d=4.586 avg_d=0.748 std_dev=1.227

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.00	0.13	0.15	0.39	0.10
C2	0.02	0.00	0.23	0.39	0.01	0.19	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.22	0.02	0.06	0.60	0.54	0.31
C2'	0.00	0.23	0.00	0.00	0.12	0.00	0.04	0.15	0.09	0.11	0.16	0.24	0.05	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.43	0.11	0.06	0.22
C3'	0.01	0.39	0.00	0.00	0.28	0.00	0.26	0.01	0.32	0.08	0.38	0.35	0.31	0.16	0.14	0.01	0.00	0.01	0.21	0.12	0.23	0.04
C4	0.01	0.01	0.12	0.28	0.00	0.12	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.09	0.01	0.09	0.46	0.54	0.26
C4'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.12	0.00	0.11	0.00	0.14	0.02	0.18	0.17	0.14	0.05	0.05	0.19	0.02	0.00	0.01	0.09	0.30	0.09
C5	0.01	0.00	0.04	0.26	0.00	0.11	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.11	0.01	0.09	0.50	0.56	0.28
C5'	0.06	0.19	0.15	0.01	0.10	0.00	0.08	0.00	0.13	0.10	0.18	0.16	0.13	0.06	0.03	0.05	0.13	0.01	0.00	0.04	0.13	0.00
C6	0.01	0.01	0.09	0.32	0.00	0.14	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.26	0.18	0.02	0.08	0.60	0.55	0.32
C8	0.01	0.00	0.11	0.08	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.06	0.01	0.14	0.25	0.51	0.15
N1	0.02	0.00	0.16	0.38	0.01	0.18	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.23	0.02	0.07	0.64	0.55	0.33
N3	0.02	0.00	0.24	0.35	0.00	0.17	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.02	0.07	0.51	0.53	0.27
N6	0.01	0.01	0.05	0.31	0.00	0.14	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.19	0.02	0.09	0.62	0.53	0.32
N7	0.01	0.00	0.07	0.16	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.04	0.01	0.12	0.38	0.54	0.22
N9	0.01	0.01	0.01	0.14	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.05	0.01	0.12	0.29	0.50	0.17
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.18	0.19	0.23	0.05	0.26	0.17	0.24	0.15	0.28	0.23	0.13	0.00	0.04	0.14	0.28	0.10	0.10	0.17
O3'	0.20	0.22	0.02	0.00	0.09	0.02	0.11	0.13	0.18	0.06	0.23	0.15	0.19	0.04	0.05	0.04	0.00	0.14	0.08	0.27	0.27	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.14	0.14	0.00	0.09	0.19	0.50	0.21
O5'	0.13	0.06	0.43	0.21	0.09	0.01	0.09	0.00	0.08	0.14	0.07	0.07	0.09	0.12	0.12	0.28	0.08	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.15	0.60	0.11	0.12	0.46	0.09	0.50	0.04	0.60	0.25	0.64	0.51	0.62	0.38	0.29	0.10	0.27	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.39	0.54	0.06	0.23	0.54	0.30	0.56	0.13	0.55	0.51	0.55	0.53	0.53	0.54	0.50	0.10	0.27	0.50	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.31	0.22	0.04	0.26	0.09	0.28	0.00	0.32	0.15	0.33	0.27	0.32	0.22	0.17	0.17	0.13	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.33	0.16	0.15	0.57	0.59	0.67	0.83	0.63	0.45	0.42	0.15	0.13	0.21	0.59	0.67	0.87	0.65	0.80	0.81
C2	0.40	0.39	0.23	0.21	0.53	0.54	0.60	0.71	0.57	0.47	0.43	0.26	0.07	0.08	0.54	0.66	0.81	0.60	0.81	0.78
C2'	0.10	0.09	0.16	0.12	0.27	0.36	0.37	0.59	0.33	0.18	0.15	0.16	0.47	0.42	0.29	0.45	0.57	0.32	0.44	0.49
C3'	0.21	0.19	0.04	0.02	0.33	0.40	0.39	0.52	0.37	0.27	0.24	0.11	0.25	0.19	0.34	0.48	0.46	0.17	0.33	0.34
C4	0.39	0.37	0.21	0.19	0.54	0.55	0.62	0.73	0.59	0.47	0.43	0.22	0.07	0.13	0.55	0.68	0.82	0.60	0.81	0.78
C4'	0.16	0.13	0.03	0.02	0.28	0.35	0.36	0.50	0.34	0.21	0.18	0.08	0.19	0.19	0.30	0.39	0.43	0.23	0.35	0.35
C5	0.40	0.38	0.23	0.20	0.51	0.51	0.57	0.65	0.56	0.47	0.42	0.25	0.07	0.12	0.51	0.64	0.76	0.57	0.79	0.74
C5'	0.05	0.10	0.16	0.14	0.03	0.14	0.08	0.21	0.08	0.03	0.07	0.20	0.29	0.22	0.03	0.15	0.10	0.11	0.08	0.04
C6	0.39	0.39	0.24	0.21	0.48	0.49	0.53	0.61	0.52	0.46	0.41	0.28	0.09	0.09	0.48	0.61	0.74	0.56	0.79	0.72
C8	0.38	0.35	0.20	0.16	0.53	0.54	0.61	0.70	0.59	0.47	0.41	0.18	0.09	0.22	0.53	0.69	0.79	0.58	0.79	0.75
N1	0.40	0.39	0.24	0.21	0.50	0.51	0.55	0.65	0.54	0.46	0.42	0.28	0.08	0.08	0.50	0.63	0.77	0.58	0.80	0.75
N3	0.39	0.38	0.21	0.20	0.55	0.56	0.62	0.74	0.59	0.47	0.44	0.23	0.07	0.10	0.57	0.67	0.84	0.61	0.81	0.79
N6	0.38	0.38	0.25	0.21	0.43	0.43	0.47	0.54	0.47	0.43	0.39	0.30	0.12	0.10	0.43	0.54	0.67	0.52	0.76	0.67
N7	0.40	0.38	0.23	0.18	0.50	0.48	0.56	0.61	0.55	0.47	0.41	0.23	0.07	0.16	0.49	0.64	0.73	0.55	0.78	0.71
N9	0.37	0.35	0.19	0.17	0.55	0.57	0.64	0.76	0.61	0.47	0.42	0.18	0.10	0.19	0.56	0.69	0.84	0.61	0.80	0.78
O2'	0.16	0.11	0.07	0.05	0.36	0.54	0.51	0.85	0.47	0.25	0.18	0.19	0.43	0.31	0.38	0.57	0.84	0.66	0.70	0.79
O3'	0.20	0.17	0.04	0.04	0.30	0.36	0.37	0.48	0.35	0.24	0.21	0.09	0.18	0.12	0.31	0.43	0.42	0.17	0.31	0.31
O4'	0.32	0.28	0.20	0.19	0.49	0.55	0.59	0.76	0.56	0.40	0.35	0.12	0.07	0.13	0.51	0.58	0.76	0.57	0.70	0.70
O5'	0.17	0.06	0.07	0.18	0.18	0.51	0.30	0.60	0.31	0.17	0.07	0.15	0.18	0.01	0.17	0.43	0.42	0.31	0.38	0.38
OP1	0.07	0.12	0.32	0.29	0.20	0.06	0.21	0.20	0.18	0.13	0.16	0.10	0.36	0.02	0.23	0.07	0.44	0.72	0.56	0.58
OP2	0.32	0.15	0.07	0.12	0.15	0.59	0.24	0.55	0.29	0.25	0.12	0.12	0.41	0.02	0.12	0.66	0.37	0.15	0.26	0.27
P	0.10	0.06	0.11	0.02	0.03	0.30	0.07	0.25	0.10	0.06	0.06	0.12	0.29	0.01	0.03	0.30	0.07	0.13	0.11	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.03	0.09	0.24	0.11
C2	0.02	0.00	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.15	0.01	0.02	0.13	0.20	0.40	0.26
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.03	0.06	0.01	0.04	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.14	0.06	0.14	0.05
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.08	0.01	0.02	0.11	0.01	0.01	0.04	0.01	0.11	0.07	0.11	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.00	0.03	0.23	0.40	0.56	0.43
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.06	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.23	0.43	0.58	0.44
C5'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.12	0.00	0.13	0.00	0.09	0.04	0.09	0.02	0.03	0.01	0.14	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.17	0.33	0.46	0.34
N1	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.01	0.11	0.20	0.36	0.23
N3	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.13	0.01	0.03	0.19	0.30	0.49	0.36
O2	0.04	0.00	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.23	0.01	0.02	0.10	0.13	0.35	0.20
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.03	0.03	0.05	0.11	0.16	0.00	0.02	0.11	0.01	0.17	0.09	0.13	0.07
O3'	0.08	0.15	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.02	0.08	0.13	0.23	0.02	0.00	0.07	0.05	0.10	0.09	0.11	0.05
O4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.00	0.03	0.25	0.45	0.59	0.47
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.07	0.09	0.19	0.10
O5'	0.03	0.13	0.14	0.11	0.23	0.01	0.23	0.00	0.17	0.11	0.19	0.10	0.17	0.10	0.25	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.09	0.20	0.06	0.07	0.40	0.05	0.43	0.06	0.33	0.20	0.30	0.13	0.09	0.09	0.45	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.24	0.40	0.14	0.11	0.56	0.10	0.58	0.04	0.46	0.36	0.49	0.35	0.13	0.11	0.59	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.11	0.26	0.05	0.05	0.43	0.02	0.44	0.01	0.34	0.23	0.36	0.20	0.07	0.05	0.47	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00