Doublet Group distance statistics: 52211

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.015, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.015 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.010, 0.015, 0.021, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.012, 0.020, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.020 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.017, 0.028, 0.039, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.023, 0.036, 0.049, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.036 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.023, 0.043, 0.063, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.043 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.032, 0.054, 0.077, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.054 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.042, 0.068, 0.094, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.068 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.021, 0.108, 0.196, 0.339 max_d=0.339 avg_d=0.108 std_dev=0.087
C2'	A	0, 0.104, 0.208, 0.311, 0.445 max_d=0.445 avg_d=0.208 std_dev=0.104
O2'	A	0, 0.216, 0.351, 0.485, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.351 std_dev=0.134
C4'	A	0, 0.114, 0.250, 0.387, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.250 std_dev=0.137
C3'	A	0, 0.137, 0.291, 0.445, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.291 std_dev=0.154
O3'	B	0, 0.189, 0.357, 0.525, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.357 std_dev=0.168
O3'	A	0, 0.170, 0.385, 0.599, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.385 std_dev=0.214
C3'	B	0, 0.146, 0.369, 0.593, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.369 std_dev=0.223
C5'	A	0, 0.196, 0.438, 0.680, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.438 std_dev=0.242
C1'	B	0, 0.437, 0.684, 0.930, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.684 std_dev=0.246
P	A	0, 0.366, 0.620, 0.875, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.620 std_dev=0.254
C2'	B	0, 0.401, 0.670, 0.940, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.670 std_dev=0.270
O4'	B	0, 0.400, 0.687, 0.974, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.687 std_dev=0.287
C4'	B	0, 0.349, 0.649, 0.948, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.649 std_dev=0.300
C6	B	0, 0.134, 0.447, 0.760, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.447 std_dev=0.313
O5'	A	0, 0.101, 0.443, 0.785, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.443 std_dev=0.342
N1	B	0, 0.281, 0.625, 0.969, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.625 std_dev=0.344
OP1	A	0, 0.610, 0.998, 1.387, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.998 std_dev=0.389
O2'	B	0, 0.588, 0.996, 1.403, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.996 std_dev=0.408
C5	B	0, 0.254, 0.690, 1.127, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.690 std_dev=0.437
OP1	B	0, 0.819, 1.302, 1.784, 1.879 max_d=1.879 avg_d=1.302 std_dev=0.483
OP2	A	0, 0.557, 1.043, 1.530, 1.706 max_d=1.706 avg_d=1.043 std_dev=0.487
O5'	B	0, 0.271, 0.828, 1.385, 1.977 max_d=1.977 avg_d=0.828 std_dev=0.557
C5'	B	0, 0.503, 1.111, 1.719, 1.988 max_d=1.988 avg_d=1.111 std_dev=0.608
P	B	0, 0.222, 0.882, 1.542, 2.521 max_d=2.521 avg_d=0.882 std_dev=0.660
C2	B	0, 0.277, 0.941, 1.605, 2.503 max_d=2.503 avg_d=0.941 std_dev=0.664
O2	B	0, 0.587, 1.320, 2.054, 3.047 max_d=3.047 avg_d=1.320 std_dev=0.733
C4	B	0, 0.124, 0.877, 1.631, 2.717 max_d=2.717 avg_d=0.877 std_dev=0.754
O4	B	0, 0.302, 1.196, 2.091, 3.477 max_d=3.477 avg_d=1.196 std_dev=0.894
N3	B	0, 0.014, 0.919, 1.824, 3.187 max_d=3.187 avg_d=0.919 std_dev=0.905
OP2	B	0, 0.095, 1.448, 2.802, 5.251 max_d=5.251 avg_d=1.448 std_dev=1.354

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.24	0.03
C2	0.01	0.00	0.08	0.11	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.21	0.10	0.24	0.08
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.07	0.08	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.21	0.16	0.10
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.01	0.08	0.04	0.11	0.10	0.07	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.27	0.28	0.13	0.16
C4	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.20	0.09	0.26	0.07
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.06	0.08	0.06	0.08	0.07	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.15	0.27	0.01
C5	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.23	0.10	0.27	0.10
C5'	0.02	0.13	0.01	0.01	0.11	0.00	0.15	0.00	0.16	0.12	0.15	0.11	0.17	0.15	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.19	0.33	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.08	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.25	0.11	0.26	0.11
C8	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02	0.22	0.08	0.28	0.08
N1	0.01	0.00	0.07	0.11	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.23	0.10	0.25	0.09
N3	0.01	0.00	0.08	0.10	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.18	0.10	0.24	0.06
N6	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.26	0.13	0.27	0.12
N7	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.02	0.24	0.10	0.29	0.11
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.18	0.09	0.26	0.06
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.11	0.18	0.18	0.06
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.13	0.12	0.09	0.05	0.03	0.04	0.00	0.01	0.25	0.32	0.12	0.17
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.11	0.28	0.06
O5'	0.10	0.21	0.20	0.27	0.20	0.01	0.23	0.01	0.25	0.22	0.23	0.18	0.26	0.24	0.18	0.11	0.25	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.11	0.10	0.21	0.28	0.09	0.15	0.10	0.19	0.11	0.08	0.10	0.10	0.13	0.10	0.09	0.18	0.32	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.24	0.24	0.16	0.13	0.26	0.27	0.27	0.33	0.26	0.28	0.25	0.24	0.27	0.29	0.26	0.18	0.12	0.28	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.08	0.10	0.16	0.07	0.01	0.10	0.01	0.11	0.08	0.09	0.06	0.12	0.11	0.06	0.06	0.17	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.39	0.19	0.10	0.26	0.09	0.11	0.08	0.11	0.21	0.39	0.54	0.26	0.10	0.28	0.14	0.09	0.27	0.32	0.10
C2	0.29	0.59	0.21	0.15	0.37	0.12	0.16	0.10	0.16	0.31	0.59	0.84	0.29	0.18	0.41	0.22	0.17	0.24	0.21	0.12
C2'	0.22	0.46	0.23	0.15	0.34	0.13	0.16	0.14	0.13	0.26	0.47	0.60	0.29	0.15	0.38	0.15	0.07	0.31	0.30	0.09
C3'	0.25	0.50	0.28	0.20	0.40	0.19	0.22	0.22	0.17	0.31	0.52	0.64	0.32	0.20	0.44	0.20	0.15	0.37	0.24	0.15
C4	0.27	0.56	0.22	0.15	0.35	0.12	0.15	0.11	0.14	0.30	0.55	0.79	0.31	0.17	0.38	0.20	0.17	0.25	0.20	0.12
C4'	0.19	0.37	0.21	0.12	0.27	0.13	0.13	0.13	0.11	0.22	0.38	0.48	0.26	0.11	0.30	0.14	0.05	0.32	0.33	0.09
C5	0.30	0.64	0.24	0.17	0.40	0.14	0.17	0.15	0.16	0.34	0.64	0.91	0.31	0.21	0.44	0.23	0.25	0.23	0.28	0.19
C5'	0.21	0.38	0.23	0.17	0.28	0.22	0.15	0.24	0.13	0.24	0.39	0.49	0.27	0.18	0.30	0.21	0.21	0.40	0.20	0.20
C6	0.32	0.70	0.23	0.19	0.44	0.15	0.18	0.16	0.17	0.36	0.70	0.99	0.30	0.22	0.48	0.24	0.28	0.22	0.34	0.21
C8	0.26	0.55	0.24	0.17	0.35	0.14	0.14	0.16	0.13	0.30	0.54	0.77	0.32	0.19	0.38	0.19	0.21	0.24	0.23	0.16
N1	0.31	0.66	0.22	0.16	0.42	0.13	0.18	0.13	0.17	0.34	0.66	0.94	0.29	0.20	0.46	0.24	0.24	0.23	0.26	0.17
N3	0.27	0.53	0.21	0.13	0.33	0.11	0.14	0.09	0.15	0.28	0.53	0.76	0.29	0.16	0.37	0.20	0.13	0.25	0.21	0.10
N6	0.33	0.77	0.23	0.21	0.49	0.17	0.20	0.20	0.18	0.39	0.78	1.08	0.27	0.23	0.54	0.27	0.35	0.21	0.46	0.28
N7	0.30	0.66	0.25	0.19	0.41	0.16	0.16	0.19	0.15	0.35	0.64	0.92	0.32	0.22	0.44	0.23	0.29	0.23	0.33	0.22
N9	0.24	0.49	0.22	0.13	0.31	0.11	0.13	0.11	0.13	0.26	0.49	0.69	0.30	0.15	0.34	0.17	0.13	0.25	0.21	0.10
O2'	0.19	0.37	0.20	0.11	0.28	0.10	0.13	0.09	0.11	0.21	0.39	0.50	0.26	0.10	0.32	0.12	0.10	0.30	0.45	0.13
O3'	0.25	0.50	0.28	0.21	0.42	0.20	0.25	0.24	0.19	0.32	0.53	0.62	0.31	0.21	0.47	0.20	0.15	0.42	0.25	0.16
O4'	0.18	0.34	0.19	0.09	0.23	0.10	0.10	0.08	0.10	0.19	0.34	0.47	0.25	0.07	0.25	0.13	0.08	0.28	0.35	0.11
O5'	0.11	0.32	0.21	0.01	0.28	0.16	0.14	0.34	0.10	0.16	0.36	0.41	0.27	0.01	0.32	0.07	0.17	0.21	0.39	0.18
OP1	0.15	0.20	0.07	0.11	0.15	0.41	0.11	0.61	0.11	0.13	0.21	0.25	0.06	0.02	0.17	0.32	0.14	0.18	0.27	0.17
OP2	0.31	0.61	0.39	0.15	0.54	0.18	0.34	0.43	0.27	0.41	0.65	0.70	0.42	0.02	0.58	0.20	0.41	0.26	0.51	0.35
P	0.08	0.31	0.18	0.02	0.27	0.19	0.14	0.37	0.09	0.16	0.35	0.39	0.21	0.00	0.30	0.09	0.18	0.20	0.23	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.13	0.25	0.46	0.10
C2	0.02	0.00	0.19	0.23	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.25	0.01	0.09	0.18	0.42	0.59	0.07
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.04	0.01	0.11	0.02	0.15	0.03	0.15	0.32	0.00	0.02	0.05	0.01	0.24	0.27	0.34	0.13
C3'	0.02	0.23	0.00	0.00	0.15	0.01	0.07	0.03	0.06	0.10	0.23	0.29	0.01	0.01	0.17	0.01	0.36	0.33	0.25	0.22
C4	0.02	0.01	0.04	0.15	0.00	0.11	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.03	0.44	0.27	1.02	0.34
C4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.11	0.00	0.13	0.01	0.13	0.07	0.09	0.08	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.15	0.32	0.05
C5	0.02	0.01	0.11	0.07	0.01	0.13	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.07	0.00	0.11	0.61	0.09	1.21	0.56
C5'	0.03	0.15	0.02	0.03	0.24	0.01	0.28	0.00	0.25	0.14	0.19	0.15	0.05	0.03	0.25	0.01	0.01	0.14	0.36	0.02
C6	0.02	0.01	0.15	0.06	0.01	0.13	0.00	0.25	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.06	0.00	0.14	0.58	0.08	1.06	0.51
N1	0.01	0.00	0.03	0.10	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.02	0.30	0.26	0.70	0.21
N3	0.02	0.00	0.15	0.23	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.26	0.01	0.06	0.27	0.40	0.75	0.13
O2	0.02	0.00	0.32	0.29	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.33	0.01	0.17	0.17	0.53	0.40	0.20
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.05	0.12	0.05	0.14	0.03	0.08	0.24	0.00	0.05	0.05	0.06	0.08	0.16	0.29	0.07
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.18	0.01	0.07	0.03	0.06	0.09	0.26	0.33	0.05	0.00	0.21	0.01	0.30	0.39	0.11	0.23
O4	0.02	0.01	0.05	0.17	0.00	0.12	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.21	0.00	0.02	0.46	0.27	1.08	0.36
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.03	0.00	0.11	0.01	0.14	0.02	0.06	0.17	0.06	0.01	0.02	0.00	0.09	0.26	0.44	0.14
O5'	0.13	0.18	0.24	0.36	0.44	0.02	0.61	0.01	0.58	0.30	0.27	0.17	0.08	0.30	0.46	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.25	0.42	0.27	0.33	0.27	0.15	0.09	0.14	0.08	0.26	0.40	0.53	0.16	0.39	0.27	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.46	0.59	0.34	0.25	1.02	0.32	1.21	0.36	1.06	0.70	0.75	0.40	0.29	0.11	1.08	0.44	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.07	0.13	0.22	0.34	0.05	0.56	0.02	0.51	0.21	0.13	0.20	0.07	0.23	0.36	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00