Doublet Group distance statistics: 52217

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.013, 0.018, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.013 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.018, 0.035, 0.051, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.035 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.023, 0.040, 0.058, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.040 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.035 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.019, 0.038, 0.057, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.038 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.018, 0.037, 0.057, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.037 std_dev=0.020
C1'	A	0, 0.026, 0.050, 0.074, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.050 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.027, 0.052, 0.078, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.052 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.026, 0.055, 0.084, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.055 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.021, 0.052, 0.083, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.052 std_dev=0.031
N6	A	0, 0.044, 0.077, 0.109, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.077 std_dev=0.032
C2'	A	0, 0.083, 0.201, 0.320, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.201 std_dev=0.119
O4'	A	0, 0.064, 0.205, 0.346, 0.435 max_d=0.435 avg_d=0.205 std_dev=0.141
O2'	A	0, 0.104, 0.254, 0.405, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.254 std_dev=0.151
C3'	A	0, 0.133, 0.314, 0.495, 0.531 max_d=0.531 avg_d=0.314 std_dev=0.181
C4'	A	0, 0.123, 0.315, 0.506, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.315 std_dev=0.192
O3'	B	0, 0.235, 0.445, 0.655, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.445 std_dev=0.210
O3'	A	0, 0.190, 0.473, 0.757, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.473 std_dev=0.283
O2'	B	0, 0.317, 0.618, 0.919, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.618 std_dev=0.301
C2'	B	0, 0.354, 0.671, 0.988, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.671 std_dev=0.317
C3'	B	0, 0.298, 0.619, 0.940, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.619 std_dev=0.321
P	A	0, 0.267, 0.599, 0.930, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.599 std_dev=0.331
OP2	A	0, 0.298, 0.635, 0.972, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.635 std_dev=0.337
C5'	A	0, 0.168, 0.506, 0.844, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.506 std_dev=0.338
C4'	B	0, 0.388, 0.814, 1.240, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.814 std_dev=0.426
OP1	A	0, 0.322, 0.762, 1.203, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.762 std_dev=0.440
C5	B	0, 0.423, 0.888, 1.353, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.888 std_dev=0.465
C6	B	0, 0.473, 0.943, 1.414, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.943 std_dev=0.470
C1'	B	0, 0.455, 0.938, 1.421, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.938 std_dev=0.483
N1	B	0, 0.464, 0.964, 1.463, 1.848 max_d=1.848 avg_d=0.964 std_dev=0.500
C4	B	0, 0.369, 0.882, 1.395, 1.759 max_d=1.759 avg_d=0.882 std_dev=0.513
N3	B	0, 0.447, 0.988, 1.529, 1.885 max_d=1.885 avg_d=0.988 std_dev=0.541
O4	B	0, 0.325, 0.868, 1.411, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.868 std_dev=0.543
C5'	B	0, 0.462, 1.010, 1.559, 2.022 max_d=2.022 avg_d=1.010 std_dev=0.549
C2	B	0, 0.468, 1.019, 1.570, 1.912 max_d=1.912 avg_d=1.019 std_dev=0.551
O4'	B	0, 0.501, 1.066, 1.630, 2.131 max_d=2.131 avg_d=1.066 std_dev=0.565
O5'	A	0, 0.259, 0.835, 1.411, 1.596 max_d=1.596 avg_d=0.835 std_dev=0.576
O2	B	0, 0.509, 1.140, 1.771, 2.007 max_d=2.007 avg_d=1.140 std_dev=0.631
O5'	B	0, 0.450, 1.149, 1.847, 2.583 max_d=2.583 avg_d=1.149 std_dev=0.699
P	B	0, 0.637, 1.352, 2.066, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.352 std_dev=0.715
OP1	B	0, 0.659, 1.388, 2.116, 2.619 max_d=2.619 avg_d=1.388 std_dev=0.728
OP2	B	0, 0.732, 1.498, 2.264, 2.683 max_d=2.683 avg_d=1.498 std_dev=0.766

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.14	0.43	0.15	0.09
C2	0.03	0.00	0.15	0.12	0.01	0.03	0.02	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.17	0.15	0.09	0.25	0.37	0.13	0.10
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.08	0.01	0.06	0.03	0.09	0.06	0.13	0.14	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.34	0.26	0.09
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.07	0.09	0.10	0.11	0.08	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.11	0.26	0.32	0.12
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.02	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.05	0.25	0.39	0.13	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.03	0.03	0.06	0.08	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.29	0.19	0.05
C5	0.01	0.02	0.06	0.06	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.05	0.30	0.34	0.13	0.12
C5'	0.04	0.10	0.03	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.14	0.15	0.12	0.08	0.17	0.17	0.09	0.04	0.02	0.02	0.01	0.17	0.18	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.07	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.10	0.11	0.06	0.31	0.30	0.13	0.12
C8	0.02	0.02	0.06	0.09	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.10	0.06	0.29	0.38	0.14	0.11
N1	0.02	0.00	0.13	0.10	0.01	0.03	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.14	0.14	0.08	0.29	0.33	0.13	0.11
N3	0.03	0.00	0.14	0.11	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.15	0.13	0.08	0.22	0.41	0.12	0.10
N6	0.02	0.02	0.08	0.08	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.11	0.06	0.33	0.27	0.14	0.15
N7	0.02	0.03	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.17	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.09	0.05	0.33	0.32	0.14	0.14
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.22	0.42	0.13	0.10
O2'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.08	0.04	0.06	0.04	0.10	0.04	0.14	0.15	0.09	0.03	0.01	0.00	0.05	0.04	0.06	0.34	0.27	0.07
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.08	0.03	0.08	0.02	0.11	0.10	0.14	0.13	0.11	0.09	0.03	0.05	0.00	0.03	0.20	0.21	0.40	0.17
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.02	0.06	0.06	0.08	0.08	0.06	0.05	0.02	0.04	0.03	0.00	0.15	0.45	0.14	0.13
O5'	0.14	0.25	0.06	0.11	0.25	0.02	0.30	0.01	0.31	0.29	0.29	0.22	0.33	0.33	0.22	0.06	0.20	0.15	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.43	0.37	0.34	0.26	0.39	0.29	0.34	0.17	0.30	0.38	0.33	0.41	0.27	0.32	0.42	0.34	0.21	0.45	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.13	0.26	0.32	0.13	0.19	0.13	0.18	0.13	0.14	0.13	0.12	0.14	0.14	0.13	0.27	0.40	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.10	0.09	0.12	0.10	0.05	0.12	0.01	0.12	0.11	0.11	0.10	0.15	0.14	0.10	0.07	0.17	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.37	0.24	0.16	0.15	0.18	0.20	0.17	0.23	0.24	0.30	0.59	0.31	0.16	0.13	0.23	0.29	0.56	0.34	0.35
C2	0.32	0.24	0.22	0.15	0.22	0.23	0.30	0.20	0.32	0.29	0.19	0.31	0.29	0.13	0.20	0.32	0.22	0.45	0.24	0.25
C2'	0.35	0.46	0.31	0.26	0.24	0.28	0.25	0.28	0.27	0.32	0.38	0.68	0.34	0.24	0.21	0.32	0.40	0.61	0.43	0.44
C3'	0.26	0.35	0.25	0.23	0.11	0.24	0.21	0.26	0.23	0.22	0.27	0.57	0.28	0.24	0.08	0.24	0.44	0.66	0.47	0.49
C4	0.29	0.25	0.22	0.15	0.16	0.21	0.24	0.18	0.27	0.25	0.18	0.37	0.30	0.14	0.14	0.27	0.21	0.46	0.24	0.26
C4'	0.17	0.28	0.18	0.10	0.08	0.10	0.25	0.14	0.25	0.13	0.21	0.51	0.24	0.13	0.08	0.12	0.39	0.69	0.46	0.48
C5	0.28	0.19	0.21	0.16	0.18	0.22	0.25	0.21	0.28	0.24	0.15	0.25	0.27	0.14	0.16	0.28	0.21	0.44	0.24	0.25
C5'	0.17	0.23	0.19	0.07	0.23	0.06	0.38	0.11	0.35	0.18	0.20	0.41	0.24	0.07	0.24	0.10	0.41	0.73	0.47	0.51
C6	0.30	0.20	0.21	0.16	0.22	0.24	0.29	0.23	0.31	0.27	0.17	0.19	0.26	0.13	0.20	0.32	0.23	0.44	0.25	0.27
C8	0.25	0.26	0.22	0.17	0.14	0.21	0.20	0.19	0.22	0.21	0.20	0.40	0.29	0.15	0.13	0.24	0.21	0.47	0.25	0.26
N1	0.32	0.23	0.22	0.16	0.24	0.24	0.31	0.22	0.33	0.29	0.20	0.23	0.27	0.13	0.22	0.33	0.22	0.44	0.24	0.25
N3	0.31	0.27	0.22	0.14	0.19	0.21	0.26	0.18	0.29	0.27	0.20	0.39	0.30	0.14	0.16	0.29	0.22	0.47	0.25	0.26
N6	0.30	0.20	0.21	0.17	0.24	0.25	0.29	0.26	0.31	0.27	0.20	0.16	0.24	0.14	0.23	0.32	0.27	0.44	0.30	0.31
N7	0.25	0.18	0.20	0.16	0.16	0.22	0.23	0.21	0.25	0.21	0.14	0.25	0.26	0.14	0.14	0.26	0.22	0.45	0.26	0.27
N9	0.27	0.29	0.22	0.16	0.14	0.20	0.21	0.18	0.24	0.23	0.22	0.47	0.31	0.16	0.12	0.25	0.22	0.49	0.26	0.28
O2'	0.37	0.52	0.32	0.26	0.30	0.28	0.28	0.28	0.30	0.36	0.47	0.75	0.35	0.23	0.29	0.34	0.44	0.66	0.50	0.49
O3'	0.24	0.32	0.24	0.27	0.13	0.27	0.26	0.32	0.27	0.21	0.26	0.53	0.24	0.27	0.10	0.25	0.53	0.71	0.57	0.58
O4'	0.17	0.27	0.16	0.08	0.08	0.08	0.24	0.11	0.24	0.14	0.21	0.50	0.23	0.12	0.07	0.11	0.28	0.60	0.35	0.37
O5'	0.22	0.31	0.22	0.14	0.43	0.12	0.51	0.18	0.47	0.31	0.36	0.39	0.25	0.01	0.45	0.17	0.31	0.54	0.26	0.32
OP1	0.04	0.14	0.10	0.02	0.15	0.12	0.25	0.23	0.24	0.08	0.14	0.26	0.13	0.01	0.17	0.07	0.24	0.78	0.44	0.48
OP2	0.14	0.24	0.17	0.11	0.18	0.16	0.27	0.25	0.25	0.16	0.21	0.36	0.14	0.01	0.18	0.14	0.23	0.58	0.40	0.39
P	0.04	0.13	0.09	0.01	0.14	0.07	0.27	0.14	0.26	0.07	0.12	0.27	0.11	0.01	0.16	0.03	0.20	0.61	0.30	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.21	0.19	0.19	0.08
C2	0.02	0.00	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01	0.07	0.40	0.31	0.14	0.25
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.04	0.01	0.10	0.02	0.12	0.02	0.08	0.21	0.01	0.01	0.04	0.01	0.24	0.35	0.05	0.15
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.10	0.01	0.16	0.02	0.18	0.05	0.09	0.17	0.01	0.01	0.10	0.01	0.28	0.45	0.09	0.24
C4	0.03	0.01	0.04	0.10	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.05	0.57	0.45	0.36	0.46
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.12	0.01	0.11	0.05	0.07	0.06	0.02	0.02	0.11	0.00	0.02	0.16	0.29	0.06
C5	0.02	0.01	0.10	0.16	0.01	0.12	0.00	0.19	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.19	0.02	0.04	0.60	0.48	0.38	0.49
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.18	0.01	0.19	0.00	0.15	0.08	0.14	0.09	0.03	0.04	0.20	0.02	0.01	0.19	0.34	0.01
C6	0.02	0.01	0.12	0.18	0.01	0.11	0.00	0.15	0.00	0.00	0.02	0.02	0.08	0.20	0.02	0.05	0.53	0.40	0.24	0.37
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.40	0.30	0.14	0.23
N3	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.07	0.02	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01	0.09	0.11	0.01	0.07	0.49	0.38	0.25	0.35
O2	0.04	0.01	0.21	0.17	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.20	0.22	0.02	0.10	0.31	0.28	0.09	0.16
O2'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.03	0.08	0.02	0.09	0.20	0.00	0.03	0.03	0.02	0.06	0.24	0.17	0.07
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.11	0.02	0.19	0.04	0.20	0.05	0.11	0.22	0.03	0.00	0.12	0.02	0.17	0.51	0.17	0.25
O4	0.03	0.01	0.04	0.10	0.00	0.11	0.02	0.20	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.12	0.00	0.06	0.61	0.50	0.44	0.52
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.10	0.02	0.02	0.06	0.00	0.11	0.10	0.37	0.15
O5'	0.21	0.40	0.24	0.28	0.57	0.02	0.60	0.01	0.53	0.40	0.49	0.31	0.06	0.17	0.61	0.11	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.19	0.31	0.35	0.45	0.45	0.16	0.48	0.19	0.40	0.30	0.38	0.28	0.24	0.51	0.50	0.10	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.14	0.05	0.09	0.36	0.29	0.38	0.34	0.24	0.14	0.25	0.09	0.17	0.17	0.44	0.37	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.25	0.15	0.24	0.46	0.06	0.49	0.01	0.37	0.23	0.35	0.16	0.07	0.25	0.52	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00