Doublet Group distance statistics: 52220

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.008, 0.022, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.011, 0.027, 0.043, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.010, 0.029, 0.047, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.029 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.007, 0.027, 0.046, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.003, 0.024, 0.044, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.024 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.014, 0.035, 0.056, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.035 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.009, 0.030, 0.052, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.022
O4'	A	0, 0.053, 0.136, 0.220, 0.250 max_d=0.250 avg_d=0.136 std_dev=0.084
C2'	A	0, 0.051, 0.139, 0.226, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.139 std_dev=0.088
O2'	A	0, 0.137, 0.298, 0.459, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.298 std_dev=0.161
C3'	A	0, 0.042, 0.206, 0.371, 0.456 max_d=0.456 avg_d=0.206 std_dev=0.164
C4'	A	0, 0.097, 0.289, 0.480, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.289 std_dev=0.192
O3'	A	0, 0.025, 0.263, 0.501, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.263 std_dev=0.238
O2'	B	0, 0.243, 0.491, 0.740, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.491 std_dev=0.248
C2'	B	0, 0.424, 0.743, 1.062, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.743 std_dev=0.319
C5'	A	0, 0.180, 0.517, 0.854, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.517 std_dev=0.337
C1'	B	0, 0.411, 0.770, 1.129, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.770 std_dev=0.359
C4'	B	0, 0.480, 0.876, 1.272, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.876 std_dev=0.396
O3'	B	0, 0.319, 0.722, 1.124, 1.376 max_d=1.376 avg_d=0.722 std_dev=0.402
C3'	B	0, 0.496, 0.910, 1.324, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.910 std_dev=0.414
O4'	B	0, 0.425, 0.885, 1.346, 1.633 max_d=1.633 avg_d=0.885 std_dev=0.461
P	A	0, 0.132, 0.629, 1.126, 1.614 max_d=1.614 avg_d=0.629 std_dev=0.497
OP2	A	0, 0.349, 0.865, 1.380, 1.739 max_d=1.739 avg_d=0.865 std_dev=0.515
O5'	A	0, 0.211, 0.737, 1.263, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.737 std_dev=0.526
N1	B	0, 0.529, 1.061, 1.592, 1.783 max_d=1.783 avg_d=1.061 std_dev=0.531
OP1	A	0, 0.016, 0.644, 1.272, 2.030 max_d=2.030 avg_d=0.644 std_dev=0.628
C6	B	0, 0.675, 1.341, 2.008, 2.159 max_d=2.159 avg_d=1.341 std_dev=0.667
C5'	B	0, 0.295, 1.027, 1.760, 2.180 max_d=2.180 avg_d=1.027 std_dev=0.733
C5	B	0, 0.687, 1.529, 2.370, 2.934 max_d=2.934 avg_d=1.529 std_dev=0.842
C2	B	0, 0.266, 1.139, 2.012, 2.673 max_d=2.673 avg_d=1.139 std_dev=0.873
O5'	B	0, 0.136, 1.112, 2.089, 2.621 max_d=2.621 avg_d=1.112 std_dev=0.977
O2	B	0, 0.106, 1.138, 2.169, 2.781 max_d=2.781 avg_d=1.138 std_dev=1.032
C4	B	0, 0.429, 1.531, 2.633, 3.789 max_d=3.789 avg_d=1.531 std_dev=1.102
N3	B	0, 0.190, 1.368, 2.546, 3.645 max_d=3.645 avg_d=1.368 std_dev=1.178
OP1	B	0, 0.603, 1.899, 3.194, 4.474 max_d=4.474 avg_d=1.899 std_dev=1.296
P	B	0, 0.265, 1.590, 2.915, 4.224 max_d=4.224 avg_d=1.590 std_dev=1.325
O4	B	0, 0.265, 1.699, 3.134, 4.774 max_d=4.774 avg_d=1.699 std_dev=1.435
OP2	B	0, 0.458, 2.029, 3.601, 4.908 max_d=4.908 avg_d=2.029 std_dev=1.571

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.08	0.18	0.43	0.15
C2	0.03	0.00	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.02	0.29	0.34	0.45	0.26
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.17	0.18	0.31	0.04
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.09	0.01	0.10	0.01	0.09	0.10	0.10	0.11	0.10	0.11	0.07	0.02	0.01	0.02	0.23	0.21	0.23	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.27	0.32	0.46	0.25
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.07	0.10	0.06	0.05	0.08	0.10	0.05	0.02	0.03	0.00	0.01	0.18	0.29	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.02	0.34	0.41	0.48	0.32
C5'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.12	0.00	0.16	0.00	0.16	0.18	0.13	0.09	0.19	0.20	0.11	0.02	0.04	0.01	0.01	0.18	0.16	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.35	0.44	0.47	0.34
C8	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.10	0.03	0.30	0.34	0.48	0.28
N1	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.01	0.33	0.40	0.46	0.30
N3	0.03	0.01	0.07	0.11	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.24	0.29	0.45	0.22
N6	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.10	0.03	0.38	0.50	0.47	0.37
N7	0.00	0.01	0.05	0.11	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.36	0.43	0.50	0.35
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.22	0.26	0.45	0.22
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.08	0.02	0.11	0.10	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.05	0.07	0.19	0.33	0.06
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.07	0.03	0.09	0.04	0.09	0.10	0.10	0.11	0.10	0.11	0.05	0.06	0.00	0.03	0.22	0.28	0.19	0.11
O4'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.03	0.00	0.10	0.21	0.43	0.20
O5'	0.08	0.29	0.17	0.23	0.27	0.01	0.34	0.01	0.35	0.30	0.33	0.24	0.38	0.36	0.22	0.07	0.22	0.10	0.00	0.02	0.05	0.01
OP1	0.18	0.34	0.18	0.21	0.32	0.18	0.41	0.18	0.44	0.34	0.40	0.29	0.50	0.43	0.26	0.19	0.28	0.21	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.43	0.45	0.31	0.23	0.46	0.29	0.48	0.16	0.47	0.48	0.46	0.45	0.47	0.50	0.45	0.33	0.19	0.43	0.05	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.26	0.04	0.06	0.25	0.07	0.32	0.01	0.34	0.28	0.30	0.22	0.37	0.35	0.22	0.06	0.11	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.58	0.17	0.17	0.58	0.12	0.48	0.12	0.42	0.45	0.62	0.64	0.15	0.21	0.62	0.29	0.34	0.19	0.59	0.28
C2	0.16	0.32	0.14	0.20	0.37	0.10	0.31	0.17	0.26	0.24	0.38	0.33	0.19	0.22	0.42	0.14	0.56	0.37	0.88	0.57
C2'	0.34	0.55	0.11	0.11	0.54	0.06	0.44	0.09	0.38	0.42	0.59	0.62	0.10	0.23	0.58	0.30	0.27	0.19	0.60	0.22
C3'	0.31	0.48	0.11	0.13	0.43	0.08	0.34	0.17	0.31	0.36	0.49	0.56	0.14	0.27	0.46	0.28	0.21	0.27	0.61	0.19
C4	0.18	0.32	0.13	0.19	0.35	0.10	0.29	0.16	0.25	0.24	0.37	0.35	0.18	0.22	0.39	0.15	0.53	0.34	0.81	0.51
C4'	0.38	0.57	0.12	0.13	0.52	0.06	0.43	0.15	0.39	0.44	0.58	0.65	0.13	0.26	0.55	0.33	0.19	0.26	0.52	0.12
C5	0.11	0.26	0.13	0.22	0.25	0.11	0.20	0.25	0.18	0.17	0.29	0.34	0.22	0.24	0.27	0.10	0.64	0.45	0.94	0.65
C5'	0.37	0.48	0.23	0.22	0.43	0.17	0.36	0.26	0.34	0.39	0.48	0.55	0.28	0.33	0.44	0.32	0.19	0.35	0.54	0.17
C6	0.10	0.28	0.13	0.22	0.26	0.12	0.21	0.28	0.18	0.17	0.32	0.37	0.22	0.25	0.29	0.09	0.69	0.51	1.03	0.73
C8	0.14	0.26	0.12	0.20	0.24	0.10	0.20	0.19	0.19	0.18	0.27	0.33	0.19	0.22	0.26	0.13	0.54	0.34	0.79	0.51
N1	0.11	0.27	0.13	0.21	0.29	0.11	0.24	0.24	0.21	0.18	0.31	0.31	0.21	0.24	0.32	0.10	0.65	0.47	0.99	0.68
N3	0.21	0.38	0.14	0.18	0.43	0.10	0.36	0.13	0.30	0.29	0.45	0.40	0.17	0.21	0.48	0.18	0.49	0.30	0.78	0.47
N6	0.12	0.38	0.14	0.24	0.33	0.14	0.24	0.36	0.21	0.22	0.42	0.50	0.24	0.28	0.37	0.11	0.77	0.62	1.15	0.85
N7	0.10	0.28	0.12	0.22	0.22	0.12	0.17	0.28	0.16	0.16	0.30	0.41	0.23	0.26	0.24	0.09	0.66	0.47	0.95	0.66
N9	0.22	0.37	0.13	0.18	0.39	0.10	0.32	0.13	0.28	0.28	0.41	0.41	0.16	0.20	0.42	0.19	0.46	0.27	0.71	0.41
O2'	0.47	0.74	0.18	0.16	0.75	0.12	0.62	0.12	0.55	0.59	0.80	0.82	0.13	0.23	0.81	0.43	0.27	0.23	0.54	0.17
O3'	0.35	0.52	0.13	0.17	0.47	0.11	0.37	0.24	0.34	0.40	0.53	0.60	0.17	0.31	0.49	0.33	0.16	0.36	0.59	0.17
O4'	0.36	0.60	0.15	0.17	0.58	0.11	0.48	0.12	0.42	0.46	0.63	0.67	0.11	0.23	0.61	0.30	0.27	0.16	0.53	0.21
O5'	0.39	0.35	0.28	0.19	0.35	0.31	0.38	0.26	0.39	0.37	0.35	0.36	0.33	0.02	0.35	0.44	0.34	0.27	0.51	0.18
OP1	0.08	0.10	0.07	0.09	0.21	0.12	0.24	0.32	0.19	0.10	0.15	0.13	0.09	0.01	0.24	0.11	0.24	0.35	0.78	0.31
OP2	0.12	0.23	0.14	0.11	0.36	0.09	0.37	0.19	0.32	0.24	0.31	0.18	0.23	0.02	0.40	0.06	0.43	0.38	0.83	0.44
P	0.11	0.13	0.10	0.01	0.21	0.06	0.24	0.14	0.21	0.14	0.17	0.13	0.10	0.00	0.23	0.11	0.24	0.23	0.65	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.12	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.01	0.32	0.23	0.38	0.28
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.00	0.04	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.08	0.01	0.04	0.43	0.23	0.42	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.09	0.02	0.12	0.19	0.12	0.05	0.06	0.12	0.01	0.06	0.10	0.01	0.47	0.27	0.48	0.33
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.18	0.00	0.22	0.03	0.20	0.12	0.13	0.07	0.02	0.00	0.18	0.01	0.23	0.13	0.44	0.16
C4	0.01	0.00	0.09	0.18	0.00	0.10	0.01	0.39	0.02	0.01	0.00	0.01	0.18	0.12	0.01	0.03	0.46	0.21	0.72	0.19
C4'	0.03	0.04	0.02	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.13	0.06	0.06	0.04	0.19	0.07	0.10	0.01	0.02	0.11	0.37	0.18
C5	0.02	0.01	0.12	0.22	0.01	0.13	0.00	0.43	0.01	0.00	0.00	0.01	0.15	0.18	0.02	0.06	0.45	0.19	0.83	0.24
C5'	0.12	0.25	0.19	0.03	0.39	0.01	0.43	0.00	0.39	0.27	0.32	0.17	0.04	0.17	0.41	0.02	0.01	0.29	0.31	0.01
C6	0.02	0.01	0.12	0.20	0.02	0.13	0.01	0.39	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.15	0.03	0.06	0.45	0.20	0.66	0.25
N1	0.00	0.01	0.05	0.12	0.01	0.06	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.02	0.11	0.06	0.02	0.01	0.42	0.22	0.44	0.23
N3	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.06	0.00	0.32	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.07	0.00	0.02	0.45	0.23	0.53	0.19
O2	0.05	0.01	0.12	0.07	0.01	0.04	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.00	0.17	0.16	0.01	0.08	0.41	0.24	0.36	0.25
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.18	0.19	0.15	0.04	0.12	0.11	0.18	0.17	0.00	0.14	0.20	0.09	0.36	0.20	0.52	0.29
O3'	0.10	0.08	0.06	0.00	0.12	0.07	0.18	0.17	0.15	0.06	0.07	0.16	0.14	0.00	0.13	0.07	0.30	0.28	0.47	0.23
O4	0.02	0.01	0.10	0.18	0.01	0.10	0.02	0.41	0.03	0.02	0.00	0.01	0.20	0.13	0.00	0.04	0.45	0.22	0.79	0.19
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.06	0.01	0.02	0.08	0.09	0.07	0.04	0.00	0.29	0.27	0.54	0.45
O5'	0.32	0.43	0.47	0.23	0.46	0.02	0.45	0.01	0.45	0.42	0.45	0.41	0.36	0.30	0.45	0.29	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.23	0.27	0.13	0.21	0.11	0.19	0.29	0.20	0.22	0.23	0.24	0.20	0.28	0.22	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.38	0.42	0.48	0.44	0.72	0.37	0.83	0.31	0.66	0.44	0.53	0.36	0.52	0.47	0.79	0.54	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.28	0.22	0.33	0.16	0.19	0.18	0.24	0.01	0.25	0.23	0.19	0.25	0.29	0.23	0.19	0.45	0.01	0.01	0.00	0.00