Doublet Group distance statistics: 52223

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C2	A	0, 0.008, 0.025, 0.041, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.005, 0.024, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.009, 0.036, 0.062, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.036 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.021, 0.051, 0.081, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.051 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.020, 0.053, 0.085, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.053 std_dev=0.033
N6	A	0, 0.020, 0.056, 0.092, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.056 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.045, 0.115, 0.184, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.115 std_dev=0.070
O2'	A	0, 0.033, 0.111, 0.190, 0.222 max_d=0.222 avg_d=0.111 std_dev=0.079
O4'	A	0, 0.012, 0.148, 0.283, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.148 std_dev=0.135
C3'	A	0, 0.040, 0.255, 0.470, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.255 std_dev=0.215
C4'	A	0, 0.044, 0.286, 0.529, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.286 std_dev=0.243
O3'	A	0, 0.068, 0.315, 0.563, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.315 std_dev=0.248
O2'	B	0, 0.113, 0.388, 0.662, 0.647 max_d=0.647 avg_d=0.388 std_dev=0.275
O3'	B	0, 0.092, 0.459, 0.827, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.459 std_dev=0.368
C5'	A	0, 0.067, 0.472, 0.877, 1.112 max_d=1.112 avg_d=0.472 std_dev=0.405
C2'	B	0, 0.079, 0.498, 0.917, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.498 std_dev=0.419
O5'	A	0, 0.067, 0.511, 0.955, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.511 std_dev=0.444
C1'	B	0, 0.138, 0.620, 1.101, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.620 std_dev=0.481
C3'	B	0, 0.062, 0.568, 1.074, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.568 std_dev=0.506
N1	B	0, 0.143, 0.685, 1.226, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.685 std_dev=0.541
P	A	0, 0.095, 0.655, 1.214, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.655 std_dev=0.560
C2	B	0, 0.223, 0.839, 1.455, 1.503 max_d=1.503 avg_d=0.839 std_dev=0.616
C6	B	0, 0.070, 0.695, 1.320, 1.672 max_d=1.672 avg_d=0.695 std_dev=0.625
C4'	B	0, 0.156, 0.788, 1.420, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.788 std_dev=0.632
O4'	B	0, 0.173, 0.821, 1.470, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.821 std_dev=0.648
OP2	A	0, 0.159, 0.817, 1.475, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.817 std_dev=0.658
C4	B	0, 0.187, 0.848, 1.510, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.848 std_dev=0.662
C5	B	0, 0.096, 0.763, 1.430, 1.773 max_d=1.773 avg_d=0.763 std_dev=0.667
N3	B	0, 0.235, 0.912, 1.589, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.912 std_dev=0.677
OP2	B	0, 0.431, 1.134, 1.836, 1.904 max_d=1.904 avg_d=1.134 std_dev=0.702
O2	B	0, 0.235, 0.940, 1.644, 1.910 max_d=1.910 avg_d=0.940 std_dev=0.705
O4	B	0, 0.246, 0.958, 1.670, 1.721 max_d=1.721 avg_d=0.958 std_dev=0.712
OP1	A	0, 0.054, 0.856, 1.659, 2.169 max_d=2.169 avg_d=0.856 std_dev=0.803
O5'	B	0, 0.224, 1.076, 1.927, 2.376 max_d=2.376 avg_d=1.076 std_dev=0.851
P	B	0, 0.163, 1.029, 1.896, 2.389 max_d=2.389 avg_d=1.029 std_dev=0.867
C5'	B	0, 0.163, 1.067, 1.970, 2.499 max_d=2.499 avg_d=1.067 std_dev=0.904
OP1	B	0, 0.192, 1.635, 3.077, 3.902 max_d=3.902 avg_d=1.635 std_dev=1.442

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.09	0.06	0.07
C2	0.04	0.00	0.11	0.17	0.02	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.20	0.03	0.21	0.22	0.31	0.22
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.04	0.10	0.11	0.06	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.12	0.00	0.11	0.01	0.15	0.06	0.17	0.15	0.15	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02
C4	0.01	0.02	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.12	0.01	0.16	0.17	0.24	0.18
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.09	0.07	0.09	0.08	0.10	0.08	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.03	0.19	0.20	0.31	0.21
C5'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.15	0.08	0.14	0.11	0.17	0.12	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.22	0.24	0.38	0.25
C8	0.03	0.02	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.05	0.06	0.08	0.11	0.15	0.11
N1	0.03	0.00	0.10	0.17	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.19	0.01	0.23	0.25	0.37	0.25
N3	0.04	0.01	0.11	0.15	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.03	0.18	0.18	0.25	0.19
N6	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.10	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.16	0.03	0.24	0.28	0.43	0.28
N7	0.02	0.01	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.05	0.14	0.17	0.27	0.17
N9	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.09	0.12	0.14	0.11
O2'	0.03	0.11	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.04	0.09	0.09	0.05	0.02	0.02	0.00	0.06	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.12	0.02	0.11	0.02	0.16	0.05	0.19	0.17	0.16	0.06	0.04	0.06	0.00	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.05	0.11	0.03	0.07
O5'	0.06	0.21	0.03	0.02	0.16	0.02	0.19	0.01	0.22	0.08	0.23	0.18	0.24	0.14	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.09	0.22	0.04	0.04	0.17	0.03	0.20	0.03	0.24	0.11	0.25	0.18	0.28	0.17	0.12	0.02	0.07	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.31	0.03	0.02	0.24	0.01	0.31	0.02	0.38	0.15	0.37	0.25	0.43	0.27	0.14	0.02	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.22	0.04	0.02	0.18	0.02	0.21	0.01	0.25	0.11	0.25	0.19	0.28	0.17	0.11	0.02	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.11	0.09	0.19	0.19	0.41	0.26	0.48	0.27	0.19	0.12	0.06	0.16	0.09	0.19	0.43	0.39	0.60	0.35	0.43
C2	0.37	0.43	0.13	0.20	0.47	0.43	0.44	0.43	0.42	0.40	0.46	0.42	0.12	0.19	0.49	0.55	0.35	0.56	0.36	0.36
C2'	0.17	0.11	0.06	0.14	0.18	0.33	0.22	0.39	0.23	0.16	0.12	0.05	0.15	0.06	0.18	0.35	0.31	0.60	0.28	0.37
C3'	0.09	0.05	0.02	0.09	0.10	0.24	0.13	0.30	0.13	0.08	0.05	0.03	0.16	0.02	0.10	0.24	0.21	0.60	0.24	0.30
C4	0.34	0.34	0.12	0.20	0.37	0.42	0.37	0.42	0.36	0.34	0.35	0.32	0.13	0.17	0.37	0.51	0.33	0.57	0.35	0.36
C4'	0.03	0.08	0.02	0.09	0.02	0.25	0.09	0.35	0.10	0.03	0.06	0.16	0.19	0.04	0.02	0.20	0.27	0.60	0.24	0.35
C5	0.36	0.42	0.11	0.18	0.40	0.38	0.37	0.35	0.36	0.37	0.42	0.46	0.12	0.19	0.41	0.49	0.26	0.53	0.33	0.29
C5'	0.07	0.13	0.06	0.05	0.06	0.14	0.03	0.24	0.02	0.08	0.11	0.19	0.18	0.10	0.06	0.07	0.17	0.59	0.22	0.28
C6	0.37	0.50	0.11	0.18	0.47	0.36	0.40	0.33	0.38	0.40	0.52	0.57	0.12	0.20	0.50	0.49	0.24	0.51	0.32	0.25
C8	0.32	0.28	0.12	0.20	0.29	0.39	0.30	0.38	0.31	0.30	0.27	0.26	0.12	0.17	0.29	0.47	0.29	0.58	0.34	0.35
N1	0.38	0.49	0.12	0.19	0.50	0.40	0.44	0.37	0.41	0.42	0.53	0.53	0.12	0.20	0.54	0.53	0.29	0.53	0.33	0.30
N3	0.34	0.34	0.13	0.21	0.40	0.44	0.40	0.46	0.39	0.35	0.37	0.31	0.13	0.18	0.41	0.53	0.38	0.58	0.37	0.40
N6	0.37	0.55	0.10	0.17	0.50	0.32	0.39	0.26	0.36	0.41	0.58	0.67	0.12	0.21	0.54	0.46	0.19	0.48	0.30	0.18
N7	0.35	0.40	0.12	0.18	0.36	0.35	0.33	0.31	0.33	0.35	0.39	0.46	0.12	0.19	0.36	0.45	0.23	0.53	0.32	0.27
N9	0.30	0.24	0.12	0.21	0.28	0.43	0.32	0.44	0.32	0.28	0.24	0.18	0.13	0.15	0.28	0.49	0.36	0.60	0.36	0.40
O2'	0.13	0.06	0.05	0.12	0.15	0.32	0.22	0.41	0.22	0.13	0.08	0.08	0.17	0.02	0.16	0.33	0.34	0.58	0.28	0.39
O3'	0.06	0.04	0.02	0.06	0.07	0.18	0.09	0.25	0.10	0.05	0.04	0.05	0.14	0.01	0.07	0.17	0.17	0.61	0.26	0.27
O4'	0.12	0.05	0.05	0.17	0.08	0.38	0.17	0.47	0.19	0.09	0.03	0.16	0.18	0.04	0.08	0.35	0.38	0.60	0.33	0.43
O5'	0.04	0.04	0.01	0.05	0.04	0.15	0.05	0.18	0.06	0.03	0.04	0.05	0.12	0.00	0.04	0.13	0.09	0.61	0.27	0.22
OP1	0.05	0.06	0.09	0.08	0.08	0.07	0.09	0.12	0.09	0.06	0.07	0.06	0.08	0.01	0.09	0.06	0.07	0.72	0.34	0.25
OP2	0.09	0.13	0.12	0.10	0.13	0.07	0.15	0.13	0.14	0.11	0.13	0.16	0.15	0.04	0.14	0.05	0.18	0.61	0.41	0.11
P	0.03	0.06	0.03	0.03	0.05	0.04	0.05	0.07	0.05	0.04	0.06	0.09	0.07	0.01	0.05	0.03	0.04	0.61	0.32	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.12	0.33	0.06
C2	0.03	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.04	0.18	0.48	0.06
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.03	0.07	0.01	0.03	0.08	0.00	0.00	0.03	0.02	0.09	0.32	0.30	0.12
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.06	0.02	0.01	0.03	0.01	0.08	0.42	0.22	0.12
C4	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.09	0.38	0.63	0.08
C4'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.03	0.05	0.02	0.02	0.05	0.00	0.03	0.17	0.14	0.06
C5	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.05	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.03	0.02	0.02	0.09	0.42	0.66	0.08
C5'	0.03	0.06	0.03	0.02	0.12	0.00	0.14	0.00	0.12	0.08	0.09	0.03	0.02	0.04	0.13	0.01	0.02	0.09	0.18	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.03	0.02	0.02	0.07	0.30	0.58	0.05
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.01	0.04	0.17	0.47	0.05
N3	0.03	0.00	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.06	0.27	0.56	0.07
O2	0.04	0.00	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.09	0.01	0.05	0.03	0.16	0.42	0.07
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.05	0.02	0.10	0.02	0.10	0.04	0.05	0.12	0.00	0.03	0.06	0.03	0.11	0.42	0.34	0.15
O3'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.05	0.09	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.44	0.24	0.12
O4	0.03	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.02	0.13	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.10	0.45	0.66	0.11
O4'	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.12	0.10	0.26	0.10
O5'	0.02	0.04	0.09	0.08	0.09	0.03	0.09	0.02	0.07	0.04	0.06	0.03	0.11	0.06	0.10	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.12	0.18	0.32	0.42	0.38	0.17	0.42	0.09	0.30	0.17	0.27	0.16	0.42	0.44	0.45	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.48	0.30	0.22	0.63	0.14	0.66	0.18	0.58	0.47	0.56	0.42	0.34	0.24	0.66	0.26	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.06	0.12	0.12	0.08	0.06	0.08	0.01	0.05	0.05	0.07	0.07	0.15	0.12	0.11	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00