Doublet Group distance statistics: 52228

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.010, 0.028, 0.046, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.032 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.013, 0.034, 0.054, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.034 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.010, 0.034, 0.057, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.034 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.014, 0.055, 0.096, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.055 std_dev=0.041
C2'	A	0, 0.173, 0.413, 0.653, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.413 std_dev=0.240
O4'	A	0, 0.181, 0.431, 0.681, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.431 std_dev=0.250
O2'	A	0, 0.199, 0.476, 0.753, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.476 std_dev=0.277
C2'	B	0, 0.231, 0.547, 0.864, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.547 std_dev=0.316
C1'	B	0, 0.261, 0.622, 0.983, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.622 std_dev=0.361
C3'	A	0, 0.272, 0.647, 1.023, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.647 std_dev=0.376
C4'	A	0, 0.277, 0.659, 1.040, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.659 std_dev=0.382
O3'	A	0, 0.328, 0.782, 1.236, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.782 std_dev=0.454
O5'	A	0, 0.458, 1.086, 1.713, 1.482 max_d=1.482 avg_d=1.086 std_dev=0.628
O2'	B	0, 0.480, 1.140, 1.799, 1.585 max_d=1.585 avg_d=1.140 std_dev=0.659
C2	B	0, 0.490, 1.159, 1.829, 1.575 max_d=1.575 avg_d=1.159 std_dev=0.670
C5'	A	0, 0.511, 1.217, 1.923, 1.684 max_d=1.684 avg_d=1.217 std_dev=0.706
N1	B	0, 0.520, 1.236, 1.953, 1.713 max_d=1.713 avg_d=1.236 std_dev=0.716
C3'	B	0, 0.592, 1.405, 2.218, 1.940 max_d=1.940 avg_d=1.405 std_dev=0.813
O4'	B	0, 0.670, 1.585, 2.501, 2.147 max_d=2.147 avg_d=1.585 std_dev=0.916
P	A	0, 0.777, 1.840, 2.904, 2.523 max_d=2.523 avg_d=1.840 std_dev=1.064
OP1	A	0, 0.776, 1.843, 2.910, 2.554 max_d=2.554 avg_d=1.843 std_dev=1.067
N3	B	0, 0.782, 1.851, 2.921, 2.519 max_d=2.519 avg_d=1.851 std_dev=1.070
C4'	B	0, 0.885, 2.098, 3.310, 2.852 max_d=2.852 avg_d=2.098 std_dev=1.213
O5'	B	0, 0.894, 2.118, 3.342, 2.914 max_d=2.914 avg_d=2.118 std_dev=1.224
OP2	A	0, 0.942, 2.233, 3.524, 3.049 max_d=3.049 avg_d=2.233 std_dev=1.291
O2	B	0, 0.980, 2.319, 3.659, 3.155 max_d=3.155 avg_d=2.319 std_dev=1.340
O3'	B	0, 1.083, 2.565, 4.047, 3.492 max_d=3.492 avg_d=2.565 std_dev=1.482
P	B	0, 1.184, 2.802, 4.420, 3.787 max_d=3.787 avg_d=2.802 std_dev=1.618
C5'	B	0, 1.204, 2.858, 4.513, 3.923 max_d=3.923 avg_d=2.858 std_dev=1.654
C6	B	0, 1.337, 3.164, 4.991, 4.266 max_d=4.266 avg_d=3.164 std_dev=1.827
C4	B	0, 1.343, 3.182, 5.021, 4.326 max_d=4.326 avg_d=3.182 std_dev=1.839
OP2	B	0, 1.631, 3.861, 6.090, 5.208 max_d=5.208 avg_d=3.861 std_dev=2.229
O4	B	0, 1.679, 3.977, 6.275, 5.405 max_d=5.405 avg_d=3.977 std_dev=2.298
C5	B	0, 1.715, 4.059, 6.404, 5.474 max_d=5.474 avg_d=4.059 std_dev=2.345
OP1	B	0, 1.832, 4.334, 6.837, 5.811 max_d=5.811 avg_d=4.334 std_dev=2.503

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.17	0.09	0.12
C2	0.02	0.00	0.05	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.10	0.02	0.19	0.27	0.18	0.24
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.06	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.15	0.12	0.11
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.09	0.10	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.13	0.13	0.10
C4	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.20	0.27	0.21	0.25
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.10	0.11	0.02
C5	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.23	0.30	0.30	0.31
C5'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.08	0.04	0.09	0.07	0.07	0.06	0.04	0.03	0.03	0.01	0.00	0.12	0.05	0.01
C6	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.24	0.32	0.31	0.33
C8	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.24	0.28	0.30	0.31
N1	0.02	0.00	0.03	0.09	0.00	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.02	0.22	0.30	0.25	0.29
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.17	0.25	0.14	0.21
N6	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.07	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.27	0.35	0.39	0.38
N7	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.02	0.03	0.25	0.31	0.36	0.35
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.19	0.25	0.19	0.23
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.08	0.16	0.03
O3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.08	0.09	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.06	0.16	0.06
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.14	0.07	0.06
O5'	0.11	0.19	0.12	0.12	0.20	0.01	0.23	0.00	0.24	0.24	0.22	0.17	0.27	0.25	0.19	0.02	0.04	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.17	0.27	0.15	0.13	0.27	0.10	0.30	0.12	0.32	0.28	0.30	0.25	0.35	0.31	0.25	0.08	0.06	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.09	0.18	0.12	0.13	0.21	0.11	0.30	0.05	0.31	0.30	0.25	0.14	0.39	0.36	0.19	0.16	0.16	0.07	0.02	0.00	0.00	0.01
P	0.12	0.24	0.11	0.10	0.25	0.02	0.31	0.01	0.33	0.31	0.29	0.21	0.38	0.35	0.23	0.03	0.06	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.24	0.11	0.03	0.18	0.19	0.52	0.20	0.53	0.13	0.15	0.61	0.18	0.16	0.17	0.15	0.27	0.57	0.30	0.40
C2	0.15	0.26	0.14	0.18	0.08	0.16	0.46	0.18	0.49	0.15	0.27	0.59	0.08	0.32	0.02	0.18	0.04	0.49	0.06	0.23
C2'	0.15	0.11	0.20	0.08	0.43	0.09	0.82	0.05	0.79	0.30	0.04	0.54	0.23	0.12	0.43	0.07	0.15	0.32	0.14	0.23
C3'	0.07	0.15	0.14	0.04	0.35	0.15	0.69	0.07	0.67	0.22	0.01	0.56	0.20	0.08	0.35	0.10	0.18	0.24	0.16	0.21
C4	0.13	0.29	0.14	0.16	0.04	0.10	0.39	0.10	0.45	0.11	0.28	0.62	0.12	0.33	0.03	0.12	0.11	0.55	0.11	0.30
C4'	0.10	0.27	0.02	0.14	0.14	0.36	0.41	0.32	0.40	0.03	0.15	0.60	0.12	0.11	0.15	0.29	0.37	0.47	0.40	0.41
C5	0.14	0.32	0.15	0.23	0.16	0.19	0.17	0.16	0.27	0.05	0.37	0.53	0.11	0.42	0.23	0.18	0.05	0.56	0.05	0.28
C5'	0.25	0.35	0.14	0.24	0.06	0.45	0.15	0.39	0.15	0.15	0.26	0.59	0.05	0.20	0.05	0.40	0.44	0.44	0.46	0.44
C6	0.16	0.29	0.15	0.26	0.21	0.27	0.14	0.25	0.24	0.06	0.40	0.47	0.08	0.45	0.31	0.25	0.08	0.51	0.09	0.20
C8	0.09	0.31	0.15	0.17	0.11	0.06	0.14	0.10	0.23	0.02	0.30	0.51	0.17	0.40	0.15	0.09	0.19	0.61	0.23	0.38
N1	0.16	0.27	0.14	0.23	0.08	0.24	0.29	0.25	0.36	0.11	0.33	0.51	0.06	0.39	0.17	0.24	0.07	0.48	0.11	0.19
N3	0.13	0.27	0.13	0.14	0.13	0.10	0.53	0.11	0.55	0.16	0.23	0.64	0.10	0.28	0.09	0.13	0.10	0.52	0.08	0.28
N6	0.17	0.27	0.16	0.32	0.38	0.37	0.14	0.34	0.10	0.05	0.45	0.32	0.07	0.51	0.52	0.32	0.17	0.47	0.19	0.15
N7	0.12	0.33	0.15	0.25	0.26	0.19	0.07	0.13	0.11	0.05	0.39	0.45	0.13	0.48	0.32	0.15	0.08	0.61	0.12	0.32
N9	0.10	0.28	0.14	0.12	0.07	0.08	0.39	0.10	0.45	0.10	0.23	0.60	0.16	0.30	0.04	0.09	0.19	0.57	0.21	0.36
O2'	0.12	0.10	0.15	0.03	0.51	0.18	0.88	0.14	0.81	0.30	0.09	0.54	0.21	0.07	0.53	0.10	0.22	0.40	0.22	0.29
O3'	0.07	0.08	0.13	0.07	0.48	0.17	0.81	0.06	0.74	0.26	0.08	0.51	0.18	0.15	0.51	0.09	0.18	0.14	0.14	0.16
O4'	0.09	0.31	0.03	0.10	0.05	0.35	0.32	0.37	0.33	0.02	0.22	0.61	0.13	0.09	0.05	0.30	0.40	0.64	0.45	0.50
O5'	0.12	0.11	0.15	0.08	0.19	0.32	0.30	0.31	0.30	0.15	0.11	0.20	0.28	0.02	0.20	0.21	0.30	0.34	0.36	0.31
OP1	0.05	0.03	0.02	0.15	0.04	0.38	0.05	0.52	0.05	0.05	0.03	0.04	0.18	0.02	0.04	0.23	0.36	0.36	0.52	0.35
OP2	0.26	0.30	0.38	0.22	0.41	0.06	0.43	0.13	0.40	0.33	0.35	0.23	0.47	0.02	0.43	0.13	0.16	0.33	0.10	0.23
P	0.10	0.10	0.15	0.03	0.16	0.18	0.18	0.20	0.18	0.13	0.12	0.05	0.25	0.01	0.17	0.06	0.16	0.09	0.24	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.01	0.01	0.22	0.21	0.15	0.24
C2	0.01	0.00	0.08	0.14	0.02	0.22	0.01	0.43	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.03	0.14	0.12	0.11	0.25	0.07
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.11	0.10	0.02	0.06	0.15	0.00	0.03	0.02	0.01	0.17	0.07	0.14	0.11
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.03	0.15	0.01	0.10	0.27	0.02	0.01	0.02	0.01	0.12	0.11	0.14	0.07
C4	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.02	0.34	0.32	0.24	0.43
C4'	0.01	0.22	0.03	0.01	0.04	0.00	0.14	0.01	0.19	0.01	0.17	0.42	0.02	0.04	0.06	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.14	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.06	0.01	0.10	0.66	0.69	0.66	0.82
C5'	0.05	0.43	0.11	0.03	0.13	0.01	0.17	0.00	0.24	0.08	0.37	0.76	0.10	0.02	0.16	0.00	0.01	0.06	0.10	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.15	0.01	0.19	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01	0.15	0.71	0.71	0.68	0.82
N1	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.08	0.02	0.01	0.31	0.30	0.21	0.36
N3	0.01	0.00	0.06	0.10	0.01	0.17	0.01	0.37	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.10	0.09	0.05	0.17	0.05
O2	0.02	0.01	0.15	0.27	0.02	0.42	0.02	0.76	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.14	0.03	0.28	0.50	0.53	0.69	0.51
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.04	0.02	0.07	0.10	0.08	0.02	0.06	0.13	0.00	0.07	0.04	0.03	0.16	0.11	0.13	0.09
O3'	0.11	0.11	0.03	0.01	0.08	0.04	0.06	0.02	0.06	0.08	0.09	0.14	0.07	0.00	0.09	0.12	0.09	0.10	0.09	0.07
O4	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.09	0.00	0.03	0.32	0.29	0.21	0.41
O4'	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.10	0.28	0.03	0.12	0.03	0.00	0.19	0.31	0.11	0.24
O5'	0.22	0.12	0.17	0.12	0.34	0.01	0.66	0.01	0.71	0.31	0.09	0.50	0.16	0.09	0.32	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.21	0.11	0.07	0.11	0.32	0.05	0.69	0.06	0.71	0.30	0.05	0.53	0.11	0.10	0.29	0.31	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.15	0.25	0.14	0.14	0.24	0.05	0.66	0.10	0.68	0.21	0.17	0.69	0.13	0.09	0.21	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.24	0.07	0.11	0.07	0.43	0.02	0.82	0.02	0.82	0.36	0.05	0.51	0.09	0.07	0.41	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00